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Heatmap: Cluster_86 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.9 -0.58 -3.47 0.2 -0.3 -0.28 0.16 -0.65 -0.28 0.57 -0.06 0.64
0.1 -0.38 0.14 -0.49 -0.75 -0.02 0.02 0.35 0.44 -0.05 0.01 0.19
0.2 -0.26 0.18 -0.02 -0.06 0.05 0.12 -0.04 0.02 -0.18 0.05 -0.13
-0.09 0.44 -0.47 -0.02 -0.37 -1.06 -0.99 -0.35 0.19 0.53 0.8 0.17
-1.2 -1.88 - -2.23 -3.81 0.62 0.47 1.55 0.69 0.59 0.12 -0.07
1.44 -0.01 0.31 -3.48 -0.99 -0.4 -2.33 -0.89 0.6 -0.47 0.89 -0.2
-1.26 -1.22 -0.18 -1.92 -0.59 1.37 0.35 -1.05 0.07 0.84 -0.67 0.61
0.44 -0.05 0.27 -0.03 -0.24 0.17 0.01 -0.86 -0.85 0.35 -0.04 0.22
0.03 -0.07 -0.22 -0.17 -0.19 -0.23 0.05 0.08 0.24 0.25 0.08 0.05
-1.4 -2.54 1.31 -0.94 - - 1.44 1.19 0.13 -0.33 0.41 -2.13
0.32 0.13 0.18 -0.08 -0.49 -0.38 -0.52 -0.06 0.22 0.15 0.12 0.11
-0.43 0.0 0.95 -1.02 - -0.58 1.03 -0.29 -0.47 0.81 -0.47 0.13
0.33 0.04 0.24 -0.71 -0.64 -0.32 0.01 -0.29 0.03 0.41 0.33 0.06
0.16 -0.13 -0.01 0.03 0.06 -0.07 0.13 0.01 -0.1 -0.05 0.04 -0.11
-0.13 -0.19 -0.15 -0.15 -0.02 0.02 0.17 0.11 0.3 0.02 0.03 -0.08
-0.27 0.03 0.18 -0.0 -0.46 -0.06 0.13 0.21 0.0 0.14 0.08 -0.12
-0.26 -0.11 0.14 0.03 -0.42 0.24 0.2 0.31 -0.39 0.21 0.02 -0.22
0.24 -0.04 0.17 0.15 0.02 -0.14 0.12 -0.27 -0.31 0.33 -0.46 -0.04
-0.51 -1.47 0.69 -0.23 -0.84 0.39 0.15 0.43 -1.55 1.08 -0.43 -0.09
0.3 -0.16 0.07 -0.19 -0.24 0.11 0.21 0.16 -0.22 0.11 -0.03 -0.29
-0.72 -0.57 -0.06 -0.51 -0.4 0.07 0.21 0.36 0.61 0.08 0.17 0.12
0.2 -0.27 -0.58 0.0 -0.16 0.39 -0.18 0.42 0.2 -0.09 -0.05 -0.21
-0.07 -0.08 0.01 0.14 -0.13 0.14 0.01 -0.11 -0.22 0.26 -0.01 -0.01
0.8 0.5 0.17 -0.18 -0.32 0.06 0.0 -0.61 -0.53 -0.15 -0.33 -0.08
-0.02 -0.24 0.94 0.52 -1.06 0.07 -0.54 -0.83 -1.06 1.06 -0.21 -0.76
0.65 - 0.06 - -2.73 1.04 1.25 -0.26 0.15 -2.0 0.61 0.11
0.87 -0.78 0.26 0.41 -1.6 -0.04 0.12 0.47 -3.17 0.62 -0.53 -0.07
0.61 -0.45 -0.55 -0.31 -0.4 0.37 -0.29 0.24 -0.25 0.22 -0.22 0.42
-0.31 -0.19 0.01 -0.47 -0.25 0.01 0.26 0.26 0.18 0.12 0.11 0.06
0.2 -0.2 -0.02 -0.27 -0.92 0.07 -0.03 -0.02 0.34 0.25 0.25 -0.04
-0.16 0.44 0.34 -0.14 -0.82 -0.68 0.02 0.21 -0.39 0.4 -0.01 0.18
-1.89 -0.39 -0.26 0.51 0.3 -0.22 0.12 0.82 -0.4 0.58 -0.53 -0.26
1.16 -2.34 - -2.24 -1.87 0.01 0.16 1.1 0.15 1.29 -0.8 -0.56
0.84 -0.18 0.02 -0.48 -0.08 -0.13 0.23 -0.28 -0.44 0.05 0.02 -0.09
0.06 -0.08 -0.03 -0.04 -0.15 0.16 0.21 0.07 -0.14 0.12 -0.07 -0.18
0.42 0.55 1.31 -1.62 -1.39 0.08 -0.04 -0.77 -3.05 -0.24 -0.86 0.92
-0.68 -0.34 0.12 0.15 0.01 -0.28 0.15 0.09 -0.04 0.3 0.13 0.13
