Heatmap: Cluster_196 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.37 -0.2 -0.43 -0.09 0.1 0.3 -0.16 -0.09 0.45 0.19 0.18 -0.17
0.02 0.01 -0.26 0.0 -0.09 -0.18 -0.1 -0.15 0.15 0.15 0.29 0.06
-0.08 0.29 -0.2 0.17 0.22 -0.3 -0.13 -0.57 0.18 -0.25 0.34 0.05
0.56 -0.09 -0.13 0.02 -0.39 0.49 0.0 -0.48 -0.74 -1.05 0.52 0.34
-0.51 -0.14 -0.18 0.06 0.07 0.26 -0.04 0.06 0.24 0.11 0.23 -0.38
-0.07 -0.35 -0.49 -0.21 -0.24 0.13 -0.12 -0.03 0.33 0.19 0.41 0.16
-0.2 -0.01 0.09 0.04 -0.04 0.09 0.09 -0.14 0.06 0.06 0.07 -0.12
-0.1 -0.1 -0.25 -0.06 0.03 -0.0 -0.01 -0.09 0.21 0.04 0.22 0.05
-0.6 0.04 -0.63 0.19 0.33 0.17 -0.06 -0.35 0.12 0.12 0.35 -0.08
-0.84 -0.3 -1.32 0.26 -0.12 0.2 0.03 -0.07 0.44 0.35 0.13 0.33
-0.03 -0.2 -0.44 -0.31 -0.12 0.23 0.03 0.28 0.09 0.11 0.29 -0.13
-0.26 0.04 -0.08 0.13 -0.4 0.05 -0.19 -0.31 0.34 0.15 0.3 0.03
-0.03 -0.2 -0.37 -0.33 -0.18 0.31 0.03 -0.13 0.22 0.16 0.29 0.01
-0.24 0.01 -0.25 -0.04 -0.09 -0.22 -0.08 -0.1 0.24 0.21 0.34 0.07
-0.62 0.05 -0.22 0.24 -0.14 0.21 -0.03 -0.22 0.27 0.18 0.29 -0.29
-0.08 0.05 -0.36 0.05 -0.06 -0.28 -0.19 -0.36 0.04 0.23 0.47 0.24
-0.26 0.0 -0.24 0.19 -0.06 0.18 -0.01 -0.11 0.13 0.06 0.1 -0.06
-0.5 -0.48 -0.51 0.14 -0.21 0.29 0.07 0.38 0.32 0.21 0.09 -0.22
-0.52 0.3 -0.64 -0.38 -0.44 0.13 0.22 0.11 0.19 0.35 -0.08 0.28
-0.16 -0.03 -0.27 0.08 -0.11 -0.17 -0.16 0.2 0.13 -0.06 0.35 0.07
0.11 -0.06 -0.16 -0.04 -0.08 -0.02 -0.05 -0.08 0.07 0.1 0.19 -0.03
-0.32 -0.15 -0.85 0.11 -0.15 0.33 0.15 0.06 0.16 0.18 0.26 -0.15
-0.06 -0.15 -0.65 0.12 0.22 -0.05 0.15 -0.36 0.11 0.29 0.47 -0.5
- 0.91 -1.19 -1.28 - -0.66 -0.71 -0.98 0.83 1.05 1.64 -0.84
-0.48 -0.8 -0.68 -1.44 -2.23 0.44 -0.22 0.43 0.87 0.29 0.73 0.31
-0.04 -0.11 -0.3 0.01 -0.17 0.04 0.06 0.13 0.1 0.17 0.16 -0.13
0.15 0.06 -0.28 0.0 -0.24 -0.2 -0.31 0.05 0.07 0.17 0.3 0.08
-0.39 -0.26 -0.12 -0.41 -0.99 0.39 0.28 0.37 0.41 0.48 -0.1 -0.4
-0.05 0.01 -0.14 -0.08 -0.32 -0.05 -0.13 -0.04 0.18 0.16 0.22 0.15
-1.61 -4.07 -2.68 - -4.23 0.87 0.67 0.73 1.31 0.97 0.15 -0.37
