Heatmap: Cluster_42 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
101484	0.0	0.0	0.5	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.11	0.22
106030	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
106976	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
110695	0.04	0.06	0.09	0.15	0.05	0.2	0.2	0.04	0.04	0.1	0.06	0.04
111512	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
115966	4.58	4.48	5.06	4.93	3.99	4.17	4.3	4.89	4.21	4.35	4.7	4.04
126188	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
127200	0.0	0.0	0.26	0.03	0.0	0.04	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
128270	0.21	0.12	0.26	0.16	0.0	0.04	0.16	0.0	0.25	0.18	0.14	0.09
134276	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
134711	0.0	0.1	0.28	0.19	0.0	0.0	0.51	0.0	0.17	0.1	0.0	0.21
16539	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0
17751	0.0	0.06	0.0	0.05	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
19225	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
26992	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.07	0.07	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
28204	0.0	0.04	0.17	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
31439	1.48	0.37	0.6	0.63	0.2	0.05	0.83	0.49	0.69	0.21	0.5	0.5
39404	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
402485	0.0	0.13	0.25	0.2	0.03	0.0	0.18	0.22	0.11	0.18	0.08	0.19
402908	0.0	0.11	0.03	0.03	0.06	0.15	0.0	0.08	0.0	0.17	0.0	0.0
402909	0.07	0.0	0.0	0.13	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04
403006	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
403326	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
403378	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.04	0.02	0.0	0.02	0.0
403467	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02
403720	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
403798	0.14	0.0	0.04	0.0	0.0	0.18	0.0	0.04	0.0	0.1	0.04	0.0
404241	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
404516	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
405141	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
406291	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
406307	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
406310	0.0	0.07	0.12	0.07	0.07	0.07	0.23	0.1	0.18	0.02	0.07	0.06
406357	0.07	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
407478	0.64	0.84	0.81	1.04	0.82	0.9	1.29	1.28	0.9	0.89	0.74	1.01
407645	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0
407938	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
408546	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
408848	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
409407	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02
409616	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.02
409889	0.07	0.24	0.21	0.61	0.36	0.58	1.07	0.17	0.14	0.05	0.0	0.04
410482	0.0	0.04	0.1	0.06	0.09	0.07	0.12	0.0	0.02	0.08	0.09	0.02
412398	0.0	0.04	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.04
412677	0.0	0.02	0.07	0.0	0.0	0.05	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.02
412713	0.43	0.24	0.65	0.26	0.4	0.35	0.72	0.24	0.45	0.25	0.46	0.0
413154	0.0	0.06	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0	0.05	0.0
413345	0.0	0.04	0.05	0.0	0.02	0.0	0.02	0.04	0.0	0.02	0.0	0.02
413662	0.21	0.06	0.26	0.04	0.04	0.17	0.02	0.12	0.02	0.07	0.12	0.11
413755	3.35	0.24	0.03	0.54	0.4	4.3	0.36	0.15	0.83	0.6	1.82	1.41
413828	0.0	0.02	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.0
414121	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
414555	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.07	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0
415511	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
415582	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
415668	0.22	0.17	0.52	0.0	0.49	0.66	0.13	0.18	0.32	0.0	0.0	0.32
416658	0.0	0.0	0.12	0.04	0.0	0.0	0.08	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0
416750	0.04	0.15	0.12	0.05	0.0	0.02	0.1	0.06	0.03	0.06	0.07	0.0
417174	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
417334	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0
417759	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
417921	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
418304	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
418416	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
418835	0.14	0.12	0.04	0.02	0.02	0.2	0.08	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0
418837	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.02	0.12	0.17	0.12	0.08	0.02
418849	0.0	0.02	0.0	0.12	0.0	0.18	0.07	0.02	0.0	0.0	0.02	0.11
419458	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
419870	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
420158	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
420513	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
421190	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
421386	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
421618	0.63	0.21	0.42	0.19	0.06	0.04	0.09	0.04	0.37	0.04	0.26	0.26
422010	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0
422158	0.0	0.08	0.09	0.02	0.0	0.0	0.05	0.02	0.05	0.08	0.0	0.0
422356	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
424001	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
424159	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.13	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
424776	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
425178	0.0	0.04	0.07	0.04	0.0	0.0	0.05	0.0	0.04	0.0	0.05	0.0
425223	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
425600	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
426227	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
426359	0.0	0.04	0.0	0.15	0.05	0.51	0.13	0.27	0.02	0.04	0.0	0.0
426391	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
426544	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
426581	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
426620	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
427485	0.04	0.0	0.0	0.04	0.0	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02
427592	0.04	0.04	0.09	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
428204	0.04	0.16	0.07	0.08	0.08	0.18	0.06	0.1	0.0	0.0	0.02	0.02
428274	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0
429404	0.0	0.02	0.07	0.03	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.05	0.0
429618	0.07	0.04	0.21	0.03	0.06	0.08	0.24	0.04	0.04	0.0	0.04	0.21
429648	0.0	0.37	0.19	0.24	0.37	0.48	0.79	0.39	0.09	0.2	0.02	0.19
429678	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
430122	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
430140	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
430436	0.0	0.04	0.28	0.09	0.17	0.0	0.09	0.04	0.07	0.19	0.07	0.0
431003	0.0	0.0	0.09	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
431316	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
431357	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
447028	0.0	0.02	0.13	0.08	0.19	0.29	0.35	0.18	0.0	0.03	0.0	0.0
5272	0.04	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
63596	54.8	60.48	57.95	54.24	51.2	60.76	67.65	64.24	51.88	56.78	50.6	54.46
64706	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.04
69737	0.18	0.47	0.74	0.48	0.38	0.0	0.1	0.1	0.09	0.2	0.3	0.11
73113	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0
73225	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
74145	0.0	0.0	0.02	0.0	0.08	0.04	0.12	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
78760	0.0	0.1	0.0	0.11	0.0	0.7	0.72	0.25	0.26	0.0	0.0	0.21
79880	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.07	0.0
83391	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)