Heatmap: Cluster_27 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.25 0.44 0.42 0.5 0.67 0.63 0.32 0.49 1.32 0.57 0.31 0.87
16.06 13.58 11.49 14.57 16.33 18.56 15.84 16.37 18.11 13.63 15.18 15.51
0.14 0.02 0.02 0.04 0.0 0.15 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.02
5.76 5.38 5.19 4.79 4.59 5.61 6.55 6.09 6.89 5.18 4.65 5.24
2.31 2.75 2.62 2.93 2.07 1.68 1.94 3.15 2.38 2.22 1.61 3.16
1.36 0.36 0.07 0.54 0.18 2.51 1.57 0.68 2.27 1.06 0.78 0.88
1.07 0.85 1.0 1.25 1.08 1.12 0.89 1.15 0.93 0.77 0.97 1.1
0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.08 0.0 0.28 0.02 0.0 0.0
0.71 0.21 0.59 0.6 0.47 0.55 0.44 1.03 1.38 1.0 0.62 0.38
0.29 0.38 0.49 0.64 0.43 1.76 0.43 0.41 1.38 0.08 0.14 0.34
0.29 0.46 0.0 0.29 0.67 0.0 0.62 0.86 0.54 0.08 0.34 0.17
57.34 59.6 63.93 63.64 64.7 67.87 65.55 67.1 69.27 62.48 66.88 59.53
31.45 47.7 64.03 54.68 48.42 40.75 34.16 66.87 54.16 42.62 36.23 40.85
2.04 2.84 2.17 3.15 2.8 4.23 2.96 3.0 3.96 2.59 2.48 3.03
6.5 5.05 5.99 5.9 7.24 6.17 6.16 6.67 9.3 7.06 8.62 7.77
1.12 1.0 1.85 1.07 1.63 1.39 1.02 2.32 1.67 1.39 1.53 0.96
0.11 0.13 0.05 0.0 0.92 0.3 0.51 0.72 1.54 0.0 0.19 0.3
7.95 7.18 9.58 7.57 7.66 9.19 9.62 8.79 9.51 8.52 9.07 9.29
4.98 3.21 2.24 2.07 2.08 1.96 2.93 2.05 3.46 2.26 2.24 2.07
6.88 8.88 7.38 8.46 9.86 10.55 8.44 7.71 10.87 9.48 8.94 9.51
0.54 0.38 0.2 0.4 0.29 0.52 0.4 0.36 0.42 0.45 0.53 0.54
1.67 1.34 1.62 2.37 1.62 2.08 2.17 2.0 1.67 1.14 1.84 1.66
0.07 0.29 0.16 0.15 0.66 0.94 0.35 0.44 0.53 0.23 0.44 0.2
0.21 0.1 0.0 0.11 0.11 0.29 0.05 0.18 0.42 0.06 0.04 0.04
8.0 8.01 8.69 9.41 9.83 9.95 10.39 9.05 9.04 6.9 9.57 8.42
1.93 1.22 1.75 1.45 1.19 1.54 1.92 1.61 2.21 1.57 1.24 1.78
0.64 0.69 0.8 0.83 0.38 0.3 0.72 0.64 0.89 0.49 0.59 0.78
0.18 0.14 0.16 0.16 0.39 0.29 0.25 0.26 0.6 0.27 0.11 0.27
0.54 0.5 0.72 0.96 1.14 0.66 0.57 1.28 2.49 1.01 1.46 1.0
0.14 0.05 0.07 0.03 0.07 0.24 0.22 0.4 0.39 0.19 0.16 0.21
3.29 3.47 5.24 5.87 5.32 6.88 6.76 5.71 7.32 6.74 6.47 4.95
0.51 0.43 0.2 0.57 0.65 1.07 0.65 0.35 0.91 0.48 0.34 0.47
1.29 1.35 1.94 1.78 2.24 2.16 2.55 1.62 2.18 1.7 1.78 1.05
