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Heatmap: Cluster_56 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.61 0.2 -0.4 -0.18 -0.44 -0.14 -0.42 -0.35 0.13 0.29 0.06 0.2
0.55 0.19 -0.2 -0.09 -0.26 0.04 -0.37 -0.34 0.1 0.16 -0.08 0.03
1.35 0.49 -0.11 0.03 -0.49 -0.17 -0.88 -0.91 -0.3 -0.23 -0.21 -0.16
0.75 0.46 0.04 -0.09 -0.57 -0.24 -1.04 -0.91 -0.07 0.15 0.19 0.3
0.73 0.32 -0.09 0.09 -0.28 0.04 -0.61 -0.53 -0.04 -0.02 -0.04 -0.07
0.89 0.51 -0.03 -0.19 -0.56 -0.29 -0.46 -0.37 0.03 0.1 -0.12 -0.22
0.36 0.28 -0.15 -0.09 -0.31 -0.04 -0.36 -0.3 0.06 0.19 0.03 0.14
0.49 0.18 0.1 -0.07 0.02 -0.12 -0.84 -0.65 -0.02 0.18 0.24 0.01
0.77 0.06 -0.42 -0.2 -0.35 -0.13 -0.48 -0.15 0.21 0.18 0.07 -0.02
0.59 0.2 -0.08 -0.1 -0.11 0.11 -0.36 -0.28 -0.17 -0.13 0.06 -0.0
0.98 0.27 -0.09 -0.24 -0.21 -0.16 -0.46 -0.41 -0.34 -0.21 0.03 0.17
1.21 0.45 -0.5 -0.38 -0.73 -0.44 -0.79 -0.58 0.13 0.09 -0.08 0.2
0.49 0.36 0.0 0.12 -0.09 -0.08 -0.68 -0.56 -0.04 0.08 0.04 -0.04
1.35 0.5 -0.72 -0.58 -0.87 -0.44 -0.54 -0.46 0.02 0.16 -0.15 0.03
0.74 0.3 -0.15 -0.12 -0.1 -0.06 -0.56 -0.39 -0.14 0.04 -0.0 0.01
0.69 0.28 -0.22 -0.23 -0.37 -0.13 -0.57 -0.33 0.03 0.1 0.16 0.13
1.39 0.56 -0.91 -0.77 -0.91 0.21 -0.96 -1.93 -0.31 0.2 0.18 0.3
0.66 0.32 -0.05 0.01 -0.24 -0.03 -0.82 -0.63 0.0 0.18 0.04 0.01
0.88 0.51 -0.42 0.04 -0.46 -0.06 -0.25 -0.56 0.0 -0.04 -0.49 0.09
1.06 0.55 -0.42 -0.37 -0.44 -0.39 -0.38 -0.31 0.04 -0.02 -0.3 0.03
1.07 0.51 -0.1 -0.18 -0.5 -0.25 -0.94 -0.85 -0.11 0.16 -0.03 0.03
0.89 0.38 0.04 -0.11 -0.36 -0.21 -0.79 -0.79 -0.39 -0.18 0.25 0.33
1.02 0.24 -0.52 -0.42 -0.56 -0.4 -0.6 -0.39 0.14 0.19 0.15 0.18
0.83 0.14 -0.37 -0.17 -0.52 -0.48 -0.56 -0.12 0.25 0.21 -0.02 0.16
2.15 0.84 -0.19 -0.65 -1.14 -1.42 -1.84 -2.51 -2.2 -1.14 0.01 0.39
1.16 0.4 -0.74 -0.28 -0.41 0.0 -0.62 -0.79 -0.13 0.02 -0.08 0.23
2.13 0.75 -2.14 -3.06 -4.28 -1.77 -3.02 -3.2 -0.85 0.31 0.73 0.65
1.46 0.62 -0.47 -0.76 -1.3 -1.03 -1.46 -1.38 -0.36 0.17 0.31 0.68
1.2 0.46 -0.61 -0.39 -0.48 0.07 -0.63 -1.02 -0.14 0.17 -0.12 0.07
1.14 0.3 -0.75 -0.61 -0.78 -0.4 -0.63 -0.28 0.31 0.35 -0.04 0.03
0.84 0.47 -0.24 -0.1 -0.52 0.06 -0.51 -0.94 -0.22 0.1 -0.06 0.25
0.69 0.19 -0.14 0.03 -0.16 -0.15 -0.57 -0.97 -0.04 0.15 0.24 0.1