0.22 -0.03 -0.83 -0.5 -1.94 0.11 -0.44 0.39 0.4 0.49 -0.01 0.56
-0.55 0.12 -0.18 0.25 0.26 0.15 -0.19 -0.83 0.19 -0.0 0.27 0.09
-0.18 0.01 0.06 0.23 -0.07 0.3 -0.03 -0.4 0.29 -0.01 0.07 -0.49
0.1 -0.5 -0.08 -0.22 -0.2 -0.08 -0.2 0.19 0.02 0.27 0.69 -0.4
-1.02 -0.08 -2.38 -0.92 0.08 0.23 1.13 -0.39 -0.46 0.59 0.5 0.02
-0.66 -0.18 0.13 -0.02 -0.27 0.31 0.37 -0.27 0.33 0.0 0.13 -0.21
-0.04 -0.23 -0.3 0.05 0.07 0.41 -0.01 -0.2 0.18 0.04 0.1 -0.22
-0.12 0.07 -0.12 0.06 0.08 0.01 -0.21 -0.11 0.02 0.07 0.15 0.06
-0.03 -0.02 -0.15 -0.06 -0.12 0.07 0.03 -0.01 0.11 0.06 0.12 -0.03
-0.11 -0.09 -0.29 0.12 0.06 0.09 0.13 -0.16 -0.02 -0.08 0.38 -0.13
-0.27 -0.09 -0.14 -0.04 0.03 0.24 0.11 -0.11 0.15 0.1 0.05 -0.1
0.12 -0.05 -0.38 -0.28 -0.11 0.14 0.1 0.2 0.08 0.11 0.18 -0.25
0.28 -0.27 -0.63 -0.26 0.05 0.07 0.31 0.19 -0.01 0.15 0.13 -0.3
-0.26 -0.14 -0.08 0.12 0.06 0.21 -0.06 0.07 0.11 0.06 0.03 -0.18
-0.68 -0.15 -0.67 0.08 -0.21 0.14 0.03 0.01 0.47 0.1 0.43 -0.03
-0.11 -0.22 -0.37 -0.04 -0.1 0.13 0.01 -0.08 0.07 0.31 0.09 0.19
-0.24 0.05 -0.32 -0.02 -0.12 -0.04 -0.08 -0.35 0.35 0.12 0.39 0.05
-0.11 -0.05 -0.3 -0.07 -0.27 0.15 0.2 -0.02 0.08 0.21 0.2 -0.16
-0.64 -0.18 -0.15 0.07 -0.09 0.5 -0.06 -0.5 0.37 0.12 0.34 -0.22
-0.65 -0.08 -0.34 0.15 -0.17 0.31 0.1 -0.22 0.51 0.07 0.23 -0.28
-0.26 -0.16 -0.12 -0.47 -0.23 0.06 0.33 -0.05 0.45 0.47 -0.12 -0.24
-0.46 0.01 -0.31 -0.1 -0.46 -0.04 0.02 -0.12 0.29 0.25 0.51 0.07
-0.27 -0.05 -0.33 0.04 0.01 0.06 0.02 -0.07 0.3 0.11 0.21 -0.16
-0.33 -0.13 -0.19 0.04 -0.16 0.07 0.08 0.17 0.05 0.13 0.17 0.02
0.08 -0.04 -0.16 -0.22 0.05 0.2 0.22 -0.36 0.06 -0.14 0.34 -0.2
-0.07 0.04 -0.72 -0.27 -0.19 -0.08 -0.07 -0.11 0.4 0.16 0.34 0.24
-0.6 -0.75 -1.19 -0.17 0.13 0.7 0.23 -0.24 0.5 0.32 0.26 -0.28
-0.01 -0.11 -0.18 -0.08 -0.22 0.15 0.01 -0.14 0.16 0.15 0.26 -0.07
-0.28 -0.32 -1.15 0.09 0.09 0.2 0.18 -0.48 0.39 0.48 0.32 -0.24
-0.52 -0.19 -0.42 0.07 -0.22 0.22 0.22 -0.18 0.47 0.16 0.35 -0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.