Heatmap: Cluster_208 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.1 0.06 -0.09 -0.04 0.1 0.1 -0.0 -0.08 -0.02 0.07 0.01 -0.25
0.59 -0.09 -0.18 -0.14 -0.3 -0.27 -0.4 -0.08 -0.01 0.32 0.22 0.02
0.29 0.17 -0.04 0.11 -0.17 0.0 -0.01 -0.07 -0.2 0.05 -0.12 -0.12
0.25 -0.08 0.0 -0.01 -0.12 0.0 -0.16 -0.03 0.04 0.0 0.01 0.07
-0.05 0.59 -0.08 0.06 0.09 0.46 0.1 -0.66 -0.92 -0.05 -0.17 0.02
0.43 0.02 -0.12 -0.09 -0.2 -0.1 -0.08 -0.04 0.05 -0.01 0.05 0.01
-0.11 0.07 0.01 0.0 0.27 0.0 0.18 -0.14 0.06 0.03 -0.04 -0.45
0.47 0.1 -0.15 -0.11 -0.35 0.03 -0.26 -0.23 0.03 0.21 0.11 -0.04
0.07 0.01 -0.26 -0.09 0.17 0.03 -0.07 -0.09 0.14 0.07 0.05 -0.09
0.4 0.02 -0.14 -0.12 -0.16 0.01 -0.3 -0.22 0.05 0.12 0.12 0.06
0.06 0.43 0.0 0.33 -0.22 0.06 0.16 -0.2 -0.19 -0.04 -0.27 -0.35
0.6 0.17 -0.26 -0.38 -0.1 -0.12 -0.13 -0.4 -0.51 0.51 -0.07 0.2
0.04 0.29 0.1 0.17 0.0 0.14 0.06 -0.22 -0.18 -0.01 -0.17 -0.35
0.06 0.17 0.06 0.14 -0.16 0.1 0.03 -0.05 -0.1 0.02 -0.14 -0.17
0.23 0.14 0.03 -0.06 -0.11 -0.04 -0.19 -0.04 -0.01 0.09 -0.03 -0.04
0.45 0.24 -0.1 -0.03 -0.2 0.18 0.14 -0.31 -0.16 -0.13 -0.21 -0.06
0.88 0.31 -0.16 -0.22 -0.25 -0.0 -0.47 -0.65 -0.12 -0.08 0.15 -0.01
2.54 - - -0.04 -0.62 - - - 1.75 - - 0.27
0.05 0.12 -0.04 0.01 -0.01 0.17 -0.05 -0.15 -0.05 0.01 0.03 -0.13
0.12 -0.1 -0.08 -0.01 0.03 -0.05 0.03 -0.05 0.05 0.12 0.02 -0.1
0.15 0.12 -0.06 0.01 -0.1 0.05 -0.12 -0.06 -0.06 0.05 0.05 -0.03
1.51 -0.7 -1.72 -0.22 -0.55 -0.16 -0.13 0.11 -0.42 0.63 -0.17 -0.69
0.42 0.2 -0.02 0.06 0.25 0.14 -0.25 -0.33 -0.11 -0.02 -0.31 -0.27
0.13 0.14 0.11 -0.02 -0.07 -0.23 0.03 -0.04 -0.02 0.01 0.01 -0.09
2.39 -1.89 -0.38 -0.54 -1.26 -1.03 -1.79 -1.13 1.22 - -1.28 -0.62
0.33 0.52 0.09 0.47 0.73 -1.01 -0.11 -0.12 -1.0 -0.08 -0.94 -0.17
-0.27 -0.17 -0.08 0.26 -0.16 -0.29 -0.15 0.13 0.01 0.53 -0.17 0.11
0.81 -0.04 0.29 -0.56 0.16 -1.29 -0.5 -0.66 -0.75 0.45 0.44 0.26
2.08 -1.76 -2.34 -0.08 -2.42 0.09 - -1.35 0.33 0.86 -1.84 0.42
0.13 0.42 0.05 0.06 -0.15 -0.0 -0.21 -0.54 -0.05 0.14 0.11 -0.15
0.27 -0.32 -0.1 -0.45 0.43 -0.12 -0.24 0.01 0.21 0.06 0.12 -0.11
0.5 -0.0 -0.21 0.17 -0.43 0.25 -0.34 -0.19 0.19 0.09 0.01 -0.34
0.05 0.25 -0.09 0.22 -0.08 -0.11 0.14 0.01 -0.23 0.09 -0.22 -0.14
2.06 -0.97 -0.85 -0.89 -0.16 -0.32 -0.98 -0.78 0.66 -2.27 -0.68 0.04
0.06 -0.25 -0.32 -0.07 -0.34 -0.11 -0.21 0.03 -0.15 0.43 0.23 0.42
2.09 -0.51 -1.43 -1.14 -2.86 -0.71 -1.34 0.01 0.58 -0.7 0.05 -0.13
0.1 0.33 0.03 0.11 -0.24 -0.04 -0.11 -0.32 -0.08 0.2 0.03 -0.15
0.32 -0.05 -0.86 0.13 0.2 -0.4 -0.3 -0.11 -0.26 0.63 -0.0 0.17
0.19 0.16 0.05 0.03 -0.1 0.03 -0.1 -0.19 -0.15 -0.03 0.16 -0.11
0.64 0.2 -0.13 -0.22 -0.37 -0.29 -0.43 -0.42 0.05 0.26 0.28 -0.02
0.38 -0.01 -0.04 -0.1 -0.12 -0.05 -0.13 -0.17 0.02 0.02 0.07 0.05
0.93 0.0 -0.16 -0.27 -0.25 -0.48 -0.07 -0.04 0.03 -0.16 0.02 -0.05
0.51 0.3 0.34 -0.13 -0.06 0.26 -0.71 -0.63 -0.58 0.15 0.12 -0.18
0.38 0.02 -0.22 -0.13 -0.32 -0.07 -0.46 -0.18 -0.31 0.5 0.28 0.15
0.95 0.49 0.51 -0.16 -0.13 -0.05 0.13 -1.15 -0.4 -0.67 -0.38 -0.4
0.12 0.15 -0.09 -0.03 0.02 0.17 -0.06 -0.16 0.07 0.02 0.04 -0.34
0.26 0.08 -0.26 0.15 0.03 -0.1 -0.48 -0.26 -0.0 0.3 -0.01 0.1
0.99 -0.67 0.11 -0.79 -0.28 -0.28 -0.35 -0.19 -0.3 0.4 0.49 -0.17
0.41 0.23 0.01 -0.09 -0.23 0.03 -0.35 -0.26 -0.04 0.13 0.01 -0.03
-0.01 0.41 0.0 0.03 -0.24 -0.34 0.12 -0.48 -0.06 0.34 0.1 -0.13
0.3 0.02 -0.06 -0.03 -0.28 0.32 -0.17 -0.1 -0.07 0.11 -0.1 -0.06
0.77 0.01 -0.21 -0.3 -0.46 -0.06 -0.23 -0.05 0.14 -0.1 0.03 0.07
0.52 0.17 -0.1 -0.14 -0.2 0.03 -0.25 -0.14 -0.03 -0.05 0.02 0.01
0.31 0.17 -0.33 0.05 -0.19 -0.19 -0.24 -0.42 0.25 0.13 0.12 0.12
0.32 0.13 0.01 -0.18 -0.14 0.3 -0.05 -0.19 -0.26 -0.15 -0.02 0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.