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Heatmap: Cluster_76 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.67 0.18 0.1 -0.33 -0.44 -0.26 -0.59 -0.08 0.01 0.05 0.09 0.15
0.22 0.11 -0.17 -0.04 0.05 -0.28 -0.3 -0.14 0.05 0.03 0.16 0.2
0.33 0.09 0.05 -0.0 0.09 -0.21 -0.41 -0.18 -0.06 -0.08 0.11 0.14
-0.12 -0.08 0.0 -0.12 -0.18 -0.12 -0.25 -0.05 0.24 0.19 0.24 0.14
0.64 0.4 0.3 -0.33 -0.3 -0.13 -0.49 -0.49 -0.34 0.15 -0.47 0.41
0.59 0.32 -0.19 0.02 0.08 -0.25 -0.56 -0.07 -0.28 -0.24 0.06 0.16
0.46 0.25 -0.06 -0.02 0.06 -0.09 -0.2 -0.06 -0.05 -0.13 -0.13 -0.17
0.4 0.16 -0.08 -0.08 -0.12 -0.2 -0.15 -0.08 0.06 -0.06 0.03 0.01
0.35 -0.02 -0.19 -0.13 0.09 -0.28 -0.3 -0.16 0.08 0.04 0.15 0.21
0.77 0.02 -0.11 -0.23 -0.29 -0.62 -0.37 -0.07 0.14 -0.05 0.18 0.15
0.62 0.1 -0.13 -0.2 -0.15 -0.56 -0.23 -0.05 -0.07 0.0 0.16 0.17
0.47 -0.0 -0.02 -0.09 -0.06 -0.27 -0.22 -0.07 -0.05 -0.0 0.07 0.11
0.06 -0.09 0.0 -0.05 -0.03 -0.05 -0.25 -0.07 0.12 0.17 0.13 0.01
-0.16 -0.17 0.09 -0.11 -0.09 -0.3 -0.27 -0.14 0.24 0.23 0.29 0.2
0.19 -0.02 0.0 0.01 0.05 -0.21 -0.21 -0.04 -0.03 0.03 0.13 0.04
0.58 0.05 -0.12 -0.2 -0.31 -0.27 -0.19 -0.14 0.19 0.02 0.14 -0.01
0.12 0.04 0.04 -0.03 -0.06 -0.17 -0.15 -0.02 0.08 -0.0 0.02 0.09
0.03 -0.14 0.03 -0.02 -0.09 -0.19 -0.24 0.13 0.14 0.06 0.13 0.1
0.09 0.2 0.01 -0.02 -0.01 -0.18 -0.14 -0.05 -0.05 0.05 -0.0 0.07
0.28 0.01 0.14 -0.09 -0.26 0.07 -0.43 -0.19 -0.06 0.07 0.19 0.11
0.49 0.11 0.01 -0.05 0.04 -0.36 -0.41 -0.08 -0.05 0.0 0.03 0.09
0.25 0.18 0.04 -0.03 0.07 -0.33 -0.11 -0.01 -0.1 -0.09 0.02 0.03
0.04 0.08 -0.01 0.06 -0.03 0.02 -0.16 -0.06 0.02 0.01 0.03 -0.01
0.48 -0.02 0.15 -0.11 0.08 -0.25 -0.18 -0.11 -0.11 -0.11 -0.04 0.06
0.1 0.12 0.07 0.07 -0.07 -0.07 -0.15 -0.05 0.0 -0.02 0.02 -0.04
0.17 0.02 -0.07 0.05 0.02 -0.27 -0.14 0.04 0.01 -0.0 0.08 0.04
0.17 -0.07 -0.11 -0.4 -0.03 -0.34 -0.42 -0.03 0.27 0.28 0.19 0.24
0.34 0.33 0.46 -0.03 -0.17 -0.38 -0.61 -0.85 0.28 -0.08 0.22 -0.08
0.19 0.04 -0.1 -0.02 -0.08 -0.16 -0.24 -0.18 0.0 0.07 0.24 0.15
