Heatmap: Cluster_138 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.18 -0.13 0.08 -0.15 0.03 0.06 -0.15 -0.14 0.11 0.11 0.06 -0.14
0.27 0.19 0.32 0.08 -0.05 -0.17 -0.3 -0.19 -0.14 -0.14 -0.01 0.01
0.05 -0.21 -0.03 -0.05 0.07 0.09 0.0 0.06 -0.03 0.07 0.09 -0.15
0.45 0.1 0.06 0.04 0.14 0.04 -0.22 -0.24 -0.11 -0.19 -0.11 -0.11
0.43 0.03 0.08 -0.0 0.05 -0.02 -0.25 -0.16 -0.06 -0.05 -0.02 -0.14
-0.09 -0.09 0.01 0.07 0.12 0.05 0.11 -0.03 0.06 0.06 0.0 -0.35
0.18 -0.07 0.03 -0.08 0.03 0.02 -0.13 -0.5 0.11 0.08 0.38 -0.23
0.18 0.03 0.08 0.01 0.06 0.07 -0.09 -0.2 -0.03 0.01 -0.06 -0.11
0.27 0.01 0.22 -0.06 0.17 -0.0 -0.1 -0.15 -0.14 -0.14 -0.12 -0.05
0.17 -0.07 -0.02 -0.13 -0.13 0.0 -0.17 -0.14 0.21 0.13 0.1 -0.01
0.32 0.04 0.04 0.06 -0.22 -0.04 -0.34 -0.38 -0.09 0.13 0.16 0.15
-0.01 -0.03 -0.07 0.03 0.12 0.02 0.03 -0.0 0.12 -0.02 -0.05 -0.16
0.75 0.51 -0.04 -0.12 -0.09 0.23 -0.2 -0.58 -0.3 -0.24 -0.2 -0.29
0.27 0.2 0.28 -0.05 -0.04 -0.02 -0.21 -0.2 -0.09 -0.16 -0.09 -0.0
0.33 0.05 -0.14 0.01 -0.02 -0.11 -0.14 -0.11 -0.12 0.05 0.12 -0.0
0.52 0.15 0.23 -0.11 0.05 0.02 -0.27 -0.39 -0.19 -0.02 -0.1 -0.12
0.31 0.19 0.28 -0.08 -0.04 -0.24 -0.16 -0.29 -0.04 -0.09 -0.07 0.09
0.26 0.03 0.16 -0.14 0.01 0.08 -0.23 -0.19 0.07 0.05 -0.02 -0.16
0.02 -0.17 0.11 -0.09 -0.03 0.06 -0.35 -0.08 0.12 -0.03 0.23 0.11
0.58 0.26 -0.04 -0.01 -0.1 -0.03 -0.2 -0.29 -0.25 -0.1 0.01 -0.06
0.54 0.31 0.42 0.02 0.07 -0.12 -0.49 -0.56 -0.24 -0.06 -0.3 -0.04
0.17 -0.05 0.0 -0.09 -0.12 -0.05 -0.16 -0.05 0.04 0.15 0.1 0.01
0.46 0.16 0.11 -0.14 -0.1 0.13 -0.1 -0.26 -0.1 -0.04 -0.05 -0.22
0.41 -0.42 0.18 -0.18 -0.0 0.04 -0.61 -0.29 0.15 0.17 0.22 0.0
0.51 0.25 -0.28 -0.04 -0.07 0.14 -0.21 -0.26 -0.06 -0.13 0.1 -0.14
0.32 -0.05 0.37 0.01 0.09 0.05 -0.0 -0.29 -0.14 -0.26 0.03 -0.3
0.1 0.01 0.04 0.05 0.02 0.01 -0.13 -0.15 0.07 0.01 0.05 -0.11
0.12 0.19 0.09 -0.09 0.08 0.01 -0.53 -0.12 -0.21 0.13 0.1 0.08
0.69 -0.14 0.14 -0.25 -0.31 -0.01 -0.52 -0.44 0.07 0.05 0.04 0.27
0.03 -0.02 0.35 0.03 -0.21 -0.05 -0.08 -0.06 0.07 0.06 -0.02 -0.16
0.08 0.02 0.13 -0.02 -0.18 0.04 -0.25 -0.14 -0.01 0.12 0.14 -0.01
0.08 0.1 0.29 -0.06 -0.03 -0.07 -0.13 -0.22 -0.05 -0.01 0.12 -0.09
0.08 -0.14 0.07 0.07 0.03 0.11 -0.01 -0.37 0.16 0.06 0.05 -0.19
