Heatmap: Cluster_120 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
2.18 1.42 1.79 1.78 1.6 2.28 1.97 2.34 2.21 1.76 2.32 1.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0
3.0 3.06 3.27 2.53 2.08 2.74 1.98 2.73 3.35 3.03 4.11 2.83
2.73 3.9 4.05 3.73 3.6 3.47 4.82 4.32 3.97 3.55 4.55 3.82
1.08 1.54 1.47 2.1 1.9 1.97 1.98 1.67 1.44 1.25 2.06 1.1
19.47 16.41 19.7 17.79 19.48 18.98 19.86 22.11 21.69 21.21 21.13 19.7
0.18 0.77 0.34 0.5 0.35 0.51 0.59 0.61 0.39 0.45 0.54 0.41
26841.39 26766.1 27789.33 24540.65 24599.68 24073.79 27154.08 24760.45 24129.22 24152.66 24027.99 24728.09
0.32 0.12 0.55 0.12 0.16 0.14 0.15 0.14 0.4 0.15 0.26 0.3
3.58 1.69 3.95 2.23 2.46 2.46 2.0 3.72 3.2 3.55 4.22 3.0
1.11 1.16 1.12 1.64 1.1 1.31 1.99 1.2 1.24 1.6 1.6 1.11
0.32 0.35 0.61 0.74 0.41 0.36 0.57 0.39 0.47 0.43 0.55 0.41
0.72 0.67 0.97 0.75 0.82 0.51 0.63 0.82 0.74 0.48 0.91 0.77
15.38 19.04 20.9 22.09 22.18 23.27 22.6 18.13 20.96 16.39 23.29 18.83
0.39 0.04 0.18 0.31 0.14 0.0 0.28 0.45 0.33 0.16 0.18 0.32
0.21 0.19 0.24 0.4 0.03 0.15 0.25 0.16 0.09 0.27 0.07 0.19
1.86 1.25 1.49 1.65 1.58 1.64 2.06 1.78 1.75 1.31 1.62 2.34
0.07 0.04 0.0 0.0 0.14 0.07 0.11 0.29 0.05 0.02 0.27 0.08
0.75 0.17 0.49 0.58 0.43 0.5 1.09 1.0 0.95 0.79 1.16 0.19
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.12 0.0
0.43 0.57 0.73 0.71 0.4 0.47 0.65 0.39 0.42 0.39 0.71 0.49
9.59 7.96 7.04 9.9 7.27 11.93 11.21 12.95 11.14 10.48 9.48 9.65
0.28 0.08 0.26 0.18 0.08 0.22 0.18 0.29 0.11 0.14 0.24 0.19
0.68 0.28 1.15 0.57 0.9 0.86 0.75 1.47 1.07 0.99 1.12 1.06
2.11 1.21 1.14 1.59 1.82 2.27 1.74 2.06 2.55 3.45 2.88 2.35
0.07 0.07 0.0 0.02 0.03 0.15 0.05 0.02 0.19 0.21 0.18 0.02
3.26 2.12 1.6 2.31 2.12 1.69 2.38 3.08 3.04 3.01 2.63 2.48
0.14 0.44 0.37 0.58 0.22 0.43 0.33 0.31 0.18 0.31 0.27 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
1.11 1.39 1.69 1.72 1.26 1.17 1.41 1.39 0.84 0.81 1.81 0.92
0.0 0.04 0.05 0.06 0.0 0.07 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.04
0.28 0.12 0.22 0.14 0.12 0.31 0.3 0.44 0.37 0.2 0.34 0.24
12.16 12.11 10.91 13.73 11.21 12.86 12.66 11.64 12.88 11.55 12.35 10.78
0.97 1.0 1.37 1.46 0.48 1.07 1.15 0.63 0.56 1.03 1.05 0.64
0.96 0.52 0.34 0.66 0.63 0.37 0.83 1.0 0.75 0.51 0.51 0.86
