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Heatmap: Cluster_211 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.12 -0.18 -0.25 -0.12 0.14 0.13 -0.05 0.0 0.15 0.12 0.11 -0.01
-0.51 -0.68 -0.43 -0.33 0.02 -0.02 0.34 0.37 0.38 0.11 0.12 0.15
-0.07 -0.34 -0.08 -0.21 0.14 0.22 -0.34 -0.03 0.22 0.01 0.16 0.16
-0.06 -0.23 -0.36 -0.11 0.04 0.19 -0.26 0.09 0.22 0.07 0.15 0.11
0.27 -0.09 -0.08 -0.19 -0.05 0.06 -0.21 -0.06 0.06 -0.05 0.26 -0.01
-0.24 -0.2 -0.44 -0.14 0.12 0.08 -0.17 -0.08 0.28 0.17 0.37 0.05
-0.24 -0.15 -0.25 -0.15 0.07 0.02 -0.01 0.18 0.12 0.09 0.17 0.07
-0.17 -0.26 -0.09 -0.12 0.13 0.08 -0.09 0.06 0.21 0.09 0.1 -0.0
-0.06 -0.13 -0.16 -0.03 0.11 -0.06 -0.13 -0.08 0.16 0.09 0.19 0.05
-0.14 -0.34 -0.01 -0.11 0.16 -0.0 -0.05 0.14 0.2 0.1 0.03 -0.07
-0.06 -0.11 -0.04 -0.03 0.15 -0.17 -0.15 -0.0 0.0 0.03 0.16 0.17
-0.41 -0.38 -0.19 -0.17 0.07 -0.01 0.09 -0.04 0.22 0.18 0.37 0.08
-0.14 -0.18 -0.2 -0.11 0.23 -0.02 -0.12 0.03 0.1 0.02 0.15 0.15
-0.14 -0.17 -0.21 -0.04 0.04 -0.17 -0.11 0.1 0.08 0.17 0.18 0.18
0.08 -0.11 -0.34 -0.04 -0.02 -0.18 0.03 0.05 0.11 0.12 0.17 0.06
0.04 -0.27 -0.35 -0.03 0.12 -0.07 -0.02 -0.01 0.11 0.1 0.23 0.06
-0.09 -0.24 -0.02 -0.05 0.18 0.02 -0.18 0.01 0.05 0.06 0.08 0.12
-0.28 -0.81 -0.21 -0.05 0.46 -0.35 -0.71 -0.27 -0.18 0.7 0.25 0.56
-0.13 -0.24 -0.16 -0.02 0.08 -0.02 -0.06 -0.0 0.15 0.13 0.15 0.06
-0.39 -0.28 -1.0 -0.32 0.02 0.04 -0.03 -0.07 0.45 0.4 0.47 0.09
-0.07 -0.33 -0.48 -0.39 0.08 0.14 -0.01 0.15 0.43 0.04 0.06 0.13
0.15 -0.32 -0.29 -0.09 0.04 -0.01 -0.4 0.0 0.11 0.18 0.27 0.18
-0.12 -0.36 -0.01 -0.04 0.17 0.13 -0.22 0.03 0.17 0.12 0.13 -0.11
0.11 -0.21 -0.44 -0.21 -0.16 0.06 -0.18 -0.23 0.27 0.19 0.39 0.19
-0.09 -0.34 0.1 -0.18 -0.01 -0.04 0.03 0.02 0.14 0.18 0.1 0.01
-0.07 -0.31 -0.27 -0.1 0.14 0.07 -0.15 0.08 0.25 0.11 0.08 0.06
-0.19 -0.44 0.03 -0.14 0.14 -0.35 -0.23 -0.14 -0.05 0.13 0.27 0.61
-0.19 -0.22 -0.16 -0.14 -0.04 0.09 -0.09 -0.11 0.14 0.09 0.31 0.21
-0.02 -0.29 -0.03 -0.15 -0.09 0.1 -0.35 -0.05 0.21 0.06 0.22 0.24
0.07 -0.02 -0.2 -0.17 -0.15 -0.06 -0.13 -0.18 0.12 0.16 0.42 0.0
0.14 -0.05 -1.15 -0.46 0.57 -0.23 -0.35 -0.02 0.15 0.24 0.25 0.23
-0.33 -0.19 -0.02 -0.15 0.04 0.13 -0.14 0.21 -0.09 0.25 -0.04 0.21
