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Heatmap: Cluster_66 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.12 0.02 0.12 -0.07 -0.16 -0.34 0.01 -0.01 0.21 0.02 0.05 -0.06
-0.8 -0.44 -0.33 0.16 -0.52 0.23 0.39 0.0 0.4 0.78 -0.28 -0.42
0.22 -0.11 -0.06 -0.2 -0.16 -0.01 -0.05 -0.15 0.09 0.01 0.25 0.09
-0.09 -0.08 0.16 -0.19 -0.43 -0.82 -0.13 -0.22 0.57 0.06 0.25 0.41
-0.47 -0.39 0.05 -0.53 -0.1 -0.38 0.01 0.31 0.49 0.27 0.1 0.21
-0.06 -0.06 0.21 -0.16 -0.05 -0.32 -0.34 0.14 0.19 0.11 0.18 0.05
0.0 -0.06 0.0 -0.06 0.07 -0.15 -0.43 -0.17 0.08 0.2 0.21 0.19
-0.11 -0.3 -0.0 -0.32 -0.36 -0.07 0.01 0.27 0.16 0.28 0.24 0.0
-0.22 -0.14 -0.77 -0.64 -1.57 -0.03 -0.03 -0.25 0.91 0.49 0.47 0.26
-0.33 -0.25 0.13 0.17 -0.34 0.18 0.06 -0.24 0.12 0.17 0.08 0.09
-0.24 -0.41 0.3 -0.16 -0.28 -0.01 -0.32 -0.06 0.35 0.03 0.24 0.28
-0.03 -0.17 0.07 -0.06 -0.05 0.21 0.07 -0.15 0.17 -0.08 0.0 -0.02
0.14 -0.07 0.02 -0.26 -0.24 -0.23 -0.27 -0.11 0.05 0.18 0.21 0.38
-0.31 -0.77 0.45 -0.23 -0.43 0.25 0.44 0.41 0.65 -0.24 -0.28 -0.94
0.47 -0.06 0.74 -0.6 -1.6 0.06 0.77 -2.45 0.46 -0.25 -0.27 0.03
0.31 -0.14 0.03 0.05 -0.24 0.1 -0.03 -0.12 0.03 0.24 -0.09 -0.27
-0.14 -0.05 0.04 -0.05 -0.09 -0.3 0.03 0.12 0.08 0.17 0.1 0.03
-1.54 -0.25 0.9 -0.42 -0.33 0.16 0.05 0.1 -0.17 0.48 0.31 -0.61
-0.26 0.23 1.3 -0.55 -1.88 -1.58 -0.25 -0.65 0.57 0.2 0.08 0.11
0.09 -0.07 -0.02 -0.11 -0.18 -0.09 -0.14 -0.19 0.09 0.08 0.22 0.22
0.04 -0.2 -0.19 -0.12 -0.3 -0.02 -0.15 -0.11 0.13 0.15 0.29 0.32
0.01 -0.02 0.01 -0.22 -0.3 -0.28 -0.15 -0.18 0.11 0.2 0.42 0.2
-0.73 -0.85 0.21 -0.56 -0.73 -0.35 0.08 0.61 0.5 0.44 0.49 -0.22
0.1 -0.21 0.37 -0.06 -0.16 -0.05 0.03 0.06 0.05 0.06 -0.11 -0.18
-0.07 -0.19 0.06 -0.08 -0.24 -0.27 -0.1 0.01 0.23 0.22 0.2 0.11
-0.2 -0.97 -0.16 -0.16 -0.19 -0.84 0.02 0.09 0.53 0.42 0.5 0.16
0.2 -0.24 -0.2 0.03 -0.08 -0.24 -0.03 -0.25 0.17 -0.08 0.39 0.17
