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Heatmap: Cluster_21 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.12 -0.06 -0.5 -0.31 -0.11 -0.18 -0.31 -0.11 0.27 0.17 0.35 0.37
-0.01 -0.19 -0.33 -0.13 -0.02 -0.1 -0.14 0.03 0.12 0.14 0.27 0.24
0.03 0.08 -0.24 -0.22 -0.36 -0.31 -0.11 0.09 0.03 0.25 0.17 0.39
-0.0 0.07 -0.53 -0.15 -0.23 -0.2 -0.1 0.14 0.02 0.28 0.19 0.31
-0.19 -0.46 -0.3 -0.49 -0.16 -0.3 -0.11 0.27 0.51 0.14 0.3 0.35
0.13 -0.13 0.04 -0.26 -0.08 -0.47 -0.19 0.09 0.13 0.06 0.2 0.32
-0.22 -0.44 -0.51 -0.86 -0.62 -0.33 -0.33 0.55 0.26 -0.04 0.44 0.93
-0.01 -0.05 -0.19 -0.16 -0.12 -0.22 -0.18 -0.03 0.21 0.18 0.23 0.22
-0.13 -0.09 -0.1 -0.02 -0.02 -0.13 -0.24 0.03 -0.05 0.12 0.23 0.3
0.1 -0.07 0.08 -0.68 -0.3 -0.64 -0.52 0.03 0.25 0.18 0.39 0.58
0.1 -0.04 0.02 -0.26 -0.19 -0.12 -0.21 0.02 0.13 0.08 0.14 0.23
-0.05 0.23 -0.2 -0.26 -0.6 -0.47 -0.15 -0.16 0.03 0.37 0.36 0.46
-0.1 -0.17 -0.37 -0.88 -0.6 -0.9 -0.62 0.2 0.65 0.64 0.47 0.44
0.39 -0.0 -0.38 -0.32 -0.43 -0.46 -0.5 -0.16 0.27 0.11 0.54 0.39
0.14 -0.25 -0.25 -1.27 -0.74 -0.87 -0.57 -0.02 0.62 0.51 0.62 0.58
0.32 0.09 -0.47 -0.27 -0.26 -0.27 -0.27 -0.09 0.01 0.14 0.37 0.38
0.05 -0.07 -0.04 -0.18 -0.17 -0.21 -0.04 0.15 0.1 0.05 0.11 0.18
-0.15 -0.24 -0.1 -0.22 -0.13 -0.08 -0.22 0.28 0.2 0.06 0.2 0.24
0.28 -0.28 -0.54 -0.77 -0.65 -0.2 -0.55 -0.35 0.33 0.17 0.85 0.61
-0.03 -0.11 -0.28 -0.11 -0.23 -0.27 -0.3 0.03 0.19 0.3 0.31 0.3
-0.0 -0.12 -0.37 -0.22 -0.48 -0.58 -0.39 -0.09 0.21 0.45 0.53 0.47
0.18 -0.24 -0.17 -0.99 -0.49 -0.36 -0.58 0.06 0.41 0.3 0.47 0.57
0.12 0.07 -0.45 -0.41 -0.16 -0.38 -0.14 -0.05 0.22 0.23 0.28 0.37
0.13 0.03 -0.26 -0.28 -0.34 -0.27 -0.19 0.02 0.11 0.28 0.23 0.32
0.15 -0.15 -0.07 -0.76 -0.23 -0.56 -0.64 0.06 0.32 0.34 0.44 0.44
0.09 -0.1 -0.33 -1.02 -1.26 -1.46 -0.35 0.27 0.45 0.67 0.47 0.69
0.04 0.0 -0.39 -0.3 -0.25 -0.3 -0.2 0.12 0.15 0.29 0.26 0.32
-0.13 -0.18 -0.23 -0.32 -0.62 -0.56 -0.45 0.11 0.43 0.42 0.45 0.44
0.14 -0.16 -0.34 -0.29 -0.09 -0.25 -0.28 0.16 0.17 0.08 0.24 0.39
0.01 -0.11 -0.14 -0.05 -0.06 -0.22 -0.16 -0.03 0.16 0.22 0.21 0.09
0.07 -0.1 -0.12 -0.27 -0.16 -0.14 -0.29 -0.24 0.2 0.15 0.4 0.3
