Heatmap: Cluster_179 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.06 -0.14 0.01 -0.15 -0.1 -0.03 -0.05 0.09 0.06 0.05 0.1 0.07
0.57 -0.57 0.05 -0.03 -0.7 -0.07 -0.79 -0.23 0.16 0.05 0.52 0.32
0.01 -0.09 -0.02 -0.15 -0.17 -0.17 -0.25 -0.13 0.21 0.27 0.26 0.11
0.67 -0.1 -0.18 -0.87 -0.93 -1.55 -0.55 0.3 -0.14 0.26 0.75 0.57
0.34 -0.09 -0.12 -0.08 0.14 -0.19 -0.22 0.0 0.03 0.04 -0.03 0.1
-0.19 -0.38 -0.09 -0.11 -0.11 -0.25 -0.36 0.34 0.29 0.2 0.09 0.31
0.05 -0.37 -0.23 -0.39 -0.01 -0.49 -0.31 0.22 0.54 0.17 0.19 0.24
-0.45 -0.43 -0.03 -0.22 -0.05 0.0 0.07 0.3 0.42 0.13 -0.05 0.06
0.44 -0.19 0.19 -0.16 -0.44 -1.0 -0.25 0.15 0.16 0.09 0.23 0.26
0.11 -0.28 0.16 -0.38 -1.48 -0.82 -0.42 0.09 0.4 0.28 0.79 0.29
0.29 -0.02 -0.07 -0.05 -0.04 -0.06 -0.16 0.02 0.02 0.02 0.08 -0.08
0.51 -0.51 -0.52 -0.36 0.12 -0.13 -0.13 0.3 0.26 -0.03 0.19 -0.12
0.34 -0.04 -0.14 -0.14 0.0 -0.08 -0.21 -0.0 0.02 0.1 0.09 -0.03
0.39 -0.08 -0.09 0.02 -0.12 -0.24 -0.25 0.08 -0.04 0.08 0.08 0.06
0.04 -0.26 -0.01 -0.11 -0.0 -0.23 -0.06 0.04 0.21 0.11 0.18 0.0
-0.07 -0.31 0.06 -0.13 -0.02 -0.01 -0.09 0.16 0.19 0.12 0.13 -0.11
0.28 0.09 0.08 -0.11 -0.15 0.0 -0.19 -0.03 0.07 -0.09 0.07 -0.08
0.73 -0.82 -0.01 -0.53 -0.22 -0.89 -0.5 -0.12 0.44 0.32 0.42 0.17
0.26 -0.34 0.01 -0.28 -0.1 -0.34 -0.32 0.07 0.14 0.18 0.27 0.21
0.54 -0.21 -0.31 -0.39 -0.64 -0.42 -0.32 0.03 0.31 0.28 0.39 0.18
0.51 -0.17 -0.09 -0.16 -0.63 -0.14 -0.43 -0.0 0.11 0.34 0.23 0.06
0.24 -0.27 0.11 -0.22 -0.08 -0.12 -0.1 0.06 0.14 0.01 0.21 -0.09
0.27 -0.05 -0.06 -0.18 -0.24 -0.19 -0.25 0.06 -0.01 0.14 0.23 0.15
0.3 -0.26 0.03 -0.16 -0.12 -0.08 -0.12 -0.01 0.12 0.02 0.16 0.03
0.55 0.17 -0.33 -0.27 -0.28 -0.53 -0.23 -0.12 -0.03 0.23 0.19 0.27
0.28 -0.16 -0.03 -0.13 -0.11 -0.15 -0.2 0.14 0.09 0.19 0.09 -0.1
0.09 -0.24 -0.28 -0.56 -0.0 -0.21 -0.18 -0.18 0.17 0.34 0.43 0.29
-0.83 -0.99 0.35 -0.47 0.07 -0.31 -0.66 0.97 -0.29 0.19 -0.29 0.78
0.21 -0.19 0.01 -0.02 -0.13 -0.12 -0.02 -0.01 0.21 0.05 0.03 -0.08
0.02 -0.22 -0.03 -0.09 -0.05 -0.12 -0.06 0.12 0.15 0.13 0.04 0.07