-0.07 -0.21 -0.15 -0.1 0.11 0.11 -0.19 -0.05 0.08 0.15 0.15 0.1
-0.23 -0.29 -0.36 -0.19 0.05 -0.02 0.08 0.29 0.31 0.07 0.06 0.06
-0.19 -0.45 -0.55 -0.21 0.08 -0.07 0.06 0.29 0.53 0.04 0.14 -0.01
-0.39 -0.4 -0.69 -0.43 -0.12 -0.14 0.13 0.23 0.33 0.33 0.49 0.15
-0.33 -1.75 -4.66 -0.51 -0.08 0.43 0.52 0.56 0.16 0.85 0.25 -0.23
-0.38 -0.45 -0.32 -0.08 0.22 -0.04 -0.17 0.13 0.07 0.27 0.34 0.13
-0.09 -0.19 -0.21 -0.04 -0.04 -0.14 0.02 0.14 0.05 0.14 0.18 0.12
-0.14 -0.26 0.07 -0.22 0.19 -0.04 -0.22 0.18 0.18 0.04 0.11 0.01
0.31 -0.61 -0.43 -0.37 0.36 0.09 -0.34 -0.11 0.37 -0.2 0.25 0.23
-0.53 -0.6 -0.24 -0.69 0.24 -0.26 0.09 0.2 0.48 0.2 0.41 0.12
-0.26 -0.21 -0.25 -0.01 -0.1 -0.12 -0.21 0.22 0.14 0.18 0.25 0.22
-0.37 -0.32 -0.68 -0.27 0.07 0.38 -0.07 0.15 0.4 0.14 0.08 0.11
-0.09 -0.24 -0.0 -0.12 0.0 0.09 -0.05 0.1 0.13 0.11 0.06 -0.05
-0.11 -0.23 -0.52 -0.01 0.15 0.01 -0.11 0.07 0.15 0.15 0.14 0.17
-0.02 -0.12 -0.22 -0.12 0.09 0.04 -0.16 0.07 0.12 0.09 0.08 0.1
0.32 -0.13 -0.31 -0.43 -0.11 -0.1 -0.72 -0.11 0.2 0.23 0.4 0.32
-0.01 0.08 -0.49 -0.04 0.16 -0.03 -0.18 -0.47 0.16 0.2 0.39 -0.0
-0.24 -0.01 -0.27 0.01 0.06 -0.21 -0.05 0.1 0.07 0.19 0.11 0.15
-0.73 -0.21 -0.77 0.09 0.28 0.15 0.24 -0.04 0.11 0.18 0.27 -0.0
-0.05 -0.62 0.02 -0.29 -0.19 0.06 -0.01 0.11 0.2 0.17 0.2 0.18
-0.19 -0.29 -0.18 -0.19 -0.07 0.19 -0.04 -0.05 0.21 0.21 0.18 0.1
0.1 -0.08 -0.14 -0.17 -0.11 0.07 -0.25 -0.03 -0.04 0.21 0.15 0.21
-0.15 -0.34 -0.01 -0.12 0.09 0.11 -0.02 0.14 0.2 -0.03 0.09 -0.02
-0.23 -0.26 -0.34 -0.13 0.05 0.18 -0.1 -0.1 0.3 0.23 0.24 0.0
-0.42 -0.51 -0.45 -0.2 0.07 -0.0 -0.05 0.07 0.36 0.13 0.42 0.23
-0.16 -0.26 -0.02 -0.11 -0.0 0.14 -0.17 0.09 0.07 0.1 0.07 0.18
-0.22 -0.25 -0.05 0.06 0.13 0.13 -0.06 0.04 -0.07 0.04 0.1 0.1
-0.44 -0.63 -0.32 0.07 0.33 -0.09 -0.5 -0.29 -0.4 0.71 0.2 0.58
-0.25 -0.32 -0.19 -0.03 0.05 0.15 -0.11 0.06 0.17 0.27 0.05 0.05
-0.11 -0.13 -0.28 -0.08 -0.08 0.06 -0.29 0.13 0.1 0.19 0.13 0.25
-0.35 -0.36 0.09 -0.01 0.21 0.05 0.02 0.08 0.03 0.12 0.12 -0.11
-0.25 -0.21 -0.21 -0.05 0.02 0.09 -0.13 0.12 0.28 0.07 0.07 0.11
-0.06 -0.23 0.19 -0.26 0.19 -0.29 -0.18 0.19 0.09 0.13 -0.01 0.09
0.2 0.14 -0.4 -0.17 -0.2 -0.05 -0.33 -0.1 0.3 -0.08 0.29 0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.