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Heatmap: Cluster_176 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.93 -0.97 0.15 -0.83 -0.36 0.44 1.0 0.29 -0.31 0.28 0.17 -0.36
-0.27 -0.82 0.65 -0.38 -0.44 -0.55 0.47 0.35 0.5 0.59 -0.66 -0.68
0.09 0.2 -0.69 0.54 -0.44 -0.47 0.84 0.47 -0.51 -0.25 -0.43 -0.31
- -3.0 -0.15 -3.36 -1.11 1.2 1.14 0.91 - 0.49 1.17 -1.4
-0.87 -0.26 0.23 0.12 -0.1 0.24 -0.04 0.06 -0.05 0.03 0.36 -0.07
-0.27 -0.2 0.06 0.13 0.22 0.07 0.14 0.01 0.02 -0.1 -0.0 -0.16
-0.97 -0.35 0.53 0.25 -0.17 -0.46 0.5 0.19 -0.07 0.09 0.06 -0.23
-2.28 -1.42 -0.27 -1.3 -1.86 0.35 0.99 0.22 0.75 0.72 0.21 0.0
-0.79 -0.05 0.38 -0.15 0.13 0.23 0.54 -0.29 -0.12 -0.09 -0.04 -0.18
-0.51 -0.72 0.23 -1.07 0.04 -0.17 0.35 0.65 0.38 0.07 0.06 -0.19
-0.29 -0.28 0.1 -0.15 -0.02 0.23 -0.13 0.23 0.05 -0.01 -0.07 0.23
-0.47 -1.02 0.06 -0.26 -0.24 0.38 0.64 0.34 0.2 0.04 -0.23 -0.15
-0.2 -0.15 0.13 0.24 -0.03 -0.29 0.13 -0.08 0.02 -0.01 -0.02 0.17
-0.21 -0.63 0.09 -0.39 0.14 0.56 0.43 0.08 -0.02 -0.17 -0.13 -0.17
-0.68 -0.04 0.19 -0.09 -0.08 -0.03 0.17 -0.26 0.07 0.28 0.28 -0.07
-1.98 0.03 -1.0 0.68 -0.89 -0.15 1.12 0.89 -0.03 -1.04 0.0 -0.57
0.27 -1.11 -0.12 -2.81 -1.57 0.44 0.45 0.23 0.41 0.22 0.64 -0.02
-0.02 0.03 0.09 0.07 -0.21 -0.14 0.02 -0.1 0.06 0.08 0.1 -0.03
-0.78 -1.51 0.45 -0.78 0.08 0.75 0.8 0.19 0.03 0.04 0.08 -1.39
-0.9 -0.13 -0.21 -0.02 0.22 0.21 0.68 0.16 0.08 0.11 -0.43 -0.35
-0.09 -0.22 -0.03 -0.43 -0.84 0.52 0.85 0.3 0.11 -0.73 -0.26 -0.09
-0.46 -0.2 -0.08 0.14 -0.11 0.03 0.12 -0.21 0.06 0.16 0.41 -0.03
0.81 0.21 -1.55 1.25 -1.09 -0.15 0.71 -0.52 -0.92 -0.63 -0.25 -0.64
-0.95 0.02 0.5 -0.15 0.12 -0.37 -0.05 0.21 0.52 0.53 -0.02 -1.73
-0.38 -0.17 0.01 0.04 -0.12 -0.02 0.05 -0.03 0.25 0.13 0.1 0.05
-0.08 -0.28 -0.14 0.09 -0.54 0.23 -0.05 -0.23 0.07 0.13 -0.07 0.57
-1.06 -1.34 0.25 -1.92 0.11 0.3 0.81 0.62 0.69 -0.1 -0.1 -0.75
-0.25 -0.25 -0.3 -0.08 -0.05 0.16 0.15 -0.31 0.04 0.4 0.29 -0.02
-0.49 - - -0.35 0.47 0.55 - 0.71 0.47 0.62 0.05 1.04
