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Heatmap: Cluster_6 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.94 0.94 0.72 0.91 0.82 1.0 0.66 0.53 0.71 0.66 0.56 0.61
1.0 0.89 0.81 0.82 0.65 0.75 0.47 0.5 0.59 0.58 0.62 0.63
0.94 0.99 0.81 0.94 0.87 1.0 0.82 0.81 0.9 0.82 0.57 0.63
1.0 0.92 0.65 0.81 0.65 0.67 0.53 0.47 0.7 0.6 0.44 0.57
0.93 1.0 0.73 0.84 0.65 0.8 0.51 0.44 0.62 0.54 0.39 0.43
0.99 1.0 0.86 0.98 0.85 0.81 0.7 0.72 0.86 0.76 0.5 0.53
1.0 0.99 0.73 0.94 0.74 0.82 0.54 0.35 0.62 0.57 0.38 0.51
0.95 1.0 0.79 0.97 0.81 0.95 0.81 0.81 0.93 0.79 0.54 0.59
1.0 0.71 0.47 0.7 0.69 0.87 0.44 0.24 0.56 0.57 0.48 0.5
1.0 0.98 0.84 0.98 0.87 0.97 0.85 0.82 0.97 0.81 0.58 0.62
0.93 1.0 0.82 0.92 0.87 0.96 0.81 0.79 0.93 0.88 0.66 0.66
1.0 1.0 0.72 0.81 0.72 0.83 0.64 0.55 0.71 0.58 0.41 0.51
1.0 0.94 0.78 0.89 0.81 0.87 0.75 0.69 0.86 0.86 0.73 0.76
0.93 1.0 0.78 0.99 0.82 0.99 0.79 0.65 0.82 0.76 0.51 0.55
0.99 1.0 0.76 0.97 0.79 0.91 0.8 0.77 0.96 0.81 0.53 0.56
0.9 1.0 0.84 1.0 0.84 0.92 0.77 0.83 0.96 0.8 0.58 0.63
0.86 1.0 0.89 0.98 0.87 0.89 0.83 0.71 0.86 0.8 0.64 0.73
0.92 0.9 0.67 0.85 0.86 1.0 0.67 0.5 0.61 0.56 0.41 0.47
0.91 0.94 0.95 1.0 0.88 0.87 0.56 0.5 0.78 0.72 0.6 0.63
0.91 0.98 0.87 0.96 0.81 1.0 0.84 0.83 0.93 0.83 0.68 0.64
0.94 0.97 0.88 0.99 0.92 1.0 0.67 0.6 0.72 0.69 0.66 0.71
1.0 0.82 0.71 0.96 0.77 0.91 0.47 0.43 0.74 0.74 0.67 0.66
1.0 0.93 0.81 0.96 0.78 0.91 0.75 0.7 0.82 0.77 0.55 0.59
0.72 0.93 0.83 1.0 0.83 0.91 0.79 0.72 0.8 0.7 0.53 0.68
0.93 0.93 0.84 1.0 0.82 0.91 0.67 0.51 0.64 0.64 0.51 0.76
1.0 0.91 0.73 0.88 0.86 0.97 0.73 0.62 0.72 0.62 0.49 0.57
0.81 1.0 0.88 0.94 0.89 0.96 0.73 0.71 0.84 0.76 0.65 0.69
1.0 0.91 0.79 0.85 0.8 0.91 0.69 0.64 0.68 0.72 0.63 0.66
0.75 0.92 0.93 1.0 0.86 0.88 0.6 0.58 0.77 0.75 0.6 0.58
0.96 0.74 0.58 0.8 0.77 1.0 0.58 0.39 0.56 0.5 0.34 0.42
1.0 0.82 0.57 0.71 0.78 0.88 0.64 0.59 0.8 0.76 0.58 0.58
