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Heatmap: Cluster_74 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.28 -0.19 -0.15 0.12 0.13 0.09 -0.0 -0.04 0.07 -0.0 0.2 -0.01
-0.19 -0.08 -0.07 0.03 0.1 0.02 0.07 -0.01 0.11 0.01 0.1 -0.12
-0.31 -0.28 -0.38 0.03 -0.13 0.2 -0.17 0.03 0.31 0.06 0.32 0.11
- -0.19 - 1.57 0.06 0.13 - - 1.65 1.53 - -
-0.21 -2.4 -2.26 -0.2 0.41 -0.28 -0.17 0.27 -0.82 1.12 0.4 0.64
-0.21 -0.08 -0.33 0.11 0.16 -0.13 -0.02 0.04 0.25 0.18 0.02 -0.11
-0.12 -0.03 -0.16 0.03 0.02 0.09 -0.01 0.05 0.03 0.07 0.05 -0.05
-0.07 -0.05 -0.01 0.06 0.08 -0.02 -0.04 0.05 0.12 0.02 -0.01 -0.15
-0.41 -0.2 -0.05 -0.05 -0.1 0.16 -0.09 0.26 0.3 0.28 0.0 -0.28
-0.28 -0.3 -0.76 -0.14 -0.04 0.27 -0.04 0.06 0.14 0.29 0.35 0.1
-0.2 -0.06 -0.11 0.08 0.19 0.08 -0.1 -0.03 0.14 -0.06 0.11 -0.09
-0.14 -0.02 -0.07 0.03 0.09 0.06 -0.02 -0.02 0.01 0.04 0.08 -0.05
-0.37 0.07 0.06 0.19 0.13 0.01 -0.14 0.09 0.06 -0.01 -0.03 -0.14
-0.34 -0.21 -0.17 0.09 0.04 -0.16 0.0 0.07 0.12 -0.02 0.2 0.26
-0.35 -0.17 -0.2 -0.09 -0.03 0.03 -0.01 0.06 0.26 0.09 0.24 0.06
-0.07 -0.51 -0.54 0.49 -0.98 -0.3 -0.37 0.13 0.73 0.79 -0.27 -0.24
-0.16 -0.61 -0.52 0.02 -0.08 -0.03 -0.0 0.02 0.18 0.4 0.31 0.14
-0.24 -0.1 -0.11 0.02 0.21 0.08 0.01 0.09 0.16 -0.11 0.09 -0.18
-0.14 -0.29 -0.35 0.17 -0.09 0.25 -0.07 0.18 0.21 0.34 -0.16 -0.3
-0.22 0.0 -0.05 0.08 0.09 0.02 -0.1 0.04 0.04 0.04 0.07 -0.04
-0.62 -0.2 -0.5 0.29 -0.27 -0.0 0.12 0.38 0.43 0.41 -0.28 -0.26
-0.8 0.72 0.53 0.12 0.25 0.15 -0.17 -0.38 -0.09 -0.38 0.14 -1.03
-0.65 -0.14 -0.18 -0.32 -0.14 0.68 0.09 -0.26 0.65 0.41 -1.56 0.16
-1.19 0.18 - 1.46 - 0.52 -2.08 0.11 1.08 1.23 -2.23 -1.99
-1.41 -0.05 -1.39 0.51 -0.07 0.0 0.11 -0.14 0.61 0.36 0.06 0.08
-0.41 -0.26 0.0 0.06 -0.19 -0.0 -0.08 -0.05 0.47 0.16 0.06 0.06
-0.31 -1.29 -0.89 0.55 -1.55 0.1 -0.51 -0.41 0.85 0.64 0.37 0.33
-1.37 0.63 - 1.34 - -0.33 - 0.1 1.16 0.78 0.04 -0.54
0.04 -0.02 -0.06 -0.31 -0.74 0.07 -1.18 -0.39 0.85 0.58 -0.34 0.36
-0.17 -0.29 -0.88 0.11 0.03 0.05 0.24 0.2 0.14 0.16 0.17 -0.08
-0.27 -0.14 -0.31 -0.11 -0.29 0.24 0.28 0.28 0.25 0.18 -0.19 -0.15
-0.08 -0.08 -0.08 0.0 0.05 -0.03 0.03 -0.03 0.07 0.09 0.07 -0.02
-0.13 -0.08 -0.56 -0.08 -0.12 -0.14 0.12 0.24 0.32 0.31 -0.12 0.01
0.51 -1.03 -3.74 1.17 -2.28 0.35 -3.26 -0.92 1.14 0.09 -0.16 0.58
-0.26 -0.12 -0.31 0.06 0.15 0.19 0.02 0.12 -0.04 0.14 0.0 -0.05
-0.38 -0.08 -0.08 0.02 0.05 -0.0 0.0 0.03 0.07 0.07 0.12 0.11
-0.46 -0.07 -0.1 -0.13 -0.07 0.09 -0.09 0.16 0.25 0.32 0.03 -0.09
-0.13 0.08 -0.03 0.26 -0.24 0.29 -0.17 -0.36 0.15 0.24 -0.33 0.04
-0.27 0.23 0.07 0.27 0.19 0.07 -0.17 0.11 -0.13 -0.17 0.12 -0.51
-0.65 0.03 -0.04 0.09 -0.33 0.61 0.03 -0.35 0.42 -0.16 0.15 -0.27
-0.38 -0.29 -0.2 0.04 0.13 0.12 -0.04 0.13 0.1 0.2 0.02 0.05
0.04 0.02 -0.14 -0.1 -0.13 0.13 -0.01 -0.05 0.15 0.02 0.1 -0.06
-0.19 -0.15 -0.12 0.05 0.1 -0.01 -0.09 -0.07 0.09 0.12 0.2 0.02
-0.17 -0.02 -0.18 0.11 0.03 0.17 0.0 0.05 0.1 -0.01 0.04 -0.17
-0.07 -0.32 -0.23 -0.14 0.21 -0.0 -0.28 0.35 -0.12 -0.2 0.26 0.32
-0.13 -0.13 -0.46 0.27 -0.18 -0.49 -0.33 -0.07 0.23 0.33 0.22 0.38
-0.91 -0.03 -0.36 0.37 0.02 0.5 0.54 -0.72 0.53 0.17 -0.9 -0.27
-0.3 -0.26 -0.18 -0.12 -0.06 0.03 -0.0 0.06 0.24 0.17 0.21 0.09
0.07 -0.27 -0.13 -0.04 -0.29 0.06 -0.14 -0.04 0.36 0.17 0.06 0.07
-0.27 -0.15 -0.26 0.13 0.16 -0.15 0.04 -0.1 0.1 0.21 0.24 -0.07
-1.94 -0.6 -1.69 -0.89 0.22 0.27 0.36 0.05 0.61 0.85 0.17 0.14
-0.18 -0.02 -0.01 0.09 0.11 0.08 -0.08 -0.03 0.06 0.02 0.01 -0.07
-0.2 -0.08 0.02 0.1 0.13 0.04 -0.15 -0.1 0.09 0.04 0.09 -0.03
-0.95 -0.18 0.53 -0.28 -1.16 0.97 -0.78 -0.3 1.4 -0.87 -0.09 -1.31
-0.49 0.01 -3.82 -0.25 -1.52 0.2 -0.49 -0.02 0.57 1.26 0.05 0.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.