2.93 2.28 2.09 3.01 3.43 2.21 3.39 2.0 1.97 2.37 1.73 2.07
0.07 0.08 0.03 0.16 0.0 0.32 0.56 0.39 0.51 0.12 0.24 0.32
0.07 0.04 0.02 0.02 0.07 0.23 0.07 0.02 0.32 0.08 0.05 0.04
0.0 0.11 0.0 0.09 0.06 0.47 0.43 0.24 0.35 0.08 0.12 0.0
2.03 2.35 1.95 2.7 2.65 3.25 1.81 3.36 4.71 2.15 2.56 2.31
0.25 0.21 0.1 0.52 0.52 0.17 0.79 0.29 0.3 0.17 0.24 0.27
0.61 0.82 0.57 1.13 1.1 1.13 0.99 0.81 1.05 1.04 1.14 0.45
0.14 0.17 0.0 0.26 0.09 0.4 0.0 0.1 0.4 0.16 0.11 0.17
0.25 0.02 0.03 0.1 0.1 0.96 0.43 0.36 1.56 0.1 0.55 0.41
0.36 0.04 0.58 0.47 0.07 0.88 0.1 0.42 1.95 0.39 0.24 0.36
0.61 0.87 0.33 0.5 0.25 0.61 0.4 0.31 0.56 0.5 0.63 0.28
1.63 1.13 0.77 2.09 0.63 1.85 0.86 1.47 3.23 0.85 1.59 1.53
0.04 0.02 0.02 0.02 0.11 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0
17.8 17.33 17.72 16.76 17.28 13.4 15.7 18.17 17.78 15.48 15.44 19.13
0.75 0.99 0.52 0.71 0.61 0.74 1.44 1.27 1.04 1.25 1.1 1.26
3.83 4.77 5.02 4.62 4.55 5.8 3.96 3.88 4.74 4.25 6.56 4.14
0.32 0.3 0.29 0.14 0.33 0.36 0.62 0.15 0.67 0.61 0.2 0.45
0.0 0.0 0.26 0.22 0.33 0.28 0.14 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0
8.97 8.97 9.01 8.93 9.39 9.59 10.06 9.0 10.71 9.66 10.28 9.4
1.0 0.91 1.56 1.34 0.91 1.37 1.24 0.75 2.82 0.69 1.13 1.41
1.72 2.33 1.89 2.33 2.33 3.71 2.05 2.25 3.73 1.92 2.67 1.83
0.25 0.24 0.07 0.31 0.4 0.31 0.21 0.29 0.4 0.24 0.48 0.34
0.07 0.19 0.34 0.08 0.07 0.78 0.29 0.12 1.17 0.31 0.61 0.28
0.68 0.75 0.75 0.69 0.64 0.56 0.61 0.84 0.44 0.88 0.46 0.94
2.04 1.52 0.99 1.41 1.94 2.68 1.95 1.31 2.54 1.27 2.62 1.68
0.68 0.82 0.84 1.16 1.01 1.09 1.14 0.83 0.86 0.7 0.9 0.73
0.0 0.02 0.0 0.15 0.36 0.17 0.07 0.1 0.58 0.07 0.0 0.0
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.04 0.47 0.1 0.11 0.19
0.18 0.12 0.0 0.08 0.19 0.42 0.26 0.04 0.98 0.25 0.26 0.04
0.11 0.0 0.02 0.09 0.0 0.15 0.27 0.11 0.58 0.14 0.23 0.04
0.46 0.39 0.26 0.35 0.09 0.45 0.29 0.8 1.17 0.22 0.69 0.43
1.11 1.09 0.43 0.71 0.72 1.16 0.86 0.93 1.51 0.87 1.19 1.33
0.07 0.02 0.15 0.14 0.19 0.11 0.06 0.21 0.16 0.1 0.1 0.13
0.04 0.07 0.04 0.29 0.24 0.29 0.15 0.27 0.65 0.16 0.05 0.24
0.14 0.11 0.41 0.16 0.32 0.52 0.37 0.29 0.23 0.08 0.21 0.11
