Heatmap: Cluster_144 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
101823	-0.4	-0.36	0.03	0.01	0.33	0.19	0.22	0.27	0.22	-0.12	-0.17	-0.51
102601	0.17	-0.17	0.15	-0.34	0.15	0.34	0.38	0.3	0.07	-0.23	-0.65	-0.64
105841	-0.33	-0.09	0.16	0.08	0.09	0.11	0.05	0.08	-0.08	0.07	-0.08	-0.13
105846	0.08	-0.22	0.08	0.1	0.06	0.12	-0.01	0.01	-0.08	0.06	-0.07	-0.18
105943	0.09	-0.42	0.18	-0.3	0.23	0.24	0.07	0.03	0.04	-0.02	0.01	-0.35
106157	-0.23	-0.21	-0.11	-0.04	0.27	0.07	0.12	0.18	0.14	-0.22	0.09	-0.18
110413	0.02	-0.2	-0.02	-0.05	0.13	0.16	-0.07	0.12	0.04	-0.07	0.02	-0.12
118775	-0.05	-0.33	0.17	-0.02	-0.14	0.22	0.16	0.17	0.18	0.01	-0.13	-0.39
126282	-0.32	-0.17	0.06	-0.38	0.18	0.24	-0.07	0.35	0.09	0.04	-0.16	-0.06
132834	0.12	-0.07	0.13	-0.01	-0.03	0.14	0.02	-0.08	-0.12	0.03	-0.03	-0.14
133997	-0.31	-0.29	0.08	-0.09	0.15	0.18	0.13	0.15	0.04	-0.01	-0.06	-0.07
139450	0.06	-0.02	0.02	-0.09	0.0	0.07	0.04	-0.08	0.01	0.01	-0.01	-0.01
139660	-0.21	0.04	0.11	0.03	0.02	0.19	0.07	0.02	0.11	-0.16	-0.12	-0.15
145705	-0.54	-0.63	0.39	0.08	0.35	0.57	-0.04	0.02	-0.01	-0.07	-0.23	-0.4
146763	-0.08	0.09	0.14	0.04	0.1	0.08	0.03	-0.09	0.13	-0.13	-0.25	-0.13
146904	-0.14	-0.27	-0.05	-0.11	0.16	0.09	-0.02	0.1	0.16	-0.01	0.07	-0.04
147110	-0.13	-0.01	0.05	0.04	0.05	0.14	0.15	0.02	0.07	-0.0	-0.13	-0.31
150177	-0.11	-0.07	0.06	0.01	0.1	0.17	0.03	-0.04	-0.02	0.02	-0.11	-0.07
150295	-0.24	-0.37	-0.21	-0.02	0.18	0.25	0.01	0.15	0.05	-0.01	0.13	-0.05
160867	0.04	-0.09	0.07	-0.16	0.13	0.2	0.09	0.17	0.01	-0.13	-0.08	-0.35
161477	0.04	-0.12	0.03	0.02	0.17	0.02	0.03	-0.04	-0.05	-0.03	-0.03	-0.06
165356	-0.84	-0.34	0.14	0.18	0.03	0.29	0.19	0.23	0.22	-0.12	-0.05	-0.32
165509	-0.2	-0.29	0.37	0.03	0.19	0.06	-0.04	0.24	0.13	-0.13	-0.39	-0.18
168470	-0.26	-0.09	0.16	0.13	-0.03	0.2	0.18	0.11	0.08	0.03	-0.25	-0.41
170207	0.11	-0.08	0.05	-0.07	0.06	0.0	0.1	-0.04	-0.0	0.01	-0.02	-0.14
170784	0.05	-0.27	0.07	-0.02	0.09	0.07	-0.12	0.04	0.1	-0.04	0.03	-0.06
172407	-0.03	-0.02	0.11	-0.19	-0.03	0.29	0.11	-0.05	-0.02	-0.12	0.07	-0.2
172788	-0.22	-0.58	-0.27	-0.28	0.11	0.26	0.06	0.26	0.29	-0.02	0.17	-0.06
177615	-0.23	-0.19	0.04	-0.02	0.1	0.17	0.04	0.1	0.14	0.0	0.0	-0.22
178059	-0.31	-0.38	-0.36	0.08	0.02	0.1	0.11	0.22	0.28	0.02	0.1	-0.06
185060	-0.13	-0.15	-0.09	-0.09	0.06	0.32	0.14	-0.03	0.12	-0.02	-0.01	-0.21
185811	-0.07	-0.19	-0.15	-0.04	-0.04	0.15	0.02	0.16	0.15	0.0	0.03	-0.06
228167	-0.09	-0.3	-0.15	-0.12	0.09	0.28	0.03	0.1	0.18	0.03	-0.02	-0.14
