Heatmap: Cluster_184 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.18 0.2 0.07 -0.34 -0.01 0.19 0.15 -0.84 0.03 0.07 0.32 0.01
-0.01 -0.38 0.14 -0.13 0.14 0.1 -0.52 0.04 0.29 -0.06 0.13 0.08
0.27 -0.03 0.19 0.29 0.13 0.42 -0.4 -0.48 -0.12 -0.37 0.02 -0.24
0.43 0.15 0.23 0.04 0.1 -0.32 -0.42 -0.26 -0.48 -0.32 0.22 0.27
0.04 -0.1 -0.46 -0.07 -0.62 0.32 0.03 -0.78 0.05 0.32 0.17 0.53
-0.67 0.44 0.53 0.15 -0.77 0.55 -0.52 0.11 0.07 0.05 -0.34 -0.38
-0.2 -0.14 1.16 -0.11 -0.64 -0.08 0.54 -0.34 -0.5 -0.09 -1.2 0.2
-0.0 0.1 0.26 0.04 0.06 0.03 0.08 -0.17 -0.5 0.06 0.15 -0.23
0.17 0.03 0.23 0.2 0.12 0.32 -0.39 -0.43 -0.19 -0.16 0.08 -0.2
0.1 0.17 0.58 0.05 0.06 0.51 -0.24 -0.61 -0.25 -0.42 -0.17 -0.27
0.08 0.09 0.19 0.04 -0.19 0.14 -0.01 -0.2 -0.11 0.04 0.06 -0.19
0.59 0.02 0.25 0.4 0.32 -0.43 -0.95 -0.2 -0.56 -0.33 0.13 0.03
-0.46 -0.33 0.46 -0.41 -0.12 0.14 0.29 -0.5 0.1 0.21 0.01 0.24
0.63 -0.22 1.02 -0.3 -0.41 0.21 -0.43 -0.08 -0.23 -0.4 -0.4 -0.35
1.0 0.66 0.29 -0.81 0.62 1.09 0.27 -1.19 -1.98 -1.77 -1.08 -1.72
0.71 0.16 0.1 0.21 -0.32 0.57 -0.03 -0.22 -0.68 -0.54 -0.34 -0.34
0.34 0.27 0.61 0.17 0.04 0.52 -0.27 -0.65 -0.54 -0.34 -0.13 -0.87
1.35 0.46 1.05 0.06 -1.05 0.16 -1.49 -0.94 -1.07 -1.0 -0.39 -0.44
0.11 -0.04 0.28 0.11 0.07 0.1 -0.23 -0.24 -0.08 -0.12 -0.01 -0.05
-0.01 -0.04 -0.01 -0.01 0.03 0.23 -0.22 -0.03 0.08 -0.01 0.01 -0.08
-0.09 0.12 0.12 0.05 -0.35 0.18 0.02 -0.33 0.05 0.12 0.2 -0.25
-0.07 -0.65 0.11 -0.73 -0.39 0.47 0.58 0.37 0.35 0.14 -0.87 -0.19
-0.52 -0.48 0.26 -0.38 -0.89 1.64 0.32 - 0.15 0.33 - 0.41
0.19 0.25 0.14 0.18 0.16 0.47 -0.26 -0.29 -0.42 -0.6 0.03 -0.22
-0.87 0.08 0.7 0.11 -0.91 0.59 -0.72 -0.47 -0.09 0.24 0.39 -0.16
0.14 0.24 0.46 0.1 -0.03 0.43 -0.09 -0.66 -0.36 0.05 -0.51 -0.23
-2.77 -0.41 1.23 0.26 -1.56 1.64 -3.33 -1.6 0.13 -0.84 0.37 -0.46
0.52 0.01 0.35 0.21 0.28 -0.82 -0.13 -0.71 -0.67 -0.36 0.05 0.46
0.3 -0.47 0.37 -0.21 -0.36 0.59 0.0 0.11 0.12 -0.78 0.02 -0.24
0.26 0.03 -0.04 0.11 0.26 -0.45 -0.38 -0.48 -0.05 0.04 0.08 0.34
0.33 -0.09 0.32 0.36 0.34 -0.38 -0.18 -0.3 -0.21 -0.47 0.13 -0.21
-0.1 -0.32 0.4 -0.1 -0.06 0.32 -0.27 -0.4 0.13 -0.16 0.23 0.08
1.31 0.34 -0.27 0.8 0.15 1.15 -1.1 -2.23 -2.39 -1.25 -1.4 -0.52
-0.12 0.01 0.3 0.18 0.2 0.09 -0.12 -0.34 -0.03 -0.13 0.0 -0.16
-0.49 -0.26 0.64 0.01 -0.0 0.7 -0.13 -0.57 -0.16 -0.02 0.02 -0.38
