Heatmap: Cluster_161 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.35 -0.12 -0.06 0.18 0.06 0.32 0.23 -0.01 0.01 -0.04 -0.02 -0.35
-0.34 -0.13 0.09 0.27 -0.01 0.46 0.28 -0.3 -0.19 0.05 0.01 -0.49
-0.32 0.07 -0.14 0.02 0.02 0.38 0.22 -0.37 0.01 0.14 0.08 -0.32
-0.51 -0.13 -0.15 -0.02 0.07 0.35 0.24 0.22 0.18 -0.08 -0.07 -0.35
-0.56 -0.35 -0.37 -0.22 -0.1 0.51 0.04 0.03 0.35 0.14 0.29 -0.14
-0.4 -0.15 0.02 0.16 -0.11 0.42 0.2 0.08 -0.08 0.06 -0.14 -0.26
-1.15 -0.55 -0.5 0.36 -0.39 0.6 0.69 0.2 0.64 -0.13 -0.62 -0.47
-0.15 -0.17 0.02 0.05 0.04 0.3 0.1 0.16 -0.02 -0.01 -0.14 -0.28
-0.91 0.14 -0.2 -0.12 -0.19 0.19 0.38 -0.05 0.2 -0.02 0.43 -0.32
-0.29 -0.18 -0.37 -0.1 -0.39 0.09 0.21 0.09 0.27 0.32 0.19 -0.06
-0.18 0.05 -0.22 0.13 -0.09 0.34 0.23 -0.02 -0.05 -0.02 0.04 -0.34
-0.03 -0.14 0.08 -0.03 0.01 0.18 0.09 -0.11 0.11 -0.06 0.03 -0.18
-0.29 -0.04 -0.03 0.1 -0.06 0.14 0.02 0.02 0.1 0.03 0.06 -0.11
-0.19 -0.03 0.1 -0.1 0.02 0.18 -0.0 -0.16 0.17 0.12 0.01 -0.21
-0.32 0.01 -0.02 0.02 -0.17 0.13 0.08 0.14 0.04 0.05 0.1 -0.11
-0.14 -0.19 0.23 -0.17 -0.08 0.26 0.13 -0.17 0.21 -0.09 0.07 -0.17
-0.21 -0.13 -0.1 -0.02 -0.01 0.3 0.07 0.18 0.04 0.03 0.0 -0.25
-0.14 -0.03 -0.1 0.02 -0.14 0.12 0.05 -0.03 0.12 0.02 0.13 -0.06
-0.09 -0.08 -0.03 -0.01 -0.09 0.29 0.04 0.02 0.18 -0.04 0.02 -0.29
-0.19 -0.11 -0.05 0.02 0.02 0.09 0.08 0.13 0.05 0.02 0.0 -0.1
-0.23 -0.09 -0.16 -0.02 -0.02 0.17 0.26 0.18 0.04 0.08 -0.1 -0.22
-0.27 -0.1 -0.29 0.01 -0.03 0.44 -0.09 -0.48 0.15 0.17 0.36 -0.14
-0.58 -0.16 -0.22 0.14 0.1 0.66 0.36 0.34 -0.54 -0.08 -0.04 -0.58
-0.23 -0.02 -0.2 -0.05 -0.17 0.79 -0.02 -0.41 0.1 0.0 0.21 -0.42
-0.1 -0.18 -0.23 0.13 0.05 0.35 0.19 0.25 0.03 -0.03 -0.22 -0.42
-0.02 -0.09 -0.01 -0.01 -0.08 0.22 -0.0 0.03 0.06 0.01 -0.03 -0.1
-0.3 -0.16 -0.18 -0.02 0.04 0.16 0.08 0.07 0.04 0.03 0.15 0.03
-0.23 -0.03 -0.06 0.07 0.01 0.38 0.22 -0.05 -0.05 -0.09 0.04 -0.32
