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Heatmap: Cluster_83 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.34 -0.22 -0.26 -0.18 -0.13 -0.11 -0.12 -0.11 0.3 0.1 0.25 -0.04
0.49 -0.22 -0.37 -0.29 0.02 -0.17 -0.3 -0.24 0.38 0.25 0.22 -0.12
2.11 - - - 1.12 - - - 1.13 1.74 - -
0.39 -0.18 -0.09 -0.15 -0.18 -0.34 -0.26 0.03 0.31 0.06 0.08 0.14
0.46 -0.65 -0.37 -0.15 -0.04 -0.34 -0.43 0.2 0.39 0.09 0.07 0.31
1.38 -1.55 -0.39 -0.67 -1.17 -0.23 0.6 0.09 -1.0 0.3 0.19 -0.13
-1.36 -1.22 0.28 -0.52 -1.13 -2.36 0.41 0.29 0.12 0.63 0.81 0.74
1.65 -2.44 -0.67 - -1.67 - -2.17 -0.37 1.45 0.77 0.44 -0.09
0.68 -0.54 -0.37 -0.68 -0.43 -0.35 -1.11 -0.17 0.66 0.31 0.43 0.34
0.36 -0.11 0.06 -0.18 -0.18 -0.38 0.07 0.08 0.09 0.07 0.02 -0.05
0.19 -0.07 -0.28 -0.17 -0.12 -0.05 -0.16 0.06 0.19 0.18 0.1 0.02
2.61 - -0.75 -1.84 - - 1.02 -1.47 -0.15 -0.41 -0.06 -
0.44 -0.42 -0.13 -0.22 -0.04 -0.2 -0.23 0.03 0.23 0.14 0.1 0.09
0.92 -1.11 -0.13 -0.79 -0.37 -0.59 -0.96 -0.01 0.43 0.35 0.38 0.36
0.63 -0.57 -0.25 -0.36 -0.11 0.15 -0.22 -0.13 0.26 -0.09 0.24 0.05
0.11 -0.5 -0.13 -0.16 0.1 -0.13 0.14 0.24 0.24 0.04 -0.02 -0.08
-0.37 -0.4 -0.22 -0.02 -0.1 -0.24 0.2 0.27 0.33 0.37 -0.09 0.0
0.88 -0.49 -0.64 -0.56 -0.08 -0.51 0.13 0.23 0.15 0.27 -0.0 -0.16
0.49 -0.77 -0.2 -0.59 -0.39 -0.11 -0.18 0.04 0.37 0.4 0.24 0.1
0.76 0.12 0.23 -0.5 -0.23 -3.12 -1.85 -0.43 0.63 0.5 -0.15 0.58
0.3 -0.04 -0.05 -0.18 -0.15 0.07 -0.33 -0.11 0.14 -0.03 0.14 0.13
0.76 -0.89 -0.69 -0.45 -0.18 -0.47 -0.16 0.39 0.06 0.46 0.26 -0.02
0.04 -0.06 0.08 0.01 0.15 0.12 0.21 0.03 0.03 -0.13 -0.2 -0.38
0.46 -0.03 -0.01 0.07 -0.02 -0.24 0.04 0.04 -0.1 -0.07 -0.09 -0.2
-0.17 -0.05 0.05 0.07 0.2 0.06 0.08 0.01 0.02 -0.06 -0.09 -0.16
0.13 -0.17 -0.18 -0.26 -0.15 -0.33 -0.2 -0.05 0.37 0.46 0.23 -0.11
0.64 -0.61 -0.25 -0.25 -0.01 -0.58 -0.18 -0.14 0.37 0.08 0.26 0.15
0.1 -0.17 -0.13 -0.2 -0.01 -0.13 0.08 0.07 0.04 0.13 0.1 0.07
0.53 -0.28 -0.24 -0.45 -0.2 -0.33 -0.19 0.28 0.15 0.17 0.12 0.12
0.38 -0.57 -0.4 -0.47 -0.38 -0.02 -0.25 0.14 0.45 0.26 0.37 -0.0
0.41 -0.09 -0.12 -0.24 -0.13 -0.36 0.04 -0.03 0.01 0.13 0.12 0.11
0.67 0.61 -0.88 -0.36 -1.18 0.09 0.34 -0.6 -0.22 -0.06 -0.06 0.44
-0.14 -0.51 -0.03 -0.28 -0.05 -0.18 0.26 0.37 0.25 0.2 -0.15 0.02
0.75 0.16 -0.7 0.37 -1.02 0.41 -1.62 0.07 -1.28 -0.01 -0.51 0.99
0.1 -0.17 -0.19 -0.13 -0.05 -0.08 0.04 0.09 0.07 0.06 0.12 0.09
