Heatmap: Cluster_122 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.34 -0.47 -0.4 -0.5 -0.29 0.49 0.72 0.34 0.13 0.2 -0.13 -0.46
-0.31 -0.51 -0.1 -0.33 0.12 -0.07 0.29 0.26 0.26 0.03 0.28 -0.19
-0.26 -0.51 -0.37 -0.29 -0.09 0.5 0.36 0.21 0.13 0.26 0.02 -0.37
-0.16 -0.56 0.06 -0.12 0.22 0.0 -0.03 0.26 0.13 0.05 -0.02 0.01
-0.68 -0.57 -0.0 -0.0 0.49 0.1 0.05 0.23 -0.02 0.29 -0.12 -0.15
-0.2 -0.13 0.04 0.06 0.12 0.09 0.12 0.18 -0.06 -0.03 -0.05 -0.2
-0.98 -1.43 -2.09 -1.33 0.99 -0.16 0.85 0.82 0.56 0.16 -0.53 -0.4
-0.19 -0.11 -0.2 0.07 -0.03 0.27 0.05 0.21 0.22 -0.1 0.01 -0.32
-0.53 -0.44 -0.14 -0.12 -0.05 0.35 0.21 0.28 0.15 0.23 -0.08 -0.14
-0.46 -0.27 -0.06 -0.02 0.05 0.3 0.09 0.16 0.1 0.16 0.01 -0.21
-0.3 -0.36 -0.08 -0.09 0.23 0.06 0.17 0.26 0.1 0.2 -0.11 -0.24
-0.21 -0.63 -0.4 -0.95 0.09 0.0 0.16 0.58 0.44 0.26 0.11 -0.15
-0.88 -1.16 -0.8 -1.27 0.6 -0.04 0.61 0.6 0.73 0.33 -0.43 -0.23
-0.39 -0.27 -0.03 -0.11 0.17 0.06 0.18 0.18 0.11 0.05 0.04 -0.1
-0.33 -0.4 -0.14 -0.16 0.01 0.04 0.15 0.23 0.16 0.14 0.13 0.01
-0.43 -0.63 -0.27 -0.19 0.21 0.33 0.45 0.18 0.34 -0.08 -0.07 -0.29
-0.36 -0.42 -0.08 -0.23 0.28 0.51 0.34 0.15 0.11 -0.2 -0.06 -0.42
-0.65 -0.7 -0.15 -0.0 0.33 0.44 0.29 0.08 0.19 0.06 -0.04 -0.33
-0.12 -0.29 -0.11 0.02 0.15 0.28 0.11 0.11 0.01 -0.05 -0.06 -0.14
-0.26 -0.24 -0.22 -0.22 0.15 -0.13 0.09 0.22 0.19 0.14 0.04 0.1
-0.35 -0.7 -0.21 -0.3 0.22 0.25 0.01 0.33 0.25 -0.05 0.17 0.03
-0.08 -0.39 -0.06 -0.0 0.19 0.15 0.06 0.14 0.17 0.02 -0.14 -0.16
-0.15 -0.15 -0.07 0.05 0.14 0.01 0.08 0.14 -0.06 0.07 0.04 -0.15
-0.35 -0.46 -0.11 -0.01 0.31 0.21 0.2 0.18 0.13 0.01 -0.14 -0.16
-0.3 -0.46 -0.14 -0.23 0.24 0.1 -0.02 0.15 0.17 0.26 0.08 -0.03
-0.2 -0.33 -0.19 -0.15 0.12 0.0 0.06 0.37 0.11 0.15 -0.02 -0.07
-0.15 -0.32 -0.16 -0.14 0.09 0.05 -0.03 0.2 0.16 0.15 0.04 0.03
-0.34 -0.17 -0.06 0.02 0.18 0.03 0.05 0.14 0.12 0.07 -0.03 -0.08