1.22 0.1 -0.06 -0.23 -0.12 0.4 -1.0 -1.02 -0.07 -0.26 0.01 -0.39
0.86 0.38 -0.16 0.08 -0.38 -0.39 -0.74 -0.61 -0.56 -0.05 0.25 0.4
0.65 0.01 0.08 -0.1 0.05 0.01 -0.14 -0.3 -0.13 -0.09 -0.15 -0.14
0.63 0.18 0.29 -0.18 -0.21 0.02 -0.26 -0.37 -0.04 -0.11 -0.05 -0.2
0.07 0.09 0.24 0.03 0.24 0.02 -0.33 -0.1 -0.16 -0.19 0.02 -0.04
0.76 0.09 -0.18 -0.1 0.1 0.25 -0.4 -0.51 -0.15 -0.16 0.07 -0.21
0.25 0.11 0.21 0.08 0.07 -0.02 -0.21 -0.25 -0.01 -0.13 -0.11 -0.09
0.32 0.14 0.23 0.17 0.3 -0.01 -0.43 -0.65 -0.03 0.01 -0.18 -0.18
0.05 -0.11 -0.15 -0.07 -0.0 0.05 -0.05 -0.02 0.04 0.11 0.14 -0.02
0.45 0.05 0.32 0.1 0.33 0.1 -0.44 -0.51 -0.06 -0.23 -0.17 -0.31
0.82 0.52 0.48 -0.25 -0.47 0.15 -0.52 -0.57 -0.34 0.01 -0.34 -0.34
0.12 0.06 0.12 -0.04 -0.11 -0.04 -0.12 -0.18 0.0 0.09 0.11 -0.05
0.65 0.08 0.07 -0.02 -0.28 -0.07 -0.25 -0.57 -0.32 0.02 0.18 0.14
0.83 0.08 0.17 -0.11 -0.03 -0.07 -0.41 -0.72 -0.16 -0.15 0.05 -0.01
0.22 -0.05 -0.01 -0.11 -0.13 -0.0 -0.24 -0.12 0.1 0.16 0.06 0.04
0.18 -0.01 0.08 -0.1 -0.12 -0.06 -0.17 -0.23 0.01 0.23 0.15 -0.06
0.32 -0.06 0.07 0.05 0.13 0.11 -0.12 -0.17 -0.03 -0.07 -0.08 -0.23
0.95 0.06 0.45 -0.4 -1.44 -0.65 -0.85 -0.33 -0.07 0.02 -0.07 0.7
0.63 0.36 0.25 0.06 0.23 0.25 -0.64 -1.12 -0.05 -0.34 -0.29 -0.14
0.79 0.04 0.42 -0.04 0.01 -0.02 -0.57 -0.55 -0.18 -0.11 -0.11 -0.26
1.22 -1.56 0.5 -1.11 -0.46 -0.54 -0.47 -1.28 0.66 0.42 0.33 -0.47
0.14 -0.16 0.02 0.03 0.05 0.08 -0.21 -0.04 0.1 0.07 0.02 -0.13
0.01 -0.11 -0.09 -0.07 0.04 0.12 -0.16 -0.13 0.22 0.03 0.14 -0.06
0.2 0.21 0.27 0.15 -0.02 -0.13 -0.19 -0.22 -0.07 -0.16 -0.05 -0.1
0.2 -0.03 0.06 0.01 -0.13 -0.12 -0.11 -0.28 0.01 0.13 0.2 -0.02
0.11 -0.15 0.02 -0.06 -0.09 0.12 -0.18 -0.18 0.22 0.13 0.17 -0.19
0.38 0.2 0.13 0.09 -0.01 0.02 -0.37 -0.27 -0.11 -0.09 -0.04 -0.07
0.24 0.23 0.39 0.15 0.23 -0.16 -0.42 -0.45 -0.21 -0.2 -0.02 -0.06
0.6 0.24 -0.35 -0.04 -0.16 0.07 -0.27 -0.5 -0.03 -0.39 0.35 0.07
0.28 0.12 0.07 -0.0 0.08 -0.0 -0.29 -0.16 -0.07 -0.06 -0.0 -0.04
0.4 0.19 -0.18 0.04 -0.14 -0.24 -0.18 -0.27 -0.13 0.16 0.1 0.07
0.46 0.3 0.13 -0.2 -0.09 -0.06 -0.19 -0.43 -0.06 -0.02 0.11 -0.15
0.98 0.27 0.38 -0.21 0.06 -0.11 -0.19 -0.72 -0.06 -0.23 -0.41 -0.65

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.