0.84 0.98 0.85 1.0 0.76 0.89 0.8 0.8 0.95 0.81 0.62 0.8
0.84 0.98 0.85 1.0 0.77 0.87 0.75 0.71 0.93 0.84 0.59 0.72
1.0 0.95 0.76 0.9 0.79 0.9 0.72 0.66 0.73 0.67 0.47 0.5
1.0 0.95 0.88 0.94 0.86 0.85 0.76 0.72 0.79 0.78 0.72 0.77
1.0 0.84 0.65 0.8 0.75 0.84 0.6 0.57 0.73 0.72 0.61 0.57
0.97 0.96 0.79 0.94 0.86 1.0 0.86 0.81 0.91 0.8 0.62 0.62
0.98 0.96 0.84 0.97 0.94 1.0 0.83 0.68 0.73 0.73 0.59 0.69
0.92 1.0 0.76 0.97 0.87 0.82 0.61 0.46 0.65 0.57 0.36 0.57
0.88 1.0 0.77 0.86 0.79 0.92 0.81 0.79 0.88 0.81 0.64 0.65
0.96 1.0 0.81 0.94 0.84 0.91 0.83 0.81 0.99 0.87 0.62 0.62
1.0 0.84 0.56 0.81 0.72 0.91 0.53 0.43 0.76 0.74 0.53 0.41
1.0 0.79 0.59 0.79 0.76 0.92 0.52 0.38 0.74 0.74 0.59 0.6
0.98 1.0 0.79 0.86 0.86 0.95 0.8 0.72 0.79 0.71 0.65 0.58
0.88 1.0 0.82 0.99 0.75 0.83 0.75 0.61 0.83 0.78 0.54 0.56
0.96 1.0 0.79 0.88 0.81 0.95 0.74 0.61 0.74 0.69 0.51 0.54
0.96 1.0 0.82 0.92 0.76 0.82 0.75 0.74 0.91 0.81 0.54 0.56
0.94 1.0 0.8 0.9 0.76 0.87 0.79 0.76 0.88 0.76 0.56 0.62
1.0 0.96 0.73 0.86 0.76 0.81 0.59 0.58 0.88 0.74 0.53 0.5
1.0 0.9 0.82 0.96 0.78 0.76 0.55 0.5 0.6 0.59 0.42 0.52
1.0 0.89 0.7 0.73 0.63 0.68 0.52 0.39 0.55 0.52 0.36 0.39
1.0 0.86 0.79 0.83 0.75 0.92 0.6 0.6 0.69 0.67 0.56 0.56
0.86 1.0 0.81 0.93 0.82 0.94 0.68 0.51 0.74 0.78 0.54 0.58
0.93 1.0 0.84 0.96 0.79 0.87 0.56 0.49 0.78 0.71 0.5 0.62
1.0 0.77 0.59 0.77 0.75 0.91 0.57 0.48 0.69 0.7 0.55 0.5
0.93 1.0 0.89 0.99 0.89 0.98 0.87 0.8 0.88 0.82 0.68 0.81
0.95 0.96 0.83 1.0 0.79 0.8 0.69 0.65 0.72 0.59 0.44 0.51
0.92 1.0 0.78 0.87 0.8 0.98 0.73 0.63 0.9 0.88 0.66 0.72
1.0 0.89 0.78 0.96 0.83 0.97 0.7 0.65 0.89 0.89 0.72 0.82
0.9 1.0 0.76 0.88 0.81 0.88 0.81 0.67 0.84 0.8 0.54 0.64
1.0 0.89 0.67 0.88 0.72 0.82 0.62 0.42 0.63 0.61 0.44 0.61
0.88 1.0 0.77 0.96 0.81 0.95 0.72 0.59 0.86 0.81 0.61 0.68
0.94 1.0 0.72 0.93 0.67 0.72 0.53 0.48 0.57 0.6 0.34 0.52