0.64 0.02 -0.5 -0.44 -0.36 -0.51 -0.34 -0.21 0.26 0.48 0.11 0.23
-0.22 -0.15 -0.05 -0.02 0.47 -0.2 0.25 0.0 0.19 0.04 -0.31 -0.21
1.12 -0.9 -0.54 -1.11 -1.32 -0.98 0.0 0.26 0.6 0.17 0.28 0.25
0.35 -0.11 -1.04 -0.49 0.02 -0.19 -0.13 0.21 0.46 0.08 0.27 0.01
0.33 -0.12 -0.06 -0.24 -0.07 -0.24 -0.24 -0.0 0.16 0.08 0.15 0.11
-0.08 -0.14 0.01 -0.1 0.21 -0.12 0.17 0.09 0.15 0.01 -0.09 -0.15
2.57 - - 1.45 - - 1.72 - - - - -
0.69 -1.47 -0.52 -1.55 -1.14 -0.86 -0.57 0.22 0.58 0.42 0.65 0.8
0.78 -0.21 -1.11 -0.03 -1.11 -0.88 0.25 0.14 0.1 0.31 -0.01 0.46
0.81 0.38 -1.31 -0.22 -1.27 -0.03 -0.19 0.05 -0.35 -0.18 -0.35 0.94
0.77 -0.38 -0.82 -1.07 -0.1 -0.6 -0.56 0.33 0.39 0.3 0.3 0.24
0.34 -0.42 -0.22 -0.47 -0.31 -0.06 -0.37 0.16 0.34 0.4 0.26 -0.05
0.49 -0.75 -0.47 -0.49 -0.16 -0.11 -0.39 0.18 0.21 0.34 0.31 0.26
0.55 0.28 -1.46 0.19 -0.5 -0.8 -1.06 0.23 -0.2 0.12 0.37 0.7
3.04 - - 1.92 - - - - - - - -
1.9 -1.19 - 0.03 - - 0.64 0.15 0.51 1.11 - -0.86
0.61 0.77 -0.39 0.44 -1.0 -0.05 -0.3 -0.68 -1.18 -0.62 0.04 0.7
0.82 -0.12 -0.81 -0.66 -0.74 -0.13 0.1 0.07 0.18 0.5 -0.0 -0.1
0.48 -0.17 -0.71 -0.39 -0.82 -0.14 0.41 0.33 0.24 0.36 -0.05 -0.25
-0.02 -0.19 0.06 -0.09 -0.06 -0.26 0.1 0.06 0.07 0.15 0.1 0.02
0.05 -1.84 -0.48 -0.66 0.28 -0.6 0.34 0.47 0.46 0.61 0.2 -0.4
0.19 -0.12 0.01 -0.2 -0.08 -0.6 -0.01 0.13 0.12 0.26 0.09 0.04
0.05 -1.51 -0.57 -0.92 0.22 -0.39 0.28 0.55 0.44 0.31 0.1 0.19
0.07 -0.86 0.02 -0.59 -0.5 -0.55 0.37 0.43 0.2 0.35 0.27 0.08
-0.06 -0.72 -0.42 -0.16 0.07 -0.27 0.24 0.34 0.25 0.28 0.18 -0.1
0.61 -0.45 -0.66 -0.29 -0.4 -0.67 -0.92 -0.52 0.46 0.39 0.49 0.66
0.3 -0.09 -0.02 -0.21 -0.02 -0.23 -0.25 0.05 0.25 -0.05 0.06 0.08
0.25 -0.21 -0.09 -0.17 -0.04 -0.26 -0.06 0.11 0.18 0.04 0.07 0.08
0.34 -0.2 -0.05 -0.16 -0.05 -0.15 0.06 0.06 0.1 0.04 0.02 -0.1
0.24 -0.08 -0.01 -0.01 0.07 -0.04 0.04 -0.03 -0.08 0.03 -0.05 -0.11
0.34 -0.22 -0.04 -0.08 0.01 -0.24 -0.27 -0.04 0.23 0.03 0.12 0.02
0.02 -0.1 -0.05 0.06 0.17 -0.0 0.09 0.1 0.02 -0.07 -0.12 -0.15
-0.04 0.01 0.02 -0.04 0.19 -0.01 0.24 0.06 -0.0 -0.07 -0.24 -0.18
0.19 -0.66 -0.02 -0.3 -0.06 -0.22 -0.35 0.36 0.18 0.15 0.4 -0.03
0.2 -1.01 -0.47 -0.57 -0.08 -0.43 0.06 0.66 0.42 0.35 0.02 0.02
1.46 0.09 -2.52 -1.36 -3.88 -1.94 -1.67 -0.65 0.84 0.21 0.59 0.92
1.0 -0.27 0.1 -0.64 -0.89 -0.99 0.11 -0.58 0.21 0.08 0.39 0.19