-0.69 -0.4 0.66 -0.01 0.02 -0.21 -0.09 -0.09 0.23 0.15 0.24 -0.28
- - 2.53 - - -1.43 - 1.56 - 0.09 - 0.88
0.43 -0.22 -0.64 -0.2 -0.11 -0.1 -0.56 -0.55 0.36 -0.2 0.81 0.22
-0.12 -0.07 0.05 -0.04 -0.1 -0.55 -0.04 -0.06 0.25 0.16 0.16 0.21
0.2 -0.18 -0.03 0.11 -0.19 -0.72 -0.41 -0.19 0.36 0.16 0.52 -0.08
-0.13 -0.55 0.2 -0.41 -0.44 -0.28 -0.04 0.37 0.43 -0.05 0.35 0.12
0.18 -0.24 0.51 -0.5 -0.45 -0.26 0.07 0.18 0.21 0.53 -0.36 -0.38
-0.12 -0.11 -0.17 -0.01 -0.38 -0.01 -0.36 -0.06 0.07 0.39 0.36 0.17
-0.02 -0.03 0.12 -0.15 -0.16 0.09 -0.02 0.08 0.11 -0.03 0.03 -0.04
-0.56 -0.44 0.34 -1.0 -0.79 -0.09 -0.01 0.35 0.95 0.63 -0.5 -0.22
-2.1 -0.1 -0.04 -0.13 -1.13 0.54 0.53 0.18 0.73 0.22 0.37 -1.52
-0.16 -0.48 0.37 -0.51 -0.26 -0.52 -0.75 -0.49 -0.07 0.35 0.91 0.53
-0.27 -0.23 0.33 -0.05 -0.24 -0.17 -0.39 -0.24 0.23 0.57 -0.05 0.17
-1.09 -0.14 0.55 -0.08 -0.38 0.16 0.51 -0.34 0.47 0.06 -0.22 -0.29
-1.87 -0.43 0.93 0.99 -2.25 -2.6 -0.38 -1.68 1.33 -0.06 0.26 -0.06
-0.12 0.02 0.52 -0.05 -0.18 0.25 0.26 -0.12 0.03 -0.23 -0.27 -0.38
-0.4 -0.43 0.45 -0.15 0.11 0.08 0.0 -0.32 0.05 -0.2 0.59 -0.19
-1.01 -0.8 1.13 0.35 -0.09 -1.15 -0.78 -1.2 1.71 - 0.71 -2.8
-1.82 -1.78 1.51 -0.88 -0.64 - -0.27 0.3 1.34 -0.67 -0.82 0.68
0.32 0.4 0.08 0.34 -0.38 -0.05 -0.74 -0.9 0.94 -0.25 -0.51 -0.38
-1.21 0.73 0.86 0.72 0.21 -1.51 -1.03 -1.56 1.33 -1.6 -0.42 -0.96
-0.03 -0.6 0.34 -1.15 -0.24 0.51 -0.27 0.12 0.77 -0.95 0.36 -0.07
-0.6 -0.85 0.98 -0.31 -1.22 -0.4 -0.72 -0.28 0.7 0.07 0.46 0.41
0.18 0.03 1.4 -1.72 0.24 -2.4 -1.16 0.16 0.59 -0.83 -0.64 0.34
-0.79 0.06 1.47 -1.95 -1.41 -1.42 -0.09 1.12 -0.85 0.12 0.21 -0.52
-0.52 -0.43 0.97 -1.05 -1.3 -0.89 -0.26 0.63 0.63 0.63 -0.17 -0.31
0.07 -0.52 0.24 -0.34 -0.72 -0.2 -0.06 -0.09 0.13 0.15 0.5 0.35
-2.19 -0.73 1.12 -0.98 -2.51 -0.54 1.35 -2.94 1.06 0.88 0.05 -
-0.51 -0.3 0.3 -0.12 -0.06 0.5 0.29 -0.33 0.11 0.08 -0.03 -0.3
- -0.21 1.72 -0.3 -2.01 -0.73 -0.06 0.53 0.96 -0.79 -0.06 -1.71
