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Heatmap: Cluster_215 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.38 0.25 -0.99 0.09 0.38 0.51 -0.0 -0.82 -1.06 -1.47 -0.53 -0.3
-0.73 -0.72 0.07 0.66 -0.72 1.0 -0.38 -0.37 0.58 -2.62 0.72 -0.51
-0.58 0.57 0.74 0.43 -0.08 0.48 0.01 0.01 -0.01 -1.37 -0.53 -1.31
0.2 0.02 0.14 -0.0 -0.96 0.19 0.08 -0.11 0.05 0.24 -0.03 -0.16
0.44 0.56 0.66 0.09 -0.44 -0.71 0.06 -0.38 -0.94 -0.48 -0.17 0.29
0.18 -0.01 -0.1 0.05 -0.18 0.18 0.04 -0.06 0.17 -0.09 -0.0 -0.25
0.07 -0.08 0.09 -0.03 0.01 0.03 -0.21 -0.13 0.1 0.1 0.06 -0.04
0.23 0.09 0.05 0.0 -0.33 0.15 -0.0 -0.17 0.25 0.08 -0.13 -0.37
-0.03 0.14 0.09 0.14 -0.0 0.6 -0.14 -0.2 0.17 -0.65 0.07 -0.62
-0.06 0.35 -0.41 0.12 0.3 0.38 0.05 -0.59 0.08 -0.15 0.0 -0.45
-0.21 -0.11 -0.14 0.06 0.09 -0.13 0.14 -0.03 0.11 0.09 0.16 -0.11
0.19 -0.05 -0.02 -0.06 0.01 0.2 0.04 -0.09 0.11 -0.06 -0.05 -0.27
-0.09 -0.11 -0.15 0.07 0.03 -0.11 0.08 0.13 0.04 0.08 0.11 -0.12
0.0 0.38 0.28 0.04 -0.41 -0.37 -0.15 -0.29 0.24 -0.13 0.3 -0.18
0.49 0.06 0.27 -0.43 -1.35 -0.11 0.17 -0.06 0.36 0.07 -0.08 -0.11
-0.08 -0.09 0.15 0.1 0.05 0.04 0.07 0.02 -0.02 -0.01 -0.08 -0.18
0.58 0.76 0.4 0.27 -0.45 -0.85 -0.74 -0.91 0.17 -0.11 -0.27 -0.0
0.06 0.26 -0.18 0.04 0.16 0.68 0.04 -0.51 -0.32 -0.41 0.22 -0.55
-0.1 0.21 0.22 0.33 -0.0 0.13 -0.01 0.04 -0.09 -0.48 -0.31 -0.12
0.68 -0.11 -0.77 1.18 -0.92 1.07 -2.2 -0.73 0.73 -1.39 -1.29 -0.49
0.72 0.17 0.72 -0.04 -0.54 -0.2 0.37 -0.7 -0.9 -0.13 -0.77 0.15
-0.3 -0.1 0.01 0.08 0.11 0.01 0.17 -0.01 0.12 -0.12 0.1 -0.13
-0.81 0.69 0.43 1.12 -0.05 1.71 -0.29 -1.02 -2.81 -3.5 -3.34 -1.24
0.53 0.01 -0.01 0.58 -1.06 0.7 -0.96 -0.19 0.09 -0.44 -0.84 0.28
0.13 -0.07 -0.14 0.27 -0.18 -0.14 -0.26 -0.46 0.26 -0.02 0.17 0.22
0.33 0.41 -0.7 -0.32 - - -0.49 - 0.32 0.56 0.59 1.61
0.26 0.07 0.47 -0.21 0.12 -0.24 -0.13 -0.42 0.32 -0.17 -0.07 -0.3
2.25 - - - 0.66 1.55 0.41 0.48 - - - -
-1.64 -0.36 0.29 0.18 0.41 0.31 0.78 -0.06 -0.46 -0.05 -0.4 -0.24
0.37 -0.14 0.11 0.01 -0.22 -0.1 -0.52 -0.07 0.16 0.08 0.16 -0.03
0.92 0.94 1.2 0.09 - -0.38 0.33 -0.52 -1.72 0.84 - -