0.09 0.09 -0.63 -0.27 -0.73 -0.81 -0.5 -0.39 0.18 0.43 0.59 0.83
0.06 -0.12 -0.43 -0.32 -0.14 -0.43 -0.46 0.06 0.31 0.11 0.35 0.55
0.28 -0.04 -0.33 -0.32 -0.17 -0.31 -0.45 0.02 0.17 0.12 0.18 0.52
-0.22 -0.29 -0.52 -0.43 -0.78 -0.54 -0.77 -0.25 0.15 0.71 0.75 0.82
0.08 -0.13 -0.3 -0.21 -0.1 -0.11 -0.21 0.1 0.21 0.04 0.18 0.31
0.16 0.12 -0.71 -0.41 -0.15 -0.43 -0.11 0.09 0.15 0.23 0.27 0.38
0.02 -0.08 -1.06 -0.75 -0.78 -0.72 -0.49 -0.17 0.42 0.45 0.77 0.82
0.11 -0.71 -0.0 -0.88 -0.16 -0.75 -0.37 -0.08 0.2 0.23 0.45 0.91
0.05 -0.07 -0.44 -0.17 -0.07 -0.16 -0.24 0.15 0.21 0.02 0.22 0.32
0.24 -0.08 -0.41 -0.35 -0.14 -0.3 -0.49 0.04 0.27 0.01 0.27 0.55
0.16 -0.07 -0.65 -0.32 -0.48 -0.68 -0.29 0.2 0.21 0.44 0.37 0.47
0.17 0.05 -0.02 -0.91 -0.95 -1.63 -0.75 0.09 0.45 0.47 0.55 0.69
0.03 -0.2 0.13 -0.19 -0.14 -0.16 -0.11 0.13 0.1 0.05 0.15 0.13
-0.02 0.04 -0.54 -0.52 -0.75 -1.02 -0.39 0.43 0.31 0.19 0.34 0.82
0.08 -0.06 -0.08 -0.12 -0.19 -0.21 -0.12 0.01 0.18 0.01 0.2 0.2
0.18 -0.02 -0.25 -0.32 -0.19 -0.17 -0.16 0.06 0.13 0.14 0.2 0.25
0.2 0.02 -0.13 -0.59 -0.42 -0.59 -0.3 0.02 0.31 0.34 0.29 0.38
0.02 -0.13 -0.42 -0.29 -0.1 -0.24 -0.15 -0.04 0.24 0.23 0.3 0.34
-0.04 -0.31 -0.34 -0.38 -0.16 -0.09 -0.16 0.11 0.28 0.23 0.27 0.33
-0.06 -0.04 -0.38 -0.18 -0.29 -0.6 -0.18 0.06 0.17 0.27 0.31 0.52
-0.08 -0.06 -0.37 -0.19 -0.13 -0.08 -0.04 0.21 0.03 0.02 0.12 0.42
-0.03 -0.07 -0.26 -0.21 -0.21 -0.19 -0.05 0.13 0.23 -0.08 0.21 0.37
0.26 0.1 -0.32 -0.5 -0.4 -0.32 -0.25 0.06 0.16 0.25 0.19 0.42
-0.23 -0.3 -0.32 -0.26 -0.17 -0.27 0.0 0.3 -0.03 0.29 0.4 0.29
0.04 0.1 -0.37 -0.17 -0.13 -0.25 -0.42 -0.15 0.11 0.25 0.39 0.34
0.6 0.41 -0.53 -1.53 -1.33 -1.86 -1.48 -0.56 0.25 0.09 1.18 0.92
-0.14 -0.09 -0.21 -0.15 -0.12 -0.17 -0.17 0.12 0.07 0.23 0.29 0.2
0.04 0.24 -0.23 -0.23 -0.58 -0.31 -0.15 -0.11 0.13 0.15 0.24 0.48
-0.06 -0.37 -0.65 -0.48 -0.82 -0.55 -0.29 -0.1 0.18 0.61 0.74 0.66
0.11 -0.06 -0.45 -0.22 -0.09 -0.18 -0.24 0.0 0.19 0.13 0.29 0.32
-0.02 -0.15 -0.25 -0.22 -0.17 -0.09 -0.1 0.04 0.07 0.21 0.24 0.31
0.05 0.09 -0.23 -0.15 -0.2 -0.29 -0.11 0.1 0.01 0.18 0.08 0.34
0.06 -0.02 -0.4 -0.37 -0.18 -0.41 -0.38 -0.03 0.38 0.17 0.45 0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.