Heatmap: Cluster_72 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.99 0.82 0.94 0.88 0.77 0.87 0.82 0.86 0.84 0.92 1.0 0.88
0.57 0.27 0.48 0.17 0.33 0.75 0.73 0.75 1.0 0.83 0.44 0.83
1.0 0.94 0.67 0.77 0.76 0.58 0.72 0.86 0.93 0.58 0.89 0.91
0.9 0.7 0.57 0.72 0.57 0.63 0.75 0.96 0.76 0.84 1.0 0.97
0.0 0.58 0.0 0.2 0.1 0.29 0.26 0.09 0.07 0.08 0.9 1.0
0.95 0.88 0.83 0.89 0.92 0.86 0.93 1.0 0.85 0.86 0.96 0.98
0.0 0.27 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.3 1.0 0.66
0.67 0.39 0.16 0.36 0.22 0.0 1.0 0.77 0.83 0.57 0.34 0.59
0.9 0.74 0.69 0.55 0.57 0.74 0.54 0.6 0.71 0.61 0.96 1.0
0.78 0.8 0.83 0.84 0.91 0.76 0.86 1.0 0.87 0.84 0.88 1.0
0.84 0.75 0.4 0.65 0.37 0.44 0.94 1.0 0.2 0.31 0.55 0.66
0.0 0.47 0.19 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.45 0.0 0.0 0.44 0.86 0.12 0.0 1.0 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.86 0.7 0.75 0.86 0.91 0.84 0.93 1.0 0.84 0.9 0.79 0.78
0.78 0.85 0.78 0.76 0.84 0.86 0.82 1.0 0.9 0.85 0.83 0.95
0.81 0.75 0.73 0.82 0.91 0.74 0.58 0.83 0.9 0.76 0.94 1.0
0.96 0.93 0.84 0.98 0.81 0.77 0.82 0.99 0.97 0.97 0.88 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.93 0.98 0.9 0.87 1.0 0.8 0.88 0.97 0.9 0.95 0.9 0.98
1.0 0.55 0.61 0.49 0.44 0.36 0.55 0.87 0.73 0.71 0.75 0.72
0.94 0.97 0.91 0.8 0.86 0.69 0.67 0.85 0.81 1.0 0.86 0.93
0.94 0.83 0.85 0.91 0.93 0.99 0.84 0.88 0.91 0.94 1.0 0.79
0.93 0.7 0.91 0.8 0.86 0.85 0.77 0.86 0.89 0.78 1.0 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.0
0.37 0.45 0.96 0.86 0.68 1.0 0.8 0.82 0.99 0.67 0.64 0.84
0.78 0.65 0.63 0.76 1.0 0.55 0.92 0.79 0.64 0.73 0.83 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.95
0.0 0.0 0.08 0.0 0.25 0.47 0.0 0.78 0.68 0.58 0.35 1.0
0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 1.0 0.0 0.95
0.85 0.96 0.89 0.89 0.62 0.91 0.84 0.83 0.95 0.85 0.95 1.0
0.32 0.15 0.0 0.35 0.08 0.0 0.33 0.37 0.0 0.19 1.0 0.86
0.78 0.56 0.26 0.57 0.25 0.78 0.84 0.81 0.82 0.83 0.74 1.0
0.25 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.17 0.0 1.0 0.14 0.0 0.6
0.78 0.81 0.83 0.76 0.81 0.83 0.72 0.81 0.92 0.81 1.0 0.96
0.0 0.13 0.0 0.6 0.0 0.0 0.15 0.13 0.0 0.0 1.0 0.41
0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.58
0.0 0.17 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.39 0.14 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.46 0.55 0.52 0.68 0.93 0.96 0.94 0.7 0.6 1.0 0.77 0.92
0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.54 1.0 0.57
0.12 0.42 0.0 0.11 0.36 0.22 0.58 0.37 0.65 0.07 0.76 1.0
0.34 0.17 0.12 0.34 0.17 0.27 0.56 0.78 1.0 0.33 0.31 0.1
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.72 0.65 1.0
