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Heatmap: Cluster_68 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.22 0.5 0.52 -0.01 -0.1 -0.33 -0.28 -0.43 -0.38 -0.35 0.19 -0.0
0.35 0.23 0.38 0.27 0.13 0.09 -0.29 -0.32 -0.39 -0.23 -0.28 -0.27
0.56 0.32 0.17 0.03 -0.09 0.17 -0.07 -0.07 -0.31 -0.32 -0.33 -0.4
1.38 1.43 0.86 -0.4 -0.09 0.22 -0.31 -1.91 -2.87 -2.59 -1.91 -1.4
0.35 0.27 0.19 0.18 0.13 0.05 0.08 -0.09 -0.34 -0.35 -0.31 -0.46
1.14 1.17 1.33 -0.4 0.48 -1.13 -0.38 -1.66 -2.47 -2.23 -2.46 -0.4
0.58 0.46 0.17 -0.02 -0.01 0.07 -0.46 -0.36 -0.29 -0.38 -0.03 -0.13
0.2 0.13 0.02 0.05 0.09 -0.14 -0.15 0.04 -0.09 -0.12 -0.04 -0.01
0.4 0.34 0.15 0.01 0.13 0.14 -0.19 -0.16 -0.3 -0.29 -0.25 -0.22
0.84 0.63 0.66 0.28 0.32 -0.12 -0.35 -0.82 -0.95 -1.05 -0.89 -0.29
0.42 0.25 0.37 0.19 0.05 -0.03 -0.1 -0.39 -0.26 -0.13 -0.28 -0.4
0.3 0.22 0.25 0.08 0.09 0.17 -0.09 -0.16 -0.23 -0.4 -0.22 -0.21
1.08 0.98 0.41 0.43 -0.11 -0.01 -0.94 -1.28 -0.96 -0.78 -0.68 -0.61
0.35 0.33 0.21 0.24 0.24 0.19 -0.03 -0.16 -0.41 -0.51 -0.4 -0.45
1.19 0.81 0.22 0.21 0.11 0.15 0.01 -0.62 -1.19 -1.09 -0.98 -1.37
0.33 0.33 0.14 0.11 0.15 0.02 -0.05 -0.25 -0.22 -0.29 -0.2 -0.3
0.09 0.44 0.37 -0.04 0.08 -0.21 -0.19 -0.37 -0.11 -0.22 -0.03 -0.02
0.43 0.32 0.29 0.09 0.11 0.05 -0.06 -0.07 -0.37 -0.42 -0.41 -0.28
0.19 0.11 -0.05 -0.02 0.05 0.03 0.08 0.01 -0.12 -0.09 -0.14 -0.1
0.71 0.6 0.32 0.14 0.19 0.33 -0.26 -0.69 -0.4 -0.75 -0.61 -0.67
1.02 0.63 0.18 0.11 -0.07 0.08 -0.36 -0.87 -0.58 -0.65 -0.27 -0.44
1.32 0.72 0.33 -0.01 0.13 0.02 -0.3 -0.71 -0.85 -1.0 -0.92 -1.01
0.43 0.22 0.06 0.04 -0.0 -0.01 -0.08 -0.08 -0.19 -0.26 -0.11 -0.16
0.66 0.72 0.1 0.33 -0.07 0.07 -0.31 -0.5 -0.59 -0.65 -0.2 -0.41
1.1 0.22 0.12 0.42 -0.25 0.58 -0.96 -0.16 -0.95 -0.48 -0.69 -0.59
0.73 0.97 0.37 0.09 -0.41 0.07 -0.54 -0.97 -1.15 -0.57 0.19 -0.41
0.92 0.2 0.39 0.14 0.26 -0.3 -0.57 -0.53 -0.31 -0.48 -0.21 -0.35
1.27 0.85 0.17 -0.02 -0.19 -0.39 -0.74 -1.03 -0.6 -0.57 -0.45 -0.19
1.21 0.9 0.28 0.13 0.25 -0.16 -0.28 -0.53 -1.25 -1.15 -0.83 -1.07