-0.93 -1.43 -0.02 -1.42 0.24 0.09 0.29 0.71 0.71 0.31 0.02 -0.41
-0.16 -0.55 -0.27 -0.17 0.3 0.06 0.16 0.25 0.19 0.05 -0.14 0.05
-0.45 -0.37 0.26 0.06 0.34 0.19 0.27 0.24 -0.09 -0.07 -0.14 -0.61
-0.59 -0.63 -0.24 -0.07 0.24 0.1 0.03 0.22 0.23 0.21 0.2 -0.04
-0.27 -0.19 -0.2 -0.04 0.1 0.17 0.11 0.05 0.2 -0.03 0.15 -0.14
-0.34 -0.62 -0.37 -0.31 0.24 -0.17 0.3 0.25 0.18 0.33 -0.01 0.14
-0.2 -0.53 -0.05 -0.27 0.19 0.3 0.24 0.12 0.12 0.03 0.08 -0.26
-0.53 -0.47 -0.17 -0.06 -0.1 0.04 0.15 0.43 0.28 0.02 0.16 -0.03
-1.55 -1.42 -1.1 -0.89 0.59 -0.52 0.06 0.51 0.7 0.61 0.22 0.37
-0.27 -0.4 -0.02 -0.15 0.15 0.02 0.37 0.11 0.28 0.05 -0.07 -0.28
-0.36 -0.23 0.01 0.07 0.31 0.1 0.14 0.1 0.0 0.0 -0.0 -0.28
-0.82 -0.7 0.03 0.08 0.09 0.43 0.6 0.19 0.26 0.06 -0.25 -0.74
-0.42 -0.32 -0.32 -0.08 0.26 0.02 0.04 0.26 0.36 0.1 0.0 -0.12
-0.4 -0.49 0.16 -0.08 0.31 0.18 0.31 0.2 0.12 -0.07 -0.21 -0.33
-0.75 -0.47 -0.14 -0.03 0.4 0.08 0.27 0.37 0.16 0.03 -0.11 -0.23
-0.59 -0.53 -0.03 0.04 0.2 0.08 0.26 0.25 0.23 -0.0 -0.03 -0.18
-0.42 -0.5 -0.04 -0.29 -0.08 0.21 0.13 0.12 0.3 0.21 0.04 0.08
-0.63 -0.7 0.05 -0.03 0.14 0.41 0.44 0.21 0.16 0.13 -0.28 -0.43
-0.26 -0.73 -0.41 -0.1 0.22 0.27 0.16 0.24 0.22 0.08 0.1 -0.12
-0.5 -0.59 -0.16 -0.13 0.46 0.18 0.34 0.27 0.31 -0.02 -0.21 -0.42
-0.26 -0.7 -0.46 -0.19 0.26 -0.05 0.14 0.28 0.38 0.21 0.12 -0.11
-0.87 -1.5 0.12 -1.39 0.27 0.74 0.11 0.68 0.55 0.03 -0.2 -0.5
-1.5 -2.48 -0.23 -2.35 -0.03 0.81 0.34 0.72 0.78 0.52 -0.19 -0.41
-2.13 -1.02 -1.8 -0.52 0.67 0.29 0.89 0.71 0.41 -0.47 0.1 -0.18
-0.37 -0.4 -0.34 -0.33 0.25 -0.05 0.32 0.28 0.47 0.11 -0.07 -0.24
-0.58 -0.59 -0.68 -0.74 0.34 -0.23 0.5 0.58 0.42 0.59 -0.32 -0.38
-0.22 -0.22 0.04 -0.08 0.13 -0.07 -0.03 0.28 0.17 -0.04 0.03 -0.07
-0.27 -0.17 -0.08 0.06 0.3 0.11 0.02 0.04 0.08 0.03 -0.01 -0.19
-0.4 -0.49 -0.25 -0.0 0.28 0.11 0.02 0.28 0.07 0.17 0.0 -0.01
