Heatmap: Cluster_24 (HCCA clusters)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
100032	0.23	-0.45	0.86	-0.3	-0.43	-0.29	-0.23	-0.12	-0.19	0.14	0.23	-0.03
101113	0.17	0.15	0.5	-0.21	0.13	-0.22	0.02	-0.5	-0.05	-0.19	0.18	-0.26
102495	-2.8	0.11	1.72	0.16	0.56	-1.53	-1.12	-1.62	-1.53	-1.28	0.31	0.8
111378	-1.53	-1.67	2.28	-0.94	-	-	-1.43	-2.33	-	1.55	0.9	-0.75
112505	0.32	-0.36	0.31	0.0	-0.21	-0.42	-0.57	0.07	-0.0	0.19	0.18	0.18
126973	1.13	-1.57	2.22	-0.35	-	0.39	-	-	-0.5	0.73	-1.48	-
127526	0.02	-0.22	0.2	-0.01	0.22	-0.18	-0.12	-0.02	-0.11	0.26	0.02	-0.16
132462	-1.84	-0.62	1.81	-1.15	-0.56	0.5	0.83	-2.62	-0.15	0.06	-0.94	-0.71
13345	0.1	-0.05	0.2	-0.19	-0.1	-0.08	-0.05	-0.13	0.13	-0.27	0.2	0.14
133620	-0.07	-0.45	-0.07	0.16	0.15	-0.42	-0.43	0.1	-0.16	0.25	0.14	0.47
135579	-0.49	-0.05	0.02	0.05	-0.0	0.03	-0.0	-0.24	0.02	0.47	0.29	-0.34
135728	0.73	0.24	0.23	-0.33	-0.05	-0.26	-1.08	-1.1	-0.52	0.45	0.05	0.43
137764	0.1	-0.38	1.2	-0.57	-0.83	-0.2	0.41	-0.13	-1.22	0.06	-0.34	0.31
137766	0.04	-0.62	0.69	-0.66	-0.78	-1.02	0.4	-0.13	0.17	0.64	-0.18	0.27
137784	-0.0	-0.14	-0.18	-1.39	-0.31	-0.6	0.5	-0.83	-0.39	0.69	0.4	0.76
137836	-1.04	0.14	1.4	0.07	0.11	0.04	0.35	-1.67	-1.19	-0.36	-0.01	-0.28
137890	0.16	0.16	1.02	-0.22	-1.08	-0.19	0.21	-0.37	-0.51	-0.12	-0.23	0.16
152207	-0.47	-0.56	0.94	-0.39	-0.08	0.09	1.18	-0.29	-0.06	-0.72	-0.44	-0.93
177943	1.23	-0.21	1.1	-0.92	-	-1.3	0.38	-	-0.21	-0.0	-0.33	0.81
18297	0.08	-0.11	0.18	0.02	-0.16	0.0	0.1	-0.24	0.0	0.06	0.0	0.02
230649	0.68	1.02	1.85	-0.05	-2.25	0.49	-0.6	-1.49	-1.52	-4.37	-0.67	-2.79
232261	0.08	0.03	0.23	-0.05	-0.15	0.06	0.01	0.06	-0.06	-0.02	-0.06	-0.17
24801	0.28	-0.35	0.57	-0.45	-0.28	-0.47	-0.24	-0.6	-0.24	0.61	0.42	0.04
266696	0.05	-0.56	0.27	-0.04	-1.51	-0.65	-0.18	0.03	0.18	0.65	0.41	0.23
28262	0.05	0.05	0.46	-0.21	-0.25	-0.2	-0.2	-0.09	0.01	0.39	-0.04	-0.21
34543	0.12	0.19	0.36	-0.06	-0.22	-0.06	-0.21	-0.14	-0.05	0.18	-0.18	-0.04
35960	-1.15	-0.54	1.83	0.31	0.11	-0.24	-0.14	0.36	-0.85	-1.35	-1.1	-0.9
36529	0.04	-0.09	-0.18	0.03	-0.02	0.03	0.04	-0.01	-0.09	0.27	0.1	-0.19
38512	0.84	0.01	0.5	-0.63	-0.56	-0.51	-0.47	-0.09	-0.06	0.5	-0.04	-0.4
402052	-1.05	-0.42	0.48	-0.11	-0.01	-0.26	0.06	0.27	0.44	0.34	-0.31	-0.07
402806	0.19	-0.41	0.77	0.26	-0.19	0.38	-0.69	-0.54	-0.1	0.27	-0.02	-0.74
402807	-0.03	0.04	0.28	0.13	-0.03	0.15	-0.26	-0.24	-0.08	0.11	-0.0	-0.18
403502	-0.11	-0.67	1.25	-0.09	0.13	-0.24	-0.93	-1.01	-0.76	1.26	-0.91	-0.65
