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Heatmap: Cluster_150 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.45 -0.2 -0.15 -0.16 0.18 -0.13 0.19 0.11 0.13 0.24 0.15 -0.08
-0.11 -1.05 -2.62 -0.73 -0.09 0.47 0.51 0.87 -0.47 0.61 0.1 -0.1
-0.25 -0.2 -0.25 -0.02 0.23 -0.1 0.07 0.15 0.07 0.14 0.09 -0.02
0.12 -0.82 -0.01 -0.18 0.25 -0.28 0.63 0.35 -0.04 0.18 -0.03 -0.85
-0.11 -1.83 -0.82 -0.53 -0.14 -0.11 0.57 0.01 -0.3 0.8 0.33 0.48
-0.98 -0.1 -0.1 -0.16 -0.06 -0.65 0.09 -0.2 0.5 0.66 -0.04 0.3
-0.11 -0.2 0.19 0.17 0.02 0.29 0.06 0.02 -0.21 0.13 -0.13 -0.37
-0.12 -0.37 -0.22 -0.16 0.23 -0.05 0.11 0.18 0.03 0.23 0.04 -0.04
-0.0 -0.35 -0.16 -0.18 0.04 -0.05 0.15 -0.01 0.17 0.08 0.14 0.09
-0.48 -1.08 -1.0 -0.21 0.16 0.45 0.58 -0.02 -0.22 0.43 0.25 0.11
-0.17 -0.3 -0.77 -0.01 0.13 -0.09 0.15 0.37 0.01 0.21 0.25 -0.08
-0.05 -0.06 0.19 -0.05 -0.06 0.16 0.11 0.01 -0.05 0.16 -0.1 -0.35
-0.11 -0.13 -0.15 -0.09 0.02 0.08 0.12 -0.05 -0.04 0.18 0.1 0.02
-0.26 -0.59 -0.57 -0.65 0.78 0.18 0.29 0.34 0.19 0.31 -0.33 -0.57
-0.03 -0.12 0.05 0.03 -0.1 0.19 0.04 0.04 0.01 0.06 -0.13 -0.06
-0.1 -0.14 -0.1 -0.31 -0.12 0.08 0.14 0.12 -0.04 0.28 -0.12 0.19
- -2.12 -2.26 - 2.12 1.95 -0.18 - - 1.3 - -
-0.48 -0.2 -0.65 -0.05 0.44 0.16 0.21 -0.22 0.22 0.38 0.16 -0.44
-0.55 -0.94 -1.24 -0.59 0.81 -0.12 0.91 -0.08 0.51 0.76 -0.2 -2.18
-1.17 -1.99 - -0.7 - -1.67 0.9 0.97 0.43 0.84 0.84 0.7
-0.18 -0.05 -0.36 0.33 0.36 0.05 0.36 0.37 -0.67 0.77 -0.86 -1.53
-1.25 -2.05 0.27 -0.36 0.48 0.84 0.2 0.1 -0.0 0.67 -0.31 -0.87
-0.91 -2.14 -1.5 -0.73 0.75 -0.32 0.09 1.01 -0.13 0.82 0.24 -0.22
-0.32 0.19 0.27 -0.08 -0.06 0.45 0.09 -0.14 -0.17 0.11 -0.06 -0.56
-0.12 -0.3 -0.11 -0.21 0.2 0.11 0.03 0.19 0.02 0.07 0.08 -0.04
-1.21 -3.62 -1.12 -2.34 0.53 0.38 1.04 -0.28 0.47 1.14 0.06 -0.8
-0.01 -0.08 0.04 -0.12 -0.02 0.07 0.23 -0.02 -0.11 0.24 -0.08 -0.21
-0.17 -0.19 -0.28 -0.09 0.02 0.21 0.37 -0.17 0.15 -0.06 0.21 -0.16
-0.43 -0.0 -0.66 -0.66 0.34 0.2 0.11 -0.16 0.01 0.12 0.58 0.03
-1.17 -1.58 -3.8 -1.87 0.7 0.45 0.88 0.35 0.36 0.02 0.71 -0.24
-0.54 -0.38 -0.21 -0.03 0.01 0.05 0.14 0.14 0.14 0.4 0.13 -0.1
-0.1 -0.36 -0.13 -0.0 0.08 -0.02 0.21 0.26 -0.15 0.24 -0.03 -0.12
-0.45 -0.12 -0.53 -0.19 0.56 -0.56 0.36 0.34 0.35 0.2 0.01 -0.61
-0.37 -0.51 -0.1 -0.11 0.42 0.21 0.35 0.06 0.0 0.23 -0.08 -0.45
-0.5 -0.69 -0.18 -0.11 0.21 0.37 0.2 -0.09 0.16 0.5 0.17 -0.58
-1.35 -1.6 -3.1 -1.83 1.17 0.8 0.32 0.26 0.33 0.73 0.12 -1.15
