Heatmap: Cluster_153 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.55 -0.35 0.4 0.1 0.45 -0.47 0.03 0.01 -0.17 0.17 0.13 -0.14
-1.04 -0.87 -2.33 -0.65 -1.21 -1.38 -2.39 0.06 1.21 1.04 1.09 0.66
0.28 0.05 -0.11 -0.15 -0.18 -0.1 -0.07 0.14 -0.03 0.16 -0.1 0.03
-0.06 -0.01 0.1 -0.06 0.11 -0.03 -0.1 0.08 -0.03 0.06 -0.05 -0.04
-0.33 -1.0 -0.2 -0.17 -0.36 -0.24 0.43 0.22 0.15 0.25 0.33 0.34
-0.07 -0.3 0.08 -0.11 -0.07 -0.02 -0.11 -0.14 0.2 0.16 0.16 0.15
- - - - - - 2.08 - 2.21 - 1.64 -
0.05 -0.22 -0.12 -0.09 -0.1 0.24 -0.03 0.09 0.13 0.12 -0.01 -0.12
1.98 -0.39 0.35 - - -0.12 - -0.38 0.38 -0.31 -0.62 0.66
-0.04 -0.11 0.07 -0.02 -0.03 0.01 -0.04 -0.08 0.03 0.13 0.08 -0.02
0.22 -0.3 -0.1 -0.21 -0.39 -0.17 0.23 0.07 -0.09 0.43 -0.0 0.09
-0.08 -0.28 -0.02 -0.12 0.09 0.2 -0.05 -0.18 0.04 0.12 0.21 -0.03
-0.17 -0.25 0.06 -0.06 -0.02 -0.01 -0.02 0.02 0.12 0.13 0.15 -0.0
-0.13 -0.15 -0.01 0.01 0.13 0.15 -0.19 -0.17 0.14 0.08 0.14 -0.09
-0.09 -0.04 -0.08 -0.04 0.01 0.07 -0.13 0.09 0.11 0.02 0.08 -0.04
-0.09 -0.15 -0.05 -0.07 -0.05 -0.04 -0.02 0.01 0.07 0.17 0.17 0.01
-0.45 -0.02 -0.06 -0.53 -0.24 0.02 -0.01 0.55 0.15 0.08 0.1 0.08
-0.04 -0.17 -0.08 -0.12 0.01 0.0 0.06 -0.02 0.0 0.21 0.06 0.04
-0.36 -0.11 0.0 0.12 0.16 0.33 0.17 0.01 -0.11 -0.06 0.03 -0.33
-0.06 -0.0 0.06 -0.03 0.12 -0.02 -0.09 -0.13 0.12 -0.02 0.06 -0.03
-0.4 -0.77 -0.12 -0.28 0.46 -0.04 0.15 0.29 0.13 0.27 0.01 -0.12
-0.35 -0.14 -0.16 -0.13 0.01 0.15 -0.25 -0.02 0.22 0.31 0.25 -0.06
-0.08 -0.33 -0.04 -0.17 -0.18 -0.08 -0.14 -0.22 0.32 0.26 0.44 -0.02
0.3 0.15 -0.1 -0.05 0.21 0.06 -0.14 -0.2 0.01 -0.09 -0.03 -0.22
-0.08 -0.32 -0.02 -0.1 -0.08 0.17 0.0 -0.08 0.15 0.11 0.18 -0.01
-0.01 -0.01 -0.31 -0.13 -0.05 -0.0 -0.15 0.05 0.14 0.2 0.04 0.15
-0.52 0.1 0.33 0.08 0.25 0.0 0.15 -0.08 -0.08 0.1 -0.27 -0.28
0.01 -0.08 0.03 -0.03 0.02 0.03 0.01 0.08 -0.05 0.07 0.0 -0.11
-0.57 -0.26 0.05 0.26 0.13 0.26 -0.06 -0.25 0.06 0.12 0.15 -0.1
