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Heatmap: Cluster_160 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.67 0.3 0.2 0.03 0.12 0.03 -0.25 -0.96 -0.41 -0.48 0.15 -0.05
-0.77 -0.32 0.46 0.59 0.45 -0.52 -0.11 -0.0 0.19 -0.07 -0.37 -0.21
0.02 0.67 1.17 0.8 -0.14 0.14 -0.07 -0.48 -1.32 -1.87 -0.74 -1.14
0.08 0.43 0.5 0.74 0.07 -0.3 -0.1 -0.39 -0.6 -0.75 -0.56 0.02
-0.4 -0.01 0.4 0.37 0.25 -0.21 -0.11 0.11 -0.04 -0.18 -0.21 -0.22
-0.11 -0.11 0.0 0.05 -0.16 0.01 0.06 -0.12 -0.04 0.08 0.2 0.09
-0.43 0.22 0.16 0.12 -0.03 -0.3 0.05 -0.36 0.09 0.11 0.46 -0.39
0.37 0.61 0.33 0.58 -0.36 -0.32 -0.28 -0.68 -0.67 -0.08 -0.32 0.03
-0.14 -0.05 0.05 0.07 0.01 -0.01 -0.06 -0.03 0.11 0.07 0.05 -0.08
0.5 0.17 0.09 0.05 -0.08 -0.14 -0.29 -0.29 -0.11 -0.16 0.05 0.02
0.1 0.32 0.17 0.3 0.06 -0.38 -0.09 -0.32 -0.07 -0.03 -0.05 -0.19
0.13 1.07 0.95 0.71 -0.13 -1.15 -0.13 -0.5 -1.78 -0.75 -0.88 -0.25
-0.16 0.25 0.08 0.17 -0.07 -0.22 0.29 0.04 -0.01 -0.09 -0.08 -0.34
-0.72 0.31 0.25 0.3 0.28 0.11 0.82 -0.05 -0.39 -0.41 -0.62 -0.92
-0.04 0.28 0.2 0.38 0.04 -0.3 -0.15 -0.11 -0.11 -0.08 -0.11 -0.14
0.31 0.31 0.17 0.09 0.09 -0.08 -0.38 -0.7 -0.21 -0.15 0.09 0.14
-0.28 -0.12 -0.06 0.04 0.05 -0.06 0.0 0.12 0.22 0.1 -0.02 -0.05
-0.75 0.06 0.19 0.33 0.16 -0.23 -0.17 0.11 0.17 0.06 -0.06 -0.16
-0.62 0.61 0.54 0.26 -0.08 -0.34 0.54 -0.07 -0.45 -0.26 -0.4 -0.51
-0.1 0.36 -0.01 0.31 -0.13 -0.06 0.36 0.05 -0.13 -0.2 -0.31 -0.39
0.13 0.86 1.05 0.59 -0.61 -0.08 0.16 -0.29 -1.21 -1.07 -0.99 -0.83
-0.08 0.22 0.25 0.22 0.07 -0.19 -0.05 -0.07 -0.29 -0.22 -0.06 0.07
0.13 0.49 0.63 0.28 0.11 -0.68 -0.35 -0.28 -0.36 -0.41 -0.27 0.1
-0.11 0.5 0.62 0.34 -0.29 -0.25 -0.43 -0.81 -0.34 -0.08 0.11 0.11
-0.24 0.33 0.27 0.32 -0.13 -0.34 -0.24 -0.24 -0.05 0.15 0.08 -0.14
0.07 - - 1.23 -0.5 1.04 0.25 -0.68 -0.91 -0.77 0.71 0.37
-0.97 -0.59 0.29 0.3 0.14 -1.35 -0.17 -0.69 0.69 0.39 0.21 0.38
- -0.62 -0.64 1.49 - -0.35 0.51 -1.42 -0.09 0.64 0.73 0.22
0.05 0.48 0.88 0.9 0.26 -0.16 0.55 -0.38 -1.24 -1.51 -1.45 -1.34
-0.9 -0.11 0.1 -0.32 0.14 -0.28 -0.0 0.05 0.42 0.25 0.2 0.04
-0.49 0.09 0.26 0.45 -0.11 -0.25 -0.23 -0.37 -0.21 0.25 0.23 0.06
-0.09 0.31 0.17 0.17 0.02 -0.08 0.1 -0.1 -0.04 -0.21 -0.13 -0.22
0.53 0.7 0.49 0.61 0.07 0.01 -0.85 -1.45 -0.8 -0.65 -0.02 -0.28