0.9 0.86 0.79 0.9 0.73 0.89 0.82 0.78 0.8 0.84 1.0 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 1.0
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.17 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.87 0.91 0.84 0.83 0.87 0.76 0.83 1.0 0.88 0.84 0.78 0.94
0.69 0.62 0.46 0.61 0.64 0.48 0.69 0.88 0.61 0.69 0.84 1.0
0.91 0.19 0.0 0.36 0.64 1.0 0.57 0.73 0.0 0.73 0.93 0.74
0.7 0.4 0.24 1.0 0.3 0.48 0.68 0.57 0.44 0.72 0.91 0.71
0.1 0.48 0.0 0.21 0.16 0.0 0.35 0.45 0.49 0.51 0.24 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.14 0.15 0.71 1.0
1.0 0.46 0.55 0.66 0.59 0.18 0.49 0.6 0.26 0.35 0.68 0.66
0.99 0.51 0.34 0.69 0.61 0.37 0.71 1.0 0.2 0.24 0.77 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 1.0 0.0 0.46 0.18 0.0 0.25 0.63 0.54 0.2 0.38 0.87
0.9 0.79 0.67 0.97 1.0 0.95 0.82 0.9 0.95 0.79 0.93 0.82
0.16 0.41 0.07 0.57 0.0 0.0 0.21 0.36 0.07 0.18 1.0 0.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.76 0.79 0.64 0.8 1.0 0.81 0.8 0.9 0.97 0.77 0.95 0.68
0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.16 0.25 0.34 0.08 0.11 1.0 0.3 0.8 0.58 0.19 0.39 0.69
0.36 0.41 0.59 0.6 0.25 0.83 0.76 0.62 0.84 0.65 1.0 0.81
0.0 0.75 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.43 0.0 0.4 1.0 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.94 0.0 1.0
0.65 0.77 0.48 0.91 0.84 1.0 0.72 0.78 0.66 0.65 0.63 0.61
0.14 0.58 0.07 0.54 0.05 0.51 0.44 0.48 0.89 0.2 0.58 1.0
0.78 0.23 0.3 0.34 0.1 0.84 0.36 0.36 0.0 0.62 1.0 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.17 0.3 0.16 0.17 0.31 0.38 0.11 0.87 0.31 0.25 0.12 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.15 0.43 0.18 0.46 0.54 0.18 0.65 0.52 1.0 0.55 0.39 0.56
0.55 0.62 0.41 0.44 0.47 0.48 0.61 1.0 0.84 0.46 0.77 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 1.0
0.56 0.82 0.24 0.35 0.07 0.29 0.23 0.27 0.74 0.31 1.0 0.56
0.72 0.79 0.84 0.77 0.77 0.74 0.78 0.8 0.93 0.86 1.0 0.85
0.58 0.99 0.04 0.09 0.16 0.63 0.48 0.61 0.24 1.0 0.74 0.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59
1.0 0.68 0.8 0.65 0.87 0.77 0.66 0.86 0.8 0.82 0.91 0.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.75 0.74 0.6 0.7 0.73 0.69 0.7 0.66 0.78 0.85 1.0 0.91
0.33 0.67 0.17 0.28 0.05 0.31 0.42 0.46 1.0 0.18 0.82 0.44
0.97 0.79 0.7 0.68 0.61 0.64 0.47 0.5 0.63 0.79 0.81 1.0
0.0 0.0 0.1 0.17 0.27 1.0 0.1 0.84 0.82 0.57 0.18 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.43 0.73 0.43 0.65 0.44 0.85 0.68 0.82 0.66 0.51 0.76 1.0
0.97 0.93 0.96 0.95 0.92 1.0 0.96 0.96 0.96 0.95 0.95 0.96
1.0 0.59 0.4 0.54 0.34 0.57 0.36 0.39 0.41 0.41 0.67 0.47
0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.72 0.0 0.0 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)