Heatmap: Cluster_187 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
100233	-0.81	-0.96	-0.37	-0.28	-0.03	0.13	0.33	0.35	0.41	0.26	0.16	0.07
100257	-1.41	-1.43	-1.18	-0.44	-0.04	0.15	0.5	0.46	0.59	0.62	0.49	-0.38
101455	-0.87	-1.08	-0.75	-0.69	0.02	0.2	0.36	0.63	0.61	0.53	0.02	-0.35
103597	-0.58	-0.81	-3.22	-0.96	0.31	-0.02	0.64	0.66	0.29	0.73	0.11	-0.3
110980	-0.43	-0.68	-1.05	-0.6	-0.34	0.02	0.37	0.41	0.29	0.51	0.28	0.25
123078	-0.98	-0.57	-0.45	-0.16	-0.13	0.53	0.38	0.32	0.42	0.22	0.04	-0.41
123482	-0.98	-0.9	-0.9	-0.87	0.06	-0.04	0.4	0.43	0.55	0.49	0.44	-0.04
125812	-1.34	-1.14	-2.93	-2.65	-1.08	-0.01	0.6	0.55	0.98	0.98	0.51	0.06
127233	-0.53	-0.95	-1.28	-0.99	-0.09	0.39	0.34	0.79	0.32	0.41	0.3	-0.3
130525	-0.46	-0.8	-0.61	-0.59	-0.07	0.35	0.56	0.62	0.05	0.26	0.02	-0.17
137550	-1.18	-1.78	-2.74	-1.8	-0.17	0.0	0.53	0.47	1.17	0.82	0.18	-0.06
140975	-0.62	-0.42	-0.25	-0.04	0.0	-0.12	0.22	0.43	0.17	0.31	0.03	-0.04
141115	-0.75	-1.18	-1.22	-0.93	0.05	0.58	0.53	0.64	0.12	0.42	0.2	-0.14
146742	-0.32	-0.34	-0.19	-0.11	-0.09	0.06	0.08	0.19	0.25	0.17	0.13	0.02
148450	-0.44	-0.3	-0.34	-0.12	-0.09	0.16	0.17	0.31	0.22	0.19	0.04	-0.03
154240	-0.57	-0.23	-0.08	0.02	-0.14	0.14	0.11	0.11	0.14	0.09	0.23	-0.01
15483	-0.52	-0.31	-0.38	-0.02	-0.04	0.3	0.31	0.33	0.23	0.13	-0.04	-0.32
168311	-0.29	-0.31	-0.24	-0.11	0.0	0.04	0.12	0.15	0.2	0.18	0.16	-0.03
169709	-0.51	-0.35	-0.24	-0.18	0.13	0.14	0.18	0.28	0.27	0.18	0.07	-0.24
170158	-0.7	-0.47	-0.34	-0.05	0.06	0.3	0.25	0.37	0.24	0.15	-0.12	-0.08
170203	-0.4	-0.18	-0.19	0.06	0.03	0.04	0.06	0.23	0.2	0.09	0.06	-0.12
17035	-1.69	-1.89	-1.09	-0.69	0.09	0.23	0.49	0.79	0.67	0.37	0.19	-0.1
170452	-0.26	-0.54	-0.28	-0.16	0.09	0.16	0.02	0.19	0.26	0.15	0.21	-0.06
173451	-0.44	-0.44	-0.52	-0.55	-0.17	-0.05	0.31	0.35	0.36	0.41	0.21	-0.0
176429	-0.08	-0.33	-0.1	-0.01	0.06	0.08	0.04	0.1	0.06	0.12	0.05	-0.05
177176	-0.65	-0.54	-0.28	-0.07	-0.06	-0.06	0.12	0.3	0.4	0.26	0.14	0.05
228214	-0.29	-0.23	-0.17	-0.07	-0.1	0.02	0.17	0.19	0.14	0.15	0.14	-0.07
229055	-0.49	-0.28	-0.25	-0.05	-0.14	0.24	0.3	0.27	0.23	0.12	0.02	-0.2
230271	-0.35	-0.5	-0.39	-0.24	-0.01	0.28	0.16	0.34	0.24	0.17	0.1	-0.11
230291	-0.36	-0.38	-0.61	-0.38	-0.28	-0.02	0.24	0.38	0.32	0.39	0.16	0.08
