Heatmap: Cluster_87 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
102471	-0.25	-0.31	-0.01	-0.12	-0.0	0.15	0.32	0.22	0.19	0.02	-0.12	-0.25
103062	-1.14	-1.88	-0.73	-0.02	0.77	0.57	0.78	0.68	-0.03	-0.11	-0.56	-0.77
105942	-0.66	-0.58	-0.26	-0.05	-0.01	0.55	0.44	0.54	0.24	-0.14	-0.19	-0.59
107529	-0.42	-0.52	-0.23	-0.02	0.24	0.43	0.42	0.48	0.13	-0.22	-0.31	-0.53
111843	-0.53	-0.53	0.02	-0.1	-0.01	0.35	0.24	0.35	0.46	-0.11	-0.17	-0.41
113356	-0.51	-0.52	-0.38	-0.07	-0.14	0.51	0.5	0.39	0.21	0.03	-0.1	-0.48
115495	-0.5	-0.43	-0.11	0.04	0.17	0.4	0.39	0.21	0.19	-0.06	-0.16	-0.54
119017	-0.47	-0.48	-0.1	-0.01	0.12	0.43	0.4	0.25	0.19	-0.14	-0.19	-0.39
121195	-0.66	-0.62	-0.17	-0.05	-0.08	0.54	0.31	0.53	0.15	0.06	-0.26	-0.34
126946	-0.5	-0.47	-0.17	-0.05	0.16	0.3	0.28	0.45	0.02	0.06	-0.16	-0.29
127096	-0.36	-0.48	-0.09	-0.06	0.11	0.19	0.28	0.21	0.17	0.06	-0.07	-0.18
127582	-0.54	-0.51	-0.1	-0.06	0.05	0.37	0.32	0.42	0.13	-0.01	-0.06	-0.43
140429	-0.44	-0.4	0.01	-0.07	0.3	0.61	0.4	0.24	-0.02	-0.2	-0.42	-0.56
144921	-0.36	-0.44	-0.2	-0.12	0.08	0.23	0.31	0.31	0.25	0.04	-0.07	-0.29
148446	-0.29	-0.38	-0.1	-0.09	0.07	0.27	0.19	0.24	0.16	0.01	-0.02	-0.22
149266	-0.33	-0.54	-0.03	-0.2	-0.01	0.28	0.07	0.3	0.34	0.07	-0.08	-0.12
150610	-0.07	-0.12	0.02	0.01	0.07	0.19	0.09	0.08	-0.01	-0.01	-0.11	-0.19
153081	-0.61	-0.55	-0.26	-0.05	0.27	0.41	0.39	0.41	0.17	-0.12	-0.17	-0.4
153166	-0.36	-0.49	-0.26	-0.19	0.16	0.19	0.1	0.44	0.28	0.11	-0.09	-0.19
164298	-0.22	-0.42	-0.06	-0.07	-0.02	0.32	0.42	0.29	0.14	-0.11	-0.16	-0.38
165483	-0.12	-0.29	-0.22	-0.07	0.11	0.41	0.31	0.32	0.12	-0.23	-0.23	-0.38
166650	-0.42	-0.41	-0.11	-0.05	0.12	0.34	0.35	0.31	0.15	-0.06	-0.16	-0.38
168159	-0.13	-0.46	-0.04	-0.1	0.32	0.35	0.3	0.31	0.04	-0.2	-0.21	-0.52
168828	-0.28	-0.43	-0.32	-0.2	0.06	0.33	0.13	0.47	0.22	-0.02	-0.04	-0.21
169222	-0.35	-0.81	-0.21	-0.26	0.13	0.29	0.21	0.44	0.22	0.11	-0.03	-0.16
173093	-2.09	-2.39	-1.88	-1.31	-0.04	1.09	1.19	1.13	0.56	-0.15	-0.75	-1.47
176463	-0.22	-0.33	-0.18	-0.02	0.1	0.32	0.18	0.13	0.23	-0.12	-0.03	-0.21
227198	-0.2	-0.45	-0.11	-0.02	0.21	0.39	0.28	0.27	0.13	-0.14	-0.22	-0.44
228163	-0.18	-0.29	-0.11	-0.03	0.0	0.18	0.34	0.23	0.08	-0.01	-0.07	-0.29