0.79 0.01 0.63 -0.17 -0.37 -0.44 -0.66 -0.65 -0.07 -0.03 -0.06 0.21
0.19 0.26 0.35 -0.12 0.11 -0.22 -0.24 -0.3 -0.16 -0.11 0.08 0.0
0.29 0.16 0.06 0.05 0.03 -0.25 -0.41 -0.12 -0.09 -0.04 0.1 0.09
0.75 0.11 -0.06 -0.44 0.14 -0.57 -0.45 -0.16 0.01 -0.09 0.06 0.21
0.28 0.3 -0.12 0.07 -0.02 -0.35 -0.37 -0.15 -0.14 0.02 0.17 0.12
0.57 0.22 0.48 0.24 -0.02 -0.76 -0.48 -0.26 -0.2 -0.15 -0.13 -0.05
0.12 0.04 -0.02 -0.03 -0.04 -0.07 -0.23 -0.08 0.08 0.01 0.11 0.06
0.5 0.18 0.04 -0.06 -0.17 -0.19 -0.47 -0.11 -0.06 -0.11 0.09 0.14
0.16 -0.03 -0.19 -0.01 0.12 -0.05 -0.16 0.02 0.06 -0.02 0.06 -0.02
0.35 0.11 -0.11 -0.01 -0.39 -0.1 -0.54 -0.38 0.04 0.12 0.3 0.29
-0.08 -0.4 -0.08 -0.25 0.0 -0.3 -0.58 0.18 0.4 0.24 0.12 0.4
0.68 0.19 0.17 -0.19 -0.26 -0.65 -0.23 -0.38 0.05 0.1 -0.04 0.12
0.14 0.02 -0.03 0.03 0.09 -0.11 -0.28 0.01 0.07 -0.03 0.05 0.0
0.52 0.47 0.1 0.09 -0.58 -0.5 -0.67 -0.19 -0.15 -0.19 0.07 0.41
0.21 0.78 -0.07 -0.14 -0.1 -0.72 -0.69 -0.32 -0.16 -0.15 0.16 0.47
0.43 -0.24 0.37 -0.11 0.01 -0.56 -0.6 -0.09 0.06 0.19 0.0 0.16
0.18 0.04 -0.13 0.0 0.07 -0.05 -0.22 0.09 0.08 -0.07 -0.06 0.03
1.07 0.61 0.64 -0.35 -0.8 -0.11 -0.88 -0.59 -0.42 -0.38 -0.1 -0.21
0.28 0.08 -0.01 0.0 -0.18 -0.1 -0.37 -0.27 -0.03 0.06 0.23 0.16
0.05 -0.2 -0.11 -0.24 -0.03 -0.11 -0.22 0.03 0.2 0.03 0.26 0.23
0.56 -0.37 -0.54 -0.28 -0.05 -0.17 -0.77 -0.33 0.26 -0.05 0.54 0.48
0.2 0.13 0.11 0.02 -0.07 -0.07 -0.14 -0.2 -0.08 -0.06 0.07 0.04
-0.0 -0.06 0.11 -0.17 -0.02 -0.3 -0.38 0.0 0.26 0.15 0.13 0.14
0.98 0.31 0.26 -0.18 -0.14 -0.39 -1.25 -0.55 -0.2 -0.05 0.17 -0.02
0.24 0.07 0.06 -0.03 -0.01 -0.2 -0.26 -0.05 0.05 0.03 0.01 0.04
0.34 0.06 0.26 -0.11 -0.04 -0.37 -0.47 0.0 -0.07 -0.01 -0.01 0.22
0.73 0.03 -0.02 -0.21 -0.44 -0.32 -0.33 -0.05 0.2 -0.02 0.12 -0.07
0.11 0.08 0.14 -0.21 -0.24 -0.62 -0.59 0.07 0.28 0.12 0.19 0.31
0.14 0.0 0.07 0.03 0.14 -0.13 -0.21 -0.08 -0.06 -0.06 0.11 -0.0
1.2 -0.22 0.3 -0.5 0.46 -0.88 -1.53 -0.48 -0.41 -0.69 -0.01 0.64
0.14 0.05 -0.05 0.09 0.01 0.14 -0.16 0.07 0.02 -0.21 -0.07 -0.06
