Heatmap: Cluster_35 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.19 1.02 1.56 1.19 1.34 1.25 2.65 1.54 2.83 0.66 2.05 1.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.34 2.2 2.3 3.23 3.15 5.23 5.52 3.72 2.38 2.88 2.13 3.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.2 0.21 0.46 0.12 0.0 0.32 0.33 0.37 0.78 0.5 0.11
0.5 0.24 0.26 0.29 0.24 0.3 1.48 1.04 0.88 0.71 0.7 0.4
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.44 3.22 3.73 2.83 3.22 2.12 5.8 2.95 3.18 4.31 3.14 3.66
0.0 0.0 0.16 0.2 0.07 0.41 0.77 0.0 0.0 0.08 0.1 0.09
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.34 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.21 0.32
0.29 0.52 0.0 0.09 0.21 0.29 0.96 0.0 0.14 0.54 1.16 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.8 0.0 0.18 0.22 0.0 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.07 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.11 0.02 0.09 0.02 0.04 0.1 0.02 0.02 0.06 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 1.04 0.76 0.61 0.98 0.45 0.81 0.67 0.47 0.7 0.88 1.01
0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.04 0.19 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.04 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.07 0.05 0.02 0.04
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.59 0.03 0.32 0.07 0.14 0.3 0.12 0.37 0.35 0.37 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.24 0.14 0.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
0.07 0.19 0.09 0.08 0.12 0.09 0.26 0.15 0.09 0.1 0.15 0.15
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
6.41 7.02 8.13 8.58 9.0 8.85 12.25 8.92 8.14 8.43 7.05 7.35
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.07 0.38 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.16 0.0 0.03 0.04 0.04 0.13
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.11 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.2 0.09 0.03 0.1 0.0 0.02
0.0 0.0 0.02 0.21 0.02 0.0 0.3 0.02 0.05 0.06 0.05 0.08
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.42 0.05 0.16 0.28 0.02 0.21 0.02 0.05 0.02 0.05 0.04
0.04 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.04 0.05 0.05 0.07 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0
0.14 0.11 0.0 0.17 0.0 0.09 0.42 0.0 0.04 0.06 0.16 0.17
0.04 0.02 0.0 0.21 0.0 0.0 0.12 0.02 0.04 0.04 0.12 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.22 0.21 0.3 0.02 0.12 0.74 0.19 0.27 0.39 0.54 0.11
0.0 0.05 0.0 0.15 0.0 0.14 0.16 0.11 0.05 0.1 0.0 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.08 0.02 0.02 0.0 0.06 0.07
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 0.07 0.07 0.02 0.11 0.08
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.4 0.2 0.29 0.07 0.02 0.02 0.66 0.15 0.26 0.11 0.12 0.08
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.27 0.09 0.04 0.0 0.0 0.49 0.05 0.03 0.14 0.09 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.18 0.04 0.09 0.12 0.0 0.0 0.21 0.02 0.04 0.04 0.17 0.11
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.17 0.09 0.05 0.0 0.3 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.07 0.03 0.18 0.08 0.0 0.37 0.67 0.0 0.21 0.0 0.14 0.13
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.07 0.18 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.04
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.04
0.07 0.0 0.0 0.09 0.02 0.11 0.27 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.04 0.0 0.03 0.0 0.09 0.35 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.08 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.07 0.19 0.0 0.0 0.2 0.07 0.12 0.1 0.11 0.25 0.11 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0
0.0 0.06 0.18 0.04 0.02 0.13 0.2 0.22 0.11 0.08 0.07 0.15
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.07 0.04 0.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.1 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.02 0.09 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.11 0.05 0.0 0.04 0.05 0.16 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02
2.1 2.2 1.79 1.56 1.44 1.76 1.78 1.39 1.14 1.55 1.92 2.24
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.06 0.18 0.04 0.0 0.04 0.55 0.31 0.16 0.08 0.05 0.04
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.65 0.82 0.41 0.35 0.43 0.02 0.27 0.04 0.09 0.04 0.28 0.26
0.0 0.16 0.0 0.17 0.0 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
1.62 1.66 1.47 1.14 0.61 0.77 0.91 0.76 1.16 2.33 1.01 0.98
0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.04 0.02 0.0 0.02 0.04
0.0 0.06 0.05 0.49 0.07 0.0 0.48 0.48 0.11 0.37 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.39 0.05 0.13 0.04 0.11 0.04 0.24 0.15 0.23 0.02 0.02 0.11
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)