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Heatmap: Cluster_111 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.05 -0.17 0.08 -0.11 0.0 0.05 0.06 0.0 0.1 0.04 0.06 -0.2
0.01 -0.67 -0.11 -0.15 0.35 -0.22 0.15 0.31 -0.09 -0.06 0.04 0.16
0.31 -0.54 0.46 0.39 -0.29 -0.19 -0.75 -0.09 0.68 -0.5 0.5 -1.22
0.04 -0.19 0.09 -0.25 0.09 -0.01 -0.2 0.07 0.12 0.03 0.23 -0.12
-0.2 -0.07 0.29 0.04 -0.09 0.09 -0.05 -0.13 0.08 -0.25 0.18 0.01
-0.13 0.17 0.21 0.1 -0.08 0.13 -0.12 -0.28 -0.14 -0.11 0.04 0.13
-0.52 -0.95 0.03 -0.79 -0.53 0.72 0.71 -0.25 0.63 -0.74 0.7 -0.76
-0.56 -0.54 0.56 -0.81 -0.03 -0.19 -0.04 -0.18 0.26 0.26 0.49 0.1
-1.18 0.16 1.18 -0.2 -0.17 0.92 0.53 -0.27 -0.63 -0.41 -0.46 -2.95
-0.06 0.07 -0.2 0.06 -0.19 0.21 0.08 -0.28 0.14 -0.04 0.28 -0.19
0.07 0.06 -0.21 0.04 -0.12 0.08 0.17 -0.17 -0.07 -0.01 0.11 -0.0
-0.53 -0.03 0.65 0.05 -0.63 -0.15 0.4 0.35 0.37 -0.36 0.07 -1.13
-0.09 0.03 0.27 -0.15 -0.1 -0.32 -0.1 -0.03 0.24 -0.09 0.32 -0.14
-0.1 -0.45 0.06 -0.04 0.11 -0.2 -0.27 -0.08 0.23 0.13 0.18 0.26
0.22 -0.38 0.17 0.07 -0.19 -0.28 -0.06 0.05 0.19 -0.42 0.27 0.14
-2.27 -1.18 0.49 0.14 -1.14 0.57 0.19 0.37 -0.74 0.83 0.45 -0.46
-0.34 -0.06 0.18 0.06 -0.1 0.15 0.06 0.16 -0.02 -0.12 0.16 -0.21
0.02 -0.49 0.09 -0.06 0.0 0.15 -0.09 -0.01 0.21 -0.27 0.27 0.02
-0.0 0.19 0.14 0.07 0.04 0.44 0.1 0.01 -0.2 -0.24 -0.33 -0.46
-0.07 0.1 0.44 0.23 -0.08 0.03 0.12 0.0 -0.18 -0.56 -0.07 -0.2
-2.16 -0.05 0.17 -0.66 -0.25 -0.2 0.16 0.48 0.23 -0.76 1.03 0.05
-1.17 -0.56 1.16 -0.78 -0.46 -1.43 -0.31 -0.22 -0.12 -0.19 1.09 0.45
-0.76 -0.32 0.35 0.15 -0.3 0.44 0.52 0.03 -0.22 -0.17 0.12 -0.37
0.05 -0.44 0.31 0.15 -0.17 0.29 -0.28 0.13 0.09 -0.25 0.08 -0.17
-0.16 0.13 0.43 0.08 0.04 -0.13 0.17 -0.02 -0.22 -0.11 -0.13 -0.23
-0.06 -0.09 0.15 -0.19 0.42 0.05 -0.29 -0.01 -0.04 -0.23 0.2 -0.05
0.82 -0.54 0.78 0.27 -0.69 -0.7 -1.27 -0.8 0.35 -1.0 0.11 0.62
0.03 -0.02 0.13 -0.01 -0.01 0.08 -0.03 -0.24 -0.03 -0.1 0.08 0.1
0.25 0.13 0.37 0.29 0.04 0.47 -0.01 -0.18 -0.38 -0.56 -0.2 -0.74
0.3 -0.22 0.92 -0.47 0.35 -0.03 -0.39 -1.45 0.1 -1.17 0.59 -0.16
-1.12 -1.93 -0.06 -0.33 0.94 -0.06 0.38 -0.18 0.28 -0.86 0.68 0.13
-1.91 -0.83 0.59 -0.26 0.4 0.14 0.13 -0.09 0.39 -0.75 0.56 -0.01
-0.5 0.03 0.16 0.09 -0.06 0.35 0.16 0.42 -0.4 0.05 -0.46 -0.18
-0.74 0.49 0.37 0.43 0.11 0.24 -0.1 -0.27 -0.76 -0.5 -0.19 0.21
-0.44 -0.58 0.15 0.64 0.03 -0.18 0.41 0.47 -0.48 -0.36 0.04 -0.36
-0.94 -0.9 0.28 0.28 -0.74 0.63 0.05 -0.12 0.6 -0.16 0.22 -0.26
