Heatmap: Cluster_32 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
2.36 1.84 1.07 1.77 3.68 2.76 1.69 2.55 3.29 2.57 3.34 2.75
107.3 106.96 127.7 131.72 137.35 142.57 128.46 127.04 126.22 131.46 138.52 145.61
0.25 0.13 0.18 0.28 0.63 0.11 0.3 0.24 0.4 0.19 0.42 0.41
10.76 11.42 10.59 11.84 14.91 9.84 10.2 10.67 9.7 11.5 15.16 13.19
1.29 1.5 1.12 1.36 2.17 2.62 2.07 1.34 1.46 1.79 2.76 2.09
0.14 0.38 0.41 0.36 0.76 0.63 0.55 0.58 0.39 0.71 0.57 0.88
3.55 4.36 4.38 4.75 5.85 4.26 5.49 5.2 4.57 4.03 4.86 5.45
1.01 1.58 1.59 2.19 2.83 2.19 2.68 2.16 2.39 2.33 2.8 1.93
4.51 5.51 6.46 5.79 7.41 6.63 5.39 5.66 6.42 5.31 7.02 6.89
0.0 0.16 0.1 0.21 0.15 0.11 0.29 0.27 0.03 0.19 0.14 0.04
1.04 0.7 0.78 0.7 1.2 0.37 0.49 0.84 0.77 0.67 1.15 0.9
0.18 0.73 0.52 0.4 0.75 0.11 0.34 0.33 0.23 0.21 0.97 0.13
0.04 0.3 0.19 0.19 0.35 0.24 0.16 0.22 0.16 0.41 0.44 0.34
1.0 0.66 0.21 0.4 1.85 1.02 0.33 0.86 0.99 0.51 1.38 0.86
0.0 0.15 0.07 0.0 0.45 0.4 0.31 0.08 0.0 0.08 0.44 0.09
1.82 1.98 0.91 2.77 2.58 1.9 2.34 1.68 1.81 1.37 2.76 2.76
0.79 0.49 0.56 0.54 1.16 0.52 0.53 0.53 0.76 0.52 1.17 0.7
3.69 3.61 3.07 3.82 4.69 2.15 2.71 2.91 3.46 4.24 3.95 3.63
0.04 0.06 0.11 0.04 0.3 0.0 0.02 0.1 0.04 0.0 0.18 0.06
2.28 1.75 1.49 2.01 2.95 2.6 2.47 2.23 2.7 2.23 2.16 2.2
1.57 0.87 1.37 1.13 3.08 1.94 1.1 1.11 1.2 0.78 2.68 1.46
0.07 0.15 0.05 0.12 0.17 0.07 0.14 0.12 0.05 0.14 0.23 0.02
0.4 0.78 0.67 0.73 1.11 0.86 0.96 0.66 0.56 0.7 1.02 0.89
0.04 0.07 0.15 0.12 0.12 0.16 0.15 0.08 0.03 0.04 0.24 0.02
0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.07 0.02
0.85 0.81 0.54 0.75 1.48 0.56 0.47 0.82 0.42 0.75 1.07 1.0
0.53 0.36 0.38 0.54 0.64 0.64 0.6 0.54 0.49 0.4 0.77 0.83
0.11 0.16 0.09 0.1 0.19 0.16 0.13 0.15 0.11 0.13 0.22 0.21
0.5 0.43 0.2 0.58 0.5 0.31 0.46 0.33 0.3 0.35 0.6 0.71
9.8 8.16 7.55 8.45 11.37 9.54 8.96 8.03 9.53 8.66 9.73 8.3
1.19 0.77 0.73 0.26 1.01 0.21 0.17 0.2 0.9 0.65 1.06 0.5
0.79 0.79 0.21 0.89 1.51 0.89 0.92 0.46 0.79 1.29 1.58 1.38
0.8 0.12 0.16 0.72 1.36 0.26 1.07 0.62 0.31 0.2 0.86 0.6
0.14 0.14 0.04 0.18 0.51 0.0 0.02 0.18 0.12 0.31 0.35 0.22
0.0 0.06 0.03 0.03 0.21 0.09 0.04 0.1 0.09 0.19 0.26 0.11
0.21 0.12 0.1 0.08 0.19 0.11 0.11 0.06 0.23 0.12 0.16 0.15
