Heatmap: Cluster_104 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
48.88 40.61 48.72 46.33 49.79 49.31 46.56 57.25 56.04 51.26 53.05 49.92
0.07 0.16 0.2 0.16 0.2 0.11 0.15 0.07 0.11 0.36 0.12 0.11
71.51 66.66 80.96 74.56 74.67 87.16 94.31 100.64 89.01 99.08 85.08 84.22
7.45 6.41 5.04 6.27 6.15 7.15 10.48 8.59 9.94 14.61 10.68 9.72
7.21 6.39 7.45 9.73 9.65 11.96 14.67 15.96 19.34 17.51 13.49 11.81
0.47 0.19 0.34 0.15 1.47 0.93 1.06 1.62 1.41 2.46 1.42 1.12
6.17 6.78 3.11 5.97 6.31 6.91 12.32 13.15 11.97 13.26 10.17 7.09
1.84 1.79 2.28 1.7 3.55 4.17 6.64 5.89 5.57 6.36 2.65 2.97
1.32 0.87 1.1 0.74 1.83 1.94 4.04 4.0 3.01 4.13 2.39 1.39
0.71 1.26 0.53 1.61 1.52 1.74 1.17 1.63 1.95 2.94 1.34 1.41
0.57 0.47 0.17 0.73 0.24 1.02 1.46 1.66 1.03 1.87 0.51 0.59
4.13 4.49 6.92 5.55 3.71 5.42 8.6 3.73 7.23 12.67 3.78 5.89
1.1 0.98 1.27 0.82 1.32 2.77 4.41 5.08 4.31 5.59 3.21 2.06
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.03 0.03 0.0 0.46 0.04 0.3 0.08 0.09 0.64 0.09 0.0
18.78 18.97 21.47 24.57 24.47 24.77 30.36 29.35 27.62 32.89 24.71 22.91
0.5 0.11 0.0 0.4 0.26 0.42 0.28 0.06 0.0 0.68 0.2 0.24
0.04 0.03 0.0 0.11 0.2 0.18 0.66 0.53 0.65 0.86 0.21 0.28
0.14 0.07 0.39 0.09 0.12 0.22 0.41 0.19 0.12 0.62 0.33 0.3
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.1 0.31 0.36 0.32 0.43 0.07 0.1
0.0 0.09 0.0 0.08 0.07 0.0 0.21 0.0 0.3 0.51 0.0 0.15
0.18 0.3 0.47 0.31 0.07 0.04 0.41 0.35 0.07 0.64 0.33 0.15
0.11 0.08 0.22 0.02 0.0 0.05 0.87 0.28 0.21 1.14 0.11 0.13
44.23 35.78 47.86 43.93 47.41 51.73 53.25 55.14 65.73 58.36 52.52 49.19
0.14 0.16 0.29 0.19 0.16 0.29 0.32 0.23 0.23 0.49 0.17 0.26
0.04 0.06 0.0 0.03 0.0 0.05 0.27 0.34 0.1 0.12 0.09 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.19 0.0 0.04 0.02 0.35 0.02 0.02
0.07 0.02 0.07 0.02 0.1 0.23 0.59 0.62 0.54 0.88 0.36 0.26
0.28 0.04 0.02 0.08 0.38 0.27 0.63 0.97 1.23 1.0 0.32 0.53
0.04 0.02 0.0 0.18 0.17 0.07 0.04 0.05 0.02 0.29 0.05 0.02
8.07 9.07 8.82 8.98 12.4 10.54 14.89 14.71 16.45 17.62 12.36 9.86
2.27 3.29 2.52 4.25 4.81 5.57 7.46 6.36 13.96 17.08 12.64 6.68
0.15 0.07 0.0 0.08 0.0 0.17 0.05 0.04 0.04 0.31 0.11 0.17
19.37 16.59 21.7 20.77 20.47 21.85 25.56 28.45 24.97 28.47 25.16 24.84
0.04 0.06 0.0 0.12 0.14 0.17 0.02 0.04 0.16 0.56 0.02 0.15
0.0 0.0 0.02 0.0 0.32 0.0 0.59 0.49 0.35 0.97 0.35 0.23
1.5 1.6 2.04 2.37 1.77 1.63 1.98 1.59 2.0 3.13 1.92 1.67
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.22 0.56 0.15 0.21 1.3 0.09 0.15
0.21 0.13 0.02 0.13 0.25 0.55 0.6 0.63 0.68 1.18 0.39 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.02 0.0 0.16 0.05 0.04
2.0 1.92 2.15 2.29 2.46 2.81 3.5 3.86 3.2 4.32 3.09 2.94
0.68 0.1 0.03 0.53 0.69 0.04 1.47 0.77 0.71 1.52 0.14 0.55
0.04 0.02 0.0 0.1 0.12 0.02 0.15 0.31 0.23 0.28 0.06 0.02
1.86 1.69 1.76 1.83 2.41 2.07 3.64 2.79 3.53 5.85 3.3 2.89
0.21 0.17 0.29 0.44 0.25 0.11 0.97 0.61 1.46 1.89 0.59 0.43
0.75 0.6 1.04 0.88 1.11 0.86 1.32 1.24 0.8 1.94 1.01 0.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.14 0.38 0.2 0.19 0.68 0.11 0.08
23.75 21.98 26.72 26.83 26.44 31.33 26.89 30.93 29.83 27.86 29.22 25.63
9.84 8.12 7.5 9.23 9.18 11.26 12.89 12.51 13.17 11.98 11.01 10.89
1.07 0.73 0.26 0.76 0.43 0.92 3.07 2.91 1.97 2.61 1.63 0.97
0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.13 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
1.38 0.86 0.36 1.21 2.94 3.01 2.82 2.95 4.08 6.0 2.85 2.29
14.38 11.39 15.5 14.65 15.37 17.63 15.44 18.95 19.38 17.02 16.02 14.52
5.58 3.28 4.97 4.58 7.0 6.88 8.43 8.19 10.22 11.62 8.35 7.83
2.12 1.95 0.71 2.13 3.29 2.14 5.62 3.75 3.83 4.85 4.02 3.13
1.25 0.36 0.71 1.01 1.12 1.56 2.04 2.29 1.98 2.67 1.23 1.01
3.25 2.48 2.05 2.55 2.45 3.27 5.51 4.51 4.91 4.9 4.23 3.61
0.78 0.24 0.05 0.07 0.16 0.47 0.71 0.63 0.65 1.48 1.28 0.8
0.71 0.38 0.96 0.34 0.7 1.46 2.04 1.45 1.49 1.63 1.04 0.72
0.0 0.04 0.05 0.08 0.0 0.04 0.08 0.04 0.0 0.21 0.02 0.02
1.85 1.08 2.34 1.62 1.86 3.05 4.17 3.63 3.43 4.72 2.67 2.39
0.04 0.11 0.06 0.18 0.12 0.26 0.48 0.46 0.28 0.26 0.15 0.09
16.18 18.8 22.14 20.69 18.72 20.03 22.26 21.85 30.38 33.39 27.02 20.11

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)