Heatmap: Cluster_47 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.35 0.12 -0.31 -0.29 -0.32 -0.14 -0.4 -0.07 0.29 0.27 0.04 0.19
0.93 -0.13 -0.85 -0.56 0.04 0.62 -0.8 -1.3 -0.23 0.21 0.47 0.02
-0.27 -0.32 -0.89 -0.15 0.3 0.7 -0.29 -0.63 0.35 0.48 0.03 -0.12
0.58 -0.04 -0.51 -0.21 -0.15 0.06 -0.4 -0.3 0.22 0.2 0.2 0.01
-0.15 -0.25 -0.1 0.29 0.35 0.54 -0.23 -0.43 -0.05 0.0 -0.14 -0.16
0.08 -0.13 -0.6 -0.26 0.05 0.45 -0.15 -0.24 0.21 0.24 0.03 0.03
-0.09 -0.36 -0.4 0.04 0.16 0.43 -0.17 -0.01 0.27 0.21 -0.07 -0.25
0.55 0.34 0.08 0.08 0.36 0.75 -0.27 -0.63 -0.26 -0.32 -0.55 -1.32
0.17 0.03 -0.27 -0.05 0.07 0.18 -0.33 -0.08 0.2 0.2 -0.1 -0.15
0.11 0.07 -0.29 0.06 0.36 0.66 -0.01 -0.72 -0.15 -0.11 -0.3 -0.15
0.85 0.29 -0.35 -0.21 0.42 0.65 -0.39 -1.49 -0.53 -0.07 -0.09 -0.48
0.53 0.4 -0.11 -0.02 0.08 0.35 -0.24 -0.19 0.13 0.02 -0.51 -1.13
0.35 -0.11 -0.44 -0.04 0.17 0.55 -0.14 -0.32 0.14 0.13 -0.24 -0.43
0.21 -0.09 -0.45 -0.06 -0.11 0.32 -0.02 -0.12 0.13 0.16 -0.07 -0.04
0.41 0.1 -0.28 -0.03 -0.08 0.03 -0.43 -0.38 0.14 0.21 0.02 0.06
0.11 -0.06 -0.18 0.15 0.25 0.59 -0.06 -0.36 -0.07 -0.11 -0.34 -0.2
0.78 0.33 -0.31 -0.03 0.13 0.63 -0.27 -0.75 -0.01 -0.04 -0.41 -1.15
0.36 0.06 -0.24 -0.0 0.11 0.4 -0.33 -0.29 0.12 0.16 -0.18 -0.45
0.35 -0.02 -0.2 0.08 0.08 0.15 -0.21 -0.27 0.03 -0.01 -0.09 0.02
0.34 0.14 -0.21 0.24 0.41 0.61 0.06 -0.18 -0.15 -0.32 -0.84 -0.87
0.4 0.19 -0.49 -0.18 0.21 0.57 0.2 -0.05 -0.02 -0.2 -0.45 -0.73
0.95 0.08 -0.33 0.29 -0.02 0.16 -0.78 -1.16 -0.02 0.2 -0.16 -0.25
0.48 -0.0 -0.46 -0.03 0.17 0.41 -0.24 -0.56 -0.03 0.04 0.02 -0.15
0.27 -0.27 -0.78 -0.22 0.46 1.02 -0.21 -0.76 -0.02 0.09 -0.16 -0.47
0.34 0.1 -0.34 0.12 0.3 0.6 0.03 -0.28 -0.1 -0.04 -0.54 -0.73
1.04 0.3 -0.41 -0.19 0.15 0.51 -0.75 -1.19 -0.4 -0.02 0.02 -0.38
0.36 0.08 -0.23 -0.25 -0.22 0.18 -0.31 -0.18 0.21 0.2 0.04 -0.08
0.65 0.01 -0.64 -0.33 -0.08 0.23 -0.33 -0.27 0.09 0.19 0.07 -0.01
0.25 -0.03 -0.32 -0.09 0.01 0.3 -0.12 -0.11 0.13 0.15 -0.1 -0.2
0.07 -0.21 -0.19 0.28 0.41 0.49 -0.36 -0.66 -0.05 0.12 -0.1 -0.21
0.28 0.17 -0.25 0.16 0.22 0.47 -0.22 -0.5 0.05 0.07 -0.43 -0.39
0.35 0.09 -0.28 0.03 0.22 0.37 -0.34 -0.56 0.14 0.21 -0.27 -0.31
0.19 0.0 -0.3 -0.17 -0.01 0.11 -0.16 -0.19 0.28 0.26 -0.09 -0.06
0.29 -0.03 -0.41 0.07 0.35 0.71 -0.23 -0.7 -0.09 0.05 -0.21 -0.36
0.24 -0.37 -0.37 -0.01 0.19 0.38 -0.29 -0.27 0.13 0.17 0.04 -0.09
0.64 -0.01 -0.72 -0.28 0.14 0.57 -0.72 -0.93 0.03 0.19 0.1 0.08