-0.01 -0.24 0.39 0.02 -0.69 0.08 0.35 -0.73 1.2 -0.61 -0.62 -0.57
0.08 0.41 0.13 0.38 -0.08 -0.31 -0.27 -0.74 0.06 -0.68 0.33 0.16
0.11 0.21 0.18 0.38 -0.45 0.24 -0.04 0.19 -0.06 -0.4 -0.39 -0.27
0.16 -0.48 0.05 0.34 -0.33 0.37 0.13 0.32 0.18 -0.17 -0.4 -0.62
0.34 0.21 0.02 0.11 -0.11 0.21 -0.12 -0.3 -0.01 -0.26 0.09 -0.36
-1.46 0.44 0.6 0.58 0.13 0.35 0.11 0.05 -0.76 -0.53 -0.88 -0.05
-0.28 -0.12 0.19 0.14 -0.19 0.39 -0.25 0.06 0.32 -0.03 -0.27 -0.17
- 1.19 - 0.64 0.31 0.72 0.39 -0.12 - 0.43 -0.36 -0.13
-0.13 0.28 -0.38 -0.38 -0.41 -0.03 -0.71 -0.04 0.53 -0.9 0.52 0.69
0.24 -0.04 -0.28 0.11 0.01 0.37 0.2 0.01 0.06 -0.1 -0.77 -0.11
-0.14 0.05 -0.24 0.36 0.16 0.19 0.06 -0.24 0.1 -0.05 -0.4 -0.01
0.23 -0.03 0.28 -0.07 -0.23 0.14 -0.12 0.08 -0.02 -0.24 -0.1 -0.03
1.35 -1.37 1.22 1.22 - - 0.75 - - -0.97 0.31 -0.04
-1.54 -1.34 0.35 0.62 0.87 1.12 0.65 0.49 - -1.23 -1.29 -0.68
-0.06 -0.22 0.45 0.05 -0.36 0.12 -0.34 -0.11 0.13 0.11 0.1 -0.09
0.06 -0.02 1.36 -0.38 0.66 0.02 -0.44 0.16 -0.94 0.08 -2.93 -1.04
-0.1 -0.03 -0.18 0.04 -0.25 0.59 0.13 -0.16 -0.01 -0.34 0.29 -0.27
1.27 0.74 0.34 -0.03 -0.19 0.34 -1.56 0.18 - -1.59 -1.74 0.52
- -0.2 1.56 0.57 - 1.53 - -0.19 1.55 - - -
0.17 -0.08 -0.22 0.23 -0.59 0.25 -0.27 -0.27 0.31 0.12 0.11 -0.03
0.25 0.06 0.12 0.11 -0.32 0.19 -0.14 -0.04 -0.04 -0.19 -0.02 -0.09
0.25 0.1 0.21 -0.03 -0.24 0.16 -0.34 0.05 -0.09 0.0 -0.16 -0.04
0.17 -0.34 0.01 0.01 -1.06 0.78 0.11 -1.8 0.94 -2.51 0.84 -0.68
0.03 -0.13 0.17 0.36 -0.44 0.48 0.24 -0.12 0.33 -0.09 -0.76 -0.68
0.73 -0.84 -1.06 0.13 -0.34 -0.24 -0.13 -0.01 0.09 0.69 -0.34 0.27
0.06 -0.08 0.05 0.03 -0.1 -0.05 -0.1 0.07 0.17 -0.01 -0.12 0.05
0.14 0.09 -0.08 0.13 -0.29 0.34 -0.33 -0.18 0.15 -0.01 0.02 -0.13
0.17 -0.02 0.16 -0.08 0.03 -0.01 0.12 -0.21 0.22 -0.18 -0.05 -0.22
0.09 -0.05 -0.03 0.01 0.02 -0.06 -0.15 -0.05 0.03 0.16 0.06 -0.05
0.17 -0.0 0.1 0.05 0.18 -0.02 -0.53 -0.32 -0.02 0.16 0.17 -0.09
0.21 0.24 0.06 -0.02 -0.41 0.24 -0.29 -0.22 0.18 -0.2 0.16 -0.17
0.03 -0.1 0.12 0.04 0.08 -0.04 -0.14 0.11 0.06 -0.08 -0.06 -0.04
0.09 0.03 0.15 -0.16 -0.18 0.03 -0.05 -0.22 0.26 -0.04 0.09 -0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.