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Heatmap: Cluster_149 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.47 -0.36 -0.33 -0.06 -0.01 -0.02 0.15 0.15 0.27 0.23 0.21 0.02
-0.43 -0.38 -0.16 -0.06 0.03 -0.11 0.12 0.28 0.24 0.17 0.15 -0.03
-0.23 -0.3 -0.16 -0.08 -0.07 -0.04 0.04 0.09 0.15 0.23 0.2 0.06
-0.76 -0.62 -0.44 -0.13 0.12 -0.35 0.39 0.53 0.34 0.29 0.07 -0.05
-0.57 -0.68 -0.37 -0.0 0.07 -0.1 -0.03 0.24 0.33 0.27 0.31 0.11
-0.34 -0.61 -0.39 -0.07 0.01 -0.12 -0.0 0.36 0.29 0.3 0.19 0.06
-0.7 -0.54 -0.24 0.03 0.07 -0.07 0.21 0.26 0.28 0.22 0.19 -0.08
-0.66 -0.34 -0.19 0.07 -0.04 -0.16 -0.13 0.16 0.22 0.34 0.32 0.1
-1.41 -0.96 -0.61 -0.14 -0.05 -0.18 0.23 0.38 0.67 0.59 0.29 -0.13
-0.51 -0.76 -0.19 -0.0 -0.06 -0.32 0.02 0.29 0.51 0.39 0.24 -0.11
-0.37 -0.33 -0.1 -0.05 0.02 -0.24 0.05 0.19 0.17 0.22 0.2 0.06
-0.58 -0.55 -0.11 -0.03 -0.02 -0.1 -0.14 0.25 0.29 0.36 0.26 0.02
-0.58 -0.49 -0.29 -0.0 0.1 0.01 0.02 0.35 0.38 0.2 0.13 -0.19
-0.41 -0.45 -0.19 -0.01 0.06 0.11 -0.08 0.18 0.23 0.19 0.16 0.03
-0.85 -0.58 -0.16 -0.03 -0.04 0.02 -0.08 0.31 0.3 0.34 0.22 0.09
-0.44 -0.41 -0.24 -0.06 0.08 0.08 -0.07 0.24 0.28 0.15 0.13 0.05
-0.52 -0.52 -0.15 -0.0 0.02 -0.2 0.01 0.24 0.29 0.28 0.24 0.04
-0.51 -0.32 -0.17 0.02 0.18 -0.13 -0.05 0.34 0.18 0.15 0.14 -0.05
-0.53 -0.43 -0.35 -0.15 0.11 -0.06 -0.05 0.21 0.37 0.27 0.18 0.12
-0.82 -0.78 -0.11 0.03 0.13 -0.28 -0.35 0.42 0.35 0.28 0.27 0.22
-0.19 -0.25 -0.12 -0.04 0.01 -0.05 0.04 0.16 0.15 0.1 0.11 0.02
-1.04 -0.9 -0.42 0.0 -0.01 -0.25 -0.03 0.51 0.48 0.54 0.22 -0.02
-0.97 -0.59 -0.2 0.17 0.03 -0.17 -0.11 0.35 0.35 0.29 0.23 0.09
-1.37 -0.71 -0.16 -0.29 -0.86 -0.86 -0.06 0.42 0.51 0.56 0.57 0.58
-1.53 -1.08 -0.2 -0.25 -0.1 -0.83 -0.09 0.54 0.53 0.49 0.47 0.43
-0.54 -0.41 -0.18 -0.1 0.06 0.08 0.03 0.19 0.24 0.24 0.19 -0.01
-0.34 -0.31 -0.15 -0.11 0.02 -0.06 0.05 0.16 0.24 0.21 0.11 0.05
-0.49 -0.34 -0.12 -0.03 0.14 -0.12 0.09 0.28 0.2 0.2 0.08 -0.08
-0.68 -0.72 -0.36 -0.33 0.08 0.06 -0.01 0.32 0.35 0.39 0.16 0.2
-0.17 -0.27 -0.05 -0.0 0.0 -0.17 -0.03 0.3 0.11 0.2 0.07 -0.08
-1.97 -1.03 -0.5 -0.06 0.26 -0.34 0.18 0.49 0.5 0.36 0.44 0.01
-0.67 -0.38 -0.22 -0.18 -0.4 -0.93 -0.1 0.35 0.42 0.54 0.41 0.31
-0.15 -0.15 -0.07 -0.04 0.04 -0.05 -0.03 0.17 0.06 0.07 0.05 0.06
-0.36 -0.41 -0.1 -0.12 -0.15 -0.36 -0.01 0.38 0.18 0.25 0.22 0.2
-0.71 -0.53 -0.31 0.01 0.12 -0.07 0.08 0.27 0.33 0.31 0.21 -0.11
-0.3 -0.34 -0.14 -0.01 0.03 -0.12 0.09 0.25 0.25 0.12 0.11 -0.07
-1.1 -0.74 -0.16 -0.16 -0.2 -0.66 -0.08 0.27 0.51 0.49 0.51 0.3
-0.58 -0.44 -0.31 -0.01 0.13 -0.03 0.15 0.25 0.26 0.23 0.13 -0.05
-0.77 -0.58 -0.22 0.03 0.25 -0.03 0.02 0.32 0.34 0.33 0.06 -0.21
-1.28 -0.78 -0.25 -0.1 -0.07 -0.35 -0.05 0.24 0.45 0.43 0.44 0.34
-0.51 -0.35 -0.12 -0.01 0.16 -0.16 -0.11 0.29 0.17 0.16 0.06 0.22
-0.64 -0.59 -0.37 -0.08 0.09 -0.25 0.08 0.34 0.33 0.44 0.21 -0.05
-0.72 -0.51 -0.34 -0.14 0.19 -0.06 0.12 0.23 0.31 0.27 0.24 0.02
-0.12 -0.37 -0.05 -0.13 -0.31 -0.43 -0.11 0.34 0.2 0.3 0.22 0.21
-0.77 -0.9 -0.56 -0.28 -0.17 -0.4 0.21 0.38 0.48 0.57 0.31 0.21
-1.39 -0.78 -0.55 -0.72 -0.04 -1.01 -0.53 0.35 0.65 0.41 0.78 0.76
-0.4 -0.37 -0.12 -0.15 -0.02 -0.3 0.05 0.3 0.22 0.21 0.23 0.14
-0.42 -0.29 -0.07 0.1 0.09 -0.07 -0.05 0.28 0.14 0.09 0.14 -0.08
-0.45 -0.29 -0.06 -0.14 -0.0 -0.33 -0.04 0.21 0.23 0.24 0.22 0.18
-0.46 -0.4 -0.23 0.04 0.06 0.14 0.01 0.3 0.16 0.05 0.05 0.09
-0.75 -0.52 -0.5 -0.19 0.03 -0.0 0.09 0.26 0.38 0.3 0.33 0.06
-0.44 -0.39 -0.28 -0.07 0.2 0.06 -0.03 0.24 0.2 0.1 0.13 0.06
-0.59 -0.58 -0.22 -0.07 0.13 -0.11 -0.09 0.27 0.35 0.22 0.26 0.08
-0.48 -0.43 -0.22 -0.07 0.08 -0.13 0.05 0.21 0.33 0.24 0.18 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.