Heatmap: Cluster_67 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark	9 h after dark	11 h after dark
104804	-0.11	-0.02	-0.12	-0.15	-0.24	-0.05	0.1	-0.02	0.03	0.21	0.17	0.13
106093	0.11	-0.16	-0.82	-0.07	-0.24	-0.19	-0.04	-0.31	0.14	0.34	0.36	0.43
111886	-0.05	0.02	-0.36	-0.04	-0.25	-0.22	0.06	0.13	0.17	0.38	0.06	-0.05
113619	-0.42	0.09	0.28	-0.0	0.17	0.03	-0.02	-0.35	-0.13	0.17	0.15	-0.14
121433	0.01	0.11	0.05	0.14	-0.14	-0.13	0.07	-0.21	0.1	-0.14	0.13	-0.03
122531	-0.01	0.07	-0.15	0.04	-0.14	0.04	-0.05	0.09	-0.02	0.11	0.1	-0.1
131328	-0.11	-0.04	-0.27	-0.19	-0.18	-0.03	0.03	0.09	0.16	0.21	0.16	0.08
133157	-0.31	0.15	-0.49	-0.14	-0.35	-0.06	0.19	0.03	0.18	0.31	0.12	0.14
133828	-0.06	-0.67	-0.94	-0.9	-0.76	0.19	0.13	0.6	0.32	0.33	0.4	0.26
134339	-0.03	-0.02	-0.12	-0.03	-0.1	0.05	-0.01	-0.02	0.02	0.05	0.09	0.09
136743	-0.16	-0.28	-0.49	-0.14	-0.18	0.02	0.03	0.32	0.05	0.24	0.19	0.18
143191	0.21	0.12	-0.16	-0.05	-0.69	-0.33	-0.25	-0.04	0.18	0.2	0.33	0.17
144149	-0.21	-0.01	-0.25	-0.07	0.02	0.11	0.15	0.18	0.02	0.1	0.02	-0.12
145597	-0.36	-0.14	-0.09	0.02	0.04	0.06	0.07	0.18	0.09	0.07	-0.02	0.0
149722	-0.21	-0.0	-0.15	0.07	0.01	0.16	0.15	0.05	-0.09	0.09	-0.08	-0.05
160429	-0.25	-0.45	-0.32	-0.33	-0.38	0.18	0.15	0.4	0.2	0.26	0.19	0.01
16497	-0.22	0.01	-0.19	-0.02	-0.22	0.07	0.12	0.15	0.04	0.2	-0.05	0.05
165981	-0.18	0.1	-0.12	-0.07	-0.4	-0.15	-0.11	-0.04	0.14	0.16	0.39	0.11
166437	-0.36	-0.02	-0.1	-0.08	0.11	0.21	0.31	0.09	-0.04	0.07	-0.15	-0.17
17067	-0.28	0.07	-0.14	0.15	-0.12	0.2	0.18	0.06	0.01	0.09	-0.08	-0.22
173388	-0.08	-0.01	-0.17	-0.01	-0.02	-0.05	-0.03	-0.09	0.08	0.18	0.13	0.05
179125	-0.2	0.02	-0.03	0.1	-0.04	0.19	0.22	0.03	-0.08	0.05	-0.13	-0.18
182295	-0.12	-0.27	-0.43	-0.36	-0.24	0.12	0.19	-0.09	0.08	0.3	0.25	0.3
183248	-0.26	-0.04	-0.11	0.1	0.01	0.11	0.14	0.01	0.0	0.13	-0.02	-0.11
185868	-0.26	0.03	-0.21	-0.03	-0.11	0.04	0.25	0.16	0.03	0.08	-0.05	-0.01
18624	-0.17	-0.07	-0.24	-0.14	-0.13	-0.02	0.1	-0.07	0.17	0.19	0.27	0.01
227735	-0.17	0.19	-0.22	0.11	-0.1	0.09	0.21	-0.08	-0.17	0.13	-0.06	-0.02
231326	-0.5	0.17	0.13	0.04	-0.29	-0.1	0.2	-0.07	0.14	-0.09	0.24	-0.03
231982	-0.3	-0.09	-0.24	0.08	0.08	0.07	0.12	0.08	0.09	0.01	0.1	-0.07
234639	-0.08	0.11	-0.17	-0.08	-0.37	-0.0	0.04	0.04	0.2	0.08	0.26	-0.14
26786	0.03	-0.99	-1.16	-1.8	-0.93	0.28	0.03	0.49	0.47	0.43	0.51	0.51
26984	-0.19	-0.01	-0.08	0.08	-0.05	0.13	0.09	0.02	-0.02	0.01	0.01	-0.02
270723	-0.09	0.03	-0.08	0.04	-0.11	-0.02	0.02	0.01	-0.03	0.14	0.07	0.01
271790	-0.14	0.1	-0.3	-0.14	-0.09	-0.07	0.08	0.09	0.08	0.21	-0.01	0.11
27993	-0.33	0.1	0.04	0.21	-0.17	-0.03	0.05	-0.08	-0.09	0.12	0.03	0.07
