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Heatmap: Cluster_46 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.13 -0.26 -0.46 -0.27 0.07 0.2 0.16 0.47 0.33 -0.18 -0.02 -0.19
-0.26 -0.32 0.06 0.01 0.26 0.01 0.11 0.04 0.18 -0.03 0.02 -0.18
0.05 -0.15 0.26 -0.11 0.1 -0.32 -0.01 -0.04 0.2 0.06 0.01 -0.16
0.01 -0.4 -0.14 -0.12 0.13 0.07 0.16 0.18 0.19 -0.01 -0.06 -0.13
-0.36 -0.61 0.42 -0.48 0.2 -0.33 -0.03 -0.1 0.42 0.11 0.08 0.24
0.72 0.33 1.89 -0.06 1.1 -1.42 -2.29 - -1.14 -0.85 -2.67 -0.89
-0.13 -0.23 -0.03 -0.08 0.22 0.13 0.05 0.07 0.22 -0.11 -0.02 -0.16
-0.24 -0.61 -0.11 -0.19 0.14 0.18 -0.2 0.2 0.15 0.24 0.02 0.19
-0.02 -0.22 0.07 -0.07 0.11 0.18 -0.03 -0.02 0.16 -0.02 -0.05 -0.15
-0.07 -0.24 -0.08 -0.13 -0.05 0.06 0.08 0.23 0.08 0.06 0.05 -0.04
-0.19 -0.16 -0.09 0.06 0.22 -0.06 0.11 0.01 0.11 0.01 0.04 -0.12
-0.28 -0.67 0.23 -0.42 0.45 -0.29 0.26 0.05 0.43 -0.21 0.05 -0.05
-0.1 -0.36 0.06 -0.17 -0.03 0.18 0.01 0.22 0.15 0.04 -0.04 -0.07
-1.53 -0.4 0.84 -0.35 0.65 -0.56 0.08 -0.53 0.84 -0.81 -0.07 0.01
-0.45 -0.58 0.02 0.09 0.4 0.01 0.01 0.07 0.19 0.09 0.08 -0.18
-0.47 -0.16 -0.25 0.15 0.33 -0.01 0.13 0.03 0.15 0.07 0.06 -0.21
-0.19 -0.09 -0.01 0.12 0.18 -0.16 -0.01 0.01 0.15 -0.09 0.19 -0.17
0.11 -0.52 -0.38 -0.46 -0.03 0.02 -0.0 0.38 0.07 0.24 0.14 0.15
-0.36 -0.37 0.11 -0.24 0.23 0.1 0.23 0.25 0.09 0.13 -0.03 -0.36
-0.11 -0.33 -0.23 -0.05 0.14 0.06 0.05 0.06 0.24 0.21 0.01 -0.19
-0.12 -0.28 -0.06 -0.09 0.11 0.17 0.0 0.06 0.14 0.01 -0.05 0.04
-0.14 -0.17 0.14 0.0 0.25 -0.1 0.03 -0.03 0.11 -0.07 0.03 -0.12
-0.18 -0.28 0.08 -0.08 0.12 0.18 0.0 0.22 0.13 -0.01 -0.01 -0.29
0.01 0.01 0.06 -0.1 0.02 0.27 0.03 0.02 -0.13 -0.15 0.0 -0.12
- - 1.17 -2.01 1.18 - 1.11 -1.65 0.44 -1.74 0.54 0.73
-0.58 -0.21 0.49 -0.44 -0.07 -0.03 -0.13 -0.08 -0.11 0.37 0.01 0.38
-0.4 -0.37 0.03 0.13 0.35 0.14 -0.07 0.05 0.12 -0.01 0.04 -0.17
-0.9 0.6 0.35 0.06 0.37 0.24 -0.06 -0.67 -0.56 -0.33 0.36 -0.29
-0.1 -0.52 -0.17 -0.08 -0.08 0.24 0.3 0.15 0.16 0.04 -0.15 0.02
0.02 -0.26 -0.3 -0.17 0.69 0.05 -0.16 -0.29 0.2 -0.37 0.03 0.19
-0.04 0.03 0.26 -0.64 1.56 -2.26 -0.27 0.07 -1.9 0.36 -0.68 -0.04
-0.53 -0.5 0.09 -0.13 0.27 0.04 0.22 0.22 0.18 0.03 -0.01 -0.14
0.26 -0.43 0.16 0.02 0.16 0.23 0.63 -0.51 0.15 -0.64 -0.65 0.0
-0.85 -3.1 1.28 -1.3 1.47 - -1.93 -0.77 0.98 -0.96 0.39 0.08
-0.31 -0.31 0.21 -0.13 0.12 0.31 0.11 0.08 0.11 -0.0 -0.08 -0.27
0.03 0.23 1.44 -0.97 2.04 - - -0.48 - - -0.97 0.33
-0.96 -0.36 0.21 0.28 0.52 -0.34 0.2 -0.15 0.16 0.07 0.02 -0.19
-0.29 -0.84 -0.14 -0.39 -0.08 0.39 0.34 0.43 0.21 0.13 -0.07 -0.21
0.29 -1.95 - -0.67 2.22 -2.24 -2.24 -2.35 -1.56 0.86 0.15 0.42
- -0.71 0.94 -2.47 2.29 -2.15 1.49 - -1.47 0.0 - -
-1.44 0.27 0.64 -0.04 1.88 -0.52 0.85 -1.26 -3.83 -1.73 -0.43 -2.51
