Heatmap: Cluster_159 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
4.29 4.6 5.19 5.17 5.56 4.72 5.27 4.5 4.58 5.1 4.42 4.42
19.29 21.22 20.02 22.55 23.23 22.38 26.5 24.43 22.05 20.89 23.76 20.71
2.25 2.33 2.77 2.69 3.3 3.94 2.82 3.64 3.22 3.49 3.42 2.78
0.0 0.08 0.0 0.2 0.22 0.15 0.39 0.1 0.14 0.19 0.07 0.04
3.68 5.1 0.76 4.24 0.32 1.69 5.94 2.0 2.04 5.13 3.56 6.25
0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
61.98 68.56 64.44 70.53 58.22 76.2 72.31 62.97 64.25 64.18 57.13 65.16
16.52 17.89 17.47 17.24 13.75 14.0 15.44 11.7 14.48 13.35 12.99 12.71
2.85 2.77 2.13 2.27 2.23 2.54 2.58 2.49 2.1 3.81 2.48 2.2
259.97 277.65 252.9 255.23 238.47 242.67 280.32 261.9 251.34 276.35 243.21 263.38
711.59 851.56 714.41 729.1 633.82 574.42 695.51 711.4 590.29 711.9 643.71 752.56
7.98 9.61 6.67 9.08 6.79 7.07 9.38 9.37 6.49 10.23 7.54 8.61
0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0
0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.06 0.05 0.0
0.0 0.05 0.02 0.08 0.02 0.04 0.09 0.1 0.07 0.16 0.13 0.09
13.5 20.29 16.78 12.42 19.15 10.78 11.26 6.99 8.62 9.88 14.3 10.54
0.07 0.04 0.21 0.22 0.08 0.3 0.65 0.04 1.01 0.24 0.07 0.0
0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.04 0.02 0.02
0.07 0.06 0.03 0.16 0.0 0.0 0.26 0.05 0.35 0.04 0.07 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.04 0.04 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02
26.44 30.4 27.65 32.45 29.27 28.17 32.08 29.36 26.42 31.78 27.97 29.71
0.07 0.07 0.02 0.07 0.45 0.33 0.85 0.27 0.51 0.52 0.29 0.21
0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.02 0.13 0.04 0.07 0.06 0.04 0.02
27.03 26.49 28.63 28.45 29.5 27.11 28.53 30.02 27.27 27.83 27.22 26.61
0.0 0.06 0.0 0.1 0.03 0.05 0.05 0.16 0.0 0.13 0.0 0.04
0.0 0.02 0.0 0.21 0.05 0.0 0.19 0.02 0.17 0.02 0.04 0.0
1.57 2.32 1.52 2.33 2.38 1.98 3.45 2.27 1.59 1.77 2.49 1.7
0.0 0.09 0.0 0.02 0.05 0.02 0.18 0.14 0.26 0.11 0.07 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.13 0.0 0.02 0.04 0.04
0.11 0.26 0.13 0.24 0.23 0.33 0.52 0.41 0.45 0.52 0.36 0.11
1.53 1.16 1.86 1.6 1.8 1.69 1.67 1.48 0.97 1.04 1.5 1.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.07 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
33.07 35.68 35.16 42.34 37.83 40.75 55.7 45.03 43.75 49.77 41.03 38.91
0.79 1.34 0.5 1.82 0.98 0.81 2.22 0.84 1.04 2.04 0.91 1.35
0.97 0.96 0.61 1.29 1.26 2.14 2.21 1.8 1.47 1.29 1.64 1.42
0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.04 0.11 0.05 0.0 0.05 0.0
0.04 0.06 0.17 0.08 0.1 0.2 0.21 0.07 0.11 0.08 0.04 0.13
0.32 0.49 0.21 0.41 0.16 0.55 0.81 0.17 0.77 0.24 0.6 0.34
0.25 0.9 0.72 0.84 0.74 0.96 0.99 0.27 0.38 0.7 0.39 0.54
0.11 0.04 0.0 0.0 0.05 0.07 0.18 0.24 0.07 0.02 0.11 0.11
1.73 2.43 1.23 2.73 1.69 1.56 1.77 2.27 1.22 4.26 2.27 1.6
0.07 0.05 0.02 0.17 0.02 0.09 0.38 0.21 0.35 0.19 0.11 0.11
0.0 0.16 0.0 0.0 0.17 0.0 0.1 0.0 0.03 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.15 0.06 0.09 0.06 0.19 0.2 0.21 0.1 0.04 0.24 0.1
3.04 2.9 2.65 2.72 3.26 3.31 3.88 3.28 3.2 3.28 2.91 2.63
29.91 34.17 27.72 29.25 26.01 19.83 24.3 23.08 19.88 26.5 25.12 26.71
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0
0.36 0.73 1.33 0.92 0.54 0.99 1.18 0.5 0.48 0.22 0.29 0.08
0.39 0.06 0.0 0.13 0.08 0.2 0.08 0.28 0.05 0.04 0.09 0.11
0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.29 0.22 0.07 0.18 0.08 0.0 0.23 0.17 0.14 0.09 0.3 0.26
0.07 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.34 0.39 0.07 0.17 0.14 0.08
0.39 0.3 0.2 0.53 0.25 0.28 0.61 0.29 0.44 0.16 0.43 0.34
0.89 0.89 1.49 1.51 1.08 0.82 1.19 1.44 1.28 1.02 1.02 0.94
3.44 2.98 3.48 3.34 1.86 4.13 3.98 3.1 3.84 4.76 3.7 5.02
0.14 0.34 0.31 0.64 0.0 0.24 0.55 0.46 0.47 0.54 0.37 0.34
220.43 266.55 247.05 265.59 228.15 253.06 318.12 271.92 240.54 290.97 239.97 248.36
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0
0.4 0.43 0.44 0.37 0.22 0.52 0.7 0.73 0.63 0.53 0.55 0.36
27.53 31.14 25.98 33.32 21.62 29.11 32.86 20.06 24.79 27.88 23.91 23.41
28.55 30.42 26.65 30.62 29.96 31.56 30.55 27.92 28.12 26.21 26.3 26.91
6.78 7.7 8.37 8.49 9.37 9.02 8.62 9.54 8.98 7.92 9.14 8.39
40.3 43.21 47.29 46.36 45.02 42.67 47.87 50.64 50.27 49.05 48.93 46.68
38.2 36.06 25.24 37.86 36.16 36.6 40.88 41.23 38.77 51.72 45.2 50.44
12.82 14.5 13.86 15.5 15.26 12.82 15.42 17.18 16.69 15.05 12.12 13.56
139.32 172.56 136.74 138.95 118.38 94.86 108.92 127.16 110.99 124.43 120.19 149.41
7.59 12.5 12.4 10.78 8.86 9.79 10.5 7.02 8.18 6.18 8.57 6.69
0.07 0.02 0.0 0.09 0.0 0.05 0.05 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0
28.26 27.36 28.36 27.35 25.47 27.03 27.66 28.77 27.73 32.86 28.92 27.89

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)