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Heatmap: Cluster_219 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.21 0.12 0.11 0.2 -0.25 -0.09 0.24 -0.15 -0.02 0.0 0.2 -0.28
-0.34 0.26 -0.41 0.19 -0.39 0.7 0.18 -0.45 -0.01 0.01 0.17 -0.43
0.12 0.26 -0.23 0.43 -0.09 0.32 0.23 -0.34 -0.28 -0.52 0.22 -0.57
-0.79 -0.36 -0.46 0.06 0.19 0.3 0.42 -0.29 0.41 0.25 0.23 -0.62
-0.47 0.14 -0.31 0.27 -0.56 0.35 0.34 -0.25 0.21 0.17 0.16 -0.51
-0.42 -0.64 -0.58 0.01 0.06 0.48 0.15 0.33 0.11 0.24 -0.01 -0.18
-0.09 0.39 0.08 0.25 -0.11 0.04 0.14 -0.47 -0.02 -0.01 -0.21 -0.19
-0.61 0.11 -0.32 0.14 -0.29 0.44 0.23 -0.29 0.12 0.42 0.09 -0.49
-0.55 0.39 -0.69 0.61 -0.32 0.25 0.54 -0.26 -0.56 0.17 0.11 -0.52
-0.66 0.07 -0.77 0.24 -0.03 0.08 0.2 0.53 -0.18 0.21 -0.03 -0.14
-0.12 0.05 -0.14 0.04 -0.19 0.79 0.06 -0.54 -0.14 -0.06 0.26 -0.5
-0.53 0.13 -0.37 -0.03 0.26 0.19 0.27 0.09 -0.09 0.06 0.09 -0.33
0.3 -0.11 -0.49 0.11 0.31 0.06 0.05 -0.15 -0.09 -0.13 0.22 -0.3
-1.41 -0.07 0.53 0.64 -0.16 0.12 0.76 0.17 -1.01 -0.49 0.14 -0.84
-0.41 -0.03 -0.73 0.13 0.32 0.47 0.48 -0.16 0.18 -0.45 0.03 -0.41
-0.35 -1.23 - 1.0 -0.73 1.7 0.92 -1.16 -1.42 0.44 -1.39 -1.08
-0.19 -0.11 -0.42 0.02 0.09 0.24 0.14 -0.01 -0.05 -0.04 0.27 -0.07
-0.1 0.13 -0.17 0.22 0.08 0.36 -0.07 -0.27 -0.03 -0.26 0.08 -0.11
-0.58 -0.08 -0.12 0.22 0.24 0.61 0.17 -0.49 0.18 -0.26 0.07 -0.43
-0.34 -0.01 -0.5 0.24 -0.21 0.35 0.49 -0.69 0.16 -0.07 0.42 -0.4
-3.84 -0.49 -1.35 -0.17 0.54 0.33 1.27 -0.76 0.17 0.8 -0.15 -1.11
0.13 0.54 -1.94 -0.45 1.08 0.69 - -0.74 0.9 -0.12 -1.45 -0.03
0.09 -0.18 -0.13 -0.06 0.12 0.09 0.09 0.03 0.06 -0.3 0.15 -0.04
-1.0 -1.39 -0.52 -0.78 -0.13 1.06 1.35 -0.69 -1.36 0.5 -0.14 -0.06
0.32 -0.37 -0.16 -0.05 0.12 -0.2 0.26 -0.23 -0.09 -0.01 0.39 -0.2
-0.18 -0.1 -0.36 -0.02 0.2 -0.03 -0.05 0.24 0.05 0.07 0.16 -0.07
0.32 -0.45 -1.08 0.18 0.31 0.79 -0.45 0.29 -0.25 0.51 -1.18 -0.36
-0.27 0.23 -0.22 0.11 -0.34 0.37 0.13 0.04 0.0 0.12 -0.05 -0.34
-1.24 0.37 -1.2 0.38 -0.36 0.85 0.33 -0.79 0.02 0.29 0.29 -0.58
-0.77 0.02 -0.18 0.12 0.06 0.64 0.4 -0.21 0.05 -0.2 0.03 -0.49