0.46 0.84 1.31 1.1 0.0 0.84 0.64 0.27 0.32 0.96 1.23 1.33
0.28 0.74 0.09 0.68 0.41 0.28 0.62 1.14 0.51 0.84 1.74 0.41
0.21 0.07 0.0 0.08 0.11 0.32 0.43 0.58 0.82 0.82 0.69 0.33
0.04 0.06 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.04
0.07 0.13 0.16 0.07 0.0 0.05 0.02 0.05 0.07 0.08 0.1 0.13
0.07 0.03 0.07 0.04 0.0 0.15 0.08 0.21 0.09 0.11 0.22 0.1
0.14 0.18 0.0 0.1 0.0 0.0 0.18 0.16 0.12 0.1 0.46 0.22
3.59 3.87 4.06 4.07 4.01 3.67 3.6 5.11 4.3 4.84 4.56 3.9
0.36 0.35 0.4 0.21 0.08 0.49 0.28 0.31 0.21 0.26 0.46 0.32
0.07 0.18 0.22 0.14 0.02 0.34 0.21 0.14 0.1 0.14 0.3 0.37
0.14 0.24 0.18 0.18 0.1 0.04 0.29 0.12 0.11 0.14 0.29 0.17
0.0 0.14 0.0 0.24 0.07 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.31 0.0
0.04 0.08 0.07 0.06 0.35 0.02 0.24 0.67 0.12 0.29 0.49 0.06
0.61 1.66 1.91 2.1 1.44 1.4 1.18 1.85 1.79 1.21 1.64 1.21
0.25 0.54 0.42 0.66 0.28 0.51 0.34 0.47 0.6 0.25 0.42 0.3
0.22 0.34 0.66 0.65 0.42 0.44 0.49 0.8 0.44 0.37 0.82 0.13
1.81 1.05 1.07 0.91 1.27 0.82 1.46 1.5 1.46 1.28 1.9 1.03
0.07 0.12 0.23 0.26 0.1 0.39 0.36 0.16 0.24 0.12 0.28 0.17
0.11 0.15 0.43 0.07 0.09 0.51 0.12 0.62 0.35 0.22 0.71 0.17
1.22 1.47 1.96 1.56 0.95 1.25 1.58 2.77 1.63 1.63 2.75 1.53
8.11 6.94 7.42 6.1 5.45 7.63 7.0 8.06 5.66 7.31 5.49 6.78
18.61 13.11 16.87 13.81 14.52 16.12 14.38 17.78 18.97 15.69 17.12 14.94
1.39 0.55 0.88 0.67 0.7 0.63 0.47 0.82 0.65 0.81 0.91 0.84
0.25 0.75 0.25 1.38 0.7 0.72 1.12 0.89 0.65 0.71 0.69 0.36
1.93 1.01 1.39 0.65 0.28 1.4 0.43 2.04 0.11 0.86 1.5 0.64
0.04 0.17 0.02 0.17 0.05 0.05 0.07 0.14 0.09 0.02 0.04 0.06
1.51 2.59 2.52 3.14 2.3 1.38 3.21 1.58 2.67 1.51 3.93 1.35
4.9 5.43 4.99 6.52 5.25 5.88 5.91 6.22 6.43 5.91 5.92 4.81
13.22 17.2 16.47 16.43 15.49 16.01 14.03 17.94 15.94 17.39 18.39 19.97
0.14 0.73 0.34 0.15 0.0 0.29 0.1 1.24 0.07 0.55 1.95 0.46
2.38 2.25 3.0 3.22 2.74 3.5 4.36 3.48 3.47 2.11 2.24 2.36
0.94 1.46 1.49 1.62 0.07 0.82 1.51 1.71 0.53 1.26 1.48 1.83
19.92 19.78 21.83 18.64 23.83 20.2 20.92 23.12 13.0 18.33 22.02 15.74
2.64 2.2 2.45 2.19 2.44 1.57 2.3 3.07 2.69 3.14 2.32 2.65
185.12 192.72 197.85 193.98 167.16 177.4 171.0 171.82 163.46 177.18 176.61 161.45
0.47 0.79 0.59 0.9 0.64 0.7 1.0 0.76 1.07 0.59 0.84 0.58

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)