Heatmap: Cluster_117 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.31 -0.54 -0.39 -0.3 0.09 0.1 0.06 0.32 0.25 0.19 0.17 0.08
-0.49 -0.68 -0.32 -0.44 0.25 0.0 0.17 0.46 0.52 0.13 0.04 -0.17
-0.47 -0.73 -0.26 -0.23 0.22 0.42 0.1 0.22 0.31 0.06 0.08 -0.14
-0.27 -0.63 -0.46 -0.29 0.03 0.05 0.06 0.4 0.31 0.26 0.15 0.02
-0.53 -0.56 -0.44 -0.18 0.19 0.17 0.2 0.51 0.32 0.17 -0.1 -0.22
-0.28 -0.34 -0.26 -0.14 0.1 0.08 0.12 0.31 0.27 0.04 0.0 -0.06
-0.39 -0.43 -0.11 -0.11 0.2 0.0 0.13 0.46 0.19 0.05 -0.12 -0.12
-0.34 -0.32 -0.26 -0.1 0.13 0.04 0.16 0.25 0.21 0.12 0.02 -0.06
-0.49 -0.8 -0.13 -0.33 0.31 0.13 0.16 0.52 0.23 0.16 0.03 -0.32
-0.28 -0.15 -0.19 -0.05 0.1 0.04 0.04 0.25 0.12 0.04 0.01 -0.03
-0.39 -0.5 -0.34 -0.03 0.13 -0.16 0.09 0.34 0.26 0.2 0.15 -0.03
-0.63 -0.59 -0.42 -0.15 0.2 -0.3 0.36 0.43 0.15 0.31 0.18 -0.06
-0.16 -0.02 -0.17 0.02 0.11 0.13 0.1 0.19 0.04 -0.02 -0.1 -0.16
-0.5 -0.33 -0.49 -0.16 0.03 0.25 0.42 0.34 0.02 0.29 -0.05 -0.16
-0.24 -0.18 -0.18 -0.01 0.1 0.02 0.17 0.27 0.05 0.05 -0.01 -0.12
-0.78 -0.69 -0.54 -0.29 0.26 0.27 -0.02 0.35 0.49 0.2 0.19 -0.1
-1.09 -0.52 -0.6 -0.21 0.07 0.47 0.66 0.2 0.43 0.29 -0.04 -0.75
-0.49 -0.46 -0.31 -0.12 0.2 0.13 0.08 0.28 0.3 0.11 0.09 -0.09
-0.74 -0.72 -0.35 -0.16 0.21 0.08 0.28 0.47 0.31 0.19 0.06 -0.17
-0.25 -0.26 -0.13 -0.06 0.2 0.02 0.09 0.19 0.14 0.03 0.02 -0.08
-0.45 -0.59 -0.36 -0.16 0.17 0.03 0.21 0.42 0.29 0.13 0.05 -0.1
-0.48 -0.5 -0.25 -0.09 0.24 0.08 0.14 0.37 0.22 0.05 0.05 -0.11
-0.19 -0.22 -0.17 -0.03 0.16 0.0 0.21 0.23 0.11 0.06 -0.06 -0.2
-0.4 -0.42 -0.17 -0.02 0.03 -0.01 0.17 0.29 0.2 0.11 0.07 -0.02
-0.24 -0.28 -0.22 -0.09 0.12 -0.08 0.02 0.27 0.2 0.05 0.1 0.02
-0.59 -0.95 -0.38 -0.3 0.17 0.29 0.16 0.53 0.46 0.24 -0.1 -0.26
-0.36 -0.27 -0.21 -0.09 0.14 0.09 0.2 0.32 0.14 -0.02 -0.02 -0.06
-0.53 -0.46 -0.11 -0.21 0.08 0.17 0.15 0.32 0.32 0.12 0.02 -0.16
-0.42 -0.44 -0.11 -0.12 0.23 0.08 0.22 0.35 0.2 -0.01 -0.06 -0.16
-0.36 -0.38 -0.21 -0.04 0.11 -0.11 0.19 0.38 0.18 0.11 0.04 -0.1
-0.4 -0.4 -0.19 -0.13 0.07 -0.02 0.12 0.38 0.18 0.15 0.04 -0.0
-0.55 -0.66 -0.16 -0.18 0.15 0.22 0.03 0.36 0.29 0.19 0.05 -0.11
-0.46 -0.67 -0.24 -0.21 0.08 -0.19 0.16 0.46 0.36 0.28 0.14 -0.14
-0.36 -0.33 -0.21 0.02 0.1 -0.17 0.09 0.3 0.14 0.17 0.09 -0.01
-0.33 -0.53 -0.39 -0.07 -0.04 0.34 0.46 0.17 0.22 0.25 -0.09 -0.37