404507	-0.64	-0.24	0.87	-0.1	0.3	-0.53	-0.52	-1.0	0.33	0.39	-0.01	0.12
404640	0.94	-0.73	1.18	-1.0	-1.33	-0.75	-1.63	0.35	-0.5	1.05	-0.75	-0.43
406846	-0.9	-0.83	0.86	-0.64	0.02	-1.45	0.83	-1.21	0.04	0.74	0.13	0.08
407443	-0.29	-0.35	-0.08	0.25	0.12	-0.09	0.41	-0.29	-0.41	0.27	0.05	0.14
407469	-	-	2.45	1.37	-	-	-	-	-	1.99	-	-
408845	0.71	0.32	-	0.67	-	-	-0.47	0.48	-0.04	1.03	0.06	0.45
409600	-2.45	-0.36	2.29	0.52	-1.23	-0.59	-0.43	-2.32	-0.92	-0.73	-1.47	0.25
409811	-1.98	-0.79	2.25	-2.02	-2.35	0.35	0.64	-1.26	-0.24	-0.13	-0.97	-1.17
410579	0.29	-0.11	2.12	-0.32	-2.61	-	-0.04	-2.79	-2.03	0.28	0.44	-0.75
410703	-0.38	-0.42	1.04	-0.35	-0.79	0.3	0.4	-0.73	-0.99	0.51	0.29	-0.39
410884	0.25	-1.85	1.93	-2.47	-1.0	-1.35	0.06	-0.28	-2.67	1.25	-1.34	-0.24
411083	-	0.25	2.09	0.5	0.02	-1.84	-0.22	-1.66	0.43	-1.85	-2.15	-0.32
413168	0.14	-1.2	1.18	-1.24	-0.89	-	-1.29	-1.46	0.24	1.52	0.81	-0.58
413714	0.19	0.06	0.28	-0.12	-0.32	-0.12	0.14	-0.24	-0.05	0.05	-0.03	0.03
413814	-0.18	0.15	0.42	0.33	0.02	0.28	0.0	-0.38	-0.16	-0.38	0.08	-0.54
414045	-0.03	-0.95	1.56	0.68	-1.61	-	-0.0	-1.86	0.19	-0.88	0.64	0.13
415214	-0.04	0.07	0.28	0.15	0.28	-0.4	-0.03	-0.32	-0.03	0.1	-0.24	-0.01
416293	-0.37	-0.2	0.2	0.13	0.05	-0.21	0.14	0.13	0.08	0.26	-0.15	-0.22
416688	-0.44	-0.58	1.86	-0.14	-0.59	0.41	0.43	-1.42	-1.65	-0.2	-0.48	-1.16
416690	0.07	0.15	2.16	-1.03	-2.53	-0.6	-0.73	-0.77	-0.29	0.07	-0.47	-1.9
416717	-0.91	-0.37	0.19	0.0	-0.06	0.17	0.54	-0.1	0.31	0.03	0.01	-0.3
417123	0.19	-0.23	-0.35	-0.15	-0.2	-0.15	-0.15	0.17	0.39	0.41	0.08	-0.29
417333	-0.04	0.01	0.22	0.07	-0.3	-0.83	0.1	-0.04	-0.01	0.02	0.28	0.23
417600	0.04	-0.46	-0.04	0.02	-0.01	-0.48	-0.32	-0.37	-0.01	0.55	0.32	0.35
418075	0.97	-0.88	1.77	0.13	-0.63	-	-	-	-0.03	1.16	-	0.19
418098	-0.16	-0.08	0.26	0.02	-0.03	-0.09	0.13	-0.19	0.05	0.12	0.02	-0.13
418317	0.86	0.08	0.44	-0.4	-0.26	-0.44	0.28	-0.73	-0.07	-0.16	-0.28	-0.06
418759	-0.18	-0.41	0.02	-0.11	-0.02	0.07	-0.01	0.06	0.42	0.25	-0.03	-0.25
418853	0.18	-0.12	0.28	0.02	-0.37	0.0	0.02	-0.11	-0.15	0.31	-0.05	-0.16
419005	0.51	0.82	0.96	-0.22	-0.61	-0.51	-1.45	-1.16	-0.26	-0.09	0.06	0.03
419618	-0.11	0.05	0.25	0.01	-0.12	-0.02	-0.25	-0.5	-0.07	0.43	0.09	0.04
421994	-0.73	-0.22	0.36	-0.78	-0.31	-0.1	0.2	0.29	0.74	0.55	-0.71	-0.29
423028	-0.72	-0.29	0.4	-0.19	-1.13	-1.53	-0.91	0.33	0.55	1.37	-0.25	-0.15
423335	-0.12	-1.4	1.87	0.29	0.5	-0.77	-0.51	-1.64	-1.45	-0.27	0.07	-0.83
