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Heatmap: Cluster_62 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.46 0.23 -0.52 -0.83 0.39 -0.64 -0.85 -1.05 -0.23 -0.49 0.44 -0.14
0.73 -0.24 0.3 -0.23 0.14 -0.16 -0.27 -0.41 -0.01 -0.37 0.29 -0.26
0.34 -0.16 0.28 -0.11 -0.29 0.1 -0.39 -0.36 0.11 0.04 0.19 0.05
2.48 - -0.18 -1.26 0.75 - - -0.77 0.13 - -0.48 0.05
0.96 -0.35 0.13 -0.54 0.2 -0.7 -0.73 -0.54 0.15 -0.35 0.45 0.24
0.99 -0.13 -0.9 -0.15 0.61 -0.52 -0.61 -0.07 -0.72 -0.24 0.04 0.42
0.36 -0.05 0.01 -0.07 -0.05 0.01 -0.17 -0.08 0.0 0.01 -0.06 0.02
0.31 0.12 0.14 -0.11 -0.0 -0.16 -0.15 -0.29 0.12 -0.13 0.11 -0.07
-0.11 -1.0 -0.33 -0.19 0.53 0.04 0.28 0.35 0.15 0.01 -0.11 -0.15
0.89 -0.14 0.24 -0.12 0.41 0.26 -0.7 -0.93 -0.31 -0.47 0.19 -0.3
0.99 -0.67 0.42 -0.6 -0.3 -0.69 -1.1 -0.46 0.48 -0.06 0.3 0.24
0.74 0.08 0.03 -0.17 -0.06 -0.13 -0.3 -0.15 -0.04 -0.08 -0.07 -0.13
0.51 0.3 0.1 -0.1 0.02 -0.35 -0.17 -0.04 0.01 -0.24 -0.15 -0.12
0.85 0.14 -0.1 -0.26 -0.12 0.04 -0.33 -0.25 -0.07 -0.09 -0.06 -0.17
0.46 -0.15 -0.11 -0.25 -0.13 -0.25 -0.17 0.03 -0.06 -0.14 0.41 0.14
0.55 -0.17 -0.28 -0.25 -0.05 -0.25 -0.05 0.07 -0.03 -0.15 0.2 0.19
0.79 0.13 0.13 0.01 0.12 -0.32 -0.46 -0.16 -0.19 -0.21 -0.19 -0.08
0.59 0.18 0.14 -0.02 -0.04 -0.05 -0.12 -0.04 -0.36 -0.13 -0.17 -0.21
0.64 -0.58 -0.05 -0.13 0.05 -0.05 -0.48 0.2 0.09 0.02 0.06 -0.14
0.81 0.09 -0.09 -0.3 0.08 -0.09 -0.51 -0.62 -0.01 0.2 -0.05 -0.05
1.05 -0.32 -0.55 -1.85 1.1 -0.14 -0.12 0.14 -0.02 -0.24 -0.54 -0.8
0.69 0.03 -0.01 -0.15 0.02 -0.33 -0.47 -0.12 0.16 -0.19 0.08 -0.05
0.32 0.09 -0.0 -0.15 -0.02 -0.25 -0.2 -0.01 0.07 -0.09 0.01 0.13
0.44 -0.08 -0.04 -0.15 -0.02 0.01 -0.23 -0.13 0.08 -0.12 0.11 0.02
0.76 -2.03 -0.49 -0.63 1.04 -0.62 -0.05 0.53 0.2 -0.17 -0.49 -0.27
0.55 0.34 0.17 -0.18 -0.0 -0.01 -0.35 -0.21 -0.49 -0.19 0.05 0.01
0.23 0.25 0.13 -0.21 0.02 -0.15 -0.24 -0.05 -0.04 -0.05 -0.05 0.07
0.32 -0.04 0.02 -0.21 0.04 -0.02 -0.3 0.04 -0.02 -0.04 0.04 0.09
0.79 -0.9 -0.79 -0.81 0.74 -0.38 0.35 -0.03 0.56 -0.52 0.05 -0.54
0.85 0.31 0.35 -0.21 -0.32 -0.41 -0.34 -0.47 -0.44 -0.07 0.15 -0.09
0.38 -0.06 -0.17 -0.18 0.28 -0.2 -0.21 -0.08 0.06 -0.09 0.07 0.06
0.99 -0.04 -0.29 -0.63 0.41 -1.48 -0.08 0.12 0.09 -0.36 0.17 -0.18
1.29 -0.14 0.0 0.68 1.41 -2.02 -0.74 -0.82 -1.14 -0.79 -0.65 -1.7
0.88 -0.38 0.07 -0.49 0.08 0.12 -1.19 0.08 -0.23 -0.37 0.48 -0.04
0.75 -0.61 -0.05 -1.01 -0.16 0.6 -0.5 0.16 -0.27 -0.27 0.04 0.36
0.74 -0.03 0.42 -0.73 -0.52 0.36 -0.31 -0.16 0.02 -0.46 -0.52 0.37
0.41 -0.08 0.13 -0.18 0.11 0.02 -0.32 -0.07 -0.05 -0.23 0.0 0.11
0.23 0.16 0.9 -0.29 -0.02 0.17 -0.24 -0.79 0.56 -0.93 -0.17 -0.74
