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Heatmap: Cluster_45 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.23 -0.15 0.1 0.02 0.23 0.35 -0.19 -0.06 0.13 -0.4 0.19 -0.18
-0.2 -0.55 -0.13 -0.45 0.24 0.55 0.09 0.09 0.59 -0.26 -0.36 -0.14
-0.24 -0.2 0.11 0.02 0.13 0.19 -0.11 0.08 0.15 -0.06 0.01 -0.15
-0.23 -0.37 0.05 -0.3 0.32 -0.16 0.05 0.06 0.34 -0.05 0.21 -0.12
-0.23 -0.36 -0.08 -0.07 0.08 0.01 0.02 0.05 0.41 -0.05 0.13 -0.06
-0.13 -0.35 -0.34 -0.05 0.52 -0.14 -0.1 0.3 0.21 -0.14 0.14 -0.22
0.14 -0.16 -0.56 0.1 0.41 0.05 -0.32 0.11 -0.01 -0.19 -0.08 0.25
-0.22 -0.24 0.08 -0.08 0.26 0.12 -0.17 0.03 0.28 -0.15 0.11 -0.12
-0.0 -0.08 0.04 -0.01 0.02 -0.1 -0.02 0.13 0.17 -0.11 -0.01 -0.07
0.12 -0.18 -0.34 -0.21 0.15 0.49 0.4 -0.02 0.11 -0.35 -0.22 -0.27
-0.17 -0.12 -0.16 0.15 0.16 0.29 -0.27 0.19 0.02 0.04 -0.11 -0.13
0.77 - 0.45 - - - - 1.92 1.1 0.62 -1.22 0.04
-0.1 -0.3 -0.02 -0.08 0.02 0.03 -0.08 0.2 0.14 0.06 0.01 0.06
0.08 -0.11 -0.3 -0.04 0.29 0.24 0.02 -0.13 -0.08 -0.05 -0.06 0.05
0.06 -0.09 -0.23 0.08 0.21 0.06 -0.09 0.12 -0.1 -0.08 0.02 -0.01
-0.71 -0.25 -0.68 0.02 0.71 0.63 0.44 0.27 -0.36 -0.63 -1.19 0.39
0.12 -0.42 -0.16 -0.12 0.32 -0.04 -0.73 0.0 -0.01 0.1 0.46 0.11
-0.34 -1.41 0.21 -0.27 0.46 -0.26 -0.05 0.79 0.22 -0.14 0.32 -0.71
0.11 -2.37 -0.35 0.18 0.69 0.63 -0.95 0.5 -1.1 0.15 0.37 -0.23
-1.74 -0.02 0.48 -0.02 0.84 -0.26 0.0 -0.98 0.38 -0.98 0.43 0.05
-0.43 -0.25 0.07 0.26 0.02 0.28 -0.17 0.07 0.4 -0.09 -0.12 -0.27
-1.2 -0.35 0.14 -0.35 0.31 0.47 -1.03 -0.01 0.99 0.03 -0.22 -0.1
-0.14 -0.13 0.06 -0.31 0.23 -0.08 -0.04 0.3 0.3 -0.49 -0.05 0.14
-0.34 -0.19 0.06 0.34 0.51 0.06 -0.04 -0.54 -0.1 -0.35 0.03 0.19
0.46 0.01 0.12 -0.21 0.2 -0.46 -0.06 -0.01 0.3 -0.1 -0.44 -0.08
0.02 -0.12 -0.46 -0.08 0.18 0.29 0.15 -0.08 -0.06 -0.07 -0.06 0.14
-0.4 -0.95 0.0 -0.3 0.63 0.41 -0.6 0.39 0.34 -0.58 0.65 -0.8
-1.0 -0.49 0.04 0.05 0.65 0.33 -0.41 -0.51 0.64 -0.35 0.25 -0.14
0.45 -1.19 0.1 -1.53 -0.83 -0.0 -0.4 1.4 0.39 -0.32 0.15 -0.71
0.15 -0.27 -0.01 -0.01 0.22 0.09 -0.14 0.19 -0.01 -0.18 0.04 -0.16