229819	-0.08	-0.17	0.03	-0.03	-0.02	0.24	0.14	0.04	0.01	-0.17	0.05	-0.09
231406	-0.3	-0.27	0.1	0.05	0.17	0.07	-0.03	0.09	0.17	-0.06	0.06	-0.14
267388	-0.09	-0.21	0.1	-0.04	0.18	0.13	-0.06	-0.01	0.02	0.14	-0.03	-0.19
270937	0.16	0.0	0.07	-0.09	-0.01	0.09	-0.02	-0.02	0.02	-0.04	-0.03	-0.17
402204	-0.41	-0.49	-0.01	-0.01	0.21	0.4	-0.02	0.22	0.14	-0.05	0.03	-0.25
402524	-0.37	-0.33	0.28	-0.56	1.28	0.59	-0.07	-0.72	0.66	-1.98	-1.1	-0.45
402569	-0.39	-0.21	0.32	0.08	0.32	0.49	0.5	-0.12	0.21	-0.48	-0.74	-0.7
403737	-0.81	-1.09	0.79	0.44	1.15	1.39	-0.21	-1.83	-0.06	-2.79	-0.73	-2.37
403900	-0.41	-0.05	-0.22	-0.16	0.32	0.27	0.28	0.11	0.16	-0.11	-0.06	-0.36
405186	0.17	0.02	0.04	-0.05	-0.01	0.06	0.16	-0.16	-0.06	0.09	-0.18	-0.13
405986	-1.38	-0.56	-4.01	-0.04	0.06	1.81	0.51	-0.52	-0.19	-0.09	0.32	-2.7
409366	-1.37	-1.34	0.78	-0.81	-0.27	1.0	0.65	0.98	-0.06	-0.45	-1.28	-1.11
409622	-	-	-	-	2.39	1.74	-1.23	-0.5	0.65	-1.52	-	-1.39
410588	0.8	-0.29	0.32	-1.06	-	1.15	-0.5	-0.28	-0.21	-0.25	0.71	-0.66
412771	-0.5	-0.47	-0.56	0.4	0.28	1.1	0.66	-0.38	-0.57	-0.23	-0.46	-0.71
413446	-0.45	-0.52	0.26	0.04	0.13	0.1	0.16	0.33	0.16	-0.07	-0.14	-0.27
413848	-1.87	-4.99	-0.47	0.26	2.07	-0.34	-1.41	-1.42	1.16	-1.53	0.03	-1.18
418658	0.0	0.08	0.22	0.1	0.3	0.1	-0.03	-0.21	0.06	-0.23	-0.14	-0.39
418803	-1.59	-1.32	0.53	0.06	0.3	0.42	-0.04	0.47	0.07	0.1	-0.17	-0.25
420699	-0.24	-0.5	-0.04	-0.14	-0.03	-0.0	0.2	0.19	0.18	0.24	0.11	-0.16
421276	-1.07	-0.09	0.23	-0.27	1.07	0.29	0.25	-1.14	0.56	-0.54	-0.31	-0.61
422552	-0.31	-0.2	0.16	0.08	0.12	0.23	0.16	0.19	0.1	-0.22	-0.17	-0.31
428018	0.32	-0.54	0.0	-0.31	0.12	0.0	0.3	0.06	0.29	0.11	-0.21	-0.46
437220	-0.01	-0.3	0.13	0.06	0.09	0.19	-0.02	0.07	0.04	0.03	-0.08	-0.27
437623	0.09	-0.15	-0.09	-0.02	0.06	0.12	0.17	0.08	-0.05	0.05	-0.02	-0.29
438017	-0.18	-0.33	-0.36	0.27	0.44	0.42	0.41	0.0	0.13	0.05	-0.76	-0.73
438018	-0.2	-0.17	-0.03	0.07	0.08	0.19	0.02	0.11	0.0	0.08	-0.12	-0.08
440877	0.02	-0.05	0.04	0.09	-0.02	0.03	0.04	0.12	0.06	-0.12	-0.07	-0.17
441812	-0.09	-0.17	-0.06	0.03	0.28	0.12	0.05	0.09	0.02	-0.04	-0.03	-0.27
442157	-0.28	-0.53	-0.08	0.18	0.38	0.58	0.6	0.2	-0.34	0.05	-0.59	-1.09
442170	-1.34	-0.69	0.35	0.08	0.77	0.69	0.13	0.0	0.22	-0.35	-0.76	-0.53
442453	-0.08	-0.16	-0.03	0.01	0.03	0.11	0.04	0.11	0.04	0.04	-0.01	-0.12
443463	-0.11	-0.03	0.09	-0.1	0.09	0.18	-0.09	0.14	-0.1	0.13	-0.07	-0.17
