Heatmap: Cluster_121 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.36 0.25 0.27 0.24 0.39 0.05 0.29 0.25 0.14 0.2 0.32 0.19
0.36 0.39 0.35 0.38 0.21 0.29 0.67 0.49 0.11 0.32 0.33 0.26
0.79 0.61 0.78 1.03 0.52 0.51 0.7 4.11 2.86 2.7 2.29 2.59
0.32 0.69 0.28 0.43 0.17 0.24 0.46 0.53 0.42 0.16 0.4 0.37
2.4 3.5 3.7 2.82 3.28 2.27 4.71 3.61 3.12 3.16 2.78 3.59
0.25 0.28 0.27 0.37 0.27 0.37 1.08 1.0 0.88 0.14 0.61 0.28
0.11 0.58 0.29 0.26 0.2 0.15 0.73 0.5 0.18 0.44 0.09 0.28
0.14 0.25 0.14 0.14 1.34 1.68 1.39 1.89 0.77 0.73 0.21 0.34
5.81 10.75 8.92 7.24 7.2 5.67 9.8 7.05 6.12 4.96 6.62 5.35
0.49 0.22 0.09 0.34 0.14 0.17 0.39 0.67 0.16 0.15 0.48 0.04
9.24 8.19 9.44 8.16 7.98 9.83 11.43 13.55 14.57 12.74 16.71 14.14
0.5 0.96 0.0 0.58 0.46 1.04 0.32 0.68 0.39 0.65 0.56 0.37
0.04 0.02 0.05 0.05 0.03 0.0 0.12 0.21 0.16 0.12 0.25 0.15
1.38 1.26 0.84 1.82 1.47 1.54 0.52 0.88 1.49 0.75 1.06 1.44
0.29 1.03 0.34 0.67 0.42 0.72 1.11 0.86 0.25 0.24 0.36 0.27
2.25 1.81 0.7 0.58 1.21 0.57 1.1 2.1 0.38 1.5 1.15 0.84
3.64 5.27 4.29 4.71 4.58 5.21 5.96 4.62 4.88 4.13 4.75 3.46
0.11 0.08 0.09 0.0 0.02 0.0 0.14 0.04 0.02 0.04 0.0 0.06
2.72 2.24 1.08 2.16 2.25 1.67 2.07 1.27 1.74 0.81 2.66 2.14
0.46 0.31 0.18 0.3 0.28 0.21 0.28 0.29 0.18 0.12 0.31 0.32
0.25 0.5 0.56 0.54 0.52 0.8 0.54 0.67 0.77 0.47 0.48 0.38
0.0 0.08 0.02 0.2 0.02 0.14 0.16 0.06 0.05 0.13 0.09 0.04
0.58 0.74 0.33 0.31 0.31 0.4 0.55 0.58 0.46 0.51 0.54 0.56
0.0 0.14 0.0 0.03 0.06 0.32 0.12 0.25 0.0 0.0 0.07 0.15
1.17 0.95 1.25 1.07 1.31 1.16 2.35 1.71 1.21 1.33 1.08 1.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.17 0.23 0.13 0.02 0.26 0.04 0.0
0.11 0.2 0.1 0.13 0.17 0.02 0.21 0.12 0.03 0.0 0.17 0.06
0.51 0.42 1.24 1.31 0.54 1.2 1.11 1.4 1.28 0.81 1.33 0.19
0.36 0.24 0.02 0.51 0.33 0.46 0.32 0.21 0.33 0.13 0.04 0.45
0.07 0.11 0.0 0.04 0.09 0.25 0.22 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.1 0.19 0.04 0.1 0.02 0.04
0.18 0.15 0.14 0.2 0.12 0.2 0.3 0.24 0.23 0.11 0.13 0.17
0.14 0.1 0.12 0.2 0.1 0.23 0.49 0.47 0.16 0.21 0.19 0.06
0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.06 0.08 0.07 0.04 0.02 0.02 0.04
1.07 1.51 2.19 2.4 1.07 1.07 4.03 2.62 1.9 1.94 1.87 2.16
0.04 0.12 0.3 0.02 0.21 0.07 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17
0.04 0.14 0.17 0.43 0.02 0.23 0.55 0.02 0.0 0.08 0.02 0.11
0.39 0.4 0.42 0.47 0.46 1.02 0.7 0.71 0.9 0.58 0.56 0.55
0.29 0.67 0.9 0.61 0.43 1.16 1.88 2.05 1.04 1.36 0.95 0.83
0.07 0.23 0.12 0.06 0.08 0.47 0.29 0.35 0.04 0.17 0.04 0.23