1.16 0.5 0.5 0.01 -0.32 0.47 -0.16 -0.65 -0.67 -1.16 -0.54 -1.14
0.96 0.86 0.67 0.17 -0.05 -0.13 -0.19 -0.82 -0.86 -0.95 -1.07 -0.6
0.61 0.17 0.19 0.2 0.11 0.04 0.12 -0.08 -0.31 -0.42 -0.43 -0.67
0.86 0.44 0.27 0.12 0.17 0.18 -0.1 -0.39 -0.57 -0.6 -0.59 -0.78
0.9 0.61 0.3 0.26 0.24 0.37 0.26 -0.21 -1.09 -1.29 -1.24 -1.54
0.87 0.64 0.4 0.25 0.23 0.39 0.2 -0.26 -1.16 -1.27 -1.23 -1.55
0.14 0.39 0.27 0.06 0.0 -0.06 -0.3 -0.24 -0.21 -0.13 -0.01 -0.08
0.66 0.57 0.13 0.26 0.05 0.24 -0.01 -0.83 -0.46 -0.26 -0.35 -0.9
0.99 0.68 0.29 0.06 0.23 -0.09 -0.32 -0.66 -0.47 -0.79 -0.71 -0.53
0.59 0.35 0.15 0.04 -0.01 0.1 -0.24 -0.43 -0.18 -0.42 -0.08 -0.22
0.52 0.49 0.47 -0.08 0.03 -0.33 -0.15 -0.28 -0.4 -0.31 -0.32 -0.1
-0.38 0.3 0.26 -0.06 -0.03 0.05 0.32 0.24 0.02 -0.42 -0.26 -0.3
0.2 0.22 0.04 0.02 0.19 0.05 -0.07 -0.01 -0.18 -0.16 -0.14 -0.27
1.19 0.65 0.71 0.31 -0.68 0.27 -0.21 -1.5 -1.04 -0.55 -1.36 -0.56
0.39 0.13 0.13 0.1 0.08 -0.18 -0.04 -0.07 -0.11 -0.22 -0.09 -0.26
0.38 0.54 0.27 0.15 -0.03 -0.12 -0.26 -0.3 -0.36 -0.23 -0.25 -0.15
0.84 0.37 -0.12 -0.44 -0.29 0.27 0.0 0.13 -0.03 -0.41 -0.86 -0.2
0.73 0.52 0.22 0.05 -0.23 0.0 -0.4 -0.36 -0.35 -0.27 -0.27 -0.21
0.16 0.29 0.03 -0.1 0.04 -0.01 0.29 0.22 -0.12 -0.32 -0.39 -0.29
1.12 0.52 0.54 0.28 0.23 0.43 -0.49 -0.87 -1.1 -1.2 -1.2 -0.72
0.66 0.45 0.37 0.09 0.1 0.11 -0.38 -0.39 -0.52 -0.44 -0.41 -0.27
0.84 0.29 0.26 0.1 0.0 -0.01 -0.31 -0.44 -0.25 -0.33 -0.21 -0.55
0.87 0.32 0.54 0.1 0.15 -0.05 -0.14 -0.31 -0.47 -0.61 -0.69 -0.72
1.26 0.91 0.22 0.14 0.11 0.26 0.05 -0.7 -1.37 -1.4 -1.19 -1.58
0.97 0.75 0.63 0.03 0.2 -0.04 -0.34 -0.8 -0.97 -1.13 -1.01 -0.25
1.19 0.65 0.85 0.63 0.59 -0.49 -0.85 -1.17 -1.46 -1.81 -1.52 -0.79
0.5 0.53 0.4 0.23 0.25 0.11 0.13 -0.39 -0.72 -0.82 -0.67 -0.47
0.43 0.59 0.11 0.22 -0.1 -0.02 -0.12 -0.38 -0.4 -0.26 -0.03 -0.45
0.61 0.2 0.3 0.12 0.16 -0.06 -0.31 -0.32 -0.3 -0.35 -0.25 -0.19
0.87 1.15 0.18 0.35 -0.07 0.25 0.15 -0.92 -1.29 -1.38 -0.75 -1.4
0.55 0.42 0.1 0.12 0.0 -0.02 -0.12 -0.34 -0.34 -0.39 -0.18 -0.12