-0.13 -1.2 0.18 -0.38 0.22 0.28 -0.51 0.59 0.3 -0.35 0.23 -0.01
0.28 -1.2 0.5 -1.23 0.23 -2.4 0.38 0.53 0.26 -0.34 0.35 0.19
0.2 -0.25 -0.49 -0.01 0.18 0.22 -0.53 0.04 0.25 -0.09 -0.17 0.34
-0.33 -0.31 0.03 -0.11 0.19 0.12 0.06 0.12 0.16 -0.04 0.03 -0.04
-0.26 -0.1 -0.06 -0.36 0.09 0.12 0.15 0.05 0.42 0.08 0.02 -0.35
-0.34 -0.0 -0.06 -0.08 -0.05 -0.09 -0.09 0.3 0.17 0.06 0.11 -0.02
-0.41 -0.05 0.22 0.03 0.18 -0.26 -0.83 0.27 0.52 -0.01 -0.03 -0.09
-0.23 -0.13 -0.33 0.18 0.28 0.09 -0.25 0.17 0.06 -0.11 -0.15 0.25
-0.4 -0.3 -0.0 -0.12 0.09 0.11 -0.02 0.19 0.21 0.01 0.1 -0.01
-0.04 -0.02 -0.17 0.07 0.07 -0.07 -0.21 0.16 0.15 -0.21 -0.06 0.24
-0.0 -0.07 0.02 -0.04 0.01 0.01 -0.09 0.12 0.09 -0.02 0.01 -0.05
0.19 -0.09 -0.07 -0.12 0.16 0.0 -0.01 0.22 0.11 -0.3 -0.06 -0.11
0.57 -0.12 -0.26 -0.4 -0.16 -0.02 -0.34 0.15 0.01 -0.39 0.28 0.3
-0.42 -1.05 -0.05 -0.46 0.1 0.18 -0.36 0.5 0.56 0.29 0.13 -0.16
0.03 -0.04 0.08 -0.1 0.0 0.02 -0.07 0.03 0.04 -0.03 0.02 0.02
0.15 -0.25 -0.39 -0.01 0.42 -0.01 -0.11 0.03 0.05 -0.18 0.09 0.06
0.11 -0.15 -0.02 -0.03 0.15 -0.02 -0.11 0.04 0.17 -0.13 -0.05 -0.01
-0.92 -0.18 -0.82 -0.14 0.54 0.65 -0.09 -0.17 0.32 -0.27 0.22 0.03
-1.72 -1.77 -0.21 -0.5 0.19 0.67 0.04 1.48 0.34 0.08 -0.71 -1.47
0.53 0.12 0.49 -0.17 -0.07 -0.97 -0.42 0.36 0.61 -0.95 -0.06 -0.57
-0.11 -0.41 -0.37 -0.46 0.16 0.39 0.33 0.01 0.43 -0.04 -0.06 -0.22
0.14 -0.12 -0.01 0.19 0.29 0.1 0.05 0.2 -0.29 -0.35 -0.11 -0.26
-0.68 -0.33 0.03 -0.12 0.43 -0.29 0.03 0.16 0.24 0.19 0.14 -0.14
-0.21 -0.09 -0.02 0.08 0.13 0.27 -0.13 -0.06 0.11 -0.1 0.03 -0.09
-0.13 -0.02 -0.1 0.0 0.03 -0.13 -0.15 0.16 0.26 0.06 0.04 -0.09
-0.03 -0.15 -0.07 -0.07 0.18 0.04 0.13 0.14 0.08 -0.15 0.07 -0.22
-0.0 -0.08 -0.15 0.04 0.46 0.02 0.04 -0.01 0.04 -0.19 -0.16 -0.12
0.09 -0.1 0.04 0.01 0.13 -0.13 -0.14 0.05 0.09 -0.08 0.04 -0.03
-0.06 -0.11 -0.01 0.01 -0.01 0.08 -0.09 0.11 0.12 0.01 0.02 -0.08
-0.68 0.07 -0.01 -0.08 0.3 0.51 -0.06 0.05 0.47 -0.37 0.02 -0.82
0.22 -0.28 0.1 -0.36 -0.08 -0.03 0.01 0.24 0.08 -0.03 -0.06 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.