Heatmap: Cluster_97 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.03 -0.22 -0.15 -0.0 0.05 0.09 0.12 0.19 0.12 -0.01 -0.0 -0.2
-0.36 -0.19 0.0 0.01 0.03 0.1 0.02 0.07 0.16 0.09 0.13 -0.14
-0.35 -1.01 -0.39 -0.01 0.32 0.27 0.19 0.31 0.41 0.1 -0.02 -0.42
-0.35 -1.05 -0.33 0.01 0.28 0.08 0.09 0.34 0.38 0.14 0.07 -0.19
-0.99 -0.51 -0.15 0.21 0.12 -0.13 0.1 0.28 0.33 0.23 0.18 -0.16
-0.21 -0.42 -0.36 -0.17 0.04 -0.13 0.16 0.34 0.22 0.21 0.13 -0.01
-0.18 -0.26 -0.13 -0.18 0.09 0.17 -0.07 0.17 0.09 0.11 0.06 0.05
-0.19 -0.26 -0.02 -0.03 0.11 0.04 0.09 0.04 0.1 0.04 0.11 -0.08
-0.24 -0.68 -0.22 -0.0 0.1 -0.02 -0.14 0.17 0.32 0.1 0.33 0.01
-0.38 -0.44 -0.26 -0.04 0.04 0.22 0.19 0.25 0.23 0.16 -0.03 -0.17
-0.12 -0.27 -0.04 -0.05 0.01 0.12 0.19 0.25 0.04 0.0 -0.0 -0.21
-0.48 -0.34 -0.05 0.2 0.22 0.02 0.17 0.12 0.09 0.06 0.06 -0.27
-1.07 -0.82 -0.37 0.1 0.19 0.17 0.12 0.33 0.32 0.27 0.15 -0.07
-0.14 -0.54 -0.34 -0.17 0.1 0.21 0.03 0.21 0.3 0.18 0.04 -0.11
-0.46 -0.52 -0.17 0.17 0.23 -0.04 0.06 0.2 0.27 0.1 0.07 -0.15
-0.23 -0.32 -0.07 -0.06 0.05 -0.07 -0.0 0.2 0.22 0.06 0.11 0.01
-0.44 -0.28 -0.11 0.04 0.17 -0.0 0.27 0.15 0.05 0.06 0.07 -0.13
-0.33 -0.16 -0.02 0.1 0.13 -0.02 0.05 0.01 0.17 0.02 0.09 -0.12
-1.22 -1.01 -0.18 0.11 0.42 0.02 0.01 0.52 0.44 0.15 -0.11 -0.1
-0.27 -0.39 -0.16 0.02 0.22 -0.05 0.1 0.25 0.14 0.03 0.09 -0.11
-0.38 -0.28 -0.09 0.06 0.3 0.09 0.04 0.13 0.15 -0.08 0.06 -0.14
-0.54 -0.38 -0.17 -0.07 0.24 -0.0 0.16 0.03 0.21 0.17 0.11 0.03
-0.39 -0.4 -0.07 0.11 0.3 0.17 -0.05 0.18 0.1 0.02 -0.05 -0.09
-0.26 -0.29 -0.07 -0.09 0.05 0.18 0.12 0.14 0.16 0.09 0.04 -0.17
-0.41 -0.98 -0.45 -0.03 0.5 0.4 0.12 0.27 0.35 -0.07 -0.01 -0.35
-0.22 -0.22 -0.28 -0.26 0.07 -0.15 -0.02 0.23 0.31 0.25 0.03 0.09
-0.03 -0.53 -0.32 -0.27 -0.04 0.18 0.43 0.37 0.21 0.04 -0.09 -0.27
-0.53 -1.17 -0.56 -0.32 -0.08 0.41 0.5 0.59 0.44 0.35 -0.27 -0.45
-0.26 -0.5 -0.34 -0.2 0.17 0.18 -0.24 0.21 0.33 0.19 0.14 0.06
-0.35 -0.37 -0.22 -0.13 0.13 0.01 -0.03 0.14 0.24 0.11 0.23 0.06
-0.99 -0.39 -0.1 0.17 0.13 -0.07 0.07 0.27 0.18 0.18 0.13 0.02
-0.24 -0.57 -0.3 -0.19 0.26 0.32 0.13 0.17 0.25 0.03 -0.07 -0.04
