Heatmap: Cluster_188 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.02 0.05 -0.02 0.13 0.05 -0.06 -0.07 -0.09 -0.09 0.08 -0.02 0.01
-0.65 0.17 -0.0 0.64 0.62 0.03 0.08 -0.48 -0.42 -0.99 0.17 -0.03
-0.47 -0.23 -0.18 0.01 0.13 -0.02 0.05 0.44 -0.02 0.24 -0.09 -0.06
-0.26 -0.4 -0.03 -0.1 0.5 -0.31 -0.12 0.0 0.1 0.37 0.17 -0.19
-0.04 0.09 0.03 0.17 0.22 -0.11 -0.11 -0.12 -0.11 -0.01 -0.08 0.03
0.26 -1.97 -0.37 -0.39 1.28 -0.73 0.06 -0.48 -0.03 0.69 -0.08 -0.58
-0.31 -0.15 -0.12 0.06 0.17 -0.01 0.1 0.13 0.0 0.21 -0.02 -0.15
-0.79 -0.24 -1.01 0.57 0.76 -0.02 -0.13 -0.17 0.27 -0.09 0.17 -0.25
-0.4 -0.25 -0.05 -0.01 0.1 -0.04 0.37 0.33 0.05 0.02 -0.01 -0.31
-0.42 -0.14 -0.37 0.07 0.25 0.01 0.23 0.16 0.2 0.06 0.06 -0.32
0.04 -0.0 0.11 -0.02 0.11 -0.05 -0.21 -0.14 0.02 0.08 0.04 -0.02
0.06 0.11 0.0 -0.03 -0.02 -0.07 -0.07 -0.02 -0.08 -0.01 0.09 0.01
0.28 -0.31 -1.19 0.57 0.7 -0.61 -0.2 -0.48 0.46 -0.34 -0.01 0.05
0.09 -0.02 -0.19 -0.01 0.26 -0.05 -0.08 -0.22 0.16 -0.07 0.06 0.0
-0.07 -0.04 -0.05 0.03 0.16 -0.07 0.11 0.1 0.06 -0.01 -0.11 -0.15
-0.93 -0.28 0.22 0.72 0.16 0.0 0.05 -0.34 0.15 0.09 -0.05 -0.4
-0.26 -0.02 0.12 0.14 0.24 0.11 -0.33 -0.06 0.03 0.1 0.06 -0.23
-0.31 -0.49 -0.21 -0.11 0.12 0.0 0.24 -0.07 0.22 0.15 0.15 0.11
-0.12 -0.35 -0.37 -0.75 -0.07 0.24 0.01 0.3 0.15 0.77 -0.36 -0.07
-0.17 -0.05 -0.04 0.03 0.06 0.21 0.04 0.06 0.06 -0.08 -0.01 -0.15
-0.27 0.17 -0.57 0.42 0.26 -0.06 -0.34 -0.18 -0.09 0.26 -0.11 0.19
-0.71 -0.44 -0.47 0.02 0.42 0.17 0.24 0.08 -0.01 0.32 0.14 -0.22
-0.46 -0.17 -2.24 0.63 0.85 0.35 0.35 0.62 -0.62 -0.69 -1.02 -0.05
-0.29 -0.09 0.37 0.03 0.18 -0.58 0.1 -0.12 0.1 0.11 0.34 -0.48
-0.95 0.3 -0.02 0.51 0.36 0.39 0.33 0.1 -0.63 -0.34 -0.25 -0.66
-0.16 0.05 -0.22 0.09 0.44 0.13 0.05 -0.09 0.0 -0.53 0.1 -0.08
-0.36 -0.38 -1.4 1.65 0.62 -1.12 -1.15 -2.75 0.32 0.0 -0.23 0.3
-0.83 -0.09 -0.35 0.51 0.68 0.33 -0.05 -0.66 -0.78 -0.52 0.62 0.03
-0.67 -0.2 0.09 0.39 -0.46 0.1 0.16 -0.49 0.11 0.48 0.12 -0.09
-0.34 -0.24 0.11 0.2 0.07 -0.31 -0.02 -0.07 0.23 -0.01 0.35 -0.17