0.07 0.02 0.03 0.09 0.25 0.02 0.02 0.23 0.12 0.13 0.12 0.23
2.38 1.37 0.89 1.35 2.1 3.16 1.01 1.87 1.28 1.79 2.47 3.79
4.0 2.68 2.46 2.53 5.15 1.89 2.48 2.74 1.53 1.85 3.22 2.55
0.68 0.62 0.49 0.76 1.19 0.64 1.13 0.81 0.81 0.87 0.69 0.62
1.56 0.72 1.03 0.79 2.04 1.48 1.03 1.09 1.08 0.8 1.8 1.09
3.95 3.51 2.19 4.0 5.01 3.76 2.58 3.04 2.77 2.78 3.96 4.49
0.83 0.5 0.72 1.08 1.37 1.06 1.09 1.08 0.46 0.7 0.93 1.17
0.04 0.11 0.07 0.12 0.36 0.0 0.17 0.12 0.18 0.32 0.45 0.21
1.12 1.04 0.82 1.33 2.22 1.12 1.38 0.72 1.28 1.27 1.69 1.13
0.0 0.02 0.02 0.03 0.06 0.05 0.08 0.19 0.07 0.04 0.18 0.0
1.71 1.01 1.08 0.61 1.31 0.5 0.62 0.9 1.15 0.67 1.28 1.22
0.32 0.13 0.28 0.04 0.47 0.24 0.21 0.34 0.21 0.12 0.4 0.21
1.37 2.42 2.16 2.55 2.47 1.81 2.6 3.02 2.05 3.86 3.11 3.04
4.32 4.29 5.09 4.49 9.0 3.58 4.43 5.62 4.72 4.3 4.85 4.5
0.86 0.89 0.85 0.89 2.09 1.48 0.65 0.66 0.55 0.69 1.56 1.67
12.47 14.08 14.74 13.92 17.95 16.47 16.58 15.59 13.61 15.26 15.57 15.77
0.0 0.13 0.19 0.03 0.32 0.2 0.14 0.35 0.18 0.12 0.2 0.04
0.18 0.04 0.0 0.06 0.02 0.18 0.04 0.04 0.04 0.02 0.08 0.23
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
3.17 3.48 2.74 4.63 5.56 4.6 5.07 4.73 4.12 3.73 3.75 3.24
3.47 2.07 2.39 1.92 2.94 3.71 2.48 2.71 2.91 2.3 4.19 3.86
2.07 2.58 2.74 2.77 3.91 3.08 3.58 2.8 2.05 2.08 2.67 2.67
1.03 1.2 1.58 1.37 1.89 1.38 1.94 1.46 1.34 2.5 2.11 1.37
0.07 0.1 0.1 0.28 0.68 0.17 0.41 0.26 0.14 0.08 0.24 0.17
2.68 2.34 1.55 2.23 3.04 1.52 2.01 1.92 1.7 1.16 1.89 1.33
6.91 5.79 7.0 6.85 11.68 7.02 5.91 6.71 6.46 11.96 10.86 6.56
22.57 17.19 18.95 17.69 27.17 23.21 24.52 22.03 24.34 17.83 25.07 21.39
64.98 64.85 65.65 68.45 72.12 85.35 70.28 68.2 66.55 70.14 73.77 68.68
24.36 20.26 22.88 17.36 21.76 23.01 20.64 24.93 23.52 25.47 26.99 24.58
11.19 11.59 9.61 13.23 13.03 11.85 12.49 15.87 11.09 13.03 11.76 9.95
51.6 55.45 54.2 58.77 62.46 59.17 57.77 64.32 55.87 54.73 57.45 55.33
0.22 0.16 0.05 0.17 0.24 0.25 0.06 0.06 0.05 0.06 0.2 0.17
1.89 1.64 1.87 1.57 2.42 1.79 1.29 2.04 1.7 1.47 2.1 2.07
0.68 0.36 0.48 0.29 0.87 0.19 0.31 0.36 0.63 0.3 0.71 0.34
28.42 27.55 28.75 29.18 33.18 24.23 27.06 29.31 30.91 30.31 30.45 29.42
1.81 1.32 1.12 1.47 1.44 1.3 1.04 0.63 1.36 1.21 2.02 0.96

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)