0.16 -0.27 -0.15 -0.19 0.04 -0.03 -0.07 0.22 0.02 -0.04 0.16 0.07
0.74 -0.32 -0.03 -0.37 -0.43 -0.27 -0.3 0.04 -0.02 0.21 0.18 0.12
-0.38 -0.26 0.2 -0.16 -0.0 0.04 0.09 0.1 0.21 0.03 0.06 -0.05
0.83 0.02 -0.25 -0.43 -0.85 -0.63 -0.73 -0.21 0.21 0.28 0.28 0.46
0.11 -0.4 -0.57 -1.16 -0.53 -0.61 -0.41 -0.66 0.46 0.51 0.93 0.69
-0.35 -0.13 0.09 -0.23 -0.32 -0.2 -0.21 -0.08 0.23 0.48 0.22 0.23
0.19 -0.71 0.19 -0.9 -0.54 -0.94 -0.63 -0.16 0.69 0.47 0.58 0.41
0.22 -0.28 -0.09 -0.52 -0.35 -0.58 -0.31 -0.09 0.09 0.57 0.44 0.35
0.23 -0.09 -0.0 -0.1 -0.08 -0.18 -0.23 -0.05 0.02 0.11 0.1 0.19
0.47 -0.15 -0.15 -0.25 -0.25 -0.44 -0.16 -0.08 0.16 0.3 0.19 0.08
0.65 -0.58 -0.25 -0.67 -0.65 -0.61 -0.32 0.16 0.17 0.48 0.39 0.32
0.42 -0.07 -0.04 -0.13 -0.16 -0.09 -0.19 -0.12 -0.11 0.11 0.16 0.1
2.2 -0.0 -2.09 -2.16 -0.78 0.39 -2.87 -2.49 -0.13 0.61 -0.1 -1.41
0.19 -0.21 -0.14 -0.04 0.06 -0.17 -0.32 -0.05 0.11 0.15 0.22 0.1
0.88 -1.95 - -1.78 0.3 -0.8 -0.38 0.16 1.68 0.68 - 0.16
0.19 -0.3 -1.23 -0.17 -0.13 0.06 -0.47 0.46 0.23 0.11 0.29 0.27
0.38 0.13 0.12 -0.14 -0.36 0.0 -0.36 -0.07 0.14 -0.09 0.15 -0.08
0.28 -0.51 -0.32 -0.52 0.12 -0.4 -0.15 0.28 0.59 0.46 -0.26 -0.14
-0.11 -0.38 -0.01 -0.29 0.09 -0.1 -0.45 0.54 0.09 0.14 0.08 0.13
0.09 -0.28 -0.2 -0.19 -0.29 -0.08 0.0 0.02 0.16 0.25 0.2 0.18
0.06 -0.23 -0.03 -0.29 -0.11 -0.13 -0.14 -0.08 0.2 0.3 0.16 0.15
0.32 -0.05 0.02 -0.14 -0.15 -0.18 -0.12 -0.02 -0.03 0.09 0.1 0.09
0.54 -0.32 -0.64 -0.32 -0.16 -0.16 -0.06 -0.35 0.74 0.21 0.11 -0.22
0.58 -0.24 0.03 -0.34 -0.36 -0.12 -0.48 -0.03 0.17 0.19 0.25 -0.01
0.23 -0.23 -0.16 -0.21 -0.16 -0.02 -0.13 0.11 0.19 0.03 0.24 -0.02
0.02 -0.31 -0.06 -0.12 -0.12 0.09 -0.28 0.14 0.32 0.15 0.03 0.02
0.29 -0.2 -0.01 -0.11 -0.04 -0.22 -0.17 0.03 -0.0 0.04 0.13 0.16
0.17 -0.24 0.14 -0.24 -0.03 -0.27 -0.23 -0.12 0.17 0.11 0.19 0.22
0.17 -0.28 -0.14 -0.24 -0.03 -0.28 -0.07 -0.05 0.14 0.27 0.19 0.17
0.04 -0.19 -0.06 -0.05 -0.02 -0.02 -0.03 0.07 0.11 0.09 0.1 -0.06
0.47 -0.39 -0.07 -0.19 -0.35 -0.24 -0.26 -0.12 0.19 0.24 0.21 0.23