-0.68 -0.63 -1.71 -0.8 1.64 1.06 -1.5 0.11 0.33 -0.27 -0.42 -1.4
-0.71 -0.15 0.13 -0.06 -0.79 0.32 0.04 0.13 -0.32 -0.11 0.66 0.23
0.15 -0.25 -1.09 -0.93 -0.38 0.14 0.27 0.09 -0.08 0.48 0.24 0.48
-2.14 -2.06 -2.11 -0.89 -0.34 0.19 1.25 0.67 -0.33 0.86 -0.09 0.39
- - - -2.94 0.75 0.91 0.3 0.88 -0.35 1.32 -1.33 0.65
-0.24 -0.43 -0.29 -0.52 0.24 0.29 0.35 -0.23 0.26 0.12 0.13 -0.03
-0.63 -0.27 -0.38 -0.07 0.19 0.39 0.48 0.06 0.29 -0.28 0.01 -0.22
-1.71 -0.5 -1.19 -0.03 -0.25 -0.1 0.41 -0.36 0.35 0.51 0.87 0.22
-1.94 -1.95 -2.31 -2.64 0.6 0.38 0.33 0.69 0.16 1.15 0.13 0.02
0.34 -0.47 -2.72 -2.81 0.31 1.04 -2.51 1.72 -2.67 -0.06 -2.68 0.76
-0.38 -0.13 -0.04 -0.19 0.22 -0.23 0.22 0.17 0.02 0.34 0.01 -0.19
-0.65 -0.06 -1.6 0.27 0.43 -0.1 0.32 0.77 -1.02 0.73 -0.2 -0.73
-0.23 0.06 -0.23 -0.06 0.14 -0.07 0.01 -0.09 0.1 0.1 0.22 -0.02
-1.02 -1.18 -1.02 -1.44 0.11 -0.52 0.44 1.3 0.35 0.44 0.34 -0.48
0.07 -0.53 -0.68 -0.09 0.14 -0.14 0.17 0.06 0.07 0.29 0.28 0.04
-0.12 -0.16 -0.41 -0.06 0.13 -0.06 -0.12 0.16 0.37 0.19 0.06 -0.14
- - -3.93 -2.55 0.83 -0.19 1.01 0.61 1.11 1.26 -0.74 -1.28
-0.84 -0.52 -0.9 -0.51 -0.27 0.76 -0.61 0.65 -0.28 0.61 0.1 0.41
-0.1 -0.02 -0.78 0.33 0.73 0.01 0.43 -0.38 -0.62 -0.5 -0.37 0.4
0.15 -3.01 -1.55 -0.12 0.53 0.26 0.93 0.27 -0.62 0.9 -0.82 -0.61
-1.54 -0.22 0.86 -0.02 0.11 0.83 0.27 0.21 -0.48 0.05 -0.48 -1.69
-0.45 -0.2 -0.31 -0.05 0.48 -0.21 0.39 0.05 -0.02 0.09 0.09 -0.15
-1.65 -1.65 0.62 -0.14 0.17 0.71 0.64 -0.22 -0.07 0.63 -0.28 -1.24
-0.22 -0.35 -0.66 -0.15 0.25 -0.09 0.27 0.16 0.21 0.26 0.16 -0.16
-0.15 -0.33 -0.01 -0.11 0.29 0.11 0.23 0.14 -0.01 0.06 -0.09 -0.28
-0.04 -0.12 -0.15 -0.24 0.15 -0.18 -0.08 0.11 0.25 0.13 0.04 0.03
-0.37 -1.48 -1.28 -1.86 0.75 0.87 0.19 0.57 0.04 -0.07 0.36 -0.34
-0.13 0.18 -0.95 0.06 1.02 -0.25 0.25 -0.16 -0.2 -0.37 -1.23 0.44
-0.18 -0.3 -0.02 -0.17 -0.01 0.36 0.24 -0.03 0.08 0.15 -0.05 -0.21
-0.22 -0.22 0.16 0.02 -0.23 0.55 0.25 0.18 -0.31 -0.01 -0.18 -0.27
-0.1 -0.17 -0.07 -0.1 0.04 0.0 -0.0 0.19 0.26 0.01 -0.07 -0.05
-0.15 -0.23 0.13 0.08 -0.15 0.31 0.05 0.01 -0.28 0.09 0.05 -0.02
-0.17 0.04 0.26 0.06 -0.11 0.12 -0.02 -0.04 -0.06 -0.04 -0.03 -0.09
-0.34 -0.19 0.01 -0.12 0.07 0.11 0.11 0.2 0.11 0.31 -0.03 -0.4
-0.24 -0.43 -0.39 -0.13 0.17 0.1 -0.1 -0.05 -0.05 0.23 0.34 0.29
-0.9 -0.77 -2.14 -1.07 0.77 0.5 0.78 0.27 0.24 0.05 0.16 -0.32
-0.11 -0.77 -0.14 -0.45 0.2 0.74 -0.07 0.11 -0.55 0.38 -0.25 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.