-0.13 -0.19 -0.08 -0.01 -0.01 0.04 0.12 0.09 0.1 0.04 0.06 -0.07
0.13 0.04 0.07 0.01 -0.1 -0.21 -0.08 -0.11 0.07 0.13 0.02 -0.02
0.54 0.02 -0.3 -0.15 -0.12 -0.16 -0.87 -0.06 0.35 0.01 -0.09 0.35
0.61 -1.04 -0.21 -0.69 -0.05 -0.66 -0.54 0.06 0.53 0.31 0.4 0.22
0.46 -0.13 -0.26 -0.3 -0.08 -0.1 -0.24 -0.2 0.22 0.01 0.12 0.27
0.06 0.07 -0.15 -0.03 -0.43 -0.82 -0.13 0.14 0.27 0.25 0.14 0.27
0.56 -0.16 -0.14 -0.23 -0.27 -0.09 -0.11 -0.14 0.12 0.27 0.0 -0.04
0.01 -0.14 -0.0 -0.12 0.01 -0.3 0.05 0.11 0.05 0.11 0.16 -0.0
-0.26 -0.44 -0.33 -0.4 -0.29 -0.12 0.01 0.13 0.32 0.26 0.39 0.35
1.05 0.02 -0.29 0.09 -0.9 -1.92 -0.05 -0.16 -0.04 0.39 -0.39 0.41
0.52 -0.14 -0.01 -0.28 -0.48 -0.11 -0.03 -0.21 0.14 0.09 0.2 0.04
0.43 -1.54 -0.58 -0.56 -0.72 -0.09 0.11 0.6 0.67 0.19 0.17 -0.06
0.65 -0.57 0.0 -0.52 -0.53 -1.16 -0.14 0.08 0.37 0.38 0.2 0.28
0.11 -0.08 -0.11 -0.1 -0.1 -0.05 -0.04 0.13 0.05 0.11 -0.01 0.05
-0.14 -0.24 -0.1 -0.12 0.04 -0.11 0.08 0.19 0.09 0.24 -0.01 0.0
-0.03 -0.15 -0.26 -0.41 -0.13 -0.06 -0.19 0.08 0.24 0.29 0.27 0.16
0.27 0.28 0.16 -0.2 -0.16 -0.63 -0.23 0.05 0.14 0.02 -0.09 0.15
0.45 -0.49 -0.37 -0.36 -0.31 -0.19 0.15 0.16 0.09 0.4 0.21 -0.11
0.27 -0.18 -0.06 -0.08 -0.02 -0.15 0.05 0.04 0.07 0.06 -0.0 -0.06
0.22 -0.65 -0.24 -0.46 -0.24 -0.12 -0.2 0.14 0.23 0.3 0.38 0.24
0.31 -0.15 -0.18 -0.17 -0.18 0.03 -0.1 0.12 -0.02 0.17 0.02 0.05
0.31 -0.23 -0.14 -0.08 0.01 -0.02 -0.01 -0.17 0.07 0.06 0.15 -0.03
0.54 -0.32 -0.28 -0.34 -0.04 -0.35 -0.22 0.21 0.16 0.07 0.15 0.11
0.63 -0.55 -0.23 -0.33 -0.13 -0.55 0.13 0.09 0.19 0.26 0.0 0.04
0.12 -0.42 -0.49 -0.53 -0.44 -0.05 0.36 0.13 0.31 0.34 0.11 0.11
-0.01 -0.32 -0.21 -0.28 -0.17 -0.12 -0.0 0.07 0.22 0.16 0.28 0.21
0.55 -0.61 -0.4 -0.46 -0.43 -0.18 -0.12 0.03 0.39 0.38 0.19 0.11
-0.07 -0.34 -0.19 -0.13 0.16 -0.16 0.31 0.15 0.25 0.11 -0.07 -0.18
0.43 0.01 -0.02 0.04 -0.02 -0.33 -0.07 0.02 -0.0 0.12 -0.11 -0.21
0.23 -0.14 -0.12 -0.08 0.0 -0.15 -0.25 0.1 0.14 0.05 0.13 0.0
0.14 -0.13 -0.23 -0.05 -0.23 -0.02 -0.15 0.13 0.08 0.21 0.18 -0.02
1.01 -1.6 -0.71 -1.1 -1.39 0.19 -0.61 0.04 0.66 -0.1 0.67 0.34
0.65 -1.27 -1.44 -1.21 -1.67 -0.39 0.13 0.68 0.67 0.59 0.37 0.06
0.65 -0.0 -0.09 -0.14 -0.12 -0.59 -0.35 -0.13 0.29 0.06 0.07 -0.02
0.23 -0.08 -0.1 -0.13 -0.12 -0.15 -0.15 0.03 0.1 0.21 0.1 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.