234054	-0.29	-0.54	-0.4	-0.3	-0.08	0.38	0.42	0.52	0.3	0.01	-0.25	-0.27
235487	-2.93	-3.51	-2.73	-1.31	-0.35	0.98	1.65	1.13	0.38	-0.06	-0.97	-1.39
236819	-0.59	-0.47	-0.04	-0.0	0.22	0.61	0.51	0.44	0.06	-0.27	-0.77	-0.49
2490	-0.49	-0.69	-0.25	-0.22	0.03	0.42	0.44	0.31	0.53	-0.09	-0.13	-0.5
26102	-0.55	-0.55	-0.31	-0.11	0.07	0.48	0.27	0.21	0.32	0.05	-0.1	-0.18
266974	-0.69	-0.64	-0.25	-0.19	0.02	0.53	0.59	0.28	0.33	0.0	-0.14	-0.57
267638	-0.11	-0.26	-0.05	-0.03	0.09	0.19	0.19	0.23	0.11	-0.14	-0.07	-0.27
267974	-0.2	-0.25	-0.14	-0.01	0.07	0.43	0.31	0.18	0.0	-0.17	-0.15	-0.27
267976	-0.28	-0.36	-0.16	-0.06	0.02	0.33	0.22	0.23	0.13	0.05	-0.07	-0.23
268639	-0.29	-0.52	-0.22	-0.17	0.06	0.27	0.27	0.29	0.26	0.03	-0.02	-0.21
271584	-0.19	-0.36	-0.06	-0.15	-0.03	0.27	0.3	0.3	0.19	-0.03	-0.18	-0.27
271663	-0.17	-0.32	-0.14	-0.11	-0.01	0.3	0.25	0.22	0.18	0.02	-0.1	-0.28
27874	-0.39	-0.6	-0.42	-0.25	0.19	0.45	0.29	0.35	0.09	0.14	-0.0	-0.29
38981	-0.88	-0.6	-0.47	-0.12	0.04	0.6	0.35	0.39	0.31	0.19	-0.09	-0.49
402189	-0.04	-0.27	-0.12	-0.09	0.2	0.29	0.22	0.23	0.04	-0.07	-0.18	-0.37
402664	-0.74	-0.24	-0.18	0.02	0.13	0.55	0.44	0.31	-0.17	0.01	-0.23	-0.41
403602	-0.34	-0.48	-0.19	-0.16	-0.04	0.2	0.4	0.33	0.29	0.06	-0.04	-0.33
405683	-0.33	-0.31	-0.05	0.04	0.03	0.27	0.31	0.15	0.03	0.06	-0.05	-0.33
407841	-0.55	-0.5	-0.1	-0.06	0.08	0.38	0.46	0.3	0.3	-0.07	-0.27	-0.43
410403	-0.84	-0.84	-0.02	-0.34	0.54	0.56	0.66	0.56	0.25	-0.58	-0.67	-0.66
412557	-0.41	-0.99	-0.05	-0.26	0.38	0.6	0.48	0.52	-0.02	-0.02	-0.36	-0.87
413357	-2.95	-2.88	-2.35	-1.47	0.1	0.93	1.4	1.21	0.48	-0.07	-0.79	-1.57
419062	-0.52	-0.94	-0.41	-0.35	0.27	0.53	0.64	0.5	0.46	-0.2	-0.38	-0.72
423082	-0.58	-0.63	-0.19	0.0	0.43	0.58	0.44	0.23	0.36	-0.3	-0.48	-0.65
430194	-3.12	-2.3	-0.48	-0.04	0.23	1.0	0.93	1.28	-0.04	-1.24	-0.7	-1.04
430777	-1.35	-0.78	0.03	-0.38	0.25	0.41	0.53	0.52	0.23	0.27	-0.36	-0.55
432145	-0.9	-0.92	-0.21	-0.09	0.46	0.42	0.51	0.46	0.2	-0.07	-0.41	-0.38
437430	-0.33	-0.51	-0.14	-0.11	0.13	0.37	0.22	0.24	0.22	-0.11	-0.06	-0.18
437511	-0.49	-0.43	-0.12	-0.05	0.22	0.38	0.38	0.39	0.05	-0.15	-0.14	-0.41
437889	-0.84	-0.63	-0.21	-0.02	0.03	0.67	0.56	0.3	0.21	-0.15	-0.09	-0.65
437966	-0.59	-1.17	-0.36	-0.63	-0.56	0.44	0.97	0.49	0.54	0.13	-0.26	-0.56