0.04 0.12 0.09 0.1 0.0 0.22 0.22 0.14 0.05 0.02 0.02 0.04
0.97 1.36 1.05 1.46 0.96 2.71 2.86 3.11 1.72 2.22 2.3 1.41
4.05 3.89 5.01 4.51 4.51 4.86 6.92 6.71 7.39 7.75 6.87 5.97
7.85 6.84 9.33 7.6 9.13 6.91 7.38 8.21 7.53 5.35 5.75 5.72
0.97 1.78 1.68 2.31 0.6 1.85 1.72 1.39 1.39 1.06 1.6 1.56
0.0 0.04 0.51 0.75 0.26 0.59 0.47 0.2 0.12 0.58 0.04 0.04
5.22 6.18 5.43 5.24 5.44 7.66 7.28 7.13 8.37 6.48 6.47 4.37
0.04 0.08 0.0 0.02 0.03 0.37 0.45 0.36 0.21 0.1 0.29 0.0
0.0 0.0 0.02 0.06 0.09 0.2 0.45 0.44 0.19 0.22 0.29 0.06
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.51 0.68 0.58 0.11 0.23 0.05 0.06
0.07 0.27 0.19 0.16 0.09 0.0 0.2 0.0 0.03 0.04 0.13 0.08
0.18 0.09 0.2 0.08 0.3 0.11 0.06 0.47 0.28 0.24 0.45 0.59
0.18 0.16 0.0 0.15 0.13 0.02 0.31 0.41 0.11 0.27 0.11 0.25
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17 0.37 0.34 0.04 0.02 0.0 0.0
13.37 13.38 12.6 12.91 12.18 10.28 11.83 11.97 11.37 13.62 14.84 14.39
0.11 0.36 0.25 0.64 0.55 0.39 1.19 0.88 0.21 0.82 0.69 0.63
0.11 0.23 0.1 0.19 0.06 0.05 0.26 0.22 0.1 0.02 0.21 0.02
0.54 0.46 0.1 0.12 0.07 0.2 0.37 1.14 0.48 0.45 0.22 0.0
0.61 3.03 2.73 4.9 2.81 5.14 6.3 3.72 0.35 6.43 2.47 3.27
4.77 3.58 6.83 8.49 5.66 7.07 8.19 7.31 8.04 9.12 4.5 5.0
77.29 92.13 87.52 88.76 89.78 86.9 93.16 90.3 89.52 85.23 88.2 81.03
19.49 16.81 18.96 18.73 20.04 18.01 21.58 24.08 24.16 22.69 23.39 22.54
4.75 3.67 4.55 3.88 4.31 4.43 4.65 6.28 5.42 5.22 6.2 5.9
4.76 5.07 7.24 5.66 5.46 6.33 4.64 5.57 4.71 2.54 4.06 4.21
1.9 2.27 2.91 2.68 2.29 2.4 2.67 2.63 2.74 1.93 2.46 2.09
0.07 0.24 0.1 0.29 0.18 0.09 0.5 0.52 0.16 0.3 0.12 0.04
0.47 0.5 0.88 0.49 0.46 3.29 3.19 2.54 2.2 1.82 1.14 1.0
10.66 7.72 10.5 8.0 11.34 10.2 7.73 11.93 8.34 9.99 10.21 8.12
5.48 3.96 5.15 4.6 4.48 4.62 6.7 10.54 9.68 9.1 10.76 10.76
68.09 60.9 66.57 61.56 61.5 60.45 69.08 85.18 84.0 82.6 93.05 81.62
35.79 35.29 34.21 36.61 40.64 30.96 30.65 32.76 32.27 34.95 42.47 36.54
2.05 0.94 1.86 0.94 0.92 4.67 3.9 3.85 3.57 3.27 1.56 1.76
149.0 174.14 150.14 150.91 144.87 142.27 159.84 171.02 147.18 162.25 146.19 159.38
45.62 48.71 44.45 45.4 46.85 47.94 47.64 49.3 48.2 48.36 48.35 42.26
5.0 3.88 3.93 4.54 4.08 3.87 4.21 4.05 4.51 3.94 5.14 3.22
4.54 5.26 6.26 4.97 4.72 6.28 5.68 5.22 4.85 4.12 4.92 4.27
0.53 0.82 1.29 0.85 0.67 1.14 1.91 1.67 1.51 1.36 1.51 1.03
0.86 1.33 0.43 0.76 0.83 0.51 1.22 0.91 0.39 0.67 1.17 1.21
0.22 0.46 0.55 1.14 0.21 0.15 1.5 0.4 0.31 0.5 0.11 0.64

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)