1.0 0.98 0.78 0.93 0.74 0.84 0.63 0.58 0.76 0.76 0.57 0.66
0.95 1.0 0.87 0.9 0.88 0.99 0.6 0.55 0.77 0.81 0.6 0.53
0.86 1.0 0.83 0.93 0.83 1.0 0.78 0.55 0.67 0.75 0.6 0.77
1.0 0.95 0.71 0.83 0.71 0.76 0.59 0.51 0.63 0.55 0.37 0.41
0.91 0.94 0.67 0.92 0.82 1.0 0.62 0.48 0.7 0.7 0.44 0.52
1.0 0.88 0.71 0.98 0.88 0.95 0.7 0.6 0.93 0.86 0.67 0.71
0.87 0.89 0.84 1.0 0.85 0.85 0.52 0.45 0.63 0.63 0.49 0.56
1.0 0.93 0.76 0.86 0.71 0.86 0.53 0.51 0.62 0.63 0.67 0.69
0.81 0.98 0.86 1.0 0.87 0.93 0.69 0.68 0.85 0.75 0.51 0.6
0.96 0.96 0.76 0.97 0.91 1.0 0.7 0.67 0.91 0.8 0.54 0.6
1.0 0.86 0.63 0.75 0.72 0.85 0.64 0.54 0.71 0.76 0.58 0.61
0.95 1.0 0.81 0.92 0.7 0.85 0.66 0.52 0.63 0.61 0.43 0.52
0.85 0.84 0.79 1.0 0.75 0.83 0.5 0.38 0.48 0.48 0.28 0.39
1.0 0.79 0.63 0.95 0.89 0.97 0.72 0.54 0.9 0.78 0.52 0.47
1.0 0.84 0.65 0.8 0.64 0.68 0.42 0.31 0.51 0.52 0.35 0.4
1.0 0.73 0.64 0.77 0.6 0.66 0.4 0.36 0.54 0.48 0.36 0.41
0.76 0.97 0.87 0.9 0.89 1.0 0.7 0.59 0.78 0.76 0.54 0.65
1.0 0.92 0.73 0.8 0.67 0.73 0.55 0.53 0.65 0.68 0.55 0.57
0.94 1.0 0.94 0.98 0.82 0.86 0.65 0.62 0.76 0.72 0.57 0.59
0.89 0.97 0.82 1.0 0.8 0.89 0.76 0.75 0.94 0.89 0.58 0.62
0.98 0.95 0.77 1.0 0.77 0.86 0.69 0.6 0.76 0.69 0.59 0.65
1.0 0.76 0.54 0.67 0.69 0.82 0.36 0.24 0.5 0.74 0.61 0.59
0.87 0.99 0.86 1.0 0.87 0.99 0.7 0.63 0.87 0.88 0.57 0.58
0.92 0.99 0.81 0.99 0.9 1.0 0.81 0.75 0.9 0.86 0.57 0.64
0.76 1.0 0.89 0.97 0.83 0.94 0.67 0.58 0.79 0.75 0.56 0.66
1.0 0.92 0.72 0.82 0.75 0.9 0.68 0.54 0.58 0.59 0.52 0.65
1.0 0.87 0.68 0.9 0.76 0.84 0.44 0.35 0.63 0.7 0.58 0.65
0.89 1.0 0.74 0.86 0.69 0.77 0.61 0.48 0.56 0.51 0.3 0.35
1.0 0.9 0.79 0.9 0.73 0.74 0.48 0.36 0.55 0.57 0.47 0.55
1.0 0.79 0.65 0.9 0.84 0.95 0.64 0.53 0.78 0.79 0.63 0.64
1.0 0.86 0.68 0.79 0.8 0.91 0.7 0.63 0.76 0.78 0.66 0.74
1.0 0.87 0.74 0.79 0.66 0.8 0.67 0.65 0.71 0.7 0.56 0.56
0.95 0.95 0.81 1.0 0.85 0.93 0.86 0.79 0.88 0.82 0.63 0.71