438336	-0.59	-0.47	-0.15	0.12	0.56	0.33	0.4	0.35	-0.06	-0.31	-0.2	-0.59
439121	-1.55	-1.4	-0.3	-0.17	0.84	0.7	0.85	0.64	0.07	-0.42	-0.69	-1.44
439124	-0.18	-0.53	-0.14	-0.05	-0.01	0.2	0.28	0.33	0.18	0.03	-0.06	-0.27
440805	-0.3	-0.4	-0.14	-0.15	0.1	0.15	0.26	0.29	0.19	0.08	-0.07	-0.21
441577	-1.01	-0.82	-0.68	-0.51	-0.1	0.48	0.98	0.69	0.38	0.02	-0.29	-0.8
441914	-0.35	-0.96	-0.26	-0.18	0.12	0.67	0.55	0.52	0.26	-0.19	-0.46	-0.73
441968	-0.28	-0.34	-0.1	0.01	0.2	0.35	0.1	0.23	0.17	-0.15	-0.11	-0.28
442467	-0.18	-0.11	-0.12	0.05	0.14	0.18	0.22	0.07	-0.0	-0.01	-0.1	-0.21
443468	-0.78	-0.77	-0.32	-0.13	0.25	0.44	0.47	0.51	0.28	-0.02	-0.19	-0.53
444770	-0.47	-0.32	-0.07	-0.07	-0.04	0.2	0.27	0.38	0.07	0.12	-0.07	-0.23
446635	-1.47	-1.54	-0.29	-0.05	0.59	0.81	0.93	0.66	0.03	-0.46	-0.67	-1.36
447288	-0.44	-0.33	0.01	-0.01	0.22	0.3	0.25	0.23	0.12	-0.09	-0.14	-0.36
54589	-0.85	-0.59	-0.43	-0.28	0.46	0.64	0.38	0.51	0.37	-0.05	-0.82	-0.44
61158	-0.23	-0.18	-0.06	-0.01	0.04	0.1	0.14	0.19	0.01	0.08	-0.03	-0.12
61702	-0.59	-0.34	-0.18	0.02	0.05	0.36	0.19	0.27	0.32	0.11	-0.2	-0.36
62730	-0.57	-0.44	-0.18	-0.08	0.22	0.71	0.37	0.38	0.15	-0.16	-0.35	-0.81
71251	-0.2	-0.2	-0.12	-0.03	0.12	0.12	0.2	0.19	0.01	0.01	-0.07	-0.13
74975	-0.14	-0.27	0.08	0.0	0.24	0.18	0.22	0.22	-0.05	-0.16	-0.17	-0.32
75554	-0.47	-0.39	-0.28	-0.17	0.06	0.29	0.36	0.24	0.31	-0.02	0.1	-0.38
75793	-0.62	-0.67	-0.08	-0.08	0.23	0.48	0.55	0.22	0.28	-0.16	-0.22	-0.6
76038	-0.61	-0.66	-0.38	-0.21	0.18	0.3	0.48	0.44	0.18	0.04	-0.02	-0.28
77589	-0.16	-0.29	-0.07	-0.06	0.05	0.33	0.31	0.13	0.15	-0.06	-0.17	-0.32
77904	-0.77	-0.71	-0.5	-0.32	0.05	0.5	0.7	0.52	0.4	-0.15	-0.19	-0.55
77953	-0.5	-0.57	-0.13	-0.01	0.21	0.33	0.44	0.48	0.13	-0.08	-0.4	-0.42
84708	-0.57	-0.4	-0.22	-0.09	0.18	0.34	0.15	0.42	0.35	0.03	-0.2	-0.4
86169	-0.64	-0.43	-0.17	-0.03	0.27	0.16	0.29	0.4	0.29	-0.04	-0.14	-0.37
89021	-0.27	-0.41	-0.16	0.01	0.06	0.37	0.29	0.25	0.1	-0.01	-0.15	-0.32
89766	-0.34	-0.4	-0.18	-0.08	0.34	0.36	0.32	0.25	0.04	0.02	-0.29	-0.36
91546	-2.04	-0.71	-0.43	0.06	0.03	0.7	1.04	0.58	0.43	-0.08	-0.93	-1.48
91586	-0.53	-0.59	-0.4	-0.16	0.09	0.47	0.58	0.44	0.13	-0.03	-0.05	-0.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.