-0.54 -0.41 -0.45 -0.56 0.13 0.11 0.01 0.35 0.56 0.04 0.3 -0.07
-1.02 -2.43 -1.91 -1.2 0.94 -0.0 1.28 0.38 1.11 -0.38 -1.04 -0.84
-0.25 -0.18 -0.14 -0.06 0.11 0.09 0.01 0.15 0.09 0.13 0.07 -0.08
-0.44 -0.46 0.08 0.2 0.28 0.16 0.21 0.24 -0.06 -0.1 -0.1 -0.27
-0.25 -0.39 -0.41 -0.18 0.33 -0.08 0.2 0.1 0.28 0.05 0.18 -0.06
-0.54 -0.53 0.17 -0.09 -0.12 0.11 0.34 0.33 0.32 -0.03 -0.09 -0.22
-0.6 -0.83 -0.54 -0.44 -0.07 -0.18 0.08 0.39 0.39 0.32 0.49 0.24
-0.25 -0.65 -0.32 -0.37 0.19 -0.04 0.1 0.4 0.48 0.0 0.19 -0.13
-0.81 -0.43 -0.14 0.03 0.39 0.19 0.15 0.17 0.22 0.14 0.01 -0.31
-0.26 -0.41 -0.1 -0.0 0.14 0.26 0.06 0.11 0.19 0.08 -0.05 -0.18
-0.65 -0.56 -0.15 -0.03 0.18 0.31 0.12 0.35 0.27 0.3 -0.1 -0.52
-0.32 -0.19 -0.08 0.07 0.17 0.11 0.22 0.05 0.05 0.07 -0.09 -0.14
-0.47 -0.7 -0.0 0.07 0.41 0.18 0.06 0.16 0.12 0.03 0.02 -0.18
-1.12 -1.51 -2.13 -2.36 1.01 -0.03 0.94 0.47 0.52 0.25 0.01 -0.24
-0.52 -0.78 -0.17 -0.37 0.47 0.31 0.15 0.35 0.08 -0.06 0.07 -0.03
-0.38 -0.26 -0.15 -0.01 0.32 0.13 0.07 0.16 0.16 0.14 -0.17 -0.18
-0.21 -0.31 -0.09 -0.02 0.19 0.46 0.26 0.02 0.17 -0.0 -0.28 -0.45
-0.32 -0.38 -0.16 -0.2 0.14 0.31 0.28 0.08 0.11 0.15 -0.19 -0.02
-0.22 -0.22 0.07 0.07 0.25 0.02 0.04 0.09 0.01 -0.01 -0.01 -0.16
-0.24 -0.31 0.05 -0.03 0.2 0.07 0.09 0.11 0.04 0.05 0.05 -0.17
-0.3 -0.48 -0.04 -0.19 0.15 0.22 0.28 0.16 0.2 -0.08 -0.06 -0.07
-0.97 -1.25 -0.51 -1.76 0.62 -0.08 0.68 0.47 0.65 0.53 -0.13 -0.57
-0.3 -0.38 -0.08 -0.14 0.12 0.15 0.13 0.16 0.13 0.13 0.02 -0.06
-0.34 -0.46 -0.32 0.0 0.29 0.19 0.16 0.38 0.14 -0.23 0.08 -0.19
-0.34 -0.44 -0.02 -0.02 0.19 0.28 0.07 0.04 0.17 -0.03 -0.0 -0.05
-0.27 -0.29 -0.2 -0.18 0.35 -0.09 0.05 0.33 0.21 -0.07 0.0 -0.02
-0.23 -0.19 -0.07 -0.01 0.0 0.16 0.06 0.13 0.12 0.04 -0.02 -0.04
-1.96 -1.65 -0.25 -0.42 0.66 0.23 0.16 0.8 0.03 0.43 0.12 -0.39
-0.67 -0.7 0.09 -0.36 0.33 0.24 0.33 0.18 0.34 0.12 -0.11 -0.29
-0.81 -0.66 -0.53 -0.2 0.42 0.35 0.34 0.39 0.18 0.18 -0.3 -0.06