0.04 0.13 0.09 0.07 0.09 0.21 0.07 0.06 0.25 0.08 0.18 0.15
0.36 0.42 0.09 0.41 0.49 0.71 0.32 0.56 0.79 0.45 0.61 0.27
10.4 10.65 12.28 12.78 10.36 12.58 12.51 11.53 12.37 12.8 11.17 12.39
0.61 0.38 0.12 0.82 0.32 1.28 0.62 0.25 0.7 0.57 0.82 0.36
0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.02 0.1 0.12 0.04 0.02 0.02
0.86 0.76 0.63 0.96 1.2 1.4 1.03 1.31 1.53 1.0 1.14 0.75
0.96 1.0 1.22 1.41 1.17 0.76 0.92 1.24 1.1 0.96 1.06 0.79
0.89 1.53 0.65 1.66 1.88 1.57 2.21 1.53 2.44 2.59 2.11 2.31
60.11 60.83 62.26 63.31 60.57 53.35 55.87 61.38 58.52 57.19 55.7 55.76
62.58 70.37 75.63 72.21 73.62 69.72 66.89 71.4 77.25 68.52 70.78 67.68
29.27 25.82 28.56 26.79 31.15 28.78 31.16 29.5 29.19 28.92 26.31 27.57
6.09 7.34 8.2 7.47 8.53 8.12 7.55 8.25 8.4 7.09 8.34 9.15
0.71 0.66 0.31 0.71 0.42 0.82 0.82 0.92 0.98 0.14 0.8 0.35
2.14 1.8 0.79 1.05 1.83 2.11 2.7 1.88 2.26 2.59 2.28 2.45
16.89 17.08 14.82 17.46 19.48 14.59 16.54 15.02 19.9 12.21 13.79 12.78
0.5 1.54 0.84 1.99 1.86 2.19 2.21 1.61 1.91 1.29 1.09 0.65
2.42 2.57 2.33 3.17 2.91 3.25 2.89 3.29 3.28 2.36 2.66 2.08
1.26 0.97 0.69 0.76 1.42 2.24 1.1 0.69 1.49 0.71 1.33 0.94
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.59 0.1 0.1 0.44 0.14 0.09 0.17
0.14 0.08 0.03 0.29 0.08 0.62 1.23 0.55 1.1 0.26 0.23 0.04
1.4 1.93 1.98 2.68 2.65 1.67 1.67 1.88 2.24 1.09 2.36 2.02
9.08 8.29 9.81 9.87 9.99 11.83 9.84 9.82 11.48 9.31 10.08 10.23
1.97 1.92 1.46 2.3 3.01 3.47 2.34 2.12 2.06 2.32 3.61 1.56
0.14 0.48 0.16 0.41 0.3 0.43 0.48 0.37 0.75 0.43 0.41 0.76
0.04 0.21 0.1 0.26 0.26 0.16 0.16 0.07 0.33 0.23 0.16 0.13
0.11 0.34 0.1 0.23 0.05 1.21 0.2 0.48 1.21 0.19 0.27 0.13
2.79 4.69 3.77 5.91 6.47 8.45 6.33 6.88 7.67 4.81 5.23 4.02
0.83 0.25 0.73 0.29 0.24 1.32 0.41 0.98 1.16 0.77 0.3 0.43
4.05 2.34 0.6 3.06 1.23 3.29 3.3 2.14 4.43 3.98 0.78 2.94
1.29 1.63 2.16 2.63 1.93 3.64 2.24 1.97 2.73 2.04 1.84 1.09
2.57 2.77 2.03 4.21 2.16 2.63 3.1 1.63 2.39 1.3 2.87 1.6
26.57 24.0 22.27 23.55 23.29 23.76 24.22 23.97 23.72 20.83 24.56 21.48
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.02 0.14 0.05 0.0 0.1

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)