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Heatmap: Cluster_75 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.69 -0.28 -0.45 -0.24 -0.42 -0.18 0.24 0.22 0.37 0.52 0.3 0.06
-0.38 -0.55 0.05 -0.19 -0.14 -0.51 -0.2 0.28 0.38 0.32 0.41 0.08
-0.23 -0.49 -0.48 -0.1 -0.21 -0.18 0.11 0.46 0.04 0.35 0.21 0.19
-0.58 -0.5 -0.25 -0.11 -0.07 -0.09 -0.14 0.01 0.37 0.45 0.4 0.1
-0.38 -0.49 -0.6 -0.18 -0.1 0.05 -0.27 -0.05 0.23 0.5 0.53 0.25
-0.68 -0.38 -0.61 -0.12 -0.45 -0.33 0.38 0.46 0.35 0.45 0.33 -0.11
-0.64 -0.35 -0.27 -0.02 -0.02 0.1 0.36 0.27 0.26 0.19 0.14 -0.37
-0.59 -0.98 -1.6 -1.41 -0.25 -0.21 0.27 0.76 0.67 0.86 -0.01 0.17
-0.16 -0.18 -0.48 -0.64 -0.86 -0.67 -0.14 0.46 0.8 0.56 0.22 0.02
-2.09 -3.04 -0.22 -0.48 -0.81 -2.42 -0.3 0.51 1.25 0.81 0.74 0.34
-0.3 -0.7 -0.51 -0.63 -0.2 -0.19 0.24 0.34 0.28 0.49 0.34 0.19
-0.25 -0.52 -0.77 -0.66 -0.21 -0.05 0.39 0.48 0.12 0.63 0.04 0.04
-0.44 -0.82 -2.37 -0.67 -0.51 -0.06 0.29 0.65 0.35 0.89 0.38 0.01
-0.39 -0.08 -0.23 -0.29 -0.4 -0.33 0.02 0.15 0.34 0.38 0.33 0.16
-0.42 -0.47 -0.15 -0.32 -0.4 -0.47 0.01 0.31 0.6 0.2 0.38 0.2
-0.9 -0.34 -0.34 -0.32 -0.64 -0.27 0.2 0.13 0.46 0.59 0.47 0.13
-0.44 -0.02 -0.37 -0.45 -0.67 -0.91 0.08 0.19 0.52 0.59 0.45 0.15
-0.52 -0.2 -0.16 -0.11 -0.32 -0.37 -0.09 -0.06 0.39 0.44 0.42 0.18
-0.22 -0.1 -0.2 -0.06 -0.24 -0.11 -0.26 0.05 0.29 0.18 0.25 0.24
-0.96 -0.46 -0.51 -0.12 -0.34 -0.22 0.26 0.24 0.52 0.46 0.4 -0.03
-0.45 -0.27 -0.35 -0.06 -0.25 -0.1 -0.08 0.0 0.38 0.34 0.39 0.13
-0.14 -0.22 -0.28 -0.15 -0.1 -0.07 0.04 0.26 0.15 0.22 0.09 0.09
0.03 0.04 -0.21 -0.32 -0.43 -0.56 -0.06 0.01 0.24 0.46 0.26 0.2
-0.86 -0.61 -0.38 -0.13 -0.28 -0.19 0.1 0.35 0.43 0.37 0.47 0.08
-0.37 -0.14 -0.27 -0.06 -0.25 -0.34 0.21 0.14 0.17 0.31 0.26 0.12
-0.16 -0.16 -0.2 -0.25 -0.5 -0.36 -0.28 -0.03 0.39 0.46 0.41 0.26
-0.39 -0.19 -0.35 -0.17 -0.38 -0.58 -0.17 0.1 0.46 0.59 0.44 0.07
-0.77 -0.37 -0.58 -0.29 0.17 -0.04 0.31 0.23 0.36 0.52 -0.11 -0.01