0.2 -0.26 0.2 -0.81 -0.94 -0.69 -0.77 -0.7 0.19 0.24 0.86 0.86
-0.72 -0.7 0.46 0.05 - -0.37 -0.11 -0.04 0.83 0.04 0.62 0.42
-1.7 -0.4 1.1 -1.6 -1.89 -0.58 0.39 0.45 0.93 -0.42 0.35 -0.14
-0.42 -0.29 0.15 -0.08 -0.85 0.16 -0.32 -0.23 0.27 0.29 0.23 0.54
-0.93 -0.72 1.31 -0.44 -1.46 0.04 0.12 -0.23 0.4 0.12 0.61 -1.43
-0.06 -0.23 0.22 0.1 -0.86 0.04 0.02 -0.06 0.23 -0.11 0.32 0.06
0.18 -0.13 0.55 -0.15 -0.7 -0.37 -0.61 0.33 0.22 -0.2 -0.39 0.58
-2.2 -2.29 1.36 -3.32 -3.19 -0.53 0.36 -0.31 1.15 1.29 -0.06 -1.36
-0.03 0.14 -0.03 -0.52 -0.99 0.16 -0.16 -0.03 0.27 0.27 0.13 0.31
-1.55 -0.82 0.03 0.14 -0.86 0.04 1.08 0.13 0.6 0.19 -0.41 -0.36
-0.35 -0.71 0.53 -0.45 -0.8 -0.49 -0.23 0.19 0.87 -0.19 0.42 0.14
-0.11 -0.07 0.83 -1.42 -1.39 0.69 -0.29 0.37 1.0 -0.59 -0.31 -1.32
-0.3 -0.28 0.72 -0.35 -0.54 0.16 -0.58 -0.74 0.62 -0.68 0.75 0.03
- - 2.05 1.02 - - -0.33 1.73 0.79 - - -
0.26 0.19 0.1 -0.12 -0.12 -0.2 0.11 -0.44 -0.04 0.19 0.12 -0.19
-0.34 -1.35 1.05 -0.42 -1.34 -0.75 -0.25 0.9 0.21 0.29 -0.41 0.24
0.66 -1.4 0.76 0.01 -1.42 -2.46 -1.6 0.14 0.98 -0.16 0.84 -0.53
- 0.29 0.77 -1.44 -0.86 0.78 0.64 -0.31 0.73 0.33 0.05 -3.07
-0.22 -1.88 0.39 -0.25 -3.13 -0.89 0.86 0.5 1.34 -0.97 -0.41 0.06
0.07 -0.5 0.52 -0.01 -0.9 -0.17 -1.42 -0.69 -0.49 0.47 0.35 1.02
-0.8 0.19 0.15 -0.69 -0.84 0.13 0.23 -0.22 1.07 -0.05 -0.77 0.3
-0.5 -0.18 -0.02 0.06 -0.16 -0.72 -0.09 -0.31 0.39 0.45 0.44 0.12
-0.17 0.01 0.01 0.01 -0.07 -0.08 -0.08 0.01 0.15 0.07 0.19 -0.1
-0.17 -0.19 0.04 0.01 -0.2 -0.12 0.01 0.17 0.06 0.19 0.1 0.04
-0.19 0.13 0.08 -0.26 -0.67 -0.03 -0.23 -0.16 -0.06 0.35 0.22 0.47
-0.78 0.2 0.61 -1.81 - 0.57 0.03 0.28 0.37 0.6 -0.02 -0.09
-0.13 -0.15 -0.01 -0.12 0.19 -0.24 -0.4 -0.55 0.52 0.23 0.32 -0.03
0.54 0.61 0.76 0.15 -0.78 -0.36 0.28 -1.19 0.15 -0.52 -0.44 -0.59
-0.24 - 2.52 - - -0.76 0.47 1.69 - - -2.25 -
-0.14 -0.25 0.4 -0.32 -0.99 -0.12 -0.06 -0.21 0.48 0.21 0.41 0.01