-0.8 -0.32 0.37 0.0 -0.04 0.42 0.28 -1.03 0.47 -0.03 0.12 -0.22
0.33 -0.01 0.15 -0.05 -0.05 0.17 -0.01 -0.29 -0.23 -0.11 -0.01 -0.0
-0.04 -0.13 0.17 -0.07 0.03 0.18 -0.1 -0.14 0.2 -0.1 0.12 -0.21
0.05 0.03 0.7 0.39 -0.28 0.48 -0.34 -0.47 -0.58 -0.38 0.13 -0.43
-0.37 -0.16 0.0 -0.3 0.78 0.15 -0.05 -2.34 0.25 0.06 0.19 0.21
0.21 0.06 0.43 0.06 0.22 0.18 -0.17 -0.54 -0.17 -0.03 -0.19 -0.35
-0.1 -0.28 0.5 -0.35 -0.8 0.21 -0.21 -0.51 -0.34 0.42 0.42 0.36
-0.13 -0.16 0.88 -0.04 -0.31 0.44 0.15 -0.58 0.56 -0.74 -0.43 -0.66
-0.16 -0.32 0.51 0.23 -0.28 0.4 0.33 -0.5 -0.65 -0.05 -0.25 0.21
-1.01 -0.29 1.62 0.58 0.62 1.02 - - - - 1.17 -1.77
-0.54 -0.33 0.31 -0.79 0.13 0.61 0.53 -1.05 0.55 0.29 -0.86 -0.13
0.24 -0.14 0.83 -0.11 -0.22 0.56 -0.13 -0.74 -0.37 -0.16 -0.23 -0.27
-0.47 0.4 1.5 -0.31 - 0.63 -2.05 0.03 -0.91 -0.1 -0.05 0.1
-0.12 0.28 0.57 0.47 -1.57 0.26 -0.8 -1.09 0.73 -1.6 0.81 -0.57
-0.05 -1.26 1.11 -0.14 -0.81 0.63 -0.53 -0.03 -0.02 -0.56 0.53 -0.59
0.89 -0.1 1.37 -0.58 -1.04 1.75 - -0.5 - -0.48 -1.71 -1.43
- - 0.96 -0.36 - 1.88 - - 0.86 1.6 - -0.43
0.61 0.67 0.42 -0.12 -0.18 0.12 -0.22 -0.67 0.11 -0.39 -0.41 -0.81
- -1.12 1.11 -1.42 0.13 0.56 -1.12 1.52 -1.28 -0.14 -0.26 -0.06
0.49 0.04 0.42 -0.2 0.2 0.29 -0.72 -0.59 -0.22 -0.09 -0.18 0.05
-0.8 0.37 -0.65 0.77 -0.61 0.72 -0.57 -0.98 0.41 -0.08 0.17 -0.15
0.24 -2.6 1.21 -1.59 -1.1 1.21 -1.33 -0.55 -2.76 -1.47 1.63 -0.89
-1.01 -1.23 0.86 -0.58 0.05 1.02 -0.51 0.69 -1.01 0.55 -0.09 -1.69
-0.23 0.91 0.06 0.96 0.76 - 1.4 - - 0.0 -1.23 -0.95
-0.45 0.11 0.69 -0.98 -0.1 0.07 -0.47 -1.08 0.67 0.26 0.15 -0.01
0.27 0.37 0.37 0.15 0.07 0.24 -0.03 -0.48 -0.17 -0.27 -0.37 -0.54
1.43 0.96 -0.21 0.45 0.08 -0.13 0.2 -0.6 -1.34 -2.49 -1.76 -1.05
-0.05 0.01 0.28 0.02 -0.39 0.22 0.01 -0.07 -0.0 -0.03 0.02 -0.11
-0.08 -0.22 0.3 0.45 0.33 -0.09 -0.24 -0.35 0.07 -0.19 -0.04 -0.19
-0.29 -0.44 -0.08 -0.3 0.07 0.37 0.01 -0.19 0.49 0.14 -0.07 -0.01
0.28 0.07 0.46 -0.52 -0.14 0.06 0.02 -0.51 -0.31 -0.07 0.17 0.15
0.03 -0.31 0.16 -0.35 -0.14 0.15 -0.28 0.14 0.18 -0.03 0.11 0.18
0.23 0.05 0.2 0.14 -0.09 0.33 -0.11 -0.43 -0.1 -0.11 -0.17 -0.09
0.1 -0.35 0.53 -0.09 -0.09 0.15 0.2 -0.39 0.11 -0.16 -0.04 -0.23
- - 2.65 0.59 - 1.83 - - - -0.6 - -
0.05 0.15 0.2 0.13 -0.19 0.03 0.04 -0.22 -0.1 0.06 0.06 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.