-0.66 -0.0 -0.05 0.09 0.07 0.17 0.17 -0.36 0.12 0.09 0.29 -0.18
-0.25 -0.09 -0.13 0.01 -0.01 0.15 0.25 0.15 0.03 -0.01 -0.03 -0.16
-0.8 -0.24 0.15 -0.17 -1.06 0.61 0.44 -0.6 0.15 0.66 -0.1 -0.09
-0.83 0.1 0.17 0.04 -0.1 0.64 0.17 -0.1 0.29 0.34 -0.91 -0.65
-0.41 -0.28 0.19 -0.13 0.17 0.41 0.05 -0.27 0.36 -0.18 -0.03 -0.14
-0.66 -0.25 -0.07 -0.05 -0.01 0.54 0.14 -0.18 0.12 0.12 0.31 -0.39
-0.37 0.06 -0.02 0.03 -0.05 0.19 0.02 -0.36 0.19 0.11 0.24 -0.2
-0.47 0.16 -0.55 0.26 -0.03 0.59 0.17 -0.28 -0.04 0.13 0.18 -0.62
-0.3 -0.02 -0.09 0.3 0.07 0.35 0.2 -0.23 -0.15 -0.07 0.12 -0.38
-0.12 -0.22 0.1 -0.1 -0.45 0.24 0.34 -0.23 -0.04 0.22 0.22 -0.17
-0.32 -0.19 -0.17 0.05 0.05 0.43 0.23 -0.02 -0.03 0.02 0.0 -0.23
-0.08 -0.31 0.24 -0.11 -0.02 0.6 0.11 -0.25 0.24 -0.29 -0.18 -0.27
-0.78 -0.46 -0.01 -0.06 -0.0 0.66 0.12 -0.26 0.26 -0.0 0.29 -0.29
-0.08 -0.24 -0.11 0.0 0.04 0.18 0.03 0.17 0.05 0.02 0.04 -0.16
-0.12 -0.3 -0.14 -0.03 -0.02 0.35 0.16 -0.08 0.06 0.06 0.1 -0.16
-0.19 -0.08 -0.12 0.01 -0.08 0.23 0.04 -0.09 0.14 0.14 0.1 -0.18
-0.3 -0.24 -0.17 0.12 -0.11 0.34 0.07 0.09 0.03 0.07 0.1 -0.12
-0.25 -0.1 -0.16 0.34 -0.03 0.35 0.18 -0.1 0.16 -0.18 0.0 -0.42
-0.67 -0.06 -0.41 0.22 -0.14 0.51 0.07 -0.5 0.4 -0.11 0.28 -0.08
-0.86 -0.23 -0.37 0.07 0.14 0.4 0.33 0.19 0.22 0.04 -0.04 -0.33
-0.67 -0.58 -0.27 0.24 0.02 0.47 0.33 0.32 0.15 -0.01 -0.07 -0.46
-0.06 0.09 -0.17 0.0 0.03 0.29 -0.0 -0.22 0.04 0.03 0.11 -0.22
0.03 -0.16 -0.12 -0.02 -0.18 0.29 0.12 -0.13 0.25 -0.01 0.16 -0.37
-0.34 -0.43 0.4 0.07 0.17 0.39 0.14 0.1 -0.25 -0.09 -0.14 -0.33
-0.24 -0.09 0.06 0.06 0.12 0.23 0.02 0.09 -0.16 -0.1 0.09 -0.16
-0.04 -0.12 0.04 0.12 -0.03 0.46 0.2 -0.12 0.03 -0.03 -0.19 -0.52
-0.35 0.09 -0.03 0.2 -0.23 0.46 0.37 -0.05 -0.02 -0.55 0.2 -0.48
-0.43 0.05 0.16 -0.02 -0.44 0.44 0.13 -0.49 0.33 -0.33 0.42 -0.28
-0.7 -0.2 -0.18 0.02 -0.07 0.32 0.2 0.01 0.1 0.05 0.3 -0.1
-0.24 -0.12 0.12 -0.01 -0.28 0.2 0.19 -0.14 0.13 0.06 0.1 -0.11