- -0.25 0.98 -0.65 0.07 -1.54 0.19 -1.11 1.73 0.36 -0.22 -3.34
-0.37 -0.32 0.39 -0.58 -0.1 -0.99 -0.25 0.06 0.14 0.51 0.58 0.16
-0.22 -0.37 -0.18 -0.18 -0.22 -0.09 -0.02 -0.02 0.21 0.34 0.43 0.1
0.51 -0.12 0.55 -0.25 -0.4 -1.37 -0.48 0.2 0.56 -1.03 0.3 0.21
-0.56 -0.16 -0.36 0.15 -0.4 0.03 -0.06 0.24 0.28 0.23 0.18 0.13
-1.08 -1.35 0.8 -0.94 0.07 -1.03 0.18 -1.01 1.2 -1.28 0.71 0.45
-0.12 -0.57 -0.2 -0.56 -4.95 -0.78 0.36 0.4 0.79 -0.12 0.83 0.27
-0.14 0.11 0.96 -0.45 -0.86 -0.09 -0.16 -0.16 0.9 -1.68 0.48 -1.09
-0.56 0.29 1.07 0.28 -0.58 0.57 -2.11 0.05 1.35 -1.32 - -1.27
-0.7 -0.78 0.98 -2.66 -2.74 -0.09 0.38 0.83 -0.1 0.99 -0.34 -0.31
- -0.38 1.25 -1.09 - -1.8 - -1.34 1.75 -2.79 0.83 1.27
-0.14 0.35 0.41 -0.01 -0.19 -0.53 -0.36 -0.4 0.93 -0.08 -0.49 -0.29
-0.01 -0.61 0.05 -0.48 0.19 -0.1 -0.09 0.2 0.42 0.0 0.14 -0.0
0.08 -0.17 0.0 -0.26 0.01 -0.03 -0.09 -0.12 0.2 0.23 -0.12 0.16
-0.02 -0.35 0.09 -0.12 -0.27 0.0 -0.33 -0.17 0.0 0.26 0.35 0.31
0.25 -0.38 -0.05 -0.3 -0.47 -0.11 -0.07 -0.51 0.33 0.21 0.5 0.2
-0.77 -0.21 0.1 0.43 -0.2 -0.27 -0.43 0.12 0.74 -0.08 0.2 -0.28
- 0.59 0.38 -0.66 -0.45 -0.04 0.42 -0.34 1.05 -0.89 0.34 -0.23
0.1 -0.07 0.27 0.01 0.04 -0.17 -0.0 -0.08 0.11 -0.1 -0.01 -0.16
-0.22 -0.64 -0.36 -0.24 -0.33 -0.2 -0.23 0.34 0.08 0.47 0.49 0.31
-0.16 -0.13 0.13 -0.03 -0.65 -0.28 -0.16 -0.1 0.39 -0.1 0.44 0.29
-0.66 -0.11 -0.37 0.28 -0.47 -0.24 -0.32 0.04 0.05 0.54 0.33 0.39
-0.7 -0.3 0.77 -1.02 -1.04 -0.21 0.35 -0.4 0.88 -1.17 0.38 0.5
0.09 -0.59 0.18 -0.29 -0.19 -0.34 0.05 0.31 0.56 -0.1 -0.12 0.07
0.78 -0.07 0.62 -0.88 -0.76 0.27 0.54 -0.72 -1.02 0.38 -0.12 -0.56
-0.76 0.23 0.14 -0.47 -0.04 -0.64 0.06 0.23 0.64 0.4 -0.01 -0.48
-0.18 -0.24 -0.01 -0.28 -0.57 -0.57 0.04 0.18 0.42 0.34 0.28 0.16
-0.47 -0.56 -0.15 -0.32 -0.34 -0.18 -0.08 0.04 0.43 0.35 0.49 0.28
-0.54 -0.29 0.32 -0.03 -0.53 0.1 0.07 -0.14 0.42 0.23 0.3 -0.33