-0.57 -0.38 -0.14 0.03 0.14 -0.02 0.17 0.26 0.16 0.1 0.06 -0.03
-0.48 -0.58 -0.16 0.03 0.22 0.14 0.11 0.04 0.31 0.08 0.11 -0.08
-0.99 -0.81 -0.97 -0.9 0.12 -0.24 0.18 0.48 0.65 0.52 0.31 0.24
-0.33 -0.69 -0.26 -0.22 0.09 0.05 0.13 0.28 0.31 0.18 0.13 0.01
-0.47 -0.46 -0.27 -0.02 0.12 0.25 0.23 0.1 0.29 0.01 0.12 -0.17
-0.17 -0.29 -0.14 -0.09 0.07 -0.05 0.02 0.12 0.22 0.12 0.11 0.01
-0.3 -0.32 -0.36 0.04 0.23 0.04 0.11 0.29 0.23 -0.02 -0.03 -0.08
-0.32 -0.54 -0.21 -0.08 0.08 0.28 0.24 0.36 0.2 0.1 -0.16 -0.24
-0.14 -0.18 -0.12 -0.01 0.14 -0.05 0.06 0.17 0.1 0.04 -0.01 -0.03
-0.08 -0.72 -0.5 -0.11 0.16 -0.14 0.17 0.31 0.28 0.21 0.19 -0.15
-0.52 -0.35 -0.02 0.31 0.32 0.16 -0.1 0.03 0.09 0.02 0.07 -0.25
-0.17 -0.2 -0.03 0.1 0.19 0.06 0.01 0.07 0.08 -0.03 -0.01 -0.12
-0.47 -0.4 -0.11 0.06 0.24 0.03 0.05 0.27 0.26 -0.0 -0.04 -0.09
-0.56 -0.39 -0.15 0.08 0.44 0.14 -0.09 0.14 0.27 -0.05 -0.02 -0.09
-0.32 -0.15 -0.08 0.05 0.19 0.13 0.08 0.14 0.03 -0.03 0.01 -0.13
-0.73 -0.74 -0.19 0.11 0.28 0.16 0.22 0.29 0.17 0.05 0.05 -0.09
-0.39 -0.32 -0.14 0.11 0.25 0.04 0.01 0.23 0.11 0.07 0.02 -0.14
-0.37 -0.47 -0.36 -0.15 0.01 0.22 0.26 0.18 0.22 0.19 0.06 -0.04
-0.31 -0.55 -0.16 -0.08 0.08 0.07 0.03 0.2 0.33 0.14 0.11 -0.07
-0.11 -0.56 -0.17 -0.06 0.11 -0.05 0.01 0.21 0.28 0.15 0.13 -0.11
-0.64 -0.31 -0.12 0.03 0.03 0.19 0.31 0.44 0.04 0.1 -0.13 -0.26
-0.4 -0.47 -0.25 0.03 0.28 -0.06 0.13 0.31 0.3 0.01 -0.01 -0.11
-1.0 -0.79 -0.15 0.09 0.18 -0.08 0.09 0.23 0.27 0.27 0.3 0.0
-0.26 -0.14 0.01 0.05 0.18 0.0 -0.0 0.06 0.07 0.01 0.08 -0.12
-0.65 -0.58 0.06 0.28 0.28 0.02 -0.09 0.08 0.23 0.22 0.1 -0.3
-0.16 -0.43 -0.15 -0.13 0.03 0.11 -0.01 0.17 0.21 0.21 0.08 -0.05
-0.44 -0.28 -0.03 -0.02 0.11 0.12 0.06 0.08 0.16 0.13 0.08 -0.08
-0.71 -0.36 -0.17 0.1 0.05 -0.07 0.02 0.18 0.19 0.28 0.2 -0.0
-0.69 -0.7 -0.13 0.14 0.39 0.37 -0.01 0.07 0.15 0.05 0.09 -0.18
-0.32 -0.23 0.03 0.07 0.13 0.05 0.06 0.12 0.16 0.06 -0.04 -0.19
-0.64 -0.95 -0.82 -0.2 0.3 -0.07 0.22 0.4 0.37 0.3 0.11 0.18
-0.72 -0.37 -0.03 0.26 0.21 0.06 -0.09 0.21 0.24 0.02 0.06 -0.13
-0.59 -0.24 0.03 0.19 0.23 0.09 0.06 0.09 0.06 0.01 -0.01 -0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.