-0.0 -0.01 0.04 -0.08 -0.13 -0.02 -0.02 0.16 -0.11 0.18 -0.01 -0.02
-0.56 -0.34 0.42 -0.33 -0.74 0.31 -0.77 -0.12 0.33 0.43 0.55 -0.02
-0.46 -0.57 0.21 0.24 -0.24 -0.1 0.33 -1.37 0.61 0.4 0.34 -0.47
0.1 -0.01 0.03 0.04 0.35 0.23 -0.15 -0.18 0.02 -0.16 -0.29 -0.11
-0.1 -0.87 - 0.57 -0.43 0.79 - -0.93 0.89 0.97 1.15 -
-0.06 0.08 0.35 -0.05 0.0 0.13 -0.06 -0.06 0.1 -0.01 -0.11 -0.43
-0.26 -0.27 -0.41 -0.35 -0.2 0.23 -0.31 -0.2 0.32 0.59 0.36 0.06
2.92 - - - - - - - - - - 2.16
-0.13 -0.27 0.69 -1.97 -0.9 -1.32 -2.14 -0.16 0.47 0.85 0.59 0.72
-0.14 -0.16 -0.12 -0.17 -0.14 0.38 -0.0 -0.0 0.06 0.39 -0.24 -0.02
-0.04 -1.29 -0.39 0.08 -0.06 0.15 -0.1 0.16 0.26 0.45 0.2 -0.06
-0.24 -0.12 0.22 -0.11 0.09 0.05 -0.28 -0.1 0.14 -0.0 0.35 -0.13
0.04 -0.17 -0.22 -0.24 -0.08 0.22 -0.01 0.02 0.07 0.24 0.08 -0.04
- - - - - - - 1.88 1.72 2.33 - -
-0.23 -0.34 -0.12 -0.12 -0.01 0.11 0.17 0.1 0.15 0.18 0.17 -0.17
-0.05 -0.21 -0.02 -0.05 -0.05 0.12 0.08 -0.03 0.13 0.08 0.09 -0.12
-0.86 -0.08 -0.28 0.31 0.62 0.64 -0.33 -0.71 0.18 0.16 -0.24 -0.23
-0.43 -0.34 -0.02 -0.11 -0.07 -0.06 0.01 0.17 0.15 0.24 0.23 0.07
0.31 -0.07 0.01 -0.04 -0.03 -0.07 -0.35 0.01 -0.27 0.33 -0.02 0.05
-0.11 -0.37 0.69 -1.4 -1.19 0.11 -0.15 0.78 -0.2 0.27 0.18 -0.05
0.73 -0.73 0.27 -0.5 -0.9 0.36 -0.76 -0.26 0.01 0.46 0.48 -0.31
-0.32 -0.32 -0.42 -0.05 0.23 0.11 0.3 -0.38 0.6 -0.09 0.28 -0.42
2.57 - - 0.45 - - - - 0.55 - 0.58 0.81
1.9 - - - -0.67 - - - - 1.21 0.96 1.75
- - - - - 1.62 -1.06 2.13 - 2.03 - -
1.03 -2.29 -0.99 -0.33 -0.65 0.04 -0.63 0.07 0.17 0.29 0.75 0.07
0.05 -0.31 0.12 -0.3 0.03 0.15 0.02 -0.1 -0.03 0.19 0.07 0.01
-0.37 -0.59 0.24 -0.42 -0.2 0.09 -0.08 -0.03 0.44 0.26 0.33 -0.05
-0.01 -0.15 0.05 -0.06 -0.04 0.09 -0.11 -0.17 0.04 0.28 0.13 -0.1
0.17 -0.04 0.04 -0.14 -0.24 0.04 -0.28 -0.0 -0.04 0.2 0.07 0.14
1.3 0.1 -0.98 0.15 -0.72 -0.48 -1.03 -0.08 -0.33 -0.7 0.65 0.16