0.38 0.7 0.35 0.3 -0.08 -0.19 -0.74 -0.67 -0.39 -0.32 -0.2 0.12
0.49 0.22 0.27 0.16 0.0 0.06 -0.36 -0.32 -0.23 -0.24 -0.17 -0.16
0.96 1.15 0.15 0.35 -0.13 0.24 0.14 -0.9 -1.36 -1.39 -0.75 -1.49
0.57 0.34 0.24 0.03 0.09 0.21 -0.2 -0.37 -0.31 -0.31 -0.4 -0.31
0.76 0.28 0.21 0.22 -0.39 0.22 -0.43 -0.5 -0.21 -0.62 -0.1 -0.08
0.93 0.21 -0.67 -0.52 0.3 0.59 0.16 -0.09 -0.34 -0.59 -0.59 -0.5
0.69 0.46 0.03 0.07 -0.06 -0.15 -0.47 -0.39 -0.29 -0.16 -0.2 0.01
1.17 0.65 -0.01 0.22 -0.02 0.16 -0.77 -0.81 -0.7 -0.69 -0.26 -0.54
0.33 0.28 0.2 -0.02 0.12 -0.07 0.01 -0.16 -0.24 -0.29 -0.19 -0.12
0.35 0.65 0.01 0.21 -0.19 -0.16 -0.19 -0.16 -0.26 -0.21 -0.14 -0.25
0.85 0.55 0.11 -0.01 -0.18 0.17 -0.37 -0.57 -0.17 -0.43 -0.27 -0.43
0.52 0.52 0.17 0.17 -0.09 0.07 -0.18 -0.3 -0.3 -0.36 -0.36 -0.26
1.12 0.69 0.09 0.19 0.33 0.15 -0.35 -0.62 -0.83 -0.55 -1.04 -1.05
0.36 0.16 -0.1 -0.06 0.14 -0.04 -0.13 0.04 -0.07 -0.17 -0.15 -0.07
0.79 0.48 0.01 0.06 -0.16 0.36 -0.33 -0.37 -0.44 -0.48 -0.26 -0.33
0.39 0.41 0.39 0.21 -0.1 -0.02 0.02 -0.42 -0.29 -0.41 -0.24 -0.34
0.61 0.47 0.36 0.02 -0.27 0.05 -0.13 -0.47 -0.13 -0.38 -0.08 -0.59
0.68 0.49 -0.19 0.08 0.21 0.39 0.37 -0.14 -0.38 -0.93 -0.69 -1.08
0.83 0.4 0.24 0.17 0.0 -0.21 -0.47 -0.43 -0.36 -0.33 -0.3 -0.18
1.05 0.61 0.19 -0.01 -0.17 0.02 -0.4 -0.54 -0.4 -0.48 -0.45 -0.51
0.4 0.29 0.22 0.11 0.14 0.27 0.07 -0.02 -0.42 -0.49 -0.56 -0.45
0.58 0.48 0.1 -0.04 -0.17 -0.03 -0.43 -0.26 -0.17 -0.17 -0.15 -0.09
1.19 0.65 0.35 0.34 -0.0 -0.41 -1.03 -1.15 -0.7 -1.07 -0.34 0.04
0.52 0.3 0.26 0.21 0.11 -0.28 -0.01 -0.15 -0.26 -0.38 -0.26 -0.43
1.04 1.65 0.16 0.02 -0.13 -1.36 -0.69 -0.83 -1.3 -1.05 -0.69 -0.57
0.51 0.26 0.02 -0.07 -0.07 0.1 -0.08 -0.31 -0.21 -0.16 -0.03 -0.17
0.48 0.07 0.16 -0.06 -0.07 -0.0 -0.18 -0.11 -0.1 -0.17 -0.02 -0.15
0.77 0.7 0.35 -0.04 -0.23 -0.07 -0.51 -0.56 -0.46 -0.54 -0.19 -0.08
0.95 0.65 0.22 0.32 0.34 0.04 -0.17 -1.03 -0.85 -0.84 -0.5 -0.74
1.44 0.73 0.21 0.23 0.18 -0.13 -0.5 -0.73 -1.01 -1.37 -0.81 -1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.