0.73 0.32 0.24 0.21 0.1 -0.32 -0.56 -0.75 -0.44 -0.38 0.06 0.09
-0.49 -0.11 0.01 0.14 -0.08 -0.03 0.2 -0.31 -0.06 0.35 0.35 -0.22
-0.18 0.34 0.65 0.48 0.43 -0.15 0.28 0.04 -0.46 -0.76 -0.91 -0.89
-0.25 -0.01 0.15 -0.06 -0.09 -0.1 0.01 -0.16 0.15 0.16 0.22 -0.1
-0.58 0.26 0.14 0.45 0.09 -1.69 0.38 -1.06 -0.44 0.72 0.02 0.15
-0.87 0.06 1.04 1.12 0.38 -0.6 0.14 -1.29 0.32 -1.09 -0.9 -1.14
0.37 0.65 0.77 0.33 -0.05 -0.04 -0.17 -0.23 -0.85 -0.61 -0.79 -0.5
-0.01 0.05 0.23 0.04 0.03 -0.02 -0.12 -0.1 0.0 -0.03 0.04 -0.15
-0.34 -0.04 0.07 0.23 0.05 -0.24 -0.03 -0.26 0.05 0.15 0.28 -0.06
-1.12 -0.12 0.09 0.26 -0.64 0.33 0.26 -0.13 0.19 0.43 0.02 -0.25
-0.32 0.03 0.04 0.27 -0.32 -0.07 0.11 -0.12 -0.05 0.37 0.15 -0.27
-0.62 0.04 0.64 0.32 -0.09 0.24 0.49 0.14 0.05 -0.52 -0.8 -0.79
- -0.44 1.02 -0.23 -0.68 -0.58 0.56 -1.89 0.72 -0.14 1.19 -0.98
-0.24 0.05 0.06 0.11 0.13 0.07 0.17 -0.01 -0.04 -0.04 -0.14 -0.19
0.07 0.21 0.18 0.13 0.07 -0.23 0.01 -0.09 0.04 -0.12 -0.2 -0.15
0.36 0.87 0.28 0.81 -0.28 -0.59 -0.62 -1.12 -0.83 -0.14 -0.07 -0.16
-0.89 -0.29 0.24 0.27 0.09 0.07 -0.27 -0.04 0.23 0.16 0.16 -0.11
-0.12 -0.01 0.2 0.2 0.07 -0.06 -0.07 0.03 -0.03 -0.09 -0.03 -0.12
0.26 0.39 -0.06 0.1 0.08 -0.08 -0.37 -0.29 -0.35 -0.18 0.08 0.19
-0.26 0.11 0.15 0.29 -0.14 -0.03 -0.07 -0.16 0.08 0.03 0.07 -0.18
-0.18 0.27 0.23 0.07 -0.23 -0.2 0.2 -0.14 -0.13 0.1 -0.04 -0.06
0.85 0.64 0.04 0.12 0.27 -0.19 -0.44 -0.64 -0.65 -0.66 -0.22 -0.12
-0.73 -0.16 0.11 0.07 0.08 -0.18 0.02 0.03 0.34 0.12 0.18 -0.11
0.47 0.16 0.21 0.08 -0.09 -0.17 -0.18 -0.32 -0.07 -0.09 -0.09 -0.08
-0.14 0.18 0.02 0.39 -0.28 -0.33 1.29 0.26 -0.67 -0.72 -0.89 -0.74
-0.11 0.06 0.36 0.46 -0.0 -0.36 -0.33 -0.05 -0.09 0.04 -0.21 0.01
0.08 0.53 0.25 0.4 0.07 -0.09 0.51 -0.23 -0.58 -0.69 -0.42 -0.54
-0.49 0.25 0.09 0.36 -0.31 -0.62 0.29 -0.39 -0.07 0.17 0.26 0.04
-0.05 0.33 0.29 0.27 0.07 -0.37 0.16 -0.18 -0.31 -0.2 -0.13 -0.1
0.46 0.43 -0.12 0.37 -0.17 -0.59 -0.07 -0.3 -0.03 -0.24 -0.03 -0.1
0.06 -0.02 0.15 0.32 0.19 -0.03 0.37 -0.04 -0.25 -0.3 -0.35 -0.34
0.13 0.27 0.49 0.85 0.1 0.23 0.27 -0.51 -0.79 -0.54 -0.78 -1.01
-0.45 -0.01 0.06 0.13 -0.37 0.1 0.18 -0.28 0.19 0.09 0.04 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.