-0.36 -0.55 -0.16 -0.33 0.08 0.12 0.07 0.42 0.35 0.12 0.03 -0.1
-0.86 -0.88 -0.26 -0.34 0.08 0.25 0.21 0.53 0.33 0.36 -0.03 -0.13
-0.7 -0.57 -0.38 -0.12 0.27 0.17 0.27 0.42 0.31 -0.04 0.03 -0.14
-3.32 -2.74 -1.22 0.09 0.51 0.37 0.3 0.74 0.69 0.8 -0.46 -0.82
-0.6 -0.7 -0.62 -0.45 0.65 0.55 0.41 0.27 0.32 -0.06 -0.25 -0.44
-0.18 -0.23 -0.07 0.04 0.03 0.04 0.13 0.16 0.1 -0.04 0.01 -0.03
-0.09 -0.36 -0.2 -0.13 0.12 0.0 0.05 0.23 0.18 0.07 0.07 -0.03
-0.08 -0.23 -0.07 0.03 0.08 -0.12 0.09 0.12 0.13 0.0 0.02 -0.02
-0.37 -0.64 -0.33 -0.11 0.15 -0.04 0.07 0.47 0.28 0.17 0.07 -0.06
-0.49 -0.47 -0.29 -0.0 0.15 0.03 0.29 0.45 0.19 -0.08 -0.08 -0.0
-0.18 -0.8 -0.5 -0.3 0.11 -0.1 0.14 0.32 0.38 0.2 0.22 0.06
-0.35 -0.27 -0.32 -0.08 0.08 0.18 0.12 0.28 0.09 0.16 -0.08 0.02
-0.27 -0.59 -0.15 -0.27 0.22 0.26 0.19 0.22 0.13 0.09 -0.01 -0.08
-0.35 -0.38 -0.28 -0.11 0.22 -0.09 0.12 0.34 0.18 0.12 0.08 -0.06
-1.92 -1.2 -0.49 -0.3 0.15 0.0 0.31 0.92 0.7 0.17 -0.02 -0.32
-0.17 -0.4 -0.18 -0.08 0.21 0.06 0.13 0.26 0.14 0.08 -0.07 -0.12
-0.42 -0.37 -0.29 -0.11 0.2 -0.0 0.02 0.22 0.27 0.11 0.15 0.03
-0.4 -0.46 -0.27 -0.16 0.18 0.14 0.19 0.37 0.2 0.05 0.01 -0.1
-3.02 -3.14 -0.79 -0.24 0.56 0.29 0.4 0.79 1.0 0.43 -0.53 -0.85
-0.37 -0.57 -0.19 -0.13 0.3 0.11 0.34 0.28 0.19 0.03 -0.08 -0.22
-0.5 -0.56 -0.54 -0.11 0.23 0.05 0.07 0.36 0.32 0.22 0.09 -0.03
-0.87 -0.67 -0.42 -0.06 0.19 -0.09 0.25 0.48 0.23 0.4 0.14 -0.21
-0.2 -0.26 -0.33 -0.25 0.02 -0.06 0.09 0.2 0.3 0.12 0.17 0.04
-0.45 -0.49 -0.3 -0.18 0.11 0.04 0.29 0.52 0.26 -0.04 0.0 -0.12
-0.48 -0.39 -0.22 -0.1 0.13 0.01 0.14 0.28 0.24 0.15 0.13 -0.11
-0.26 -0.37 -0.15 -0.1 0.13 -0.02 0.08 0.24 0.23 0.04 0.06 -0.01
-0.35 -0.53 -0.28 -0.14 0.09 -0.09 0.12 0.39 0.25 0.19 0.11 -0.03
-0.15 -0.27 -0.08 -0.06 0.14 -0.03 0.08 0.16 0.13 -0.01 0.0 0.03
-0.29 -0.48 -0.3 0.04 0.14 -0.03 0.12 0.3 0.25 0.05 -0.03 0.04
-0.1 -0.45 -0.27 -0.22 0.0 -0.14 0.14 0.26 0.24 0.16 0.18 -0.0
-0.31 -0.65 -0.35 -0.26 0.06 -0.01 0.08 0.39 0.33 0.2 0.17 0.01
-0.31 -0.75 -0.42 -0.19 0.17 0.01 0.1 0.52 0.31 0.07 0.07 0.01
-0.43 -0.92 -0.5 -0.29 0.14 0.31 0.37 0.35 0.33 0.06 0.13 -0.15
-0.27 -0.42 -0.2 -0.02 0.27 -0.08 0.1 0.32 0.17 0.03 0.04 -0.11
-0.58 -0.68 -0.32 -0.13 0.18 0.04 0.2 0.43 0.27 0.22 0.05 -0.1
-0.31 -0.24 -0.18 -0.05 0.14 0.02 0.2 0.28 0.12 0.11 -0.05 -0.17
-0.55 -0.85 -0.49 -0.3 0.02 -0.12 0.17 0.49 0.49 0.2 0.31 -0.01