1.74 0.93 -0.59 -1.63 -1.84 -0.44 -1.68 -1.5 -0.18 0.02 0.27 -0.03
2.18 0.82 -1.75 -3.22 -4.4 -2.28 -3.11 -2.75 -0.75 0.23 0.62 0.57
1.24 0.69 -0.13 0.01 -0.26 0.11 -0.72 -1.33 -0.37 -0.28 -0.53 -0.17
1.48 0.2 -0.84 -0.36 -0.51 -0.01 -0.71 -0.6 0.36 0.17 -0.27 -0.92
1.05 0.34 -0.59 -0.45 -0.68 -0.32 -0.68 -0.33 0.21 0.26 -0.04 0.12
0.45 0.07 -0.3 0.09 -0.09 0.03 -0.37 -0.29 -0.04 0.11 0.06 0.09
0.97 0.4 -0.25 -0.21 -0.62 -0.34 -0.92 -0.65 0.01 0.17 0.1 0.28
1.42 0.57 -0.63 -0.77 -1.13 -0.75 -1.33 -1.03 -0.07 0.25 0.15 0.49
1.1 0.48 -0.71 -1.02 -1.12 -0.5 -0.81 -0.55 0.21 0.4 0.19 0.4
0.83 0.21 -0.21 -0.11 -0.41 -0.17 -0.46 -0.39 -0.02 0.02 0.01 0.2
0.86 0.28 -0.4 -0.11 -0.27 -0.05 -0.68 -0.77 0.13 0.26 -0.15 0.12
1.24 0.69 0.05 -0.2 -0.97 -0.9 -1.37 -1.1 -0.53 -0.14 0.13 0.6
0.76 0.33 -0.31 -0.26 -0.65 -0.23 -0.4 -0.52 0.04 0.27 0.05 0.26
1.57 0.62 -0.04 -0.14 -0.74 -0.64 -1.11 -1.0 -0.51 -0.3 -0.24 0.08
0.79 0.27 -0.18 -0.04 -0.32 -0.23 -0.51 -0.35 0.08 0.08 -0.01 -0.08
0.38 0.13 0.01 0.04 -0.07 0.14 -0.34 -0.46 -0.04 0.08 0.04 -0.08
1.53 0.42 -0.84 -0.87 -1.19 -0.67 -0.66 -0.58 0.05 0.22 -0.0 0.12
0.96 0.27 -0.28 -0.17 -0.35 -0.02 -0.6 -0.51 -0.07 0.03 0.03 0.01
0.86 0.32 -0.18 0.06 -0.36 -0.03 -0.5 -0.49 -0.07 -0.03 -0.16 0.0
0.97 0.43 0.16 -0.25 -0.18 -0.26 -0.9 -0.5 -0.36 -0.09 0.19 -0.11
0.96 0.3 -0.32 -0.27 -0.44 -0.35 -0.28 -0.08 0.11 -0.04 -0.29 0.04
1.76 0.57 -0.98 -1.29 -1.09 -0.66 -1.96 -1.77 -0.74 -0.14 0.4 0.8
0.77 0.06 -0.27 0.08 -0.17 -0.17 -0.55 -0.38 0.16 0.07 -0.16 0.1
1.78 0.56 -0.44 -0.41 -0.36 -0.29 -1.59 -2.63 -1.56 -0.87 0.08 0.64
0.87 0.57 0.07 0.02 -0.65 0.0 -0.87 -1.31 -0.38 0.06 -0.02 0.3
0.92 0.18 -0.41 -0.24 -0.46 -0.32 -0.36 -0.01 0.19 0.11 -0.05 -0.16
0.78 0.11 -0.5 -0.43 -0.43 -0.27 -0.23 -0.11 0.28 0.21 0.06 -0.01
1.43 0.46 -0.98 -0.74 -1.2 -0.61 -1.14 -0.78 0.12 0.24 0.2 0.36
1.23 0.55 -0.06 -0.03 -0.71 -0.63 -0.93 -0.8 -0.19 -0.09 -0.25 0.33
0.95 0.05 -0.76 -0.29 -0.47 0.04 -0.24 -0.5 0.05 0.16 0.14 0.1
0.67 0.26 -0.5 -0.17 -0.46 -0.01 -0.17 -0.33 0.15 0.12 -0.09 0.11
0.64 0.23 -0.22 -0.02 -0.34 -0.15 -0.43 -0.33 0.13 0.18 -0.15 0.09
0.93 0.48 0.4 0.09 -0.63 -0.81 -1.81 -1.54 -0.41 0.09 0.35 0.46