-0.95 -0.25 0.44 0.21 -0.25 0.07 0.34 0.13 0.26 -0.06 -0.04 -0.41
-0.52 -0.19 0.27 -0.28 -0.37 -0.01 0.33 -0.08 -0.01 0.23 0.39 -0.1
0.15 -0.24 0.57 -0.05 -0.23 -0.06 0.21 0.18 -0.07 -0.4 -0.14 -0.21
-0.39 -0.36 0.01 0.17 -0.12 0.08 0.16 0.01 0.13 0.0 0.28 -0.13
0.95 - - - - - 0.05 - 1.49 1.69 0.37 0.77
0.51 -2.95 0.22 -2.52 -0.85 1.05 0.35 -2.62 0.59 -0.09 0.34 0.43
1.08 -2.05 -1.31 0.1 -0.16 -1.96 0.19 -0.52 0.72 0.73 -0.69 0.34
-0.52 -0.16 -0.36 0.1 -0.23 0.7 0.47 -0.32 0.35 0.27 -0.25 -0.8
-0.43 -0.29 0.14 -0.05 0.05 0.21 0.31 0.14 0.06 -0.01 0.04 -0.38
-0.05 -0.54 0.38 -0.18 -0.38 0.34 0.42 -0.02 -0.33 -0.33 0.21 0.07
-0.38 -0.3 -0.16 -0.01 -0.36 0.25 0.13 0.27 0.06 0.37 -0.04 -0.08
0.15 -1.69 0.29 -0.61 -1.22 -1.71 0.48 -0.95 1.04 0.77 0.36 0.01
-2.47 -0.06 -0.74 -0.04 -0.59 0.14 -0.34 -0.58 0.41 0.76 0.35 0.83
-0.22 -0.22 0.02 -0.12 0.02 0.06 0.02 -0.22 0.2 0.17 0.16 0.04
-1.1 -0.95 0.44 -0.28 -0.03 0.11 0.64 0.11 0.31 -0.19 0.24 -0.24
-0.14 -0.49 0.52 -0.56 -1.91 0.1 0.15 -0.29 -0.04 0.24 0.46 0.57
-0.11 -0.42 -0.17 -0.04 -1.15 -0.71 0.83 0.45 0.46 0.11 -0.21 -0.09
-0.61 -0.34 -0.01 0.02 0.25 0.28 0.27 0.04 0.08 -0.01 0.02 -0.24
-0.21 -0.08 0.2 -0.03 -0.08 -0.16 -0.13 -0.12 0.23 0.19 0.12 -0.03
-0.03 0.14 -0.05 -0.11 -0.53 0.05 0.1 -0.47 0.28 0.22 0.2 -0.05
-0.62 -0.36 0.05 -0.02 0.33 0.33 0.55 0.22 0.1 -0.27 -0.33 -0.5
-0.51 -0.31 0.09 0.11 -0.15 0.18 0.13 0.22 0.11 0.21 -0.03 -0.26
-0.38 -0.01 -0.15 -0.13 -0.38 0.23 -0.13 -0.25 0.43 0.41 0.28 -0.24
-0.62 -0.1 0.41 0.26 0.3 0.04 0.19 -0.27 0.59 -0.77 -0.39 -0.31
-0.36 -0.21 0.35 -0.17 0.01 0.36 0.2 0.29 -0.18 -0.01 -0.41 -0.15
-0.23 -0.21 0.04 -0.35 -0.59 -0.08 0.41 0.0 0.08 0.25 0.2 0.19
-0.21 0.32 -0.83 0.63 -1.64 -0.06 0.78 0.33 0.51 -0.12 -0.29 -1.5
-0.07 -0.07 0.05 0.01 0.01 0.01 0.16 0.11 0.04 0.0 -0.17 -0.1
-0.27 0.19 0.13 -0.02 -0.41 0.08 -0.0 -0.17 0.19 0.08 0.19 -0.13
-0.89 -0.1 -0.04 0.17 0.11 0.19 0.16 0.05 0.19 0.23 -0.15 -0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.