-1.16 -0.79 -0.31 -0.25 0.35 0.27 -0.03 0.45 0.39 0.24 0.17 -0.17
-0.21 -0.3 -0.03 0.01 0.24 0.1 0.0 0.05 0.12 -0.02 0.08 -0.13
-0.34 -0.41 -0.19 -0.15 0.1 0.04 0.06 0.28 0.17 0.14 0.06 0.06
-0.39 -0.75 -0.0 -1.31 0.18 -0.04 0.3 0.81 0.46 0.02 -0.04 -0.36
-0.78 -2.43 -0.26 -1.81 0.97 0.19 -0.12 0.77 0.92 -0.09 -0.31 -0.42
-0.78 -2.02 -0.98 -0.88 0.22 -0.05 0.31 0.79 0.58 0.82 -0.44 0.01
-0.88 -0.69 -0.42 0.07 0.01 0.76 0.47 0.43 0.13 -0.04 -0.16 -0.62
-0.2 -0.33 -0.2 -0.06 0.11 0.14 0.09 0.17 0.28 0.01 -0.0 -0.14
-0.42 -0.25 -0.22 0.03 0.38 0.12 0.28 0.07 0.04 -0.08 -0.05 -0.09
-0.31 -0.65 -0.07 -0.18 -0.07 0.16 -0.15 0.43 0.25 0.39 -0.03 -0.11
-0.36 -0.2 -0.09 0.05 0.35 0.14 0.08 0.1 0.04 -0.03 -0.09 -0.11
-0.15 -0.51 -0.28 -0.2 0.24 0.29 0.01 0.34 0.2 0.02 -0.15 -0.06
-0.31 -0.45 -0.29 0.04 0.15 0.14 0.16 0.23 0.27 -0.16 0.13 -0.11
-0.83 -0.48 0.05 0.06 0.35 0.25 0.25 0.08 0.27 0.02 -0.09 -0.36
-0.47 -0.6 -0.2 0.15 0.35 0.28 0.25 0.27 0.19 -0.12 -0.1 -0.39
-1.0 -0.61 -0.04 -0.05 0.28 0.13 0.42 0.43 0.26 0.1 -0.09 -0.52
-1.36 -0.56 0.18 -0.32 0.05 0.34 0.16 0.78 0.36 0.2 -0.43 -0.52
-0.17 -0.18 -0.14 -0.0 0.12 0.11 0.07 0.24 0.18 -0.12 -0.01 -0.18
-0.65 -0.68 -0.03 0.14 0.24 0.2 0.05 0.35 0.08 -0.0 0.01 -0.07
-0.56 -0.64 -0.27 -0.1 0.24 0.15 0.11 0.4 0.19 0.34 -0.08 -0.2
-0.53 -1.62 -0.09 -0.9 -0.42 0.35 0.44 0.67 0.04 0.47 0.23 -0.07
-0.35 -0.25 -0.07 -0.07 0.07 0.28 0.07 0.1 0.08 0.13 -0.04 -0.05
-0.27 -0.52 -0.1 -0.16 0.17 0.14 0.12 0.29 0.19 0.1 0.02 -0.18
-0.38 -0.44 -0.16 -0.33 0.17 -0.0 -0.1 0.43 0.17 0.12 0.15 0.11
-0.27 -0.35 -0.11 -0.14 0.2 0.25 0.07 0.18 0.2 -0.08 -0.12 0.02
-0.49 -0.28 -0.47 -0.11 0.01 0.29 0.21 0.35 0.21 0.12 0.01 -0.15
-0.23 -0.04 0.01 -0.06 0.21 -0.01 -0.03 0.18 0.16 0.0 -0.06 -0.2
-0.53 -0.82 -0.07 -0.13 0.27 0.15 0.1 0.39 0.09 0.19 -0.07 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.