-0.29 -0.16 -0.68 -0.21 -1.17 1.01 1.07 0.47 -0.2 -0.23 -0.87 -0.72
0.34 -1.56 0.39 -1.01 -3.66 0.17 0.45 0.64 -0.67 0.45 0.4 0.2
-0.53 -0.23 0.32 -0.35 -1.0 -0.67 0.57 -0.39 0.26 0.48 0.55 -0.01
-0.12 -0.24 -0.03 0.03 -0.16 0.05 0.4 0.08 0.05 -0.24 0.2 -0.17
0.34 -0.39 0.3 0.1 -0.57 -0.03 -0.1 0.27 -0.25 0.18 -0.27 0.1
-0.22 -0.11 0.16 -0.0 -0.04 -0.07 -0.04 0.06 -0.08 0.08 0.11 0.11
0.05 -1.72 0.63 -2.89 - 0.41 0.76 -0.41 -0.43 1.54 -0.14 -0.67
0.35 -1.78 1.15 -0.02 -1.27 0.66 -0.51 - -1.71 1.44 -0.44 -0.39
-0.87 -0.82 -1.2 -1.06 -0.42 0.09 0.21 0.88 0.76 0.52 0.06 -0.02
-0.48 -0.03 -0.25 0.03 -0.37 -0.68 0.46 0.21 -0.06 0.28 -0.04 0.45
-0.35 -0.25 0.12 0.19 -0.02 -0.16 0.25 -0.35 0.02 0.22 0.14 0.01
- -3.52 -3.34 - - 0.98 0.84 1.65 1.33 0.42 -1.42 -0.56
0.7 0.21 0.06 -2.0 - - - 1.2 - 1.14 1.44 -0.47
-0.23 0.02 -0.29 -0.47 -0.61 0.06 0.22 0.41 0.26 0.13 -0.14 0.26
-0.18 0.02 0.3 0.1 0.09 -0.24 -0.03 -0.02 -0.04 -0.24 0.04 0.1
-0.25 -0.44 -0.11 -0.15 0.03 0.1 0.13 0.06 0.35 0.05 0.08 -0.01
0.23 0.23 0.01 -0.26 -0.31 0.12 0.31 -0.03 -0.3 -0.22 -0.18 0.2
0.96 -0.54 -0.03 -0.82 -2.27 -1.37 0.72 0.77 -1.11 0.13 0.21 0.22
0.64 0.08 0.26 -0.06 -0.41 0.06 0.16 -0.07 -0.26 -0.11 -0.33 -0.33
0.13 -0.02 -0.13 -0.0 -0.18 0.35 0.23 0.2 -0.2 0.08 -0.31 -0.33
0.15 0.02 -0.38 -0.03 -0.24 -0.01 0.02 0.27 -0.09 0.26 0.15 -0.28
0.34 -0.15 -0.1 -0.8 -2.28 -0.2 0.38 0.17 0.36 0.01 0.17 0.5
1.38 -0.43 -0.12 -0.22 -1.53 0.12 -0.43 0.13 -1.15 -0.01 -0.7 0.63
0.15 0.15 0.09 -0.1 -0.23 -0.16 -0.18 -0.08 0.0 0.07 0.19 0.04
0.05 -0.07 -0.05 -0.01 -0.05 0.05 0.12 0.06 -0.02 -0.01 0.04 -0.14
-0.28 -0.5 0.17 0.17 -0.6 0.06 0.51 -1.42 -0.03 0.36 0.5 0.05
-0.27 -0.67 -0.1 -0.56 -0.21 -0.73 0.55 -0.03 0.04 0.5 0.51 0.21
-0.14 0.08 -0.26 -0.21 -0.2 -0.23 -0.3 -0.18 0.12 0.31 0.41 0.33
0.24 - 1.87 0.12 - -2.03 1.14 - - 0.46 -0.34 0.54
0.08 -0.11 -0.03 -0.05 -0.07 0.1 0.02 -0.13 -0.27 0.15 0.05 0.21
0.01 -0.59 -0.05 -0.18 -0.12 -0.05 -0.08 -0.04 0.05 0.35 0.48 -0.06
0.02 0.21 -0.08 -0.05 -0.71 -0.8 -0.6 -0.15 0.37 0.58 0.48 -0.01
-0.42 -0.45 -0.08 -0.26 -0.07 0.12 0.31 0.02 0.4 0.12 0.1 -0.05
0.13 0.0 -0.24 -0.08 -0.09 0.09 0.13 0.11 -0.0 0.03 0.07 -0.23
0.84 0.37 0.42 -0.98 -0.18 -0.08 0.02 -0.2 -0.62 -0.54 -0.16 0.18
-0.09 -0.0 -0.06 0.05 -0.12 -0.18 -0.13 -0.04 0.07 0.08 0.23 0.15
0.09 0.07 -0.01 -0.11 -0.12 0.12 -0.13 -0.06 0.06 0.04 0.23 -0.24
0.29 0.14 0.1 -0.25 -0.23 -0.11 0.01 -0.05 -0.36 -0.0 -0.03 0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.