-0.3 -0.33 -0.52 -0.07 -0.05 0.47 0.37 -0.07 0.08 0.21 0.19 -0.35
-1.11 -0.3 -0.5 0.05 0.19 0.49 0.49 -0.52 0.05 0.4 0.5 -0.83
-0.39 -0.16 -0.98 0.27 0.34 0.0 0.25 0.18 -0.13 -0.18 0.53 -0.33
-0.05 0.07 0.04 0.12 0.02 0.13 -0.01 -0.2 0.08 -0.12 0.07 -0.18
-0.26 0.11 -0.17 0.23 -0.03 0.38 0.1 -0.13 0.05 -0.07 0.04 -0.42
-0.71 -0.28 -0.75 -0.61 -0.12 0.68 1.07 -0.24 -0.83 0.36 -0.18 0.15
0.14 0.63 -0.1 0.17 -0.13 0.21 0.17 -0.2 -0.15 -0.29 -0.6 -0.23
-1.12 0.19 -0.32 0.46 0.66 0.99 0.28 0.64 -0.82 0.23 - -2.89
-0.54 0.02 0.43 -0.61 -1.28 0.45 0.94 -0.29 -0.02 0.5 -1.05 -0.15
-0.15 0.18 -0.03 0.15 -0.15 0.17 0.36 -0.32 -0.11 -0.25 -0.1 0.08
0.02 -0.36 0.34 0.15 -0.04 0.26 0.15 -0.3 -0.23 0.28 0.12 -0.78
-0.43 -0.4 -0.12 0.52 -0.32 0.28 0.61 0.16 -0.12 0.27 -0.5 -0.62
-0.63 0.27 -2.42 1.39 -0.21 0.87 0.45 -0.49 -0.53 -0.29 -0.74 -1.13
-0.14 0.25 -0.11 0.25 0.22 0.2 -0.06 -0.78 -0.43 0.06 0.29 -0.11
-0.59 0.12 -0.03 0.24 -0.73 0.53 0.53 -0.43 -0.25 -0.02 0.39 -0.46
-0.16 0.3 0.01 0.17 -0.15 0.07 0.3 -0.09 -0.18 -0.07 -0.21 -0.11
-0.42 -0.07 0.06 0.17 0.14 0.17 -0.04 -0.17 -0.17 0.13 0.31 -0.29
0.01 0.14 -0.28 0.19 -0.21 0.48 0.26 -0.69 -0.32 0.28 0.14 -0.46
-0.65 0.05 0.05 0.02 -0.56 0.69 0.36 -0.12 -0.35 0.1 0.14 -0.27
0.09 0.19 -0.29 0.31 -0.3 0.37 0.46 -0.21 -0.6 0.13 -0.2 -0.38
-0.18 0.0 -0.17 0.12 0.03 0.28 -0.06 -0.09 -0.09 0.1 0.13 -0.15
0.03 0.39 0.13 0.25 -0.23 0.18 0.08 -0.53 -0.26 -0.07 0.07 -0.3
-0.44 -0.04 0.21 0.21 -0.03 0.16 0.13 -0.27 -0.15 0.06 0.11 -0.1
-0.75 -0.11 -0.46 -0.03 0.06 0.21 0.16 0.4 -0.3 0.31 0.36 -0.33
-0.16 -0.07 -0.12 0.1 0.14 0.31 0.13 -0.33 -0.06 -0.05 0.28 -0.33
-0.81 0.43 0.15 0.65 -0.11 0.28 0.79 -0.46 -1.31 0.05 -0.45 -0.67
-0.31 -0.04 0.25 0.29 0.1 0.72 0.07 -0.12 -0.45 -0.73 -0.14 -0.18
-0.34 -0.01 -0.49 0.08 0.05 0.2 0.07 -0.2 0.16 0.06 0.34 -0.14
-0.12 0.34 -0.35 -0.02 -0.25 0.48 0.15 -0.41 -0.14 -0.12 0.27 -0.13
-0.2 0.01 -0.14 0.13 0.01 0.15 -0.02 -0.02 0.03 0.08 0.01 -0.08
0.08 -0.0 -0.13 0.1 -0.02 0.24 -0.03 -0.1 -0.01 -0.07 0.08 -0.2
-0.61 -0.02 -0.38 0.32 -0.26 0.22 0.26 0.09 0.24 -0.02 -0.01 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.