-0.04 -0.06 -0.24 0.07 0.17 0.13 0.03 -0.13 -0.03 0.09 0.04 -0.06
-0.36 -0.15 -0.04 0.14 0.29 0.09 0.16 0.09 0.13 -0.0 -0.13 -0.38
-0.5 0.34 -1.41 0.11 0.74 0.23 0.19 -0.04 -0.13 0.08 -0.53 -0.07
-0.73 - -2.67 -0.83 1.43 0.33 0.55 1.03 -0.77 -0.47 -1.16 0.56
-0.14 -0.49 -0.09 0.15 0.66 0.22 -0.61 -0.1 -0.12 0.29 0.13 -0.4
0.26 -0.06 -0.09 -0.02 0.1 -0.14 0.12 0.05 0.03 -0.29 0.04 -0.07
-0.02 0.07 0.02 -0.1 0.37 0.31 -0.41 -0.41 0.08 0.08 0.0 -0.22
-0.48 -0.48 0.27 0.11 0.51 0.17 -0.16 -0.14 0.09 0.01 -0.08 -0.13
1.07 0.31 -1.09 -0.71 0.87 -2.03 -0.65 -1.43 0.32 -0.35 -0.05 0.57
0.9 -1.88 - 0.47 0.31 - 0.33 -0.35 0.7 0.16 -2.11 1.15
0.53 -0.07 -1.45 0.14 0.33 -0.33 0.4 -0.61 0.62 0.11 -0.8 -0.15
-0.48 -0.36 -0.09 0.34 0.36 -0.03 -0.16 -0.22 -0.41 -0.04 0.34 0.38
0.11 -0.2 -0.12 0.09 0.23 0.06 0.04 -0.09 0.03 -0.24 0.11 -0.1
0.67 1.03 -2.57 0.22 0.25 -0.35 -0.6 -0.99 -1.21 0.45 -0.07 0.2
-0.02 0.95 -1.21 0.89 0.3 -0.82 0.26 -1.33 -1.56 -0.32 -0.15 0.44
0.02 0.03 -0.15 0.25 0.01 -0.11 -0.11 -0.11 0.08 0.14 -0.19 0.09
-0.62 -0.45 -1.1 0.07 0.69 -0.15 0.3 0.0 0.49 0.16 -0.45 0.13
1.54 -0.54 -1.37 0.57 1.0 - -0.16 -2.77 -0.4 -1.78 0.56 -0.05
0.09 0.03 -0.04 0.03 0.09 0.0 -0.16 -0.0 -0.05 0.04 0.04 -0.07
-0.85 -0.38 0.27 0.01 0.1 -0.11 0.23 -0.22 -0.01 0.17 0.44 -0.06
0.38 -2.06 - 0.83 1.32 -0.23 - -0.31 0.93 -0.81 0.18 -0.12
-0.22 -0.09 -0.11 -0.01 0.13 -0.02 0.05 0.14 0.04 0.07 0.02 -0.04
-0.25 -0.36 -0.32 -0.16 0.01 -0.01 0.24 -0.34 0.3 0.2 0.19 0.26
0.79 -0.39 -0.79 0.38 0.34 -2.77 -0.21 0.3 0.49 -2.48 0.54 0.12
-0.04 -0.09 0.08 -0.01 0.19 0.05 -0.05 -0.18 0.01 -0.0 -0.01 0.03
-0.67 0.03 -0.48 -0.03 0.37 0.25 0.11 0.41 -0.12 -0.15 0.15 -0.26
0.53 -0.04 0.06 -0.29 0.28 -0.24 0.47 -0.64 0.06 -0.13 -0.11 -0.41
-0.28 0.04 -0.4 0.07 0.14 0.05 -0.13 -0.05 0.12 0.02 0.23 0.09
-0.14 0.01 0.11 0.01 0.14 0.09 -0.3 0.05 0.22 0.04 -0.08 -0.27
-0.17 -0.14 -0.19 0.03 0.17 0.02 0.06 -0.01 0.04 0.1 0.05 -0.01
0.2 0.25 - 0.64 0.73 0.37 -1.98 -0.22 0.36 0.12 -0.13 -0.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.