0.15 0.11 -0.0 -0.0 -0.01 0.07 -0.25 -0.08 0.11 -0.08 0.01 -0.08
0.01 -0.07 -0.08 -0.15 -0.01 -0.23 -0.21 -0.04 0.24 0.09 0.23 0.13
0.17 0.05 -0.02 0.01 0.04 -0.09 -0.09 -0.05 -0.02 -0.03 0.03 -0.02
0.47 0.16 0.04 -0.1 -0.12 -0.39 -0.22 -0.16 0.07 -0.02 0.05 0.04
0.19 -0.01 -0.13 -0.03 0.06 -0.07 -0.18 0.05 0.11 -0.05 0.05 -0.02
0.42 0.2 -0.08 -0.07 0.06 -0.28 -0.24 -0.03 -0.05 -0.12 -0.08 0.13
0.74 0.15 0.1 -0.14 0.1 -0.33 -0.65 -0.25 -0.21 -0.14 0.07 0.1
0.13 -0.07 -0.06 0.01 -0.05 -0.22 -0.28 -0.12 0.01 0.08 0.27 0.21
0.42 0.24 0.09 -0.06 -0.23 -0.23 -0.36 -0.39 -0.07 -0.19 0.12 0.38
0.21 0.04 -0.01 -0.01 -0.04 -0.19 -0.09 -0.14 0.04 -0.08 0.14 0.08
0.42 0.07 0.03 -0.03 -0.07 -0.36 -0.3 -0.15 -0.03 0.05 0.12 0.1
0.44 -0.03 0.17 -0.28 -0.06 0.17 -0.28 -0.2 -0.14 -0.12 0.26 -0.15
0.37 0.21 0.12 -0.09 -0.09 -0.09 -0.38 -0.28 -0.05 0.04 0.06 0.01
0.17 0.29 -0.04 -0.05 0.02 -0.42 -0.15 -0.14 -0.01 -0.01 0.06 0.17
0.05 -0.36 -0.59 -0.25 -0.25 -0.42 -0.55 -0.08 0.72 0.25 0.46 0.32
0.08 0.05 0.01 -0.04 0.04 0.06 -0.14 -0.07 0.01 -0.02 0.04 -0.05
0.36 0.21 0.07 -0.03 -0.1 -0.17 -0.18 -0.21 -0.29 0.08 0.01 0.11
0.42 -0.07 0.42 -0.12 -0.19 -0.01 -0.17 -0.37 -0.15 -0.13 0.06 0.08
0.34 -0.03 0.13 -0.08 -0.01 -0.14 -0.17 -0.08 -0.06 -0.08 0.05 0.05
0.08 -0.23 0.01 -0.05 -0.02 -0.23 -0.02 0.15 0.09 0.05 0.06 0.04
0.07 0.03 0.04 -0.01 -0.06 -0.25 -0.23 0.03 0.08 0.05 0.06 0.14
0.42 0.35 -0.25 -0.03 0.06 -0.27 -0.47 -0.24 -0.08 -0.08 0.15 0.17
0.09 0.03 -0.01 -0.05 0.01 -0.14 -0.33 0.09 0.08 -0.03 0.1 0.09
0.31 0.13 0.2 0.04 -0.01 -0.4 -0.19 -0.08 -0.03 -0.13 0.13 -0.11
0.36 0.22 0.26 -0.01 -0.21 -0.17 -0.34 -0.04 -0.1 -0.13 -0.05 0.04
0.16 0.03 -0.12 0.04 0.0 -0.27 -0.28 0.03 0.04 0.1 0.11 0.08
0.25 0.23 0.08 -0.02 -0.17 -0.3 -0.3 -0.14 -0.07 0.05 0.19 0.07
0.32 0.15 0.11 0.09 0.09 -0.32 -0.25 -0.21 -0.06 -0.15 0.04 0.04
0.45 0.08 0.19 -0.15 -0.05 -0.2 -0.39 -0.1 0.01 -0.11 0.03 0.06
0.11 0.24 -0.01 0.01 0.03 -0.19 -0.27 -0.27 -0.06 0.09 0.1 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.