0.06 -0.21 0.22 -0.06 -0.23 -0.07 -0.27 -0.27 0.08 0.04 0.32 0.25
-0.61 -0.76 0.9 0.04 -0.29 0.5 -0.27 0.35 0.52 -2.06 -0.06 -0.18
-0.13 -0.2 0.1 -0.18 -0.15 -0.16 -0.08 0.15 0.3 0.15 0.08 0.03
- -1.23 1.84 - - - - - 2.23 - 0.58 0.84
0.17 -0.12 -0.01 -0.01 -0.02 -0.35 -0.09 -0.02 0.19 -0.0 0.16 0.02
0.05 0.0 -0.17 -0.09 -0.36 -0.03 0.02 -0.12 0.12 0.24 0.08 0.16
0.51 0.26 0.23 -1.09 -1.26 -0.78 -0.14 -0.7 0.75 -0.07 -0.08 0.7
0.46 -0.61 -0.2 -0.04 -0.55 -0.24 0.38 0.06 0.27 -0.19 0.27 -0.05
-0.04 0.17 -0.46 -0.15 -0.75 0.47 0.34 -0.04 0.33 0.15 -0.16 -0.33
0.17 -0.17 0.16 -0.62 -0.42 -0.96 -0.2 0.25 0.53 -0.26 0.29 0.47
-0.09 -0.17 0.1 -0.03 -0.0 -0.39 -0.14 -0.03 0.19 0.21 0.19 0.05
-0.88 -0.82 0.78 0.17 -1.24 0.12 0.62 -0.67 0.39 0.07 0.18 -0.18
-0.3 -0.52 0.22 -0.37 -0.69 0.1 0.37 0.18 0.75 -0.13 -0.04 -0.21
0.07 -0.51 -0.04 -0.12 -0.13 0.2 0.08 0.13 0.14 -0.09 0.25 -0.12
-0.06 -0.3 -0.05 -0.23 -0.54 -0.2 -0.16 -0.03 0.25 0.24 0.46 0.3
-0.31 -0.35 0.39 -0.22 0.18 -0.74 -0.29 0.17 0.24 0.27 0.02 0.22
0.05 0.02 0.06 -0.23 -0.37 0.19 -0.05 -0.16 0.21 -0.13 0.17 0.11
-0.77 0.07 0.08 -0.03 0.06 0.26 0.36 -0.05 0.26 -0.01 -0.18 -0.38
-0.51 -0.97 1.26 - -0.91 -0.3 -1.06 1.05 0.25 -0.89 -0.47 1.02
-0.26 -0.17 0.1 -0.01 -0.2 -0.41 0.26 0.06 0.19 0.31 0.1 -0.15
-0.02 -0.3 0.13 -0.05 -0.73 0.27 -0.05 0.15 0.45 0.06 -0.07 -0.15
-0.26 -0.06 0.39 -0.12 -0.29 -0.52 -0.23 0.09 0.11 0.25 0.26 0.11
-0.1 -0.04 0.16 -0.11 0.07 -0.13 -0.3 0.24 0.03 -0.02 0.0 0.11
-0.69 -0.44 -0.0 0.02 -0.34 -0.44 0.19 0.15 0.29 0.41 0.27 0.15
-0.25 0.02 0.22 0.07 -0.65 -0.18 0.2 -0.32 0.49 0.12 -0.16 0.1
0.08 -0.03 -0.19 -0.17 -0.38 -0.02 -0.15 -0.12 0.03 0.31 0.32 0.17
0.08 -0.06 -0.06 -0.03 -0.13 -0.16 -0.1 -0.0 0.07 0.16 0.11 0.08
-0.1 -0.45 0.36 0.03 0.13 -0.0 0.08 -0.04 0.24 -0.11 -0.09 -0.22
0.06 -0.14 -0.04 -0.14 -0.16 -0.18 -0.07 -0.02 0.05 0.12 0.29 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.