-0.66 -0.13 0.09 0.08 -0.09 0.37 0.05 0.09 0.17 0.03 0.01 -0.24
-0.43 -0.28 -0.16 0.08 0.11 0.47 0.31 0.15 0.19 -0.29 -0.06 -0.42
-0.35 -0.2 -0.18 -0.18 0.03 0.17 0.07 0.05 0.27 -0.03 0.26 -0.06
-0.16 -0.19 -0.31 0.03 0.06 0.26 0.4 0.11 0.01 0.02 -0.2 -0.19
-0.06 0.01 -0.1 0.16 -0.09 0.07 0.05 0.0 0.0 0.01 0.04 -0.13
-0.44 -0.13 -0.29 0.08 0.01 0.33 0.17 0.2 0.11 0.1 -0.12 -0.22
-0.31 -0.14 -0.07 -0.27 -0.03 0.3 -0.03 0.03 0.18 0.05 0.25 -0.1
-0.27 -0.03 0.09 -0.04 -0.11 0.26 0.09 -0.35 0.06 0.05 0.28 -0.17
-0.45 0.09 -0.05 0.07 -0.01 0.28 0.3 0.03 -0.12 -0.09 0.1 -0.31
-0.28 -0.18 -0.19 0.08 -0.02 0.3 0.05 0.23 0.03 0.01 -0.02 -0.13
-0.15 0.02 -0.15 -0.07 0.04 0.33 0.06 -0.08 0.02 -0.03 0.19 -0.27
-0.35 -0.25 0.26 0.0 -0.14 0.41 -0.01 -0.44 0.1 0.12 0.13 -0.06
-0.24 -0.12 -0.09 -0.08 -0.09 0.29 -0.06 -0.04 0.17 0.09 0.19 -0.1
-0.22 -0.15 -0.15 -0.03 -0.06 0.27 0.12 0.07 0.05 -0.0 0.18 -0.17
-0.51 -0.16 -0.36 0.24 0.07 0.45 0.22 0.2 -0.07 0.02 -0.1 -0.31
-0.34 -0.14 -0.01 0.13 0.03 0.3 0.14 0.16 -0.05 -0.01 -0.09 -0.23
-0.06 -0.09 -0.15 0.15 -0.03 0.21 0.28 0.16 -0.02 -0.05 -0.06 -0.49
-0.43 0.12 0.2 0.14 -0.03 0.03 -0.0 -0.35 0.11 -0.05 0.29 -0.19
-0.87 -0.24 -0.15 0.15 0.19 0.43 0.43 0.2 0.23 -0.09 -0.24 -0.59
-0.53 -0.16 0.08 0.11 0.03 0.51 0.49 0.03 -0.31 0.15 -0.26 -0.61
-0.8 -0.56 -0.35 0.04 0.26 0.39 0.44 0.25 0.15 0.07 -0.04 -0.43
-0.08 -0.11 -0.01 0.03 -0.02 0.31 0.06 -0.09 0.07 -0.08 0.09 -0.24
-0.18 -0.34 -0.27 -0.07 0.16 0.19 0.05 0.25 0.04 0.01 0.07 -0.04
-0.33 -0.23 0.17 -0.31 -0.16 0.39 0.36 -0.57 0.17 0.14 0.26 -0.28
-0.25 -0.22 0.16 0.06 0.02 0.35 0.01 -0.01 0.03 -0.06 0.0 -0.2
-0.56 -0.13 0.08 -0.04 0.08 0.34 0.28 -0.02 -0.12 0.07 0.17 -0.41
-0.33 -0.06 -0.16 0.05 -0.09 0.2 0.26 0.04 -0.03 0.12 0.03 -0.13
-0.02 -0.1 -0.13 -0.07 0.01 0.29 0.03 0.01 -0.01 0.07 -0.01 -0.11
-0.11 -0.06 -0.19 0.06 0.04 0.24 -0.11 -0.29 0.03 0.1 0.26 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.