1.08 0.71 -0.08 -0.29 -0.3 -0.28 -0.63 -0.54 -0.19 -0.04 -0.29 -0.25
0.84 0.25 -0.33 -0.28 -0.39 -0.1 -0.37 -0.3 0.08 0.09 -0.04 0.05
1.16 0.3 -0.86 -0.3 -0.36 -0.11 -0.92 -1.35 -0.1 0.32 0.12 0.35
0.72 0.41 -0.28 0.07 -0.13 0.07 -0.79 -1.32 0.04 0.29 -0.11 0.03
1.32 0.25 -0.69 -0.23 -0.32 -0.13 -0.91 -1.52 -0.16 0.15 0.11 0.21
0.53 0.18 -0.1 -0.07 -0.24 -0.16 -0.39 -0.02 0.05 0.11 -0.01 -0.09
0.74 0.34 -0.09 -0.05 -0.24 0.21 -0.42 -0.49 -0.16 -0.12 -0.09 -0.08
0.66 0.36 0.03 -0.09 -0.7 -0.56 -0.89 -0.64 -0.13 0.31 0.31 0.38
1.02 0.29 -0.38 -0.31 -0.91 -0.43 -0.65 -0.46 0.24 0.15 0.05 0.28
0.74 0.24 -0.43 -0.06 -0.47 -0.18 -0.16 -0.37 0.04 0.17 -0.2 0.21
2.12 1.15 -0.33 -1.26 -1.85 -1.73 -3.21 -3.45 -1.96 -0.63 0.38 0.31
0.64 0.21 -0.21 0.07 -0.38 -0.12 -0.8 -0.64 0.07 0.17 0.1 0.27
0.82 0.37 -0.08 0.08 -0.19 -0.27 -0.64 -0.5 -0.06 0.06 -0.17 0.0
0.87 0.51 -0.04 -0.07 -0.36 -0.15 -0.8 -0.54 -0.06 -0.04 -0.08 -0.01
1.06 0.44 -0.31 -0.01 -0.48 -0.31 -0.9 -1.13 -0.18 0.07 -0.09 0.46
1.42 0.54 0.09 -0.19 -0.63 -0.76 -1.84 -2.21 -0.85 -0.3 0.57 0.43
1.48 0.51 -0.66 -0.45 -0.7 -0.35 -0.53 -0.52 -0.05 -0.07 -0.42 -0.04
0.76 0.49 -0.15 -0.0 -0.18 -0.07 -0.22 -0.37 -0.08 -0.1 -0.32 -0.21
0.67 0.06 -0.27 -0.01 -0.15 -0.03 -0.43 -0.32 0.04 0.06 -0.03 0.1
0.67 0.24 -0.12 0.03 -0.36 -0.08 -0.53 -0.43 0.09 0.15 -0.09 0.0
1.51 0.45 -0.78 -0.56 -0.58 -0.26 -0.6 -0.46 0.01 -0.01 -0.19 -0.37
0.56 0.17 -0.12 0.05 -0.08 -0.07 -0.31 -0.21 -0.02 -0.03 -0.07 -0.07
0.69 0.38 -0.08 0.07 -0.25 0.17 -0.23 -0.78 -0.19 0.08 -0.13 -0.25
1.1 0.3 -0.38 -0.19 -0.39 -0.24 -0.82 -0.51 0.22 0.2 -0.07 -0.28
0.69 0.32 -0.3 -0.15 -0.42 -0.21 -0.49 -0.25 0.09 0.13 -0.08 0.21
0.72 0.29 0.21 -0.2 -0.08 -0.08 -1.11 -0.58 -0.2 -0.05 0.3 0.01
0.3 0.08 -0.03 -0.09 -0.11 0.12 -0.26 -0.19 0.07 0.12 -0.08 -0.04
1.18 0.52 -0.08 -0.31 0.04 0.33 -0.97 -1.2 -0.57 -0.22 -0.06 -0.3
0.52 0.31 -0.07 0.13 -0.24 -0.14 -0.32 -0.43 0.07 0.08 -0.09 -0.09
1.56 0.43 -0.78 -0.3 -0.75 -0.28 -0.65 -0.91 0.04 0.11 -0.28 -0.35
0.87 0.45 -0.16 -0.05 -0.36 -0.08 -0.53 -0.61 0.03 0.06 -0.29 -0.02
0.88 0.22 -0.29 -0.04 -0.08 0.22 -0.43 -0.29 -0.24 -0.3 -0.13 -0.05
1.14 0.51 0.09 -0.06 -0.44 -0.54 -0.88 -0.8 -0.42 -0.19 0.01 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.