232167	-0.32	-0.36	-0.38	-0.17	-0.01	-0.02	0.1	0.34	0.28	0.23	0.1	-0.03
232328	-0.32	-0.29	-0.25	0.02	-0.16	0.18	0.18	0.14	0.18	0.16	0.12	-0.11
233053	-1.44	-1.05	-0.63	-0.08	-0.05	0.12	0.3	0.38	0.72	0.48	0.16	-0.3
235312	-0.59	-0.54	-0.34	-0.12	-0.06	0.36	0.38	0.29	0.32	0.19	-0.01	-0.35
270490	-0.46	-0.33	-0.38	-0.16	-0.07	0.23	0.07	0.22	0.3	0.18	0.18	-0.04
270732	-0.57	-0.59	-0.79	-0.37	-0.22	0.07	0.43	0.42	0.41	0.37	0.16	-0.03
270936	-0.24	-0.24	-0.24	-0.01	-0.07	0.23	0.24	0.24	0.16	0.07	-0.04	-0.26
270990	-0.1	-0.26	-0.22	-0.15	-0.02	0.03	0.01	0.08	0.18	0.12	0.18	0.08
271276	-0.18	-0.27	-0.26	-0.14	0.05	-0.02	0.11	0.13	0.17	0.16	0.13	0.02
399	-0.12	-0.15	-0.2	-0.05	-0.23	0.17	0.22	0.2	0.08	0.08	0.03	-0.14
402746	-0.8	-0.99	-0.7	-0.26	-0.08	0.24	0.1	0.48	0.64	0.21	0.16	0.07
402947	-0.56	-0.54	-0.27	-0.11	-0.17	0.12	0.23	0.27	0.45	0.11	0.2	-0.11
404295	-1.31	-1.23	-1.78	-0.94	0.01	-0.19	0.6	0.64	0.47	0.78	0.48	-0.14
405914	-0.45	-0.46	-0.53	-0.2	0.12	0.13	0.15	0.27	0.4	0.28	-0.01	-0.07
409515	-0.63	-1.12	-1.0	-1.05	-0.11	0.06	0.15	0.5	0.36	0.77	0.44	0.09
413420	-0.68	-0.45	-0.28	-0.06	0.2	0.09	0.17	0.22	0.26	0.24	0.05	-0.1
420505	-0.46	-0.36	-0.25	-0.17	-0.02	-0.01	0.02	0.18	0.45	0.2	0.14	0.03
420695	-0.7	-0.85	-0.39	-0.23	-0.04	0.4	0.13	0.45	0.31	0.29	0.05	-0.06
422731	-0.76	-0.57	-0.11	-0.06	-0.13	-0.05	0.19	0.28	0.3	0.34	0.15	0.01
422902	-0.74	-0.63	-0.35	-0.11	0.13	0.28	0.2	0.29	0.4	0.15	0.07	-0.2
422918	-0.55	-0.73	-0.8	-0.52	-0.33	0.13	0.26	0.37	0.21	0.73	0.2	0.14
425083	-0.64	-0.56	-0.42	-0.06	0.05	0.19	0.38	0.17	0.43	0.08	0.07	-0.12
428809	-0.58	-0.72	-0.4	-0.23	-0.13	0.13	0.21	0.19	0.33	0.38	0.44	-0.17
428985	-0.38	-0.43	-0.39	0.02	-0.01	0.39	0.36	0.42	0.1	-0.04	-0.15	-0.25
437404	-0.26	-0.34	-0.15	-0.12	0.0	0.02	0.05	0.28	0.23	0.12	0.04	-0.01
437421	-0.32	-0.42	-0.11	-0.29	-0.06	0.26	0.04	0.24	0.32	0.03	0.12	-0.02
438048	-1.76	-1.98	-1.74	-0.65	0.12	0.64	0.48	0.73	0.59	0.41	0.25	-0.34
439393	-0.87	-0.74	-0.57	-0.08	-0.03	0.39	0.34	0.2	0.39	0.29	0.19	-0.21
439954	-0.51	-0.55	-0.33	0.04	0.18	0.07	0.2	0.24	0.25	0.13	0.12	-0.16
440808	-0.82	-0.81	-0.38	-0.29	-0.1	0.12	0.14	0.45	0.43	0.24	0.27	0.08
442019	-0.32	-0.49	-0.21	-0.23	0.1	0.08	0.22	0.37	0.24	0.22	0.04	-0.3
