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Heatmap: Cluster_50 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.07 0.35 -0.14 0.29 -0.38 -0.08 -0.27 -0.07 -0.48 0.19 -0.07 0.31
-0.11 0.25 0.07 0.13 -0.15 -0.19 0.18 -0.29 -0.2 0.14 -0.04 0.08
2.57 2.6 - - - - - - - - - -
0.03 -0.19 -0.56 0.12 -0.08 0.3 0.39 0.41 -0.43 0.11 -0.17 -0.31
1.21 0.63 -2.83 0.46 -1.3 -0.07 -0.62 -1.96 0.96 0.17 -0.76 -0.52
0.2 0.49 -0.55 0.04 0.0 -0.0 -0.64 0.5 -0.4 -0.23 -0.03 0.12
0.41 0.31 -1.02 -0.08 -0.18 0.38 -0.29 0.22 -0.04 -0.46 0.1 0.09
0.02 0.03 -0.03 0.15 0.07 0.09 0.01 0.06 -0.12 -0.2 -0.04 -0.08
-0.0 -0.09 -0.23 0.07 -0.13 0.18 -0.15 -0.05 0.02 0.07 0.12 0.13
-0.12 0.05 -0.06 0.09 -0.01 0.15 0.05 -0.03 -0.07 0.11 -0.07 -0.11
-0.49 0.1 -0.16 0.16 0.02 -0.08 0.17 0.17 0.19 0.15 -0.1 -0.3
0.11 0.03 -0.14 -0.11 -0.0 0.08 0.12 0.09 -0.13 -0.19 -0.07 0.16
0.76 1.36 -1.22 0.5 -1.66 -1.16 -0.39 -1.24 -1.45 0.59 0.02 0.09
-0.1 0.14 0.03 0.15 -0.16 0.08 -0.08 -0.04 -0.11 0.12 0.01 -0.07
-0.15 0.81 -0.46 0.2 -0.11 0.24 -0.21 -0.18 0.0 -0.16 -0.44 -0.03
0.6 0.08 -0.33 0.04 -0.35 0.13 -0.37 0.05 -0.07 -0.19 -0.05 0.16
-0.04 0.21 -0.0 0.14 0.07 0.0 0.1 0.05 -0.19 -0.18 -0.24 0.01
-0.03 0.23 -0.03 0.06 0.02 0.09 0.08 -0.02 -0.19 -0.1 -0.19 0.02
-0.02 0.26 -0.22 0.18 0.01 0.12 0.1 -0.03 -0.3 -0.06 -0.14 -0.02
0.41 0.49 -0.11 0.29 -0.43 -0.4 -0.33 -0.25 -0.2 -0.09 0.14 0.1
-1.36 -1.08 -1.55 -1.59 -2.91 0.59 0.92 1.27 -0.07 0.02 0.65 -0.01
0.28 0.2 -0.01 -0.01 -0.06 0.18 -0.34 0.06 -0.35 -0.19 -0.01 0.09
-0.09 0.17 -0.09 0.13 0.09 0.17 0.07 -0.05 -0.19 -0.08 -0.1 -0.1
0.22 -1.31 -0.84 0.32 - 1.04 0.58 0.77 -0.82 0.6 -0.76 -0.53
-3.93 -1.3 -0.95 -1.2 -0.99 0.81 0.54 0.75 0.74 0.09 0.76 -0.41
-0.02 -0.27 -0.05 0.1 -0.01 0.16 0.2 0.24 -0.1 -0.01 -0.16 -0.18
-0.28 0.27 -0.02 0.2 0.06 -0.13 -0.32 0.27 -0.4 0.07 -0.06 0.13
-0.22 1.08 -1.05 1.1 -0.41 0.95 -0.03 -0.01 -0.82 -0.26 -2.58 -2.55
0.34 0.82 -1.21 0.41 -0.81 -0.67 -0.17 -0.24 -0.38 0.32 -0.4 0.59
0.23 0.34 -0.19 -0.06 0.14 0.23 -0.26 0.05 -0.33 -0.04 -0.02 -0.28
0.56 0.36 0.14 -0.41 -0.39 0.22 -0.36 0.05 -0.61 -0.02 0.02 -0.03
0.4 0.09 -0.96 0.04 -0.47 0.06 -0.51 0.35 -0.09 -0.14 -0.21 0.7
-0.38 0.39 0.11 0.22 0.12 0.16 0.22 0.05 0.29 -0.17 -0.76 -0.8
-0.74 -0.29 - - -0.77 1.11 0.98 1.78 -0.8 - 0.59 -1.46
-0.1 0.22 0.08 0.02 -0.43 0.11 -0.23 0.36 -0.43 -0.14 0.05 0.25
0.2 0.5 0.19 0.15 0.09 -0.04 -0.57 0.36 -1.74 -0.17 -0.07 0.07
0.28 -0.04 -0.13 -0.21 -0.69 0.61 0.09 0.24 -0.19 -0.13 -0.38 0.13