445453	-0.02	-0.31	0.15	-0.16	0.16	0.25	-0.04	-0.03	0.05	0.01	-0.0	-0.14
462	-0.13	-0.33	-0.15	-0.09	0.23	0.25	-0.02	0.13	-0.06	0.07	0.1	-0.11
47431	-0.31	-0.34	0.1	0.14	0.24	0.24	0.15	0.16	-0.15	0.04	-0.27	-0.2
48904	-0.72	-0.71	0.3	0.48	0.72	0.18	-0.22	0.23	0.27	-0.24	-0.42	-0.89
51367	0.0	-0.22	0.14	-0.03	0.1	0.0	0.06	0.07	-0.0	0.04	-0.05	-0.17
52345	-0.12	-0.19	-0.11	0.02	0.12	0.15	0.07	0.13	0.16	-0.08	0.02	-0.22
53728	-0.13	-0.27	0.15	-0.19	0.13	0.13	0.01	0.15	0.0	0.08	-0.01	-0.13
54701	-0.21	-0.25	0.01	-0.02	0.19	0.23	-0.04	0.15	0.11	-0.04	-0.1	-0.12
6079	-0.7	-1.03	0.23	0.57	0.4	0.52	-0.1	0.26	0.17	0.27	-0.77	-1.22
61162	-0.07	-0.25	-0.05	-0.15	0.14	0.25	0.2	0.26	0.06	0.04	-0.25	-0.32
6327	-0.24	-0.4	0.18	-0.07	0.12	0.32	0.19	0.25	0.29	-0.12	-0.26	-0.6
65428	-0.76	-0.9	0.21	0.07	0.57	0.16	-0.22	0.38	0.38	-0.1	-0.29	-0.23
66964	-0.11	-0.22	-0.13	0.06	0.26	0.13	0.04	0.09	0.02	0.03	-0.05	-0.2
73379	-0.31	-0.38	-0.02	-0.04	0.28	0.26	-0.0	0.05	0.22	0.02	-0.07	-0.17
74641	-	-2.7	-	-	2.1	1.45	-	-1.4	0.19	0.64	0.63	-2.37
75620	-0.31	-0.26	0.12	-0.01	0.11	0.25	0.04	0.1	0.07	0.02	-0.08	-0.14
75757	-0.26	-0.08	0.03	0.08	0.21	0.09	0.2	0.07	-0.07	0.04	-0.11	-0.29
76049	0.1	-0.23	0.11	-0.21	0.07	0.47	0.04	0.04	-0.05	-0.14	-0.0	-0.37
78122	-0.12	-0.09	0.05	-0.04	0.15	0.23	0.06	0.04	0.1	-0.1	-0.06	-0.27
79603	-0.01	-0.08	-0.05	0.03	0.11	0.07	-0.05	0.16	0.03	-0.09	-0.07	-0.09
80089	-0.14	-0.07	0.1	0.02	-0.07	0.35	0.01	-0.0	0.1	0.09	-0.18	-0.31
80863	-0.08	-0.11	0.04	-0.2	0.04	0.21	0.03	0.02	0.1	0.04	0.12	-0.29
84215	0.05	-0.14	0.05	-0.07	0.15	0.09	-0.04	0.1	0.02	-0.07	-0.05	-0.14
84330	-0.39	-0.25	0.22	0.04	0.1	0.37	0.08	0.21	0.1	-0.16	-0.29	-0.25
84627	-0.21	-0.36	0.18	-0.18	0.06	0.22	0.26	0.28	0.12	-0.14	-0.17	-0.26
84661	-0.07	-0.17	-0.03	0.01	0.13	0.08	0.01	0.16	0.02	0.03	-0.03	-0.18
85478	-0.24	-0.25	0.17	-0.09	0.2	0.04	-0.08	0.14	0.34	-0.07	-0.15	-0.14
90004	-0.1	-0.16	-0.08	0.03	0.18	0.15	-0.04	0.12	0.04	-0.01	-0.01	-0.17
90821	-0.62	-0.47	0.18	-0.09	-0.15	0.63	0.1	0.38	0.32	-0.2	-0.33	-0.3
92207	-0.15	-0.07	-0.13	0.03	0.18	0.29	0.1	-0.12	-0.02	0.03	-0.08	-0.12
96499	-0.21	-0.33	0.03	-0.2	0.03	-0.04	0.18	0.05	0.17	0.3	-0.03	-0.08
96927	-0.1	-0.34	-0.02	-0.11	-0.02	0.14	0.09	0.13	0.08	0.11	0.06	-0.08
97073	-0.18	-0.34	-0.14	-0.12	0.25	0.17	-0.01	0.1	0.19	0.11	-0.05	-0.12
99855	-0.0	-0.11	-0.16	0.06	0.04	0.06	-0.01	0.25	0.09	-0.03	-0.09	-0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.