442643	-0.27	-0.28	-0.25	-0.06	0.14	0.13	0.15	0.19	0.17	-0.0	0.06	-0.1
444170	-0.76	-0.63	-0.37	-0.13	-0.11	0.35	0.24	0.29	0.36	0.17	0.22	-0.14
444354	-0.33	-0.25	-0.28	0.01	0.08	0.16	0.09	0.18	0.16	0.08	0.05	-0.06
449148	-0.62	-0.47	-0.69	-0.11	0.29	0.31	0.44	0.4	0.29	0.01	-0.08	-0.4
55890	-0.23	-0.4	-0.25	-0.3	0.0	0.05	0.01	0.16	0.21	0.33	0.27	-0.08
59158	-0.54	-0.47	-0.52	-0.32	0.08	0.16	0.16	0.26	0.31	0.31	0.1	0.06
61072	-0.33	-0.07	-0.09	0.08	-0.06	0.05	0.13	0.03	0.09	0.08	0.15	-0.11
66109	-0.7	-0.48	-0.24	-0.3	-0.78	-0.08	0.14	0.32	0.46	0.39	0.45	0.11
68732	-0.63	-0.41	-0.32	0.05	-0.18	0.19	0.19	0.13	0.26	0.26	0.29	-0.16
71806	-0.28	-0.45	-0.18	-0.08	-0.06	0.26	0.12	0.18	0.3	0.06	0.02	-0.08
72119	-1.13	-1.17	-1.45	-0.81	0.11	0.3	0.36	0.46	0.37	0.78	0.23	0.02
73381	-1.41	-1.04	-1.06	-1.6	0.2	0.64	0.26	0.72	0.53	0.37	0.13	-0.1
74963	-0.24	-0.99	-0.56	-0.47	-0.01	0.21	0.37	0.55	0.33	0.26	-0.02	-0.16
76226	-0.44	-0.62	-0.69	-0.41	-0.07	-0.23	0.23	0.34	0.37	0.43	0.41	0.05
76736	-0.86	-1.02	-0.72	-0.52	-0.08	0.14	0.43	0.33	0.52	0.49	0.23	-0.03
77263	-0.81	-0.49	-0.58	0.01	0.16	0.45	0.29	0.26	0.28	0.11	-0.01	-0.22
79178	-0.65	-0.62	-0.65	-0.2	-0.11	0.45	0.28	0.43	0.31	0.34	0.06	-0.29
79570	-0.43	-0.55	-0.23	-0.13	0.08	-0.11	0.13	0.13	0.27	0.28	0.23	0.06
8180	-0.59	-0.71	-0.36	-0.06	-0.07	0.05	0.19	0.38	0.36	0.23	0.18	-0.05
82834	-0.43	-0.3	-0.43	-0.05	-0.1	0.27	0.13	0.17	0.21	0.09	0.29	-0.11
85338	-0.32	-0.44	-0.28	-0.15	0.06	0.15	0.13	0.27	0.15	0.19	0.09	-0.02
86206	-0.39	-0.37	-0.3	-0.12	0.28	0.17	0.16	0.21	0.09	0.1	0.03	-0.06
88062	-0.28	-0.69	-0.39	-0.39	0.1	0.37	0.28	0.33	0.45	-0.04	-0.02	-0.19
90833	-0.48	-0.34	-0.29	-0.11	0.07	0.17	0.04	0.31	0.29	0.05	0.09	-0.04
91568	-0.55	-0.86	-0.77	-0.48	-0.1	0.17	0.23	0.23	0.53	0.42	0.32	0.03
92747	-0.68	-0.58	-0.26	-0.11	0.01	0.33	0.17	0.28	0.4	0.13	0.06	-0.18
93612	-0.99	-0.74	-0.38	-0.26	0.15	0.43	0.31	0.5	0.51	0.2	-0.21	-0.41
94807	-0.97	-1.51	-1.93	-0.92	-0.24	0.38	0.33	0.56	0.74	0.67	0.15	0.13
96295	-0.46	-0.52	-0.24	-0.3	0.12	0.2	0.41	0.33	0.47	0.22	-0.31	-0.43
96495	-0.89	-0.61	-0.43	0.12	-0.02	0.19	0.2	0.29	0.37	0.11	0.24	-0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.