-0.15 -0.35 0.11 -0.16 -0.05 0.28 0.02 0.13 0.09 0.13 -0.08 -0.08
0.26 -0.1 -0.34 -0.34 -0.13 -0.02 -0.06 0.04 0.15 0.25 0.04 0.11
- - - - - - - 2.34 - 2.79 - -
0.32 -1.45 -0.04 -1.41 -0.8 -0.32 0.11 -0.07 0.79 0.44 0.44 0.25
2.02 1.2 - - - - - - 0.01 0.3 -0.0 1.27
-0.25 -0.06 0.16 -0.36 -0.43 -0.27 0.27 0.19 0.26 0.46 0.01 -0.32
-0.33 -0.75 0.15 -0.39 0.01 0.35 0.22 -0.24 0.16 0.27 0.36 -0.25
-0.12 -2.24 0.01 -0.77 - 0.95 -0.56 -0.52 -0.13 1.61 0.83 -2.13
-0.81 -3.9 0.11 -2.3 0.23 0.47 0.81 1.05 -0.49 0.75 -1.55 -0.07
-0.17 -0.28 -0.1 -0.22 -0.1 0.32 0.1 0.07 0.11 0.35 0.01 -0.28
-0.23 -0.45 -0.18 0.08 -0.14 0.06 -0.1 0.3 0.48 0.07 0.16 -0.32
-1.4 -0.09 0.48 0.06 -0.29 -0.44 -0.44 0.16 -0.27 0.48 0.7 -0.0
-0.01 -0.74 0.23 -0.38 0.09 -0.29 -0.36 -1.12 0.38 0.22 0.79 0.2
3.05 -0.36 - - - - - - - - - 1.55
-0.32 -0.5 0.11 -0.28 -0.16 0.14 0.01 -0.03 0.27 0.18 0.38 -0.04
-0.08 -0.22 -0.09 -0.19 -0.15 0.01 -0.06 -0.02 0.22 0.2 0.27 0.01
-0.14 -0.18 -0.06 -0.1 0.06 0.11 -0.08 -0.1 0.14 0.12 0.24 -0.07
-0.1 -0.25 -0.03 -0.02 0.08 0.13 0.07 -0.07 0.06 0.02 0.11 -0.05
-0.05 -0.15 -0.08 -0.02 -0.08 -0.12 0.12 0.01 0.05 0.18 0.1 -0.01
-0.2 -0.3 -0.08 -0.05 0.02 0.07 0.08 0.03 -0.0 0.33 0.16 -0.15
-0.16 -0.14 -0.13 -0.08 0.17 0.06 -0.14 -0.19 0.29 0.25 0.13 -0.18
-0.09 -0.32 0.35 -0.02 -0.17 0.08 -0.38 -0.0 0.05 0.03 0.12 0.2
-0.03 -0.17 0.04 0.07 0.08 0.09 -0.08 -0.12 -0.05 0.06 0.14 -0.07
-0.09 0.0 0.07 -0.0 0.07 0.18 -0.16 -0.17 -0.1 0.05 0.09 0.01
0.22 -0.23 -0.16 -0.19 -0.12 -0.08 -0.09 0.08 -0.04 0.0 0.14 0.35
-0.02 -0.29 -0.14 0.05 -0.14 -0.04 -0.15 0.14 0.17 0.25 0.13 -0.06
-0.12 -0.56 0.08 -0.19 -0.22 0.18 -0.16 -0.05 0.18 0.32 0.23 0.08
0.02 -0.22 -0.17 -0.01 -0.25 0.02 0.21 -0.02 0.03 0.27 0.07 -0.04
0.02 -0.12 0.02 0.01 0.22 0.15 0.04 -0.14 -0.02 -0.05 -0.02 -0.17
-0.62 -1.03 -0.39 -1.11 -0.44 0.48 0.35 -0.55 0.29 1.01 -0.01 0.4
-0.01 -0.39 0.07 0.0 0.42 0.34 -0.12 -0.31 -0.16 -0.15 0.19 -0.12