-0.09 -0.0 -0.19 -0.18 -0.23 -0.29 -0.03 0.0 0.23 0.25 0.22 0.17
-0.25 -0.67 -0.26 -0.73 -0.7 -0.79 0.06 0.41 0.76 0.4 0.29 0.37
-0.25 -0.16 -0.4 -0.16 -0.15 -0.29 -0.13 0.09 0.36 0.27 0.4 0.15
-0.11 -0.24 -0.56 -0.27 -0.17 -0.1 0.14 0.19 0.2 0.33 0.28 0.05
-0.47 -0.74 -0.35 -0.19 -0.07 -0.14 -0.22 -0.01 0.52 0.4 0.54 0.13
-0.38 -0.36 -0.24 0.09 0.11 -0.02 0.16 0.14 0.18 0.1 0.16 -0.1
-0.13 -0.24 -0.15 -0.05 -0.14 -0.4 -0.09 -0.04 0.15 0.33 0.35 0.2
0.32 -0.41 -0.35 -0.41 -0.32 -0.5 -0.47 0.18 0.32 0.5 0.33 0.23
-0.52 -0.32 -0.03 -0.21 -0.2 -0.06 0.04 0.03 0.33 0.33 0.27 0.09
-0.22 -0.3 -0.16 -0.32 -0.41 -0.45 0.06 0.06 0.46 0.49 0.29 0.09
-0.3 -0.44 -0.66 -0.26 -0.16 -0.34 -0.1 0.03 0.47 0.51 0.42 0.26
-0.9 -0.46 -0.47 -0.2 -0.48 -0.38 0.28 0.35 0.46 0.52 0.4 0.06
-0.48 -0.09 -0.64 0.06 -0.4 -0.18 0.2 0.22 0.35 0.38 0.32 -0.17
0.05 -0.12 -0.18 -0.21 -0.22 -0.19 -0.14 -0.01 0.17 0.33 0.18 0.19
-0.53 -0.25 -0.2 -0.14 -0.21 -0.18 -0.08 -0.01 0.37 0.32 0.43 0.16
-0.85 -0.66 -0.16 -0.17 -0.22 -0.13 -0.03 0.08 0.61 0.37 0.43 0.08
-0.2 -0.29 -0.81 -0.58 -0.71 -0.2 0.12 0.45 0.63 0.52 0.21 -0.0
-0.28 -0.7 -0.9 -0.54 -0.69 -0.28 -0.16 -0.07 0.55 0.65 0.7 0.46
-0.48 -0.37 -0.58 -0.51 -0.33 -0.22 -0.02 0.36 0.4 0.39 0.5 0.24
-1.03 -0.91 -1.61 -0.86 -1.61 -1.4 -0.74 0.03 1.26 1.08 0.78 0.63
-1.14 -0.51 -0.25 0.05 -0.2 -0.66 0.01 0.22 0.53 0.45 0.44 0.16
0.01 -0.44 -0.21 -0.33 -0.36 -0.0 -0.24 0.2 0.39 0.34 0.14 0.2
-0.54 -0.45 -0.42 -0.25 -0.52 -0.26 -0.32 0.04 0.54 0.64 0.4 0.38
-0.47 -0.58 -0.64 -0.03 -1.18 -0.53 0.51 0.38 0.05 0.78 0.08 0.41
-0.61 -0.47 -0.21 -0.17 -0.14 -0.14 -0.06 0.09 0.36 0.34 0.39 0.22
-0.17 -0.23 -0.17 -0.13 -0.27 -0.34 -0.14 0.15 0.33 0.26 0.32 0.15
-0.09 -0.24 -0.28 -0.06 -0.07 -0.28 0.04 0.26 0.08 0.2 0.21 0.11
0.19 -0.37 -0.27 -0.44 -0.68 -2.17 -0.65 0.16 0.4 0.58 0.59 0.68
-0.32 -0.23 -0.43 -0.21 -0.19 -0.03 0.22 0.2 0.17 0.29 0.15 0.14