403595	-0.27	-0.11	-0.47	-0.13	-0.32	0.01	0.17	0.05	0.13	0.3	0.18	0.23
406798	-0.44	-0.12	-0.15	0.07	0.0	0.28	0.12	-0.01	0.05	0.14	0.13	-0.21
407290	0.28	0.22	-0.68	-0.46	-1.26	-0.67	0.27	-0.13	0.54	0.22	0.56	0.02
408995	-0.17	0.17	-0.68	-0.25	-0.31	0.32	-0.05	0.06	0.09	0.18	0.1	0.27
409541	-0.11	-0.04	-0.3	-0.09	-0.32	0.07	0.0	-0.11	0.15	0.24	0.24	0.15
412626	-0.15	-0.19	-0.54	-0.02	-0.31	-0.04	-0.01	-0.25	0.25	0.24	0.34	0.38
413008	-0.77	-0.44	-0.18	0.44	-1.57	0.49	-0.35	0.23	-0.63	0.74	0.3	0.25
414248	0.24	0.1	-0.56	-0.15	-0.32	0.09	-0.39	-0.07	0.21	0.25	0.15	0.18
414560	-0.42	-0.31	-0.21	-0.18	-0.12	-0.11	-0.06	0.35	0.21	0.29	0.01	0.29
417267	-0.24	-0.61	-0.77	-0.27	-0.29	0.11	-0.23	0.35	0.27	0.21	0.57	0.28
423007	-0.38	-0.04	-0.31	0.1	-0.5	-0.06	0.14	0.27	0.23	0.3	0.05	-0.06
426823	0.09	0.06	-0.12	-0.01	-0.31	-0.46	-0.3	0.04	0.24	0.09	0.29	0.19
430901	-0.28	-0.05	-0.23	0.1	-0.05	0.17	0.2	0.12	-0.0	0.07	-0.01	-0.12
443870	-0.4	-0.03	-0.16	-0.14	-0.4	-0.08	0.11	0.17	0.06	0.34	0.19	0.14
55147	-0.32	-0.01	-0.25	0.14	0.0	-0.02	0.21	0.23	-0.05	0.08	-0.02	-0.08
59108	-0.06	-0.07	-0.45	-0.26	-0.42	0.1	0.03	0.18	0.13	0.2	0.22	0.18
69044	-0.59	0.12	-0.1	0.21	-0.11	0.33	0.32	0.02	-0.14	0.06	-0.08	-0.31
69258	-0.87	-0.02	0.28	0.51	0.04	0.22	0.39	0.21	-0.35	-0.05	-0.45	-0.5
69317	-0.3	0.12	-0.17	0.1	-0.34	-0.08	0.16	0.03	-0.05	0.37	0.05	-0.05
72615	-0.05	0.1	0.07	0.06	-0.07	0.09	-0.16	-0.05	-0.26	0.19	0.11	-0.12
73749	-0.16	-0.03	-0.17	-0.07	-0.38	-0.12	-0.05	-0.06	0.17	0.28	0.24	0.19
75361	-0.19	0.07	-0.07	0.07	-0.15	0.0	0.06	-0.01	-0.07	0.14	0.04	0.07
7638	-0.24	0.05	-0.22	-0.16	-0.13	-0.21	0.07	0.18	0.03	0.31	0.17	0.02
77154	-0.09	-0.05	-0.1	-0.11	-0.4	0.04	-0.03	-0.01	0.11	0.22	0.22	0.1
79823	-0.48	-0.04	-0.23	0.15	-0.01	0.11	0.08	0.21	0.12	0.15	-0.04	-0.16
83637	-0.21	-0.08	-0.76	-0.11	-0.68	-0.4	-0.08	0.2	0.43	0.42	0.36	0.3
84865	0.05	-0.6	-0.64	-0.48	-0.16	0.04	-0.05	0.34	0.41	0.07	0.32	0.23
85565	-0.34	-0.0	-0.08	0.02	0.04	-0.01	0.16	0.15	0.05	0.08	-0.01	-0.12
86151	-0.05	0.57	0.32	0.02	-1.19	-0.42	-0.28	-0.51	-0.03	0.09	0.55	0.1
89169	0.48	-0.2	-1.48	-0.26	-2.01	0.38	-0.09	-0.04	-0.29	0.5	0.41	0.6
90107	-0.1	0.05	-0.13	-0.01	-0.12	0.02	0.1	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03
90486	-0.09	-0.28	-0.34	-0.19	-0.34	0.14	-0.0	0.24	0.23	0.07	0.21	0.17
9052	0.12	0.01	-0.3	-0.09	-0.25	-0.04	0.09	0.06	-0.14	0.1	0.19	0.15
93150	-0.22	-0.07	-0.15	-0.11	-0.2	-0.03	0.09	0.15	0.03	0.17	0.06	0.2
93869	-0.15	-0.06	-0.22	-0.1	-0.18	0.05	0.02	0.2	0.12	0.14	0.05	0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.