-0.3 -0.09 -0.04 0.16 0.17 0.19 0.07 0.0 -0.06 0.1 -0.03 -0.27
0.27 -0.07 -0.01 -0.07 -0.41 0.09 -0.36 0.05 -0.09 0.16 0.22 0.06
-0.52 -0.5 -0.36 0.05 0.64 0.25 -0.18 -0.23 0.54 0.08 -0.26 -0.06
0.08 -0.39 0.66 -0.4 -0.85 -0.49 -1.02 0.06 0.03 0.4 0.31 0.54
0.18 -1.05 -0.3 -0.15 -0.21 -0.18 0.41 -0.17 0.31 0.49 0.15 -0.07
0.01 -0.03 0.12 -0.1 -0.05 0.0 0.04 -0.19 0.18 0.11 0.08 -0.26
-0.2 -0.07 0.01 -0.09 0.09 0.03 0.05 0.01 -0.07 0.18 0.01 0.01
-0.2 -0.14 0.09 0.05 0.0 0.09 -0.07 -0.03 0.07 0.11 0.08 -0.09
2.75 - - - - - - 0.39 - 0.45 - 1.38
-0.24 -0.36 0.41 -0.63 -0.27 0.07 0.01 0.26 0.11 0.33 0.04 -0.07
0.14 -0.3 -0.47 -0.27 -0.37 0.08 -0.23 0.44 0.12 0.45 0.03 0.05
-0.93 0.11 - - 0.26 -0.66 -0.83 1.45 0.46 1.48 -0.97 -0.74
-0.11 -0.4 0.02 -0.11 -0.16 0.07 0.08 0.02 0.23 0.08 0.1 0.08
0.17 -0.11 0.0 0.0 0.17 0.19 -0.15 -0.12 -0.18 0.08 0.02 -0.15
0.14 -0.3 0.17 -0.19 0.03 0.04 -0.11 -0.05 -0.0 0.15 0.06 -0.0
0.07 -0.29 -0.02 -0.17 -0.07 0.12 0.02 0.04 0.17 0.1 0.09 -0.13
-0.02 -0.07 0.12 -0.06 -0.14 0.06 -0.2 0.06 0.02 0.14 0.06 0.01
-0.08 -0.2 0.01 -0.1 0.11 -0.02 0.1 -0.06 0.08 0.16 0.04 -0.07
-0.13 -0.28 0.07 -0.06 0.11 0.07 -0.03 0.06 0.1 0.12 -0.03 -0.06
0.01 -0.2 -0.01 -0.05 -0.14 -0.08 -0.13 0.15 0.0 0.08 0.13 0.17
-0.73 -0.33 0.04 0.04 0.22 0.12 0.16 0.08 0.07 0.4 -0.1 -0.29
0.39 -0.12 -0.06 0.12 0.04 0.36 -0.72 -0.17 -0.03 0.15 -0.11 -0.17
-0.34 -0.4 0.07 -0.15 0.05 -0.12 -0.19 0.03 0.32 0.07 0.34 0.12
0.11 -0.01 0.03 0.07 0.11 -0.03 -0.09 0.13 -0.04 0.01 -0.15 -0.17
-0.12 -0.38 -0.08 0.04 -0.03 0.28 -0.5 0.07 0.33 0.19 0.01 -0.02
0.2 -0.58 0.09 -0.46 0.61 0.3 -0.28 -0.08 -0.08 -0.06 -0.12 0.05
-0.24 -0.1 0.16 0.39 0.25 0.19 -0.1 -0.19 -0.18 -0.06 -0.05 -0.23
-0.18 -0.64 0.42 0.07 -0.11 0.03 -0.34 0.16 0.04 0.31 0.15 -0.21
-0.24 -0.22 0.11 0.22 0.24 0.18 -0.17 -0.29 -0.07 0.02 0.21 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.