-0.53 -0.04 0.37 0.32 0.21 0.31 -0.37 0.07 -0.22 -0.19 -0.24 -0.0
-0.41 -0.81 0.35 -1.72 0.7 0.6 -0.65 0.24 -1.74 -1.75 1.52 -0.55
-0.14 -0.25 0.13 -0.0 -0.23 0.16 0.03 -0.03 0.02 -0.01 0.21 0.05
0.05 -0.2 -0.05 -0.07 0.07 0.02 -0.16 -0.08 -0.02 0.17 0.09 0.13
-0.23 -0.08 0.18 0.11 -0.3 0.12 0.05 -0.05 0.07 -0.11 0.27 -0.14
-0.21 -0.31 0.38 -0.16 0.32 -0.18 -0.23 0.01 0.37 -0.76 0.25 0.1
-0.14 -0.55 0.32 0.05 -0.16 -0.94 0.02 0.46 0.18 -0.39 0.27 0.29
-0.17 -0.05 0.29 -0.1 0.18 -0.15 0.05 -0.16 0.02 -0.12 0.16 -0.05
-1.0 -0.48 0.39 0.06 0.32 -0.81 0.54 -0.06 0.53 -0.2 0.27 -0.59
-0.16 -0.33 0.1 -0.08 -0.12 -0.06 0.12 0.03 -0.02 0.07 0.17 0.2
-0.1 -0.19 0.16 -0.04 0.18 0.09 0.04 -0.14 0.13 -0.19 0.17 -0.22
-0.22 -0.48 0.67 -0.4 0.21 -2.7 -1.41 0.33 0.85 -1.85 0.69 0.52
-0.04 -0.27 0.35 -0.78 0.15 -0.26 -0.04 -0.17 0.01 0.1 0.4 0.18
0.07 0.31 -0.02 0.08 0.0 0.48 -0.46 -0.65 -1.4 0.07 0.56 0.0
0.03 0.05 -0.04 -0.1 0.16 -0.4 -0.11 -0.09 0.12 -0.03 0.18 0.12
-0.2 0.02 0.05 0.08 -0.09 0.03 0.03 -0.3 0.16 0.08 0.23 -0.18
0.35 0.58 0.17 -0.18 -0.27 0.58 -0.63 -0.97 -0.63 -0.44 0.24 0.24
-0.32 0.05 -0.01 0.19 -0.09 0.1 -0.08 -0.21 0.2 0.05 0.24 -0.24
0.35 -0.79 0.62 -0.02 0.29 -0.15 0.06 -0.51 0.19 -0.45 0.32 -0.67
-0.72 -0.21 0.71 -0.27 -0.26 0.43 -0.54 0.31 0.08 -0.34 0.13 0.03
-0.1 -0.42 0.25 -0.24 0.17 -0.46 -0.37 -0.1 0.52 -0.19 0.38 0.16
-0.51 0.4 -0.19 -0.3 -0.15 0.19 0.62 -0.27 -0.14 -0.65 0.7 -0.48
-0.25 -0.03 0.38 0.17 -0.39 0.02 0.28 0.08 -0.08 0.26 -0.21 -0.52
-0.25 -0.23 0.84 -0.17 -0.12 0.21 -0.3 -0.01 0.22 -0.23 0.12 -0.66
0.19 -0.19 0.08 -0.24 0.1 -0.13 -0.34 -0.13 0.28 0.14 0.1 0.01
-0.31 0.15 0.06 -0.26 0.9 -0.41 0.24 0.25 -1.35 -0.44 0.24 -0.13
-0.13 0.14 0.34 0.16 -0.21 0.24 0.15 -0.22 -0.45 0.11 -0.05 -0.32
-0.24 -0.26 0.43 0.06 0.03 0.09 0.18 -0.01 0.04 -0.02 -0.08 -0.41
0.07 -0.36 0.23 -0.0 0.04 -0.25 0.04 0.13 0.19 0.01 -0.08 -0.14
-0.09 -0.14 0.24 0.03 0.02 0.0 0.02 -0.02 0.1 -0.13 0.04 -0.12
-0.03 -0.1 0.3 -0.07 0.05 0.04 -0.18 -0.2 0.37 -0.23 0.22 -0.38
-0.51 -0.15 -0.12 0.05 -0.07 0.01 -0.01 -0.19 0.34 0.2 0.37 -0.13
-0.44 0.1 -0.41 -0.39 0.11 1.05 -0.53 0.1 -0.74 -0.15 0.14 0.22
-0.14 -0.22 0.05 0.06 -0.27 -0.21 -0.07 -0.24 0.14 0.34 0.38 -0.01
-0.24 0.09 0.06 0.05 -0.16 -0.05 -0.08 -0.19 0.03 0.16 0.24 0.01
-0.42 0.25 0.56 -1.32 -0.98 -0.17 0.66 0.53 -0.62 -0.31 0.46 -0.12
-0.08 -0.19 -0.04 -0.07 -0.03 -0.15 -0.08 0.12 0.26 -0.16 0.15 0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.