-0.66 -0.21 -0.22 -0.18 -0.12 -0.02 0.26 0.24 0.21 0.3 0.13 0.01
-0.31 -0.25 -0.47 -0.66 -0.85 -0.26 0.02 0.33 0.48 0.59 0.44 0.1
-0.26 -0.77 -0.52 -0.57 -0.35 0.02 0.11 0.34 0.39 0.4 0.32 0.24
-0.57 -0.49 -0.33 -0.24 -0.45 -0.6 -0.24 0.17 0.49 0.65 0.4 0.4
-0.48 -0.27 -0.31 -0.12 -0.35 -0.32 -0.05 0.02 0.48 0.37 0.3 0.3
-0.37 -0.37 -0.36 -0.21 -0.31 -0.17 0.14 0.32 0.16 0.4 0.28 0.16
-0.24 -0.36 -0.29 -0.11 -0.13 -0.18 0.13 0.37 0.0 0.24 0.12 0.23
-0.12 -0.15 -0.33 -0.19 -0.29 -0.51 -0.21 -0.09 0.23 0.5 0.5 0.24
-0.55 -0.58 -0.28 -0.26 -0.05 -0.55 -0.38 0.02 0.58 0.45 0.53 0.33
-0.06 -0.5 0.02 -0.17 -0.21 -1.0 -0.63 0.23 0.27 0.31 0.54 0.43
-0.35 -0.28 -0.28 -0.23 -0.2 -0.18 -0.15 0.17 0.44 0.34 0.27 0.13
-0.1 -0.34 -0.04 -0.37 -0.13 -0.27 0.03 0.19 0.41 0.18 -0.02 0.23
-0.05 -0.18 -0.14 -0.15 -0.27 -0.62 -0.07 0.1 0.2 0.35 0.25 0.29
-0.32 -0.32 -0.51 -0.24 -0.24 -0.04 -0.06 0.0 0.34 0.31 0.44 0.26
-2.37 -2.5 -1.5 -1.22 -3.63 -3.11 -1.11 0.79 1.59 0.91 0.45 1.13
-0.07 -0.3 -0.38 -0.18 -0.28 -0.19 -0.02 -0.02 0.33 0.33 0.4 0.12
-2.05 -0.61 -0.94 -0.32 -0.7 -0.76 0.45 0.22 0.79 0.67 0.63 0.23
-0.46 -0.36 -0.77 -0.67 -0.83 -0.62 -0.16 -0.0 0.72 0.8 0.6 0.35
-0.02 -0.65 -0.1 -0.24 -0.29 -0.32 0.11 0.09 0.44 0.38 0.24 0.01
-0.13 -0.39 -0.57 -0.21 -0.05 -0.25 -0.28 0.16 0.21 0.51 0.3 0.29
-0.64 -0.95 -0.44 -0.6 -0.61 -0.26 -0.31 0.02 0.8 0.66 0.61 0.36
-0.3 -0.26 -0.29 -0.14 -0.09 -0.02 -0.01 0.22 0.32 0.12 0.18 0.11
-0.35 -0.48 -0.3 -0.25 -0.32 -0.06 0.17 0.26 0.36 0.32 0.25 0.06
-0.29 -0.38 -0.2 -0.2 -0.36 -0.34 -0.06 0.38 0.19 0.32 0.32 0.27
-0.78 -0.43 -0.27 -0.63 -0.35 -0.57 -0.05 -0.08 0.66 0.77 0.56 0.11
-0.17 -0.34 -0.83 -0.52 -0.39 -0.14 0.26 0.49 0.36 0.52 0.02 0.07
-0.35 -0.25 -0.15 -0.05 -0.1 -0.05 -0.05 0.01 0.22 0.21 0.3 0.11
-0.23 -0.41 -0.15 -0.2 -0.12 -0.21 -0.07 0.24 0.17 0.21 0.34 0.22
-0.33 -0.31 -0.11 -0.26 -0.1 -0.53 -0.02 0.14 0.38 0.37 0.35 0.09