1.0 0.92 0.72 0.89 0.76 0.86 0.63 0.54 0.69 0.62 0.45 0.51
0.69 0.93 0.86 1.0 0.86 0.76 0.7 0.67 0.73 0.67 0.47 0.53
0.76 1.0 0.77 0.85 0.75 0.81 0.67 0.54 0.71 0.63 0.46 0.56
1.0 0.94 0.75 0.98 0.78 0.86 0.8 0.74 0.83 0.69 0.41 0.56
0.97 1.0 0.7 0.7 0.64 0.86 0.73 0.47 0.53 0.51 0.35 0.48
0.98 0.99 0.91 1.0 0.89 0.92 0.79 0.71 0.76 0.65 0.52 0.6
1.0 0.89 0.46 0.55 0.56 0.7 0.44 0.35 0.57 0.52 0.37 0.39
0.69 0.93 0.86 1.0 0.76 0.88 0.69 0.68 0.81 0.68 0.47 0.53
0.91 1.0 0.87 0.92 0.82 0.93 0.79 0.76 0.87 0.85 0.73 0.71
1.0 0.98 0.73 0.73 0.72 0.87 0.61 0.59 0.72 0.78 0.62 0.64
1.0 0.85 0.75 0.93 0.76 0.87 0.57 0.44 0.69 0.65 0.53 0.7
0.92 1.0 0.85 0.99 0.9 0.93 0.63 0.5 0.63 0.62 0.51 0.66
1.0 0.98 0.78 0.91 0.79 0.82 0.68 0.57 0.72 0.63 0.46 0.52
0.96 0.95 0.91 1.0 0.85 0.85 0.74 0.69 0.78 0.79 0.62 0.65
1.0 0.67 0.55 0.68 0.71 0.74 0.52 0.54 0.63 0.6 0.48 0.47
1.0 0.83 0.65 0.81 0.58 0.8 0.49 0.48 0.61 0.59 0.45 0.48
0.86 1.0 0.83 0.95 0.79 0.86 0.7 0.55 0.66 0.61 0.42 0.51
0.75 0.92 0.78 1.0 0.79 0.86 0.82 0.77 0.93 0.79 0.55 0.6
0.86 1.0 0.8 0.99 0.73 0.89 0.75 0.68 0.95 0.85 0.54 0.66
0.98 0.99 0.8 1.0 0.83 0.86 0.7 0.75 0.95 0.82 0.58 0.75
0.91 1.0 0.76 0.92 0.73 0.79 0.67 0.56 0.79 0.71 0.5 0.62
0.86 1.0 0.72 0.89 0.66 0.85 0.62 0.64 0.69 0.69 0.5 0.57
1.0 0.91 0.81 0.99 0.83 0.98 0.77 0.75 0.96 0.78 0.62 0.7
0.89 1.0 0.9 1.0 0.77 0.93 0.78 0.77 0.87 0.79 0.56 0.62
1.0 0.94 0.9 0.97 0.78 0.72 0.66 0.6 0.74 0.67 0.53 0.56
0.88 0.87 0.83 1.0 0.93 1.0 0.67 0.56 0.72 0.73 0.57 0.62
0.95 1.0 0.93 1.0 0.83 0.91 0.66 0.64 0.8 0.69 0.61 0.64
1.0 0.92 0.76 0.79 0.74 0.84 0.62 0.56 0.7 0.65 0.5 0.51
1.0 0.98 0.79 0.96 0.82 0.94 0.84 0.79 0.94 0.83 0.67 0.7
0.98 1.0 0.81 0.98 0.73 0.79 0.78 0.65 0.81 0.7 0.49 0.66
1.0 0.91 0.67 0.77 0.67 0.71 0.55 0.53 0.62 0.54 0.41 0.45
0.86 0.91 0.84 1.0 0.9 0.93 0.57 0.48 0.63 0.61 0.44 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)