425156	0.24	-0.06	-0.41	0.26	-0.39	-0.63	-0.08	-0.32	0.46	0.26	-0.06	0.28
425297	-0.07	-0.05	0.71	-0.1	-0.39	-0.17	-0.06	-0.92	0.01	-0.35	0.42	0.3
425354	-	-	2.82	-2.54	0.26	-2.1	-1.1	0.12	-	-1.18	-0.34	-0.85
428578	-0.02	-0.65	0.92	-0.6	-0.11	-0.23	-0.33	-0.95	0.36	-0.1	0.7	-0.15
430402	0.24	-0.14	0.01	-0.02	-0.4	-0.36	-0.14	-0.24	0.01	0.52	0.3	-0.08
431311	-0.05	-0.32	-0.08	-0.26	0.38	-0.05	0.08	-0.41	-0.47	0.49	0.09	0.25
431549	-1.13	-0.58	0.7	-0.17	0.72	-0.69	0.72	-0.06	0.2	0.29	-1.51	-0.42
431674	-	-1.01	3.09	0.71	-	-	-2.06	-	-	-2.2	-2.04	-0.61
437686	0.2	-0.14	0.29	0.04	-0.19	0.04	-0.04	-0.27	-0.18	0.13	0.04	-0.02
438157	-0.77	-0.35	0.34	0.07	0.11	-0.13	0.18	0.07	0.25	0.2	-0.01	-0.31
439864	0.11	-0.59	0.97	-0.66	-0.23	-2.16	0.22	-0.79	-0.08	0.76	0.31	-0.07
440260	0.01	-0.25	0.73	-0.35	0.81	-1.34	-0.75	-0.54	-0.9	0.99	-0.15	-0.22
440561	-0.28	-0.11	0.27	-0.07	0.12	-0.03	0.1	0.04	0.06	0.17	-0.2	-0.18
440825	-0.59	-0.02	0.42	0.05	-0.23	-0.78	0.25	-0.43	0.52	0.65	-0.09	-0.61
442879	0.04	-0.0	0.04	-0.07	0.06	-0.07	-0.16	0.0	0.01	0.0	0.05	0.09
448503	-0.45	-0.3	0.65	-0.29	-0.03	0.06	0.49	-0.24	-0.17	0.21	-0.07	-0.34
4606	1.32	-0.53	0.12	-1.83	0.39	-	0.15	-0.36	-0.69	1.16	-0.67	-0.39
4698	0.34	-0.09	0.04	0.03	0.02	-0.89	-0.45	-0.31	0.08	0.3	0.11	0.37
49732	0.13	0.28	0.13	0.13	-0.14	-0.13	-0.19	-0.18	-0.07	-0.3	0.08	0.13
49950	0.06	-0.2	0.18	-0.45	-0.22	-0.68	0.52	-0.11	0.0	0.23	0.18	0.1
6219	-0.02	-0.09	1.29	-1.03	-0.9	-0.41	0.3	-0.57	-0.47	0.24	-0.2	0.24
69126	-0.01	-0.08	0.42	-0.1	0.06	-0.07	-0.16	-0.16	-0.02	0.04	0.09	-0.1
73710	0.12	-0.0	0.18	0.04	-0.14	-0.48	-0.18	-0.1	-0.02	0.56	0.05	-0.28
74004	0.04	-0.07	0.29	-0.06	-0.16	-0.11	0.09	-0.19	0.02	-0.02	0.04	0.05
75226	0.51	-0.41	0.26	0.27	0.11	0.21	0.11	-0.8	-0.28	-0.06	-0.23	-0.15
77297	0.23	0.11	0.08	0.04	-0.38	-0.24	-0.02	0.03	-0.44	0.03	0.34	0.03
79072	-0.33	-0.06	1.1	-0.79	-1.79	0.5	-0.17	0.39	-0.03	0.48	-0.17	-1.46
79372	0.12	-0.01	0.18	-0.05	-0.05	-0.13	-0.25	-0.06	-0.14	0.13	0.15	0.06
79811	-1.23	-0.86	0.93	-0.5	0.44	0.4	0.35	-0.37	-0.16	-0.19	-0.15	0.01
83267	0.74	0.12	1.4	-0.02	-1.25	0.28	-1.32	-0.86	-0.56	-1.64	-0.03	0.06
85067	0.47	-0.44	0.21	-0.46	0.21	-0.21	0.03	-0.06	-0.05	0.19	-0.09	-0.06
8844	0.14	-0.15	0.03	0.14	0.01	-0.04	-0.09	0.15	-0.16	0.0	-0.11	0.04
96514	-0.11	-0.29	0.64	-0.19	0.16	-0.32	-0.14	-0.75	0.08	0.35	0.02	0.09
99665	0.62	0.87	0.7	0.33	-1.36	-0.02	-0.74	-4.34	-1.89	-0.58	0.23	0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.