- 0.91 2.3 -0.91 2.22 - - - - - - -
-0.43 -0.5 0.06 0.04 0.06 0.26 0.15 0.29 0.31 -0.1 -0.07 -0.35
-1.02 -1.79 0.65 0.5 1.61 -1.75 0.28 -1.78 0.77 -0.87 -2.02 -0.2
-0.21 -0.22 0.46 0.33 1.03 -1.11 0.27 -1.12 0.18 -0.88 -0.04 -0.27
-1.94 -1.34 0.9 0.07 0.76 -1.22 0.57 -0.98 0.94 -0.65 0.15 -0.6
-0.24 -0.1 0.08 0.01 0.09 -0.13 -0.1 -0.01 0.17 0.03 0.08 0.07
-0.04 -0.28 -0.25 -0.03 0.05 0.15 -0.03 0.02 0.16 0.14 0.03 0.01
-0.09 -0.33 -0.01 -0.14 0.15 0.15 -0.02 0.19 0.24 0.01 -0.1 -0.16
-0.4 -0.44 0.08 -0.11 0.29 0.03 0.0 0.09 0.27 0.07 0.01 -0.07
- - 2.17 -0.34 2.16 -2.75 0.29 - - -1.76 -0.79 -
-0.85 -0.62 -0.56 -0.24 0.66 -0.53 -0.52 0.07 0.57 0.45 0.54 -0.06
-0.14 -0.32 0.04 -0.08 0.27 0.17 0.06 -0.16 0.31 -0.09 -0.03 -0.17
-0.02 -0.22 -0.06 -0.01 0.2 0.07 0.03 0.0 0.17 -0.06 -0.01 -0.14
-0.9 -1.26 -0.06 -0.14 0.59 0.75 0.16 -0.26 0.71 -0.23 -0.64 -0.13
0.31 -0.64 -0.82 -1.4 -0.28 -0.54 0.01 0.58 0.32 0.36 0.22 0.55
-2.1 0.76 0.54 -0.06 0.78 0.39 0.15 -0.72 -0.29 -1.79 0.14 -0.47
-0.74 -1.41 0.16 -1.58 0.27 0.52 0.55 0.12 0.61 -0.05 -0.0 -0.2
-0.04 -0.08 -0.3 0.09 0.29 0.2 0.29 -0.04 0.31 -0.25 -0.52 -0.23
0.0 -0.15 0.14 0.01 0.6 -0.37 -0.52 -0.34 0.43 -0.4 -0.33 0.39
-0.4 0.1 -0.01 -0.07 0.75 -0.34 0.26 0.15 -0.13 -0.39 -0.22 -0.14
-2.36 -0.4 1.12 0.24 2.24 - -0.17 -1.53 -1.02 0.29 - -
- - 2.25 - 2.86 - - - - - - -
-0.24 -0.4 0.15 -0.13 0.29 -0.03 0.21 0.07 0.25 -0.22 0.09 -0.22
-0.02 -0.23 -0.16 -0.22 -0.06 0.22 -0.12 0.16 0.13 0.05 0.02 0.13
-0.24 -0.25 0.07 -0.04 0.12 -0.13 0.04 0.16 0.19 0.01 0.07 -0.08
-0.39 -0.53 0.08 -0.05 0.32 0.21 -0.05 0.16 0.22 0.05 -0.07 -0.2
-0.24 -0.16 0.0 -0.03 0.12 0.04 0.09 0.01 0.15 0.08 -0.01 -0.08
-0.33 -0.26 -0.03 -0.22 0.1 0.23 -0.05 0.16 0.29 0.12 0.01 -0.19
-0.18 -0.3 -0.12 -0.23 -0.01 -0.07 0.1 0.13 0.08 0.2 0.17 0.12
-0.51 -1.19 -0.8 -0.18 0.18 -0.18 0.6 0.53 0.67 0.08 -0.36 -0.01
- - 2.89 - - - - - 2.19 - - -
- -0.53 0.67 - 2.4 -2.52 - - 0.3 0.89 - 0.24
0.26 -0.62 2.47 - - - - - 0.81 1.52 - -
-0.2 -0.1 0.18 0.03 0.14 -0.04 0.07 -0.09 0.08 -0.03 0.02 -0.1
0.03 0.14 -0.12 -0.09 0.25 -0.4 -0.38 -0.23 0.23 0.12 0.02 0.22
-0.23 -0.31 -0.19 -0.08 0.15 0.13 0.05 -0.05 0.33 0.11 -0.03 -0.01
-0.13 -1.03 -1.76 -1.71 -0.55 0.11 0.34 1.24 0.83 0.18 -0.0 -0.51
-1.21 0.3 0.41 -1.01 1.5 -1.83 0.29 -0.17 -0.32 -0.61 -0.28 0.0
-0.1 -0.24 -0.14 0.03 0.21 0.17 0.17 -0.11 0.22 -0.14 -0.07 -0.09
-0.69 -0.9 0.92 -0.2 0.27 -2.73 -0.72 -0.13 0.51 -0.07 0.83 0.07
-0.57 -0.71 0.2 0.34 0.42 0.07 -0.04 0.1 -0.06 0.12 0.05 -0.35
-0.05 -0.3 -0.02 -0.15 0.24 0.0 0.19 0.18 0.16 -0.11 -0.05 -0.2
-0.49 -0.27 0.0 -0.1 0.35 -0.02 0.19 0.21 0.25 -0.06 -0.14 -0.14
-0.33 -0.34 0.07 -0.16 0.16 0.24 -0.03 0.13 0.17 -0.01 -0.01 -0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.