0.1 -0.06 -0.16 -0.01 0.03 -0.09 -0.08 0.08 0.11 0.01 0.05 -0.01
0.45 -0.38 0.14 -0.27 -0.49 -0.25 -0.3 -0.05 0.25 0.14 0.23 0.19
0.04 -0.16 -0.07 -0.08 0.1 -0.05 -0.11 0.09 0.24 0.04 -0.02 -0.07
0.35 -0.15 -0.23 -0.3 -0.22 -0.08 -0.27 -0.16 0.16 0.27 0.26 0.15
0.24 0.06 -0.28 -0.13 0.0 -0.26 -0.25 0.11 0.04 0.16 0.08 0.12
0.0 -0.25 -0.12 -0.02 -0.24 -0.23 -0.21 0.03 0.27 0.31 0.09 0.2
0.21 -0.24 -0.18 -0.17 0.0 -0.23 -0.07 0.2 0.1 0.07 0.12 0.09
0.33 -0.04 0.06 -0.16 -0.2 0.04 -0.25 0.05 0.16 0.01 0.0 -0.1
0.5 -0.3 -0.4 -0.76 -1.11 -1.02 0.01 0.44 0.34 0.12 0.59 0.33
0.43 -0.43 -0.51 -0.4 -0.17 -0.22 -0.61 0.33 0.26 0.42 0.19 0.16
0.26 -0.16 -0.09 -0.13 0.0 -0.06 -0.16 0.08 0.19 -0.05 0.11 -0.05
0.07 -0.23 0.03 -0.19 -0.17 -0.31 -0.12 -0.11 0.25 0.26 0.28 0.07
-0.24 -0.4 -0.07 0.02 0.03 0.03 -0.01 0.2 0.18 0.11 0.03 0.02
-0.02 -0.08 -0.11 -0.11 0.03 -0.33 -0.24 -0.31 -0.04 0.24 0.43 0.31
-0.4 -0.37 -0.09 -0.26 -0.15 -0.73 -0.36 -0.45 0.25 0.39 0.74 0.6
0.39 -0.26 -0.14 -0.29 -0.02 0.01 -0.36 -0.06 0.14 -0.05 0.24 0.19
0.51 -0.32 -0.16 -0.24 -0.56 -0.39 -0.31 -0.16 0.33 0.39 0.3 0.12
0.56 -0.05 0.1 -0.19 -0.26 -0.29 -0.29 -0.05 -0.06 -0.11 0.23 0.16
-0.21 -0.26 -0.18 0.04 0.0 0.01 -0.16 0.07 0.28 0.16 0.14 0.01
0.32 -0.03 -0.04 -0.06 -0.05 -0.16 -0.29 -0.05 0.01 0.11 0.07 0.09
0.11 -0.0 -0.06 -0.04 -0.02 -0.18 -0.11 -0.01 0.09 0.06 0.14 -0.0
0.2 -0.53 0.01 -0.13 -0.23 -0.26 -0.7 -0.13 0.29 0.33 0.5 0.16
0.06 -0.13 -0.06 -0.24 -0.27 -0.14 -0.13 -0.03 0.06 0.25 0.25 0.24
-0.87 -0.63 -0.48 -0.61 0.2 0.24 -0.6 0.53 0.79 0.22 0.25 -0.12
0.32 -0.62 -0.02 -0.12 -0.02 -0.77 -0.57 0.02 0.19 0.3 0.53 0.16
0.35 -0.07 -0.31 -0.18 -0.17 -0.18 -0.23 -0.1 0.27 0.22 0.19 0.02
0.22 -0.22 -0.46 -0.22 -0.36 -0.13 -0.09 0.17 0.27 0.28 0.13 0.16
1.41 -0.33 -1.44 -0.17 -0.19 -2.55 -2.08 0.67 -0.38 0.16 0.61 0.0
0.25 -0.29 -0.1 -0.18 0.03 -0.38 -0.31 -0.07 0.13 0.19 0.22 0.31
0.46 -0.28 -0.24 -0.36 -0.19 -0.19 -0.16 0.08 0.12 0.09 0.25 0.19
0.17 -0.13 -0.09 -0.1 -0.07 -0.11 -0.1 0.07 0.1 0.1 0.07 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.