1.82 -1.42 0.73 -1.39 0.6 0.08 -2.64 - 0.13 - -1.47 0.9
2.22 -2.33 - -2.36 1.86 -1.92 1.08 -2.0 - -1.01 -2.24 -
-0.07 -0.04 0.1 -0.54 0.07 0.04 -0.75 0.27 0.34 0.13 0.01 0.1
0.86 0.08 -0.46 -0.75 -0.15 -0.67 -0.71 -0.51 0.18 0.15 0.55 0.33
1.85 -1.81 -1.19 -1.18 1.12 -0.2 -0.61 -1.65 0.3 -2.7 -0.32 0.03
1.22 -1.05 -3.09 -0.67 1.44 -0.68 0.07 -0.11 0.21 -0.95 -1.22 0.03
0.54 -0.6 -0.07 -0.82 0.65 -0.14 0.25 -0.06 0.35 -0.33 -0.01 -0.54
0.82 0.06 0.03 -0.06 -0.01 -0.22 -0.31 0.03 -0.16 -0.16 -0.05 -0.37
0.62 -0.06 -0.06 -0.0 -0.17 0.06 -0.41 -0.26 -0.12 -0.09 0.07 0.16
1.48 -1.13 0.24 -0.49 0.83 -0.53 -0.69 - 0.3 -0.48 -0.07 -0.2
0.4 0.05 0.17 -0.21 -0.06 0.06 -0.37 -0.16 0.01 -0.09 0.03 0.02
0.53 0.14 0.03 -0.08 0.1 -0.34 -0.25 -0.06 -0.4 -0.04 0.1 0.02
0.74 0.12 0.55 -0.18 -0.34 -0.17 -0.22 -0.44 0.03 -0.45 -0.14 -0.04
1.83 - - - 1.84 - - -0.39 -1.64 -0.92 -0.82 1.42
0.48 -0.14 0.28 -0.19 0.19 -0.05 -0.52 -0.07 -0.25 -0.13 -0.1 0.22
1.61 0.38 -0.43 -0.79 1.02 -1.75 -4.1 -1.53 -1.15 -1.24 -0.26 0.91
1.68 -1.47 -0.13 -2.48 0.07 -0.13 -0.25 0.71 -1.09 -1.69 0.2 -0.04
1.02 0.04 0.19 -0.1 -0.24 -0.43 -0.96 -0.46 -0.3 0.13 0.16 0.03
0.68 0.21 0.34 -0.09 0.05 -0.34 -0.49 -0.38 0.04 -0.25 -0.13 -0.08
0.39 -0.1 -0.13 -0.2 0.09 -0.03 -0.03 -0.06 0.02 -0.12 0.0 0.07
0.57 0.23 0.07 -0.09 0.04 -0.22 -0.11 -0.03 -0.02 -0.26 -0.2 -0.21
0.08 0.01 0.16 -0.17 0.05 0.03 -0.23 -0.04 0.06 -0.01 -0.05 0.06
1.79 0.45 0.29 -0.58 0.01 -1.27 -2.22 0.06 -1.92 -0.68 -0.63 0.09
0.54 -1.08 -0.0 -0.99 1.67 - -0.84 -0.01 -0.46 -1.47 0.74 0.12
1.21 0.26 -0.01 -0.1 0.12 -0.67 -0.77 -0.85 -0.72 -0.12 0.03 0.21
0.44 -0.24 0.39 -0.19 0.06 0.0 -0.19 -0.36 0.11 -0.17 0.11 -0.22
0.55 0.09 -0.15 -0.18 0.11 -0.1 -0.29 -0.26 -0.04 -0.1 0.06 0.1
0.75 0.06 0.03 -0.19 -0.09 -0.25 -0.37 -0.06 0.01 0.0 -0.09 -0.12
0.76 0.31 0.05 -0.39 0.11 -0.33 -0.44 -0.65 -0.14 -0.02 0.22 -0.07
1.44 -1.31 0.1 -1.52 -1.0 0.51 0.24 0.52 -3.4 -1.14 -0.03 0.49
0.31 -0.24 -0.25 -0.31 0.18 -0.19 -0.44 0.08 -0.19 0.1 0.38 0.28
0.44 -0.37 -0.34 -0.22 0.27 -0.32 -0.17 0.23 0.21 -0.01 0.04 -0.03
0.74 -0.07 0.06 -0.33 0.02 0.12 -0.28 -0.19 -0.03 -0.17 -0.02 -0.19
0.78 -0.42 0.12 -0.44 0.21 -0.42 -0.33 -0.67 0.18 -0.02 0.24 0.12
1.92 -2.22 0.26 -1.69 0.81 -0.96 -1.71 -0.89 0.12 -1.75 -0.13 0.1
0.41 -0.05 0.19 -0.44 0.2 -1.59 -0.44 0.13 0.11 0.25 -0.03 0.34
0.4 -0.02 -0.04 -0.24 0.06 -0.09 -0.17 -0.09 -0.08 -0.13 0.17 0.11
0.46 -0.14 -0.1 -0.19 0.04 -0.3 -0.19 -0.25 0.13 -0.08 0.3 0.09
0.27 -0.16 0.42 0.07 0.19 -0.04 -0.49 -0.34 0.24 -0.41 0.07 -0.12
1.03 -0.14 -0.15 -0.56 -0.15 -0.18 -0.3 0.02 -0.07 -0.31 -0.03 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.