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Heatmap: Cluster_175 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.65 -0.05 0.25 0.1 0.0 -0.25 -0.27 -0.55 0.05 -0.1 0.08 -0.29
0.07 -0.2 0.23 0.18 -1.02 -0.23 -0.39 0.1 0.23 0.16 0.38 0.01
0.69 -0.18 -0.19 0.34 0.15 -0.33 -2.47 -0.47 0.6 -0.32 0.26 0.06
0.37 0.25 0.16 0.21 -0.1 -0.58 -0.06 -0.16 -0.32 -0.06 0.16 -0.14
0.4 0.03 -0.0 0.14 -0.02 0.13 -0.13 -0.33 0.03 0.1 -0.09 -0.45
0.81 -0.22 0.38 0.13 0.12 -0.35 -0.82 -0.62 0.3 -0.43 0.1 -0.21
0.42 0.03 0.13 0.11 -0.13 -0.27 -0.3 -0.13 0.28 -0.19 0.04 -0.18
0.65 0.55 -0.48 0.24 -0.23 -0.57 -0.61 -0.56 0.39 -0.34 0.39 -0.34
0.05 -0.11 0.02 0.11 -0.03 -0.19 -0.29 -0.05 0.05 0.14 0.21 0.01
-0.08 -0.08 0.11 0.01 0.01 -0.13 -0.15 -0.14 0.03 0.19 0.13 0.05
1.07 0.33 -1.03 -0.27 0.11 0.14 -0.7 -1.0 0.03 -0.31 0.22 0.04
0.25 -0.03 0.21 0.14 0.04 -0.22 -0.59 -0.37 -0.01 0.13 0.24 -0.01
0.26 -0.12 0.05 -0.05 0.07 0.08 -0.13 -0.1 -0.04 0.03 0.03 -0.14
0.18 -0.05 0.19 -0.03 -0.23 0.0 -0.17 -0.21 0.01 0.08 0.16 -0.02
0.64 0.39 -0.01 0.16 -0.09 0.32 -0.63 -0.8 -0.42 -0.24 0.08 -0.06
0.37 -0.13 -0.13 -0.02 0.14 -0.12 -0.16 -0.07 0.03 0.04 -0.04 0.02
0.35 -0.04 -0.12 0.06 0.24 0.02 -0.25 -0.26 0.04 -0.06 -0.02 -0.08
-0.06 0.45 0.15 -0.41 0.23 -0.1 -0.08 -0.46 -0.15 0.35 -0.1 -0.11
0.37 0.16 -2.36 0.11 -0.97 -0.55 -0.37 -0.32 0.35 0.4 0.64 0.49
0.28 -0.04 0.45 0.05 -0.01 -0.49 -0.53 -0.38 -0.2 0.09 0.17 0.26
-0.3 -0.07 -0.01 0.41 -0.17 -0.24 -0.22 -0.33 0.19 0.28 0.34 -0.15
0.48 0.09 0.13 -0.16 -0.24 0.09 -0.23 -0.49 0.08 -0.09 0.41 -0.39
0.1 -0.0 0.23 -0.14 -0.31 -0.25 -0.09 -0.12 0.09 -0.11 0.32 0.13
0.23 -0.16 0.05 0.07 0.02 -0.17 -0.22 -0.02 0.04 -0.07 0.16 -0.0
0.64 0.34 -0.44 -0.17 0.05 0.12 -0.18 -0.16 -0.18 -0.1 0.05 -0.32
-0.76 0.16 -1.79 0.49 -1.74 1.47 -1.31 -0.58 0.81 0.4 -1.75 0.11
0.27 0.27 -0.1 0.13 -0.01 0.22 -0.49 -0.33 -0.01 0.11 0.02 -0.32
0.01 0.2 0.03 -0.03 -0.09 0.03 -0.08 -0.15 0.18 -0.0 0.03 -0.19
0.5 0.09 0.26 -0.01 0.0 -0.43 -0.09 -0.38 -0.12 0.06 0.06 -0.19
0.92 0.46 -2.13 -0.19 -3.08 0.13 -0.78 -0.45 0.35 -0.11 0.8 0.2
0.36 0.05 0.06 -0.09 0.12 -0.07 -0.41 -0.19 0.01 -0.08 0.06 0.05
0.19 0.01 0.06 -0.04 -0.03 0.01 -0.07 -0.15 0.01 0.05 0.06 -0.13
0.86 -0.23 -1.59 -0.16 -0.67 0.05 0.03 -0.5 0.17 0.14 0.36 0.26
0.34 0.07 0.07 0.1 0.03 -0.2 -0.28 -0.23 -0.12 0.01 0.11 -0.01
0.71 1.21 -0.2 -0.41 - - -0.11 1.06 0.69 - -0.28 -0.01
0.2 0.18 0.62 -0.11 -0.08 -0.15 -0.56 -0.19 -0.27 0.18 -0.13 -0.03
0.44 0.1 -1.42 -0.21 -0.44 0.14 -0.15 -0.57 0.49 0.44 0.32 -0.14
-0.0 -0.09 0.25 0.02 0.09 -0.29 -0.32 -0.27 0.14 0.13 0.21 0.0
- - - 2.64 - - - - - 2.53 - -
0.48 -0.15 0.02 0.05 0.22 -0.33 -0.16 -0.01 0.32 -0.25 0.05 -0.54
0.27 0.1 -0.15 -0.03 -0.06 0.01 -0.14 -0.07 0.06 0.03 0.03 -0.11
0.59 0.1 -0.19 -0.12 -0.04 0.07 0.02 -0.36 -0.23 -0.01 0.08 -0.14
0.05 -0.04 0.06 0.01 0.07 -0.13 -0.25 -0.15 0.04 -0.01 0.19 0.09
0.29 0.04 0.47 -0.43 -0.08 -0.0 -0.14 -0.2 -0.34 -0.09 0.26 -0.04
0.53 -0.16 0.02 -0.09 0.03 0.22 -0.65 -0.58 0.04 -0.2 0.46 -0.09
-0.08 -0.04 0.19 -0.04 -0.13 -0.21 -0.31 -0.02 0.24 0.04 0.25 -0.02
0.11 -0.13 0.17 0.11 0.13 -0.06 -0.29 -0.13 0.07 -0.03 0.07 -0.08
0.24 0.04 -0.03 0.05 0.05 -0.14 -0.26 -0.23 0.16 -0.01 0.16 -0.14
0.61 0.46 -0.47 0.07 -0.25 -0.4 -0.49 -0.42 0.08 -0.03 0.31 -0.03
0.14 0.16 0.07 -0.05 -0.0 0.03 -0.16 -0.27 0.06 0.09 0.02 -0.14
1.09 0.05 -0.68 -0.02 -0.0 0.12 -1.16 -0.9 0.36 -0.05 0.01 -0.18
0.33 0.0 -0.05 -0.04 0.03 0.01 -0.36 -0.09 0.03 0.02 0.08 -0.06
0.89 -0.05 -0.18 -0.15 -0.17 -0.17 -0.9 -1.03 0.34 0.27 0.43 -0.33
0.34 -0.16 0.23 0.02 -0.02 -0.13 -0.19 -0.2 -0.15 0.05 0.14 -0.04
0.33 0.06 -0.02 0.09 -0.19 0.12 -0.21 -0.21 -0.24 0.11 0.16 -0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.