0.08 0.05 -0.14 0.12 0.21 0.49 -0.14 -0.38 0.07 0.01 -0.28 -0.32
0.41 -0.07 -0.4 -0.1 0.09 0.29 -0.53 -0.54 0.2 0.31 0.11 -0.18
0.16 0.0 -0.19 0.05 0.18 0.45 0.03 -0.24 -0.01 -0.03 -0.3 -0.27
0.15 -0.01 -0.26 -0.02 0.1 0.34 -0.02 -0.16 0.11 -0.03 -0.12 -0.17
0.17 0.02 -0.33 0.01 0.11 0.37 -0.03 -0.1 0.17 0.04 -0.24 -0.37
0.14 -0.07 -0.32 0.08 -0.07 0.14 -0.28 -0.17 0.29 0.28 -0.07 -0.11
0.1 -0.16 -0.38 0.01 0.13 0.28 -0.14 -0.16 0.23 0.17 -0.04 -0.19
0.16 -0.17 -0.5 -0.12 0.03 0.34 -0.16 -0.09 0.33 0.27 -0.02 -0.32
0.21 -0.12 -0.15 0.02 0.05 0.28 -0.36 -0.33 0.01 0.07 0.11 0.06
-0.22 -0.49 -1.02 -0.2 0.11 0.59 0.05 -0.15 0.29 0.39 0.12 -0.1
0.54 -0.04 -0.3 -0.13 -0.1 -0.04 -0.4 -0.22 0.14 0.16 0.1 0.05
0.34 0.04 -0.45 -0.18 -0.05 0.26 -0.25 -0.34 0.34 0.19 -0.13 -0.04
0.5 0.13 -0.21 -0.28 0.26 0.76 -0.42 -0.5 -0.23 -0.07 0.04 -0.66
0.02 0.27 -0.45 -0.26 0.53 1.06 -0.29 -1.06 -0.23 0.05 -0.18 -0.68
0.32 -0.25 -0.85 -0.17 0.06 0.68 -0.26 -0.18 0.1 0.19 0.11 -0.3
0.57 0.11 -0.72 -0.4 -0.12 0.48 -0.25 -0.5 0.2 0.33 -0.05 -0.27
0.18 0.03 -0.37 0.06 -0.03 0.29 -0.18 -0.36 0.35 0.24 -0.28 -0.15
0.14 -0.03 -0.3 0.09 -0.07 0.32 -0.15 -0.31 0.24 0.14 -0.16 -0.06
0.27 -0.22 -0.33 0.19 0.23 0.37 -0.19 -0.3 0.03 0.02 -0.15 -0.15
0.35 0.0 -0.51 0.08 0.21 0.51 -0.39 -0.54 0.13 0.11 -0.24 -0.14
0.02 -0.28 -0.61 -0.03 0.09 0.51 -0.26 -0.6 0.21 0.42 0.04 0.02
0.05 -0.17 -0.41 0.26 0.15 0.83 0.29 -0.32 0.11 -0.05 -0.55 -0.99
0.26 0.15 -0.2 0.34 0.28 0.68 0.09 -0.57 -0.12 -0.18 -0.66 -0.82
0.91 0.37 -0.41 -0.3 -0.25 0.41 -0.53 -0.96 -0.11 0.12 0.07 -0.26
-0.06 0.27 -0.07 -0.05 0.61 0.97 -0.24 -0.68 -0.34 -0.33 -0.3 -0.8
-0.11 0.13 -0.23 0.19 0.31 0.67 -0.1 -0.69 0.03 0.09 -0.46 -0.33
0.07 -0.3 -0.64 0.03 -0.04 0.28 -0.42 -0.52 0.38 0.46 0.06 0.15
0.54 -0.07 -0.4 -0.06 -0.06 0.2 -0.25 -0.29 -0.0 0.06 0.02 0.06
0.33 -0.09 -0.29 0.23 0.59 0.91 0.11 -0.61 -0.28 -0.26 -0.75 -1.2
0.42 0.3 -0.27 0.0 0.18 0.74 -0.39 -0.76 -0.02 -0.03 -0.22 -0.73
-0.34 -0.36 -0.85 -0.2 0.2 0.71 -0.02 -0.33 0.3 0.35 -0.01 -0.07
0.32 -0.11 -0.33 0.08 0.1 0.38 -0.31 -0.33 0.11 0.13 -0.08 -0.19
0.2 0.01 -0.17 0.5 0.33 0.62 -0.15 -1.08 -0.4 -0.03 -0.27 -0.32
0.74 0.18 -0.39 -0.19 -0.1 0.3 -0.35 -0.54 -0.06 0.06 0.01 -0.12
0.52 -0.09 -0.27 -0.14 -0.02 0.24 -0.46 -0.27 0.01 0.09 0.24 -0.13
0.25 0.02 -0.32 0.08 0.05 0.29 -0.4 -0.52 0.17 0.26 -0.07 -0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.