Heatmap: Cluster_133 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.0 0.99 0.97 1.2 0.69 1.05 1.2 1.39 0.74 1.46 1.53 0.75
0.65 0.91 0.55 1.3 0.58 0.72 1.05 0.6 0.63 1.78 1.29 1.04
11.61 12.67 13.22 12.47 10.59 12.08 13.32 10.32 11.87 11.98 12.05 11.81
7.02 3.75 3.71 5.53 3.51 6.93 6.14 4.47 5.9 7.88 4.84 4.79
0.21 0.06 0.24 0.06 0.1 0.37 0.09 0.12 0.09 0.14 0.2 0.17
1.5 0.99 1.22 1.26 0.55 1.29 1.55 0.96 1.38 1.49 1.44 0.97
0.04 0.02 0.1 0.09 0.02 0.06 0.08 0.04 0.0 0.06 0.15 0.0
0.47 0.48 0.55 0.79 0.3 1.19 0.5 0.66 0.25 0.65 1.02 0.45
36.55 34.61 31.84 35.43 38.09 29.29 35.9 35.0 34.89 38.96 37.01 36.22
4.16 3.95 4.24 4.51 5.34 6.66 4.72 4.94 3.86 4.25 5.17 3.0
77.71 67.85 75.09 74.05 77.33 77.05 75.02 81.72 73.19 78.31 69.63 76.46
24.59 22.34 21.76 20.11 22.43 33.27 22.49 24.73 24.66 30.24 29.69 28.98
4.83 3.61 1.99 3.76 3.65 4.53 2.8 3.64 1.37 4.92 6.9 4.79
0.25 0.13 0.12 0.69 0.2 0.46 0.52 0.28 0.4 0.92 0.63 0.27
3.71 3.98 2.65 3.4 2.95 3.71 2.82 4.03 4.38 4.38 3.43 3.3
27.59 18.44 20.57 19.6 18.52 23.1 17.73 21.88 19.92 27.08 24.52 21.04
66.41 59.08 55.26 67.12 63.81 61.1 64.07 61.93 65.39 68.23 65.2 64.03
22.99 22.33 21.12 24.65 23.66 24.26 24.74 23.76 24.13 25.15 23.64 22.51
0.64 0.92 1.15 0.73 0.12 1.95 1.08 0.66 1.22 0.72 0.71 0.71
1.71 1.92 1.77 1.7 0.98 2.68 1.79 1.83 2.74 2.64 3.33 3.31
0.28 0.33 0.39 0.42 0.34 0.32 0.3 0.27 0.58 0.8 0.46 0.47
7.65 6.72 4.81 8.01 7.02 6.01 6.4 8.22 5.72 9.26 7.8 9.19
1.5 1.37 1.2 1.92 1.74 0.85 1.31 1.79 1.44 3.37 2.42 2.54
0.0 0.04 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04
1.49 0.88 1.02 0.81 0.67 1.18 0.76 0.74 1.55 2.04 1.08 1.83
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.25 0.14 0.0 0.14 0.19 0.28 0.3 0.09 0.09 0.39 0.25 0.23
0.25 0.15 0.17 0.14 0.21 0.58 0.0 0.13 0.07 0.48 0.05 0.21
8.19 7.72 7.61 8.75 7.77 8.35 8.04 7.93 8.17 8.52 8.21 7.01
2.79 2.85 2.31 2.18 1.49 1.34 3.18 3.27 2.74 5.16 3.41 3.94
1.17 1.45 1.36 1.84 1.03 2.04 1.66 1.6 1.23 2.52 2.13 2.06
0.14 0.08 0.0 0.07 0.08 0.2 0.26 0.04 0.05 0.2 0.09 0.15
0.79 0.44 0.56 1.05 0.45 0.79 0.59 0.2 0.28 0.24 0.26 0.61