-0.53 -0.55 -0.2 -0.29 -0.25 -0.14 -0.12 0.13 0.48 0.32 0.44 0.24
-0.61 -0.19 -0.21 0.05 -0.36 -0.28 0.02 0.17 0.25 0.43 0.33 0.05
-0.38 -0.61 -0.68 -0.31 -0.46 -0.02 -0.42 -0.03 0.58 0.47 0.65 0.33
-0.09 -0.19 -0.38 -0.11 -0.16 -0.14 -0.05 0.14 0.21 0.23 0.21 0.18
-0.27 -0.3 -0.16 -0.14 -0.08 0.09 -0.1 0.02 0.19 0.15 0.32 0.13
-0.1 -0.36 -1.09 -0.3 -1.04 -0.2 0.29 0.65 0.18 0.4 0.14 0.39
-0.65 0.06 -0.28 -0.11 -0.6 -0.58 0.17 0.09 0.3 0.49 0.41 0.12
-0.84 -0.51 -0.16 -0.18 -0.22 -0.1 0.33 0.5 0.38 0.32 -0.06 -0.01
-0.55 -0.18 -0.34 -0.23 -0.4 -0.38 0.28 0.25 0.32 0.38 0.33 0.09
-0.7 -0.74 -0.26 -0.32 -0.5 -0.3 0.03 0.49 0.38 0.5 0.45 0.18
-1.02 -0.69 -0.27 -0.32 -0.39 -0.3 -0.05 0.02 0.43 0.49 0.77 0.31
-0.08 -0.44 -0.81 -0.44 -0.18 0.17 0.08 0.48 0.26 0.32 0.11 0.03
-0.71 -0.69 -0.22 -0.01 0.07 0.05 0.35 0.21 0.32 0.34 0.01 -0.19
-0.09 -0.42 -0.6 -0.29 -0.41 -0.12 -0.62 -0.11 0.41 0.42 0.56 0.52
-0.16 -0.34 -0.06 -0.25 -0.07 -0.16 -0.07 -0.08 0.18 0.37 0.26 0.22
-1.26 -0.26 -0.35 0.04 -0.2 -0.37 0.37 0.4 0.06 0.51 0.07 0.2
-0.34 -0.2 -0.36 -0.13 -0.24 -0.1 0.23 0.21 0.17 0.34 0.19 0.0
-0.19 -0.2 -0.06 -0.3 -0.31 -0.2 0.06 0.06 0.35 0.25 0.19 0.14
-0.38 -0.24 -0.44 -0.11 -0.24 -0.06 0.27 0.32 0.2 0.29 0.15 -0.03
0.18 -0.15 -0.17 -0.18 -0.08 -0.07 -0.01 0.02 0.18 0.04 0.05 0.14
-0.14 -0.3 -0.2 -0.11 -0.09 -0.17 -0.09 -0.06 0.23 0.41 0.24 0.11
-0.29 -0.26 -0.36 -0.19 -0.26 -0.14 -0.24 0.02 0.38 0.32 0.41 0.27
-0.22 -0.13 -0.3 -0.13 -0.23 -0.03 0.15 0.11 0.2 0.26 0.15 0.04
-0.23 -0.5 -0.05 -0.41 -0.49 -0.6 -0.39 0.06 0.62 0.4 0.47 0.38
-0.05 -0.29 -0.18 -0.52 -0.15 -0.14 -0.06 0.03 0.34 0.2 0.32 0.24
-0.43 -0.28 -0.48 -0.28 -0.19 -0.01 -0.13 -0.03 0.46 0.26 0.45 0.25
-0.24 -0.22 -0.14 -0.08 0.0 -0.08 0.02 0.14 0.23 0.06 0.13 0.11
-0.06 -0.26 -0.23 -0.25 -0.12 -0.09 -0.07 0.13 0.3 0.08 0.16 0.26
-0.2 -0.61 0.05 -0.09 -0.27 -0.39 -0.39 -0.04 0.33 0.45 0.43 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.