0.3 -0.43 -1.07 -0.46 -2.61 0.23 0.16 1.54 -1.04 -2.73 0.84 0.06
0.42 -0.23 -2.63 0.11 -0.15 0.35 0.24 0.4 -0.05 0.17 -0.52 0.14
1.24 1.33 0.11 -0.15 -1.34 -2.54 -1.37 -0.99 -0.98 0.3 -0.07 -0.02
-0.06 0.42 0.06 -0.12 -0.09 -0.25 -0.31 0.58 -0.36 -0.22 -0.16 0.18
-1.33 -0.18 1.33 -1.45 -0.65 0.08 -0.88 1.17 -0.35 -1.17 -2.32 0.95
-0.06 0.69 - 0.02 0.57 0.39 0.34 -0.93 -1.09 0.74 - 0.76
0.06 0.2 0.18 0.27 0.04 0.02 0.01 0.07 -0.26 -0.32 -0.31 -0.11
1.43 -0.27 0.11 0.33 -0.06 -2.56 -0.29 0.0 -0.48 -0.01 -0.73 -0.19
0.64 0.25 0.11 -0.08 -0.55 -0.55 -0.15 0.14 -0.82 -0.13 0.01 0.47
-0.61 -0.15 -0.68 -0.02 0.1 0.56 0.06 0.32 -0.16 0.17 -0.29 0.22
1.73 -0.08 -3.49 -0.68 0.31 -0.38 -0.69 0.93 -3.44 -0.06 -0.2 -0.85
-0.8 -0.35 -0.29 0.64 - 1.57 - - 0.16 -0.61 0.21 1.24
0.12 0.51 -0.41 -0.09 -1.09 0.11 0.01 0.25 -0.83 0.39 -0.07 0.3
0.81 -1.46 - -1.04 -0.5 0.6 -0.13 - 0.81 0.56 0.11 0.96
0.79 1.29 0.0 0.22 -0.58 -0.59 -0.66 -0.85 -0.61 -0.41 -0.06 -0.37
0.55 0.37 0.33 -0.34 -0.38 -1.56 -1.87 -0.88 -0.47 -0.21 0.93 0.84
-0.51 -0.1 -1.05 -0.38 -0.08 0.41 0.55 0.91 0.03 -0.16 -0.85 0.04
0.23 0.45 -0.57 0.41 - 1.02 - 0.72 -0.54 0.29 0.53 -1.25
0.02 0.15 0.03 -0.22 -0.2 -0.09 -0.19 -0.0 -0.28 0.24 0.21 0.21
0.12 -0.1 0.44 -0.43 -0.91 0.13 -0.63 0.45 -0.11 -0.18 0.19 0.38
0.15 0.01 0.15 -0.08 0.11 -0.05 -0.26 0.13 -0.43 -0.01 0.01 0.14
0.2 0.37 -0.46 0.41 -1.02 -0.28 -0.71 0.28 -0.82 0.3 0.19 0.51
0.3 0.39 -0.01 0.17 -0.38 -0.28 -0.57 -0.64 -0.12 0.13 0.23 0.32
-1.32 -0.38 -2.94 0.22 0.28 0.59 -0.62 -0.17 0.33 0.1 0.47 0.63
0.05 0.19 -0.16 0.07 -0.04 -0.17 -0.07 -0.04 -0.1 0.0 0.11 0.11
-0.99 0.51 -0.41 0.4 -0.33 0.23 -0.91 0.99 -0.98 -0.38 0.15 0.17
-0.21 0.1 0.15 0.06 -0.1 0.07 -0.15 0.01 -0.23 0.04 0.16 0.03
0.01 0.03 -0.28 -0.09 -0.09 -0.01 0.06 0.19 0.02 0.04 0.01 0.07
0.01 0.31 0.09 0.16 0.04 0.18 -0.0 -0.02 -0.4 -0.28 -0.42 0.12
0.15 0.07 -0.1 -0.08 -0.05 0.08 -0.18 0.18 0.14 -0.18 0.02 -0.12
0.2 0.13 -0.09 0.08 -0.03 0.08 -0.14 0.08 -0.25 -0.1 -0.2 0.15
-0.07 0.18 -0.05 0.21 -0.2 0.36 -0.11 -0.06 -0.2 -0.12 0.03 -0.09
0.09 0.37 -0.2 0.18 -0.37 -0.13 0.04 -0.14 -0.22 0.07 -0.02 0.18
-0.16 0.06 -0.07 0.11 -0.11 0.05 -0.1 0.12 -0.02 0.07 0.05 -0.04
0.1 0.37 -0.21 0.17 -0.17 0.27 -0.21 0.02 -0.36 -0.08 0.04 -0.13
-0.01 0.49 -0.09 0.03 0.08 -0.43 -0.07 -0.36 -0.07 0.1 -0.05 0.15
0.15 0.16 -0.02 0.09 -0.05 0.27 -0.07 -0.03 -0.21 -0.12 -0.03 -0.22
0.17 0.25 0.11 0.16 0.06 0.1 -0.0 -0.01 -0.32 -0.36 -0.33 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.