0.04 0.14 0.13 0.18 0.13 0.11 0.13 0.2 0.0 0.06 0.09 0.15
0.89 0.76 1.0 0.9 0.66 0.94 0.79 0.79 0.7 1.03 0.92 0.79
2.21 2.24 2.03 2.39 2.12 1.84 2.46 2.83 1.63 2.15 2.65 2.08
0.65 0.31 0.62 0.45 0.07 0.86 0.35 0.27 0.51 0.82 0.2 0.54
0.57 0.33 0.83 0.28 0.45 0.91 0.14 0.19 0.56 1.48 0.72 0.91
0.04 0.08 0.06 0.02 0.02 0.08 0.0 0.02 0.02 0.02 0.15 0.0
0.11 0.03 0.09 0.04 0.07 0.25 0.06 0.06 0.07 0.23 0.09 0.13
0.04 0.17 0.09 0.1 0.0 0.05 0.1 0.11 0.14 0.15 0.13 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.04 0.0 0.03 0.17 0.02 0.04
0.11 0.23 0.02 0.11 0.11 0.34 0.14 0.22 0.18 0.04 0.16 0.11
0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.0
0.57 0.62 0.62 0.48 0.38 0.61 0.72 0.55 0.54 0.51 0.87 0.58
0.14 0.06 0.02 0.07 0.0 0.09 0.09 0.06 0.02 0.3 0.05 0.11
0.29 0.25 0.11 0.16 0.09 0.59 0.4 0.25 0.09 0.18 0.34 0.11
1.29 0.94 0.95 1.15 0.99 1.5 1.38 1.37 1.3 1.76 1.77 0.9
0.54 1.1 0.4 1.02 0.68 1.02 0.99 0.33 0.74 1.51 1.76 1.43
0.54 0.47 1.09 0.67 0.47 1.74 1.02 0.57 0.62 0.84 1.12 0.49
12.79 11.47 12.89 13.32 12.06 11.49 12.96 15.35 12.62 17.44 15.52 16.68
0.36 0.7 0.73 0.82 0.51 0.99 0.83 0.32 0.47 0.9 0.64 0.61
2.04 2.1 1.86 1.8 1.3 2.32 1.56 2.16 1.53 2.58 2.41 2.59
1.7 2.3 1.68 1.93 2.01 1.39 1.77 2.16 1.87 2.53 2.2 2.07
1.6 1.24 1.32 0.7 0.59 1.31 0.82 0.59 0.82 1.93 2.35 1.64
0.21 0.26 0.11 0.25 0.18 0.5 0.46 0.28 0.18 0.39 0.49 0.32
22.8 22.15 21.04 21.74 23.29 19.95 18.45 22.98 23.05 26.29 23.72 26.76
1.03 0.78 0.24 0.86 0.45 1.29 1.06 0.6 0.65 1.66 1.14 1.03
34.39 38.24 29.01 37.78 30.07 20.44 22.8 33.73 38.93 35.12 30.97 44.93
0.04 0.12 0.0 0.07 0.29 0.38 0.33 0.24 0.21 0.24 0.13 0.04
1.21 1.5 1.15 1.91 1.63 2.9 2.29 1.65 1.75 2.22 1.62 1.69
2.0 1.42 1.34 1.98 1.89 2.03 2.37 2.46 2.16 2.82 1.54 1.78
0.0 0.34 0.82 0.21 0.31 0.0 0.71 0.85 0.59 1.88 0.46 1.28
1.78 2.01 2.2 1.83 1.41 3.43 2.52 2.9 1.77 2.33 3.18 2.9
5.89 6.29 6.31 6.96 4.75 6.77 6.07 6.46 7.58 8.63 7.11 6.97
3.91 5.65 6.94 6.2 3.28 9.56 7.57 5.24 5.95 5.31 5.96 4.19
0.14 0.39 0.31 0.51 0.46 0.2 0.43 0.58 0.26 1.05 0.41 0.62

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)