-0.17 -0.31 -0.17 -0.11 0.13 -0.09 0.06 0.22 0.19 0.09 0.07 -0.01
-0.49 -0.54 -0.24 -0.05 0.22 -0.01 0.1 0.33 0.31 0.11 0.06 -0.1
-0.2 -0.31 -0.04 -0.04 0.02 -0.08 0.06 0.2 0.22 0.01 0.1 -0.02
-0.76 -0.92 -0.72 -0.26 0.43 0.5 0.34 0.38 0.3 0.04 0.04 -0.29
-0.64 -0.6 -0.29 -0.16 0.13 0.05 0.16 0.46 0.34 0.26 -0.03 -0.12
-0.05 -0.27 -0.27 -0.15 0.14 0.1 0.02 0.21 0.2 0.06 0.01 -0.1
-0.19 -0.36 -0.22 -0.16 0.11 -0.02 0.09 0.22 0.23 0.08 0.05 0.05
-0.23 -0.22 -0.07 -0.08 0.09 -0.01 0.22 0.24 0.16 0.02 -0.08 -0.14
-0.57 -0.46 -0.37 -0.22 0.24 0.21 0.21 0.35 0.28 0.22 -0.07 -0.2
-0.1 0.02 -0.18 -0.05 0.06 0.24 0.09 0.14 0.02 -0.07 -0.11 -0.12
-0.37 -0.87 -0.49 0.01 0.66 0.41 0.66 0.22 -0.19 -0.08 -0.29 -0.61
-0.98 -0.71 -0.33 -0.08 0.28 0.12 0.16 0.58 0.32 0.07 -0.03 -0.07
-0.61 -0.54 -0.35 -0.12 0.18 0.24 0.23 0.31 0.32 0.04 0.03 -0.12
-0.64 -0.75 -0.55 -0.34 0.46 0.21 0.28 0.49 0.46 -0.07 -0.06 -0.21
-0.52 -0.54 -0.3 0.0 0.19 0.05 0.29 0.43 0.28 0.06 -0.11 -0.18
-0.72 -0.57 -0.38 -0.15 0.19 0.12 0.2 0.49 0.29 0.1 -0.03 -0.01
-0.37 -0.21 -0.2 0.03 0.2 0.1 0.1 0.19 0.02 0.12 -0.0 -0.08
-0.24 -0.45 -0.09 -0.16 0.17 0.01 0.16 0.22 0.18 0.06 0.06 -0.06
-0.18 -0.21 -0.15 -0.02 0.15 -0.02 0.06 0.12 0.09 0.05 0.07 -0.02
-0.3 -0.57 -0.19 -0.26 0.21 -0.2 0.16 0.28 0.25 0.21 0.15 -0.03
-0.23 -0.32 -0.32 -0.1 0.3 0.15 0.11 0.25 0.1 0.05 -0.01 -0.16
-0.45 -0.18 -0.16 0.03 0.14 0.15 0.13 0.34 0.15 0.06 -0.24 -0.16
-0.34 -0.52 -0.26 -0.09 0.28 0.09 -0.01 0.3 0.22 0.11 0.15 -0.17
-0.5 -0.68 -0.32 -0.21 0.07 0.08 0.13 0.37 0.29 0.24 0.15 0.01
-0.43 -0.62 -0.37 -0.39 0.02 0.3 0.44 0.4 0.35 -0.01 -0.12 -0.06
-0.45 -0.48 -0.4 -0.13 0.27 0.15 0.11 0.3 0.23 0.14 -0.0 -0.02
-0.67 -1.11 -1.1 -0.59 0.27 0.44 0.15 0.64 0.53 0.31 0.14 -0.39
-0.4 -0.42 -0.22 -0.08 0.47 0.44 0.43 -0.03 0.05 -0.03 -0.22 -0.43
-0.35 -0.52 -0.18 -0.17 0.17 0.06 0.15 0.42 0.25 0.11 -0.04 -0.17
-0.4 -0.24 -0.44 -0.04 0.13 0.26 0.18 0.3 0.02 0.14 -0.03 -0.09
-0.29 -0.44 -0.17 -0.14 0.17 0.06 0.13 0.32 0.2 0.1 -0.01 -0.1
-0.22 -0.29 -0.11 -0.07 0.22 0.15 0.13 0.06 0.12 0.05 0.01 -0.15
-0.31 -0.72 -0.67 -0.38 -0.04 0.12 0.23 0.51 0.38 0.24 0.07 0.02
-0.38 -0.3 -0.16 -0.01 0.07 -0.12 0.15 0.25 0.17 0.16 0.08 -0.07
-0.27 -0.49 -0.33 -0.